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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lan12g0140 ATGGCTCCTAATCTGAAGCTCAAGTTATTCTATGTTCCTTTCCTGTTTTTACTTTTCACTTTTCTTTTAAAAGTCGAATCCGAGCATCATGTTTCACAAAAGATTATTGCTGCTCCACATAAGGATCTAGGAACCAATGTGATTGATGCCACTGGTTTCGACAATTCCTTCAGTAATGTGCTGGGTGATCGAAAAGGTGGTGTAAACAGTAAGGTTTCTGTTTCAACGGTTGCGTTGTTCACATTGGCAATGGCAGCTGCGACGGGTTTAGGTGCTGTGCCCTTCTTCTTTGTGGAGCTTGATCCACAATGGGCTGGATTATGCAATGGAATGGCAGCAGGTGTCATGTTGGCTGCAAGCTTTGATCTCATTCAGGAAGGACAGGATTATGGTTCTGGGAATTGGGTTGTGATCGGGATTTTAGCTGGTGGCATCTTTATTTGGTTATGTAAGAAGTGTCTTGAGCAATACGGGGAAGTAAGCATGTTGGATATAAAGGGTGCCGATGCAGCCAAAGTTGTTCTTGTAATTGGAATAATGACACTCCACTCCTTTGGGGAGGGATCTGGGGTTGGAGTCTCCTTTGCTGGCTCAAAGGGTTTCTCTCAAGGCCTGTTGGTGACGTTGGCTATTGCAGTACACAACATACCAGAGGGATTAGCTGTGAGCATGGTGCTGGCATCAAGGGGTGTCTCCCCACAGAATGCTATGTTATGGAGCATTATTACATCTTTACCTCAGCCAATTGTAGCTGTACCTTCTTTTATGTGTGCGGATGCATTTAGTAAGTTCCTGCCTTTCTGTACGGGGTTTGCTGCTGGATGCATGATCTGGATGGTTGTAGCAGAAGTTCTTCCTGATGCATTCAAGGAAGCCTCTGCTTCACAAGTTGCATCAGCAGCCACACTTTCAGTAGCATTTATGGAAGCTCTCAGCACTCTCTTTCAGAATTTCAACCATGATTACAACTCTGATGATGCTTCCGGCTTCTTTGTTTCACTACTTTTTGGCCTTGGTCCATTAGTTGGTGGGATTATTCTGGTTGCATTTGCTCTTGCTTTTCGTCTTCAACATGCTCTCCTCATGGGCACAGCATGTGGTATTGCCTTTGTTCTCGGTGCCTGGCGACCAGTGCAGCTTATTTTGTCTTCAAAACTAGGGCTTATTCCAGTTGTCTTACTCCTTGCAATTGGTGCTGCTTTCATCCATGTTTCTAGCTCCGGGTTACTGAAGCTGGCAGGTCAAAAGAAAGCCTCTGTTAATGACTTACCTACCCTCACTGGTCTCGCAGTGAGTGTTCACACCCTTCAGTCATTCATATCATGTGGTGCGATTGCTTTACATGCTTTGGCTGAAGGACTTGCGCTGGGAGTAGCTGCACCAAAAGCATATGGACTTGGTCGGCACATGGTTCTTCCAGTCTCTCTGCACGGCCTCCCTCGAGGTGCAGCCGTTGCTAGCTGCATCTTTGGTGCCACTGATAGCTGGCATGGTTCTCTTGCCACAGCTGCTATAATTGGATTTATGGGACCAATATCAGCAATAGGATCTATTCTGGCTGGTATTGATTATAGTGGTCTTGATCACATAATGGTTATGGCTTGTGGTGGATTAATTCCATGCTTTGGAAGTGTAGTTAAGAGGGCTCTTAGCTTGGACAAGAGGAAGAGCACATGTGGCATCATCATTGGTATTGTGTTTGCTACTCTATGCCTAACATTCACTAGGTTGGTTTGCTTGTATACACCTTACTGCAATTCTGCACCAGAGGCTGTTAGATAA 1782 0.4534 MAPNLKLKLFYVPFLFLLFTFLLKVESEHHVSQKIIAAPHKDLGTNVIDATGFDNSFSNVLGDRKGGVNSKVSVSTVALFTLAMAAATGLGAVPFFFVELDPQWAGLCNGMAAGVMLAASFDLIQEGQDYGSGNWVVIGILAGGIFIWLCKKCLEQYGEVSMLDIKGADAAKVVLVIGIMTLHSFGEGSGVGVSFAGSKGFSQGLLVTLAIAVHNIPEGLAVSMVLASRGVSPQNAMLWSIITSLPQPIVAVPSFMCADAFSKFLPFCTGFAAGCMIWMVVAEVLPDAFKEASASQVASAATLSVAFMEALSTLFQNFNHDYNSDDASGFFVSLLFGLGPLVGGIILVAFALAFRLQHALLMGTACGIAFVLGAWRPVQLILSSKLGLIPVVLLLAIGAAFIHVSSSGLLKLAGQKKASVNDLPTLTGLAVSVHTLQSFISCGAIALHALAEGLALGVAAPKAYGLGRHMVLPVSLHGLPRGAAVASCIFGATDSWHGSLATAAIIGFMGPISAIGSILAGIDYSGLDHIMVMACGGLIPCFGSVVKRALSLDKRKSTCGIIIGIVFATLCLTFTRLVCLYTPYCNSAPEAVR* 594
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lan12g0140 593 Pfam ZIP Zinc transporter 167 293 IPR003689 GO:0016020|GO:0030001|GO:0046873|GO:0055085
Lan12g0140 593 PANTHER BNAA05G29570D PROTEIN 40 353 - -
Lan12g0140 593 PANTHER ZINC/IRON TRANSPORTER 40 353 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lan12g0140 Lan-Chr12 1601253 1608378 Dispersed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lan12g0140 - - gmx:100800396 959.518
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
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Lan12g0140 12 1601253 1608378 Lan13g1213 13 17723380 17728027 PCT