Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal6g0630 ATGATAGAGACATTCCCTTCTTCCTTTTCTTCATCCTCAACAATTAAACTGAACCCTATTCATCACTTTCCACTTCATCTTCACAGATCCGACGTCGTTTCACCAGCTCCAACCTTTTCTCAATCCACCATCGATTTCCTTCCTTATTTCTCCGGTTACACATGGATCGCTTACGGTGCTTCTTCAATCCTCGTTATCACTCATTTCCCTTCTCCTCTCTCCGCCTCACAGACCCGCATCGGACCCATTTTCCGTCAACCTTTTCAACTCTCCTCCCCCGTCACCGCCGTGTCTTGGTCCCCTTCTACTCCTTCTTCCGGCGATCTTGCCGCCTCTGCTCAAAATTGCATCCATATATTCCGCCATCAGTCTTCCACCTCTAGAGGTTCTTTTTGTTGGAGGCAGAATGCAGTGCTTGTACAAAAAACGAAAGTGGAGGCCATCAGATGGACAGAATCAGGGGATGGAATCGTTTCTGGTGGCATGGAGGTCCTTTTCTGGAAAAAGAGTAACCAGAGTTGGGAAATAGCTTGGAAGTTTAAAGCAGATCAACCCCAAACTTTAGTTTGTGCAACCTGGTCTATTGAGGGACCTTCAGCAACTGCAGCTCAGCCTAGTAAAGGAAACATCGAAGGGTCATCAATTAATGAGGTAAGTAATTGTGTGTTAGTATGTCAAAGCAATGGACTATCTGAATATTCAAAAGTCAAACTGTGCCATCCTCTACCTGTCACAATGATTCAATGGAGACCATCGAGAGGAAGGATTTCAAACAGATATGAGAGGAATCGAACTAGGCATGTATTACTGACGTGCTGTGTAGATGGAACAGCAAGGTTATGGAGCGAGATTGATAGTGGAAAGTCCAAGAGGATGGGGAAGGACATGAATGATCAGAAAAACACAGGGCGCACTTTCTGTGTTATTGCTGTTATTGAGATAAATCAGGCCTTAAAAGGAACTATTGGTTCAGATATATTTGTGACATGGGGGACAGAAATCAGGGGAATATTTAAAACCGGTGAAGAAGCCAAACAAGTTTTCTTCAAAGAAGAATTTGAGCATGATATTAGAAAATGTGATTGGTTAGTTGGGTTTGGGCCTGGAATGTTGCTTAGCTTTTGGTCTGTCCACTGTCTTGATGACATTTCTCCAATGAGATTCCCCCGAGTTACATTATGGAGGAAGCATGAACTCCAGGACAATGACATAGGAGATGTTTATAAGTTTAACTCGTCTGACTTTAAAAACGCATTGCTTCTGCATAAATTCATCATGTTGAGAAACTGTTTGTCTGGCCCACCAGTTATATGCTCTCCACTCCAGTTATTACCTTGCAATTCCTTAGTTTGGTCATTTTTTCGTGTTCAAGCAATACATGATCATGTTGAGAACTCCCATGGTAAGGACACAGATAATATCTCCACCCATTTGACTGGCGGAGTTTTAAACTTAGATGGTCACAGTGGGAAAATCTTGAAGGTTTCAGTTCATCCTTATATATGTGAAGTTCAATTTGCCGCTTCTCTGGATTCTAATGGATTGGTTCTTTTTTGGTCACTTTCTAACATTTCAAACTGCATTTTGGGACATCCAACACTGGTTCCTTCTTGGGAACTCTGTGGAAAGCTTGCAACTCAAGTCTCATGCTCAAGGTATACAAGCTTGAGGTGGGCACCTTCGGTGCTTGATGACAAACTAATATTTTTTATGGGACATGCCAGGGGGATTGATTGCTTCATAGTTGATATTTGTCGAGTTGAAGAAGAAAATATAGAATGTCACTACTTATGCACTATTCCTTTCAGTGGTCATGGTCCTTACGAGGATGGTCCGAGTGATATCTTTGCAATTTCTTTGAACTCTACATGTAATAAAACATTTCTTAATAATAAACTTATGCTGTTGGCAATATGGAAGGGGAGATTTCAAGCCCTATCATGGGAAGTTATCTTGCACTCGTTTGACATGCAGATAAGCAGTTGTGAATGCAATTTTGATGCTAAAAGCGTTGATGATCACAGTGTTTGGGCATTTGAAAGTACATTTGTGAATAAAAGATATTTCATCTCTGTAAATCCATGTTCATCTGAGTTTCCAAGTTCCACTGATCTGGTTACTAGTTTTTCTGTGGTTGATGCAGGCACTCTGAGTCATAGACAACCTGAGTTTGACTTTGCGAGTGATCTTTGTAGTAGTTATCTTGCATATACTTTGGCCACTGGCTGCTCTGATGGTAGCTTGAAACTTTGGAGAAGTAACCCTGGCAACCGATCGAACCTGCACTTGCCATGGGAGCTCGTGGGTAGCTTTGTTGCACATGATGGTCCCATCAATGGTATATGTTTTACTGATTGTGGTCAGAAGATTGCTACATGTTGCAATGGAAGTAATTCAAATACTGTCAATACCATCCACATATGGGATGCTGTACATCTGATCAGTGCAGGGACTTTTATTTTGGAAGATAAACTAACGGTTGAAAGTGATGTAATTGCTCTAAATTGGTTGACTTTAGGGACCGGTCAGTTATTGCTTGGAGTTTGCTTGAAAAATGAATTTCAAGTATATGCTCCAAGGCGCTATGACGGTCTGACTTTGTCAGACCCTGTAAAATTTCCAAAAGTGAATATATGGATCCGCATTGCATTTGCTCACACTTCCCTTCCAATTTATGATTTCTCTTGGGGTCCGAGAGCTTCAGCGGTGGTAATTCATGGAAATTACTTTAGTATATTTAGTCATTGGTTGCTCCGTGTGGATAACAAGCAAGGGCATATGGGTGAAATATATGAAGACAGACTTTCTGCAGTTTTTACTGATTGTGACATTGGTGCTTTCAGAGAACTGTCAAATGGAAACAATCATGAGGATAATGACTCCATGCGGTCCATCAAAATTAATATGAAGGACAATAACCTATCAAGCAGCTTGTTTCTGTCCGAGGAACAATTAAAATCTGAACCCCTTTCCAACAATGGTTTATGGAGTATCTTAGAAGTAGCTGAGACAATTAGTGGATCTTTGCCTACTTATCACCCTAATGTTCTCCTTACTAATATAAGTTCAGGCAACTGGAAGCGTGCTTTTGTAGCTGTGAGGCATCTTGTTGAATGCCTGACTTCTAATGATGATCCTAAAAAGAGATACATAGCTACAAGGACTGGTCTTCCAGATATCGCATTACCATATTATTTAGAAGGACTTATATCAAAAAGTTCAAAAGATAAAGGATTCCAGTGGGGTGGGGATTATGCTTCAGTCATGTCAATTTCACAAGCTCAAAGTAGCTCAAATTGTTTTCCACTTCATTCAGGTTCCACTGCTGAAAATAAAAGCACCACCTCAACAAAATATGAGCTTAATGGCTTTATTGAATCTCTTGAGAATTTTCCCGAGTTATCACATTTAATCAGCATAGAAAAGTCAGGAATTCTTGCAATCATTGATCTGCTCTGTGAAGTTAGTAGTCCACACTCGTCCTCACCATATCAAAGTCTTGATGAACCTGGGCGAAGGTTTTGGGTTGCCCTGAGGTATAAGCAACTGCTTTTTCACAGAAAGTTCGCTAGAGCTGCATCTTTTGAAGAGTTACTTGTTAACTCGAGGTTGTTTGTATGGGCTTACCACACTGATTGCCTAGAAGATTTATTTGGTTCTGTCATACCCAGTGAACCATCTTGGCAAGAAATGCGTGCATTGGGTGTGGGCTATTGGTATACTAGTGTACCTCAGCTACGTGCAAGGATGGAGAAATTGGCAAGAGCACAGTATTTGAAGAACAAAAGTCCTAGGGATTGTGCGCTGCTGTATATAGCTCTGAATAGAGTTCAAGTTTTGGCTGGCCTTTTTAAAATCAGTAAGGATGAGAAGGACAAGCCTTTAGTGGGCTTTCTTTCGCGCAATTTTCAGGATGAAAGAAACAAAGCTGCTGCTTTAAAAAATGCTTATGTATTGTTGGGAAAGCATCAGGTGGAATTAGCAATTGCTTTTTTTTTGCTTGGAGGTGATCATTCTTCTGCTATCAACATTTGTGCTAAGAACCTTGGAGATGAACAACTTGCACTAGTTATTTGTCGTCTTGTTGAAGGCTGTGGTGGACCATTGGAGCATCAGCTAATAACAAAGTATATACTTCCGTCTGCAATTGATAAGGGGGACTACTGGCTTGCTAGCCTTTTGGAGTGGGAAATAGGTAATTACTATCAATCTTTTCATAGAATGCTGGAGTTTTCAGTAAACCATGCCGCTCAGGAGTCCATTGTCATGTCCAGTTGTGGTCCTTTTCTAGACCCTAGTGTTGGTGTTTATTGCCAAATGCTAGCAACAAAGAATAGCATGAGGAATGCGGTAGGGGAGCAAAATTCTGCTATCCTTTTAAGGTGGGCAACTCTGATGACAGTTACTGCCCTAAAAAGATGCGGTAATCCTCTTGAGGCATTGGAGTATTTCTCATCTTCACTGAGCATGCTTGGGACTGCAGATCAAGGAAGTGAATTGGGTGATGAACATGATGTACTGCCTAGTACTTTAAAGCCTTTTCCAAGAAAATCCTCTAACTGGTTGTCTGCTGATGTCTCTGCGCATCTGGAGTTCCATATTAAATTGAATTTGGCACTTCAGTACTTAACAAAATTGATAAGAGAGCATCCAAGTTGGCCTGGAACTTTAGCCGAATCTAATGTTGAAGCTTATTATTCTGATGAGTACGTGATGCAACATGAGAAATCAGTTGAAAGTTTTAAACAAAGGTTATATGCAGGGCTTGCTCTATTTGAACAGAGGTTTTTATTGTCTCCATTCTGTCTAATCAGCATGACTTCACTCTTACTTAGCCATCATGGATTATTGTACATTGGATATGATATGGCAGATGGATGCACTCCAGGAGAAATATCTCAAAGGAGCAACATAATTGATGCTTTCAAATTATGTCATTCTCGGGTTAAACCTGTCTTTAAGACTGTAGAAGCAATCTCCGTTTTGTATTCAAGATTTTTTGTTGCCTGCAGTATGGAATATTCTCAACAGAGTTTGACTTTTATTGAGAAAGGTGCAACAAGTGAGTGTGGATCTAAGTTTTTGGATGCCTCACAGTGTCAATTTGAAGGCCATCTGATTTCATTTTGGTATTTAAGATCCATTTTGAGGATCCAGTTGGACTCTATCAGCAAAGATTTAGTCGCAAAACAGCTTTATTATATCCTTGATTTATTTGAGTACTACTTACATTTTTCATTAGCTTGGCTTGAGAGGAACTCTGAAGCTCTTTTGTTTATGATGGGGCCTTTCTTGGTTCATTCTAATGGGCGTAATCCTTATGAGGCTGATATGGTGAACCTGAAGAAGATTATCCCTAAAATTGCTGAGATGTTGACTCAAAATTCTTTCCTAAGTAATATACAAAACCTTCAAGTATCCAAATGTGCAGCAGAAGATAAACAGGCTGCAGACATAAAGCATTCGATTCCTGATGATGAAAGATGGAGGATTCTAGGAACCTGCTTGTTTCAGCATATGTCTAAATTCATGATATCTAATTTGAACTTGGTTCTTGATCAACTGGAAAATGGAAATGTGTCTGGCTCTTTACACAGAGATTATGTTAATAGGGAATATACTGTGATGAGTATAGATTCTGATAACATCAGCTTGCCAAAGCAGATTCGATTAGTCTCACTTAGCTTATGTGATTTACTGATGACAACAGTTAATCACATTTCTTCTTATCATGTTAAACAACTTGCAGATCTTCTGTGGCAGAAATGTGAGAATAATTTGAATGTAGTGACTTTTGAATGGTTAAAACAACCAAGTCAGTCCGAATCCAATCACAGCCAAGACCTGGACATTTTGGAACTGGTGAACAGGAAAGATAAACATTTAGTTCACCAGTTGTTATGGGATCATTGTACTGATTCAAAATTGATATCTGACTGCTTTGCACAGGAAAAACTCAATTGGTCTAGTGATTTGGATCATAGGCCTACTAAAGGCTGGAATGACATGTATATAATCATGTCAGGGCTGCATAAAACTGATGATGATACACATGATAATGGATGTAAACTGAGCAATAAATCTTCTACTCATGAAGTTGGATCTCCTGTTAAAGGAAAGTTTCCAAGTGACCATGCTTACACAAGATCTAACCAGAAAGATGCAATTTGTACGGATAGTGGAGTTTTCCAGAATCCCAAAGAACTGTGCAAGAGAAACGGGGAACTTTTGGAGGCATTGTGTATAAACTCTACTGATCAACGGGAAGCTGCACTTGCTACCAACAAGAAGGGTATAATATTCTTTCATCTGGAAGATGGGATTCCGTATACTGGTGAATCAGACGTTTTGTGGGCTAAGGCTGATTGGCCCCAAAACGGGTGGGCAGGTTCAGAATCCACCCCGGCTCCAACATGTGTGTCTCCTGGTGTTGGCCTTGGGAGCAAGAAAGGGGTTCACCTTGGGCTGGGTGGAGCAACTGTTGGTGTCAATTCTTCGGCTTGGCCCAGCAGAGACTTGATTGCTGGTGGAGGCTTTGGAATTCTAGGTTATGCAGGTAATGGTGCCTCTGGATTAGGTTGGGAAGTTCAACAGGACTTTGAAGACTTTGTTGATCCACCTGCTACTTTGGAGAACATAAGTTCTAAGGCTTTGTCCAGTCATCCAATGAGGCCTTTCTTCTTGGTTGGTTCAAGCAATACACACATTTACTTGTGGGAGTTCAATAAGGATAAAGCTACTGCTACATATGGAGTCTTGCCTGCTGCCAATGTTCCTCCACCTTATGCTCTTGCGTCAATATCAGCTTTACAGTTTGATCACTTTGGACACCGTTTTGCTAGTGCTGCATTGGATGGTACTGTCTGCACATGGCAACTGGAGGTGGGAGGAAGGAGCAATGTTCGTCCAACGGAATCATCCCTCTGCTTTAATGGTCATGCATCGGATGTCACATACTTTTCTTCAAGTGGGTCTATAATAGCTGTGGCTGGATATAGCTCTAATGCTGTTAATGTGGTCATATGGGACACTTTAGCTCCACCTACAACTTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTGGTGCACGATCCCTATCTGTACTTGATAATCATGTAGGAAGTGGTTCTGTTTCTCCCCTTATTGTGACTGGTGGTAAAGGGGGTGATGTTGGAGTTCATGACTTCCGTTATATAGCTACTGGAAAGGGTAAAAGGCACAGGCACACTGATAACATTGGGCAAAGCTCTGTCACGTCCTTGACACATGACAGGGACCATAATGTAGATGGGATGCTTTGGTATATTCCCAAGGCTCACTCAGGGAGTGTTACAAAAGTAGTTACCATCCCAAATACCAGCTTGTTTTTAACTGGAGGCACAGATGGAGATGTTAAACTCTGGGATGCTCAGAGCACAAAGTTAATACATCAGTGGTCAAAGATACATGAAAGGCACACCTTTCTACAACCAAGCTCTCGTGGGTTTGGTGGTGGTGTTGTGCGGGCTGCTGTCACAGACATACAAGTTGTTCCCCATGGTTTTCTTACATGTGGTGGGGATGGAACTGTAAAGCTGGTACGGCTGAACAATCAGTCACCTGCATGGCCATGGATTTAA 7617 0.4105 MIETFPSSFSSSSTIKLNPIHHFPLHLHRSDVVSPAPTFSQSTIDFLPYFSGYTWIAYGASSILVITHFPSPLSASQTRIGPIFRQPFQLSSPVTAVSWSPSTPSSGDLAASAQNCIHIFRHQSSTSRGSFCWRQNAVLVQKTKVEAIRWTESGDGIVSGGMEVLFWKKSNQSWEIAWKFKADQPQTLVCATWSIEGPSATAAQPSKGNIEGSSINEVSNCVLVCQSNGLSEYSKVKLCHPLPVTMIQWRPSRGRISNRYERNRTRHVLLTCCVDGTARLWSEIDSGKSKRMGKDMNDQKNTGRTFCVIAVIEINQALKGTIGSDIFVTWGTEIRGIFKTGEEAKQVFFKEEFEHDIRKCDWLVGFGPGMLLSFWSVHCLDDISPMRFPRVTLWRKHELQDNDIGDVYKFNSSDFKNALLLHKFIMLRNCLSGPPVICSPLQLLPCNSLVWSFFRVQAIHDHVENSHGKDTDNISTHLTGGVLNLDGHSGKILKVSVHPYICEVQFAASLDSNGLVLFWSLSNISNCILGHPTLVPSWELCGKLATQVSCSRYTSLRWAPSVLDDKLIFFMGHARGIDCFIVDICRVEEENIECHYLCTIPFSGHGPYEDGPSDIFAISLNSTCNKTFLNNKLMLLAIWKGRFQALSWEVILHSFDMQISSCECNFDAKSVDDHSVWAFESTFVNKRYFISVNPCSSEFPSSTDLVTSFSVVDAGTLSHRQPEFDFASDLCSSYLAYTLATGCSDGSLKLWRSNPGNRSNLHLPWELVGSFVAHDGPINGICFTDCGQKIATCCNGSNSNTVNTIHIWDAVHLISAGTFILEDKLTVESDVIALNWLTLGTGQLLLGVCLKNEFQVYAPRRYDGLTLSDPVKFPKVNIWIRIAFAHTSLPIYDFSWGPRASAVVIHGNYFSIFSHWLLRVDNKQGHMGEIYEDRLSAVFTDCDIGAFRELSNGNNHEDNDSMRSIKINMKDNNLSSSLFLSEEQLKSEPLSNNGLWSILEVAETISGSLPTYHPNVLLTNISSGNWKRAFVAVRHLVECLTSNDDPKKRYIATRTGLPDIALPYYLEGLISKSSKDKGFQWGGDYASVMSISQAQSSSNCFPLHSGSTAENKSTTSTKYELNGFIESLENFPELSHLISIEKSGILAIIDLLCEVSSPHSSSPYQSLDEPGRRFWVALRYKQLLFHRKFARAASFEELLVNSRLFVWAYHTDCLEDLFGSVIPSEPSWQEMRALGVGYWYTSVPQLRARMEKLARAQYLKNKSPRDCALLYIALNRVQVLAGLFKISKDEKDKPLVGFLSRNFQDERNKAAALKNAYVLLGKHQVELAIAFFLLGGDHSSAINICAKNLGDEQLALVICRLVEGCGGPLEHQLITKYILPSAIDKGDYWLASLLEWEIGNYYQSFHRMLEFSVNHAAQESIVMSSCGPFLDPSVGVYCQMLATKNSMRNAVGEQNSAILLRWATLMTVTALKRCGNPLEALEYFSSSLSMLGTADQGSELGDEHDVLPSTLKPFPRKSSNWLSADVSAHLEFHIKLNLALQYLTKLIREHPSWPGTLAESNVEAYYSDEYVMQHEKSVESFKQRLYAGLALFEQRFLLSPFCLISMTSLLLSHHGLLYIGYDMADGCTPGEISQRSNIIDAFKLCHSRVKPVFKTVEAISVLYSRFFVACSMEYSQQSLTFIEKGATSECGSKFLDASQCQFEGHLISFWYLRSILRIQLDSISKDLVAKQLYYILDLFEYYLHFSLAWLERNSEALLFMMGPFLVHSNGRNPYEADMVNLKKIIPKIAEMLTQNSFLSNIQNLQVSKCAAEDKQAADIKHSIPDDERWRILGTCLFQHMSKFMISNLNLVLDQLENGNVSGSLHRDYVNREYTVMSIDSDNISLPKQIRLVSLSLCDLLMTTVNHISSYHVKQLADLLWQKCENNLNVVTFEWLKQPSQSESNHSQDLDILELVNRKDKHLVHQLLWDHCTDSKLISDCFAQEKLNWSSDLDHRPTKGWNDMYIIMSGLHKTDDDTHDNGCKLSNKSSTHEVGSPVKGKFPSDHAYTRSNQKDAICTDSGVFQNPKELCKRNGELLEALCINSTDQREAALATNKKGIIFFHLEDGIPYTGESDVLWAKADWPQNGWAGSESTPAPTCVSPGVGLGSKKGVHLGLGGATVGVNSSAWPSRDLIAGGGFGILGYAGNGASGLGWEVQQDFEDFVDPPATLENISSKALSSHPMRPFFLVGSSNTHIYLWEFNKDKATATYGVLPAANVPPPYALASISALQFDHFGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNVRPTESSLCFNGHASDVTYFSSSGSIIAVAGYSSNAVNVVIWDTLAPPTTSRASILCHEGGARSLSVLDNHVGSGSVSPLIVTGGKGGDVGVHDFRYIATGKGKRHRHTDNIGQSSVTSLTHDRDHNVDGMLWYIPKAHSGSVTKVVTIPNTSLFLTGGTDGDVKLWDAQSTKLIHQWSKIHERHTFLQPSSRGFGGGVVRAAVTDIQVVPHGFLTCGGDGTVKLVRLNNQSPAWPWI 2538
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal6g0630 2538 Pfam WD domain, G-beta repeat 2436 2468 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 28 2528 - -
Lal6g0630 2538 Gene3D - 85 315 IPR015943 GO:0005515
Lal6g0630 2538 PANTHER RABCONNECTIN-3A 28 2528 - -
Lal6g0630 2538 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2436 2471 - -
Lal6g0630 2538 Gene3D - 2431 2535 IPR015943 GO:0005515
Lal6g0630 2538 Pfam RAVE protein 1 C terminal 801 1411 IPR022033 -
Lal6g0630 2538 Gene3D - 695 908 IPR015943 GO:0005515
Lal6g0630 2538 Gene3D - 2203 2430 IPR015943 GO:0005515
Lal6g0630 2538 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2436 2477 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 81 121 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 692 752 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 2429 2468 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 2257 2292 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 2348 2394 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 478 520 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 2303 2343 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 2480 2527 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 764 809 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 2203 2240 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SMART WD40_4 230 282 IPR001680 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 90 814 IPR036322 GO:0005515
Lal6g0630 2538 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 2217 2533 IPR036322 GO:0005515
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal6g0630 K24155 - gmx:100789935 3915.15
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lal6g0630 6 4083562 4100403 Lal6g0630 6 4083562 4100403 ECH