Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal1g0109 ATGACTGATACTGAAGCAAATTCGAAAATGCAAAGCGAGAAGAAGACTAAAAAACGAAACCAGAAATTCGACGCCAAGCCCCAAAAACATTCCAAACTTCAAAGAGTCGATTCTTCTTCTTCTTCAATCAAACTTCAAGACCTAGAATCTCCATGGAAGAATCTTCAATTGATACGCATCATCCAAGACAAACGCTTTGATCCTCAGAGTAAGGTCATTTCAGCTTTCAGTTTTGTGCATTCGACATTGCATGAGGATAGTGATCAGAGCTCTGAAACTGTTAAACTACCTAGACTACTGTGTTTCCTCAATGATTGGATCCAGTCACTGTTGTTCCCGCCAAAAAATGCCAACATACCCCAGCTTGAGGGAATCCATGCGTATATGGATCTTCGATGTTGGGATATATTCAACTTCTGTTTGCAGGAATCCTTGAAGTTTCGTGTAACTTTGAGCATGTCGCAGAATCTCTTAAAACCTTTCCAATTGATTGCTAAAAATGCTTTTTCACTATTAGATGATTCGTCTATAGGTTCAGGGGGATTTTCTCTATCTGATGAAAGGTATAAACTTTATGACACTGCACTTGATTGTCTTTCATTGGTATTCTCATCCCATGGTGGGGTATCTAATGAAGATTTGATGTCATGGATTGACACAGCAAAGCCAGGGCTTGAACTTGTATTGAAGATTTATAGCATGAAACTTGATGGCAGCAATTTGGGTACTTTTGCACTACGCTTTCTGTGGTTGGTGCTTCAGCCATTCTCAAATTTTTTAAATGTGCATCCAGCTAGGAAAGGTAGTGCGTTTCGTGACTTTGTGCATGAACTTTTGGAGCCACTCTTGCATTTGTCGGGTGAGTTGACTCTTCGGGTTAATGGAAGTAATTCCATTTTGACGGGGAGGTTGATGAAGGTGGTGGAGGAAGTTCTTTCTCACGGACTGTTTCATCCGGTGCTTATTGGTGAATTTCTAAGTTTGCATGGTTCAGAAAAATATGTTGCTTCATGTGATAATAAACCAAATGAATCAAAAGCAACTATTCAGAGTTATCCTAAACATTTATTTGATGTACTGAACAAAATAATAGCCATAAAGAATGCTACGGCAATGGCTAGCATGGGTTTGTTATTTCACTTGTTTGTTAATTCAGCTAGAATGTTCAAGGGAACTTCAGTGGTGTATGTAGAGAACAAGACAATGGAAAATATGAACAGTGCAAGGCAGCCGGTGCCAGGAGAAAATAGTAGCTCAAATAATATTTCTACGGACATCCAAAAGTCACTCCTTAATATTTTTGTACTGATGATGGAGCCTCTTTTGCTCAAGATTAATGCCTATCTCCAACCTAAAGTAGATGCCAAACACCAATTGCTGGATCTTTGTGGGATACTCAAATCAATCGGTGGTTTGCTTTCTAGTTTTATGCAAGAGAAGGTGTATTTGAGAACAGAGGACACATCTGGAGGAGCTTGTCTCAATTTCTTGAAGAAAGTATTTAATGCACTGATAACTAGTTCCACTAGTGTACTCTGCTTGTCCAACTATGATATATCTAACGGGACGGAGATGGAAATATTTATATTATCAACTAATGAAATACTAGTTGGTATGGGACATCTTTTGGAAATTGAATATGAGGTTATTGGAGAAGATTTGGTCAAGTTATGGCTGATTATATTGTCATACTCTGCCATCAACTGTGATTCGGTGAATGGCTCTGATCAATGCTCATTATCTTCCACTATACCGGCCCTGGGGTGCCAAATAATTAATCTCTATGGTCAACTTCGTCAGGTGAAAATTGCTATTTTGGCATTGTGCAAAGCAATAAGGCTTATTGTGTCTCATGAGGGCAATTCTGAAGATGGTTCTTCCAGGCTATTGACATTTCTGTCTAGTGAAGTTTATTCTGAATCAGTTGAAAGGCTGTTATCTTCACAGAAGTTCATCTATGTCATTTATAAGGCCATTGAATCTATTCCAGAAGGGCAAGTGAGTGATTGTATTAGACAGATGACAGATGATATATCAGAATCTGTTAGGTGGATGAAAGACTTCTCCCCTTTGGTTGATGGCAAAAAAATTAGAAAATTTAATCTGCAAATGGAACTCCTGGGTAGAGGGCTGTGTAGACTATATTGTTTAGTGCTTGATTCAGTCACTATCACCGAAGGCAACAGCAATCTTCTTGGAGTTGCTGTAAAAGATCTAATGACATTTATGCGTCCCTACTTGAGTACTCTAGTTGGACAACAGGCAGATAGTCTCTACAAGTTCCTTTCTTCTGTCATGGGTGAAACTGATGATATGGATGTTGGAAAGAGAAAAGTTTTGAAGAAATTTGGCAGGTCTAGTCAATGGGTTGTTGTCTTCTTTTTTCAGTTGTTTATGTCCTGCCGAAGCTTACTTAGGCAAGCAATCAGTCTTATGCCTCCAGGTTTATCTAAGAAAGTGTCTGCGGAGGTGGGGGATTACACAACATATTCTGCCTTTGAGTTAATGGAGACGATTGATGACATTGACATTGTCTATTTTTCTTGGGTTGTTCAACCTTCTGTTTCCCTTCTTGTTGTTATGCAATTTATTTCAGACTTATATCTTAAGTATGACTCGGATGATTGTTGTCCTTTGATCTATATATTTCAATCTATGGTTCTTCAGAGGCTTGTTGACTTGAATAAGCAGATTGTGTGCTTCAAGTATTTTCAAAAAAAGCGTTATAGATCACGCATCAAAGCACTGAAGGAAGAGGCGGCCGGACTTACTAATTTTATGATGGATAACTTAGCATGTTTATATGAATCCCCAATCTTTGTTTCTGATGATGTATTTTGTGAAGATGTAACTTCGCTGGCTCCTCAAACCAATGGATGGAATGAAGGTGTTTATGTTGCAAACAAAAAATCATTGCCAACAGCCATTTGGTCAATTCTTTGCAAAAATTTTGATATTTGGGGAAATCATGCTTCCAAGAAGCAGTTGAAGAAATTCTTCTCTCAATTGCTTCATACTTCCCTTTGCCGTGCAACAAGAAATTCTCAACAACTAGGTGTGCGAGAAATCGATGAGTGCAAGCTGCTCAAGAGAGTCAGTTTGCCACAAATGTTGTCACAACTTCTAAGTGATTCAGTTCTGTATGAACAAAAATTTGCTCACAGGAATCTGGCCTCAATATTTTGCGGTGCTTTAGAGAAATCTGTATTTCCATTATTCAGCAATATTGCGTGTAATGATCTCAATCTTCAGTCATCACCTGATTGGCCCATATTTTTTAGCGTCATTGACAAGTCAGCAGATATCAGTAGAAAAGAAAAGCCATACGCTCTTACAGACAAAAGTTTTACCGTTGCCCACTGTTTGCTTAATCTATTATGTTGGACACCAGATATAAATACCAAATCTTTTTCACATCATGTGACTTGTATTTTCAACCTTGAACGGCTTCTTGTCAGTGCCTTACTATGTTTCCAGAGCACAGGATACCAGGATTCTTGTTGTGAGTATTTGAGATTATTTGTCTCTTGCCGGAAGGCCTTAAGATATATAATAATGGGATATTGTGAGAAGACAGATGCGATGCAATCCTCACCAAACTCAATAATTTCTGAAAGTTCATTTCCTGCTTTATGGATTTCAAAGTCTATATCTGTGACTGTTGGGATTAAAGAAACATTCTCAACAGAAAATTCTATTATGTTCAAATCTCTGATGTTTGCCTTAATGGACCATACATCATATGTCTTACTGGGGATAGGAAAATATCAACTTATTCATGTATTTTCCATTAGTAAAGAAGGTGAGGAACCTTGTGAAGAGAGCTCCAATTATACAATTAGCCATGAAGAGAATCATTTGCTTCCATCTCCTCAGTACGTAGATTCCTGCAAGATTGAGGCATTGAAATGTTTAACCTTTATGGCGGAGAATTTGAAGGAGCAGATGCAAGGCTTGCTTGTTTCTCTAAAGGATGTCCATTCTTTTGTCAATGTGGGATCTGATCTACCTTCTGAAAGCATTAATGGACTGTCTTCTGCAGTTTCTTGCTTAAGTGGATTTTTGTGGGGCCTCACATCTGTCAAAGGCCAAACAGATGCAGAAGGTAGTGATCATAAAGAAGTGTTGATTTGGAAAAATGAACAAGCCTCTGAAGTAAATAGTTATATTTTTCCTCTTATGGAGCTTGTTGATTTTGTTGTAAACAAATTACTTGTCAAGAGCAATCAACTCTCAAGTGATAATGTATCCAAAAGTGCCATTGATCTTGAAAGAATGTCTAACATAGAAAGTAAGAACTCTATTGCCAGTGTTTTGGCTAGTGCTGATTCCCCAGAGCATCAGGATCTGAATAAGCCTTTGTTGAGAAGCTTGCTAAAAGGTGATCATCCTGAAGTGGCTTTCTTGCTTAGGCAATTATTAGTTGCTTCCTCAGCTCTTTTAAGGCTAAATTTGCAGAAAGATGAATCTTCCTTGCTTTCAAGTTTTGTACCTACTTTAATTGAAATTTCTCAAGTCTTATTACTACAATTCACAGAGATGGTTGACGTCCCACAACAATCAGTTTTTCTTTTGTTAGATGGTGTTCTGAGCTATCTAAGAGAGTTAGCTAGTTATTTTCCTTTAACTGATCCTACCTCATCTATGAAAGTGTATGCAAAATTGGTACAGATTCACATGAGGGCAATAGGCAAGACCATACTATTACAAGGAAAAAGGGCAACACTGACCTTTCATGAAAGACAGTCAAGTACCAAAACACTTCATAAGGGATCATTTGAAGCTAACTCTTCTAGCAAATTGTACTGCTTTTACTTGGATGAATTTAAAACTAGGCTGCGGATGTCATTCAAAGCGTATATAGAGAGGCCATCAGAGTTGCATATCTTGTCTACCATACATGCTATCGAGAGAGCCCTAGTGGGAGTAAAAGAAGGATGTACTATGATCTATGACATAGAAACGAGTAAAGATGGTGGTGAAATTTCATCCCTTGTTGCAGCTGGCATTGATTGCTTTGACATGATTCTTGAATTTGTCTCAGGTTGGAAAGGCCTGAAGCTGATTAAAAGACACTGTCAGAGTTCAGTATCTTCTCTTTTCAACATTATTATGCATTTAAAGAACCCACTTATTTTTTATGGGAACAAGACTTCTGGAGCAGTTGCCAGTAATCCAGATCCTGGGTCAACCATTCTTATGTGTGTTGAAGTACTAGTTACAGTTTCAAGGAAACATGCTCTGTTTCCAATGGATGTCTGGCATGTAGGTTACTTGTTACATGTCCCTGAAGTAATCTTTCAGAATTTCCACCAGCTTAAAATTTCTAAAGATTCTGATCTATCAAGTATGTTGACAATTTCGGAAGAGAAAATTTCTAATCCAGTAGAGGCAGTGAACTTATGTCATGTAGATCATCGCTTCTCAATTGACCTATTTGTTGCATGTTGTCAACTATTGTGTACCACTATTAGACATCGCCCAAGTGAGTGTAAGCAGTGTGTAGCCCATCTTCAAGCTTCCGTTGCTGTTCTACTTAATTGCTTGGAGACATTGGTGGATAATGAATTAACAGGGAATAAAGGTTGCTTTTCATGGGAAGTAAAAGAGGGTGTTAAATGTGCTTCTTTTCTCAGAAGAATTTATGAAGAGATAAAACAGCAAAAGGTTATATTTGGCCGGCAATGTTCTCTGTTTTTATGTAACTACATATGGGTTTATTCAGGACATGGTCCCAAAAGAAGTGGTATCACAAGAGAAATAGATGAAGCTCTAAGACCAGGTGTCTATGCTTTAATAGATGCTTGCTCAGTGGATGATCTTCAATATCTTCATACTGTTTTTGGAGAGGGACCTTGCAGAAATACCCTAGCAAGTCTTCAACATGATTACAAACTCAATTTCAAGTATGAAGGAAAAGTGTGA 5925 0.3801 MTDTEANSKMQSEKKTKKRNQKFDAKPQKHSKLQRVDSSSSSIKLQDLESPWKNLQLIRIIQDKRFDPQSKVISAFSFVHSTLHEDSDQSSETVKLPRLLCFLNDWIQSLLFPPKNANIPQLEGIHAYMDLRCWDIFNFCLQESLKFRVTLSMSQNLLKPFQLIAKNAFSLLDDSSIGSGGFSLSDERYKLYDTALDCLSLVFSSHGGVSNEDLMSWIDTAKPGLELVLKIYSMKLDGSNLGTFALRFLWLVLQPFSNFLNVHPARKGSAFRDFVHELLEPLLHLSGELTLRVNGSNSILTGRLMKVVEEVLSHGLFHPVLIGEFLSLHGSEKYVASCDNKPNESKATIQSYPKHLFDVLNKIIAIKNATAMASMGLLFHLFVNSARMFKGTSVVYVENKTMENMNSARQPVPGENSSSNNISTDIQKSLLNIFVLMMEPLLLKINAYLQPKVDAKHQLLDLCGILKSIGGLLSSFMQEKVYLRTEDTSGGACLNFLKKVFNALITSSTSVLCLSNYDISNGTEMEIFILSTNEILVGMGHLLEIEYEVIGEDLVKLWLIILSYSAINCDSVNGSDQCSLSSTIPALGCQIINLYGQLRQVKIAILALCKAIRLIVSHEGNSEDGSSRLLTFLSSEVYSESVERLLSSQKFIYVIYKAIESIPEGQVSDCIRQMTDDISESVRWMKDFSPLVDGKKIRKFNLQMELLGRGLCRLYCLVLDSVTITEGNSNLLGVAVKDLMTFMRPYLSTLVGQQADSLYKFLSSVMGETDDMDVGKRKVLKKFGRSSQWVVVFFFQLFMSCRSLLRQAISLMPPGLSKKVSAEVGDYTTYSAFELMETIDDIDIVYFSWVVQPSVSLLVVMQFISDLYLKYDSDDCCPLIYIFQSMVLQRLVDLNKQIVCFKYFQKKRYRSRIKALKEEAAGLTNFMMDNLACLYESPIFVSDDVFCEDVTSLAPQTNGWNEGVYVANKKSLPTAIWSILCKNFDIWGNHASKKQLKKFFSQLLHTSLCRATRNSQQLGVREIDECKLLKRVSLPQMLSQLLSDSVLYEQKFAHRNLASIFCGALEKSVFPLFSNIACNDLNLQSSPDWPIFFSVIDKSADISRKEKPYALTDKSFTVAHCLLNLLCWTPDINTKSFSHHVTCIFNLERLLVSALLCFQSTGYQDSCCEYLRLFVSCRKALRYIIMGYCEKTDAMQSSPNSIISESSFPALWISKSISVTVGIKETFSTENSIMFKSLMFALMDHTSYVLLGIGKYQLIHVFSISKEGEEPCEESSNYTISHEENHLLPSPQYVDSCKIEALKCLTFMAENLKEQMQGLLVSLKDVHSFVNVGSDLPSESINGLSSAVSCLSGFLWGLTSVKGQTDAEGSDHKEVLIWKNEQASEVNSYIFPLMELVDFVVNKLLVKSNQLSSDNVSKSAIDLERMSNIESKNSIASVLASADSPEHQDLNKPLLRSLLKGDHPEVAFLLRQLLVASSALLRLNLQKDESSLLSSFVPTLIEISQVLLLQFTEMVDVPQQSVFLLLDGVLSYLRELASYFPLTDPTSSMKVYAKLVQIHMRAIGKTILLQGKRATLTFHERQSSTKTLHKGSFEANSSSKLYCFYLDEFKTRLRMSFKAYIERPSELHILSTIHAIERALVGVKEGCTMIYDIETSKDGGEISSLVAAGIDCFDMILEFVSGWKGLKLIKRHCQSSVSSLFNIIMHLKNPLIFYGNKTSGAVASNPDPGSTILMCVEVLVTVSRKHALFPMDVWHVGYLLHVPEVIFQNFHQLKISKDSDLSSMLTISEEKISNPVEAVNLCHVDHRFSIDLFVACCQLLCTTIRHRPSECKQCVAHLQASVAVLLNCLETLVDNELTGNKGCFSWEVKEGVKCASFLRRIYEEIKQQKVIFGRQCSLFLCNYIWVYSGHGPKRSGITREIDEALRPGVYALIDACSVDDLQYLHTVFGEGPCRNTLASLQHDYKLNFKYEGKV 1974
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal1g0109 1974 PANTHER UNHEALTHY RIBOSOME BIOGENESIS PROTEIN 2 HOMOLOG 47 1974 - -
Lal1g0109 1974 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 39 - -
Lal1g0109 1974 MobiDBLite consensus disorder prediction 8 33 - -
Lal1g0109 1974 Pfam Urb2/Npa2 family 1734 1973 IPR018849 -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal1g0109 - - lja:Lj3g3v3541690.1 2671.73
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lal1g0109 1 723923 734820 Lal1g0109 1 723923 734820 ECH