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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lan8g1434 ATGGAATCGATTTTAGCAAGAGCTCTTGAGTACACACTCAAATATTGGCTCAAATCTTTCTCCAGAGATCAATTCAAGTTGCAGGGTCGCACCGCTCATCTCTCCAATTTAGATATTAATGGTGATGTATTGCATTCTAGTCTTGGTTTTCCACCTGCCCTTAATGTCTCTACTGCTAAAGTTGCCAAATTGGAGATTATGTTGCCATCATCAGTGAGCAATGTACAAATAGAGCCGATTATTGTGAAAATTGATAGACTTGATTTGGTTCTTGAAGAGAATTCTGATTTTGATCCTGCTGATTCTCCAACCAGTTCGACTCCATCCAGTGCCTCCGCGAAGGGTAGCGGCTATGGTTTTGCTGATAAGATTGCAGATGGAATGACTATACAAATTCATACAGTTAATCTATTACTTGAAACTCGAGGGAGTGGTCGTGGCCAAGGGGGAGCAACATGGGCACCACCTATGGCATCTATCACCATACGCAACCTTTTGCTGTATACCACAAATGAAAGCTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAGGCGCGGGAATTTTCCACTAATATGAAGTATATATATGTCTTCAAAAAACTGGAATGGGAATATTTGTCTATTGATCTTTTGCCTCATCCTGACATGTTCACGGATGCTACTTTAGGCCGTTCTCAAGAAGGAGGAAACCTGAGAGATGATGATGGTGCAAAACGAGTATTCTTTGGAGGAGAGCGGTTTATAGAAGGAATATCGGGAGAAGCATATATCACGATTCAGAGAACTGAATTAAATAGTCCACTTGGGCTTGAGGTTCAGTTACATGTCACGGAAGCTGTTTGCCCTGCATTAAGTGAACCAGGACTACGAGCACTTCTCCGCTTTATGACAGGATTATATGTCTGTCTAAACAGGGGAGATGTAAATTCCAAGGCTCAGCAGCGATCGACTGAATCTGCTGGGCGTTCTCTTGTCTCAATTATCGTGGACCATATATTTCTGTGCATTAAAGATTCTGAATTCCAGCTTGAGCTTTTAATGCAGTCCCTCTTTTTTTCTCGGGCCAGTCTCTGTGAAGGAGATGATGACAGCAACTTGACCAAGATTGCAATTGCAGGACTATTTTTGAGGGATACCTTTTCACGCCCTCCATGTACCTTAGTGCAACCATCAATGCAATCTGTCACAGGAGATGCTTTCCAAGTGCCAAAATTTGCTAGAAGCTTTTGCCCCCCAATATATCCTCTTGGGGAACAGCAGTGGCAATTAATTGAGGGAACTCCTCTAATTTGCCTCCATTCCCTTCAGATCATGCCTTCTCCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTCAAACAGTTATCGACTGTCAGCCTCTTATGATTCATCTCCAGGAAGAATCCTGCCTGAGGATATCTTCTTTCTTAGCTGATGGTATTGTTATAAATCCTCGTGACATTTTACCAGATTCTTCAGTAAAATCTTTTAGTTTCTCTCTCAAGGGTCTGGATTTGACAATTCCTTTGGATAAGGCCCAGTTGGATATTTCTAAAAGCAACATGGACAATACAGTCCAGACATCCTTTGCTGGTGCAAGGCTTCATATTGAAAACTTTTCCTTTTTGGATTCACCCTCTTCGAAACTAAGAATATTGAACCTGGAGAAGGATCCTGCTTGCTTCTGTCTGTGGGAAGATCAACCGGTTGATGCTAGCCAGAAGAAGTGGTCTGCCAGAGCATCCCAGCTTACTCTATCTCTTGAAGCATGTACTGGCACACTTGGGCGTCAGAGTTCCCTTGGATGGACTGCAGGATTGTGGAGATGTGTTGATCTAAAAGATACTTGCGTTGAAGTTGCAATGGTAACTGCTGATGGTAGTCCATTGTTAAAGGTTCCTCCTCCAGGGGGTATTGTAAGGGTTGGTGTTGCTTGTGAACAGTATCTATCCAACACATCTGTTGAACAGTTATTTTTTGTCTTGGATCTCTATTCTTATTTTGGTAGAGTTAGTGAGAAAATAATAATAGCAGGAAAAACGAAACAATTGAAGGATGTTAGGAACAAATCTTTTAGTGGAAACCTGATGGACAAGGTTCCTAGTGACACTTCTGTAAGTTTAGCAGTAAAAAACCTCCAACTTCGATTTCTTGAATCTTCCCCAGCCAGTGTCGAGGGAGCGCCTCTAGTACAGTTTGTTGGTGACGATCTGTTCATTAGTGCCACTCATAGAACCCTTGGTGGTGCTGTTGTCGTTTCATCTTCTATACACTGGGAGAGCATTCAGATTGATTGTGTGGATGCTGAGGGGCACTTGGCATGTGAAAATACCCCCTTGGGTTCTGGAGAAAATGTTCCCTCCTTGAATGGTGATGGATACCCACAACTGAGAGCTGTTTTCTGGGTGAATAAGAAGAACCATATATTGAATGGCAATGCTCATCCAGTCCCTTTTCTGGACGTAACCACGGTTCATGTCATACCATTTTGTGAACTAGATATGGAGTCACATAGTTTGGATGTCTCAGCTTCTATATCTGGTGTTCGTCTTGGTGGGGGGATGAACTATGCCGAAGCTCTCCTGCACCGATTTGGAATACTTGGGCCTGACGGTGGTCCCGGGAAGGATCTTTGTAAAGGGTTGGAAAACTTGAAAAGCGGACCATTGGCTAAACTTTTTAAGACAACACCTCTCATTGCTGATAGACCAGAAGATGTTGGAAGTATGACAGAAGGGAAAGAAACCGGTTTTCCACACTTGAAGAAGCCAGATAATGTGGATGTAACTATAGAATTGAGAGACTGGTTATTTGCTCTTGAAGGTGCGCAAGAGATGGCTGAAAGTTGGTGGTTCTCCAGCCATGAAGATGTAAGAAGAGAAGAGAGGTTTTGGCACACAACTTTCCATAGTTTACAATTAAATGCAAAAAGTAGTCCAAAGAAAGTTCTAGGTGAAAAAATACAACCACGGAGAATACAACAACATGCTGTGGATCTGGTTACGGTTGGAGTTCAAGGGCTGCAGATCTTGAAGCCCCATACCCAAAAAGACGTTACTTCATCAATGTTAAATGAAACTGGGGTTAAAGAATTTTCCGACACAGTTGGAGGAATTGATCTTGAAGTGGGGTTGATAGTATCCGAGGATAACGTTGATGTTGAAATGGCTAACTGGGAAGTGGAAAACTTAAAATTTGCCATTAAGCAACCGATTGAGGCTGTTGCAACCAAGGATGAGGTTCAACATCTTACTTTTCTATGCAAGTCTGAAGTTGATTCTGTAGGCCGGATAACAGCTGGAATTCTACGGCTGCTTAAGCTAGAAGGTTCTGTTGGCCAGTCTGTAATGGATCAGCTAGGTAACCTAGGAAGCGGTGGCATTGACAAGATTTTTACTCCTGAGAAGCTCAGAAGCGAAAGTAGTGTCCATAGTGGAGGACTTTCTCCCTTTTCAAACCTGATAAATGGAAGCCCACACAAAAGTTTGGAACCAACATTAACTTTGCTTGAGGAAGAAGTTGTGGATTCACAGGCTAAGGTTAAATCTTTAATCACTGATATTGGTACTTCTGAGTCTTCTATTCAGCACCTTACTGCTGTCAAACAACTCAATGAAAAGATTGAGTCAATGCAGAGTTTATTGATGCAGTTAAGGAACCAACTTTAA 3648 0.4235 MESILARALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGRTAHLSNLDINGDVLHSSLGFPPALNVSTAKVAKLEIMLPSSVSNVQIEPIIVKIDRLDLVLEENSDFDPADSPTSSTPSSASAKGSGYGFADKIADGMTIQIHTVNLLLETRGSGRGQGGATWAPPMASITIRNLLLYTTNESWQVVNLKEAREFSTNMKYIYVFKKLEWEYLSIDLLPHPDMFTDATLGRSQEGGNLRDDDGAKRVFFGGERFIEGISGEAYITIQRTELNSPLGLEVQLHVTEAVCPALSEPGLRALLRFMTGLYVCLNRGDVNSKAQQRSTESAGRSLVSIIVDHIFLCIKDSEFQLELLMQSLFFSRASLCEGDDDSNLTKIAIAGLFLRDTFSRPPCTLVQPSMQSVTGDAFQVPKFARSFCPPIYPLGEQQWQLIEGTPLICLHSLQIMPSPLPPSFASQTVIDCQPLMIHLQEESCLRISSFLADGIVINPRDILPDSSVKSFSFSLKGLDLTIPLDKAQLDISKSNMDNTVQTSFAGARLHIENFSFLDSPSSKLRILNLEKDPACFCLWEDQPVDASQKKWSARASQLTLSLEACTGTLGRQSSLGWTAGLWRCVDLKDTCVEVAMVTADGSPLLKVPPPGGIVRVGVACEQYLSNTSVEQLFFVLDLYSYFGRVSEKIIIAGKTKQLKDVRNKSFSGNLMDKVPSDTSVSLAVKNLQLRFLESSPASVEGAPLVQFVGDDLFISATHRTLGGAVVVSSSIHWESIQIDCVDAEGHLACENTPLGSGENVPSLNGDGYPQLRAVFWVNKKNHILNGNAHPVPFLDVTTVHVIPFCELDMESHSLDVSASISGVRLGGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGKDLCKGLENLKSGPLAKLFKTTPLIADRPEDVGSMTEGKETGFPHLKKPDNVDVTIELRDWLFALEGAQEMAESWWFSSHEDVRREERFWHTTFHSLQLNAKSSPKKVLGEKIQPRRIQQHAVDLVTVGVQGLQILKPHTQKDVTSSMLNETGVKEFSDTVGGIDLEVGLIVSEDNVDVEMANWEVENLKFAIKQPIEAVATKDEVQHLTFLCKSEVDSVGRITAGILRLLKLEGSVGQSVMDQLGNLGSGGIDKIFTPEKLRSESSVHSGGLSPFSNLINGSPHKSLEPTLTLLEEEVVDSQAKVKSLITDIGTSESSIQHLTAVKQLNEKIESMQSLLMQLRNQL* 1216
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lan8g1434 1215 MobiDBLite consensus disorder prediction 96 115 - -
Lan8g1434 1215 Coils Coil 1194 1214 - -
Lan8g1434 1215 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 103 IPR026854 -
Lan8g1434 1215 PANTHER AMINO-TERMINAL REGION OF CHOREIN, A TM VESICLE-MEDIATED SORTER 1 1214 - -
Lan8g1434 1215 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1214 IPR026728 -
Lan8g1434 1215 MobiDBLite consensus disorder prediction 98 114 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lan8g1434 Lan-Chr8 21481054 21491104 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lan8g1434 - - gmx:100811661 1856.26
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lan8g1434 8 21481054 21491104 Lan8g1434 8 21481054 21491104 ECH