Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal17g0586 ATGGGAGAGGTTCCTCTCTACGAAACTCGTCGTCACGCTTCTTCTTCACCTCACCACTCTTCTAATCTCAATTATCCTCAACATCTCATTCCTCTTCAACACCAGCCAAATCAGGCCTCTACAGGTACATTTCTATCATCGCTTTCCATTCCAGGTGTGAGTCAATTGAAGGAGAAATGGAGCGAGTATAATCAGCCGAAGAGACTCAGAAGATTGGTGTCTCTGTTCGTTTCGCACAGCGCTAAACATGTAGCTGTCGCTGCTGGGAATCAGATTACGATTCTTAGTAAAGAGGATGATTATCAAGAACCTTGTGGCGTTTTCACCAATTGCAGTCCGAGTACATTTAGTGTAGGAGCTTGGTCTGAAGATGATGACATTCTCGGAGTTGCTGATGATTCTGATACACTTTATTTTATCAAATTGAATGGTGAAGTAGTAACAAAAATTATGAAGAAGCAGTTGAAATTCTCTTCACTAATCGTTGGCCTATTTTCTGATAATAATTTAGATAGGCAGAAGTCTTACTCGTTCACCATCGTTACATCAGATGGTTCATTTCAACAAATTGAGATCGATTATGGACAAAGTGGCTCTACCTTTCCAAAGTGCATTTCTAATCACAAGAATTCTCTCTGCAACAATATTTTTTACCTTGACTGGCATCACGAACTTAACCTTTTTGTGGCTGTCCACAAAAATTCTGGGTCTTGCCATCTTTCTCTTTGGCATAATAATTCAAGTACAGAGCTGGAACAGTTGTCCTCTTTGCAGCTCGAGGGATTATATTCAAAACCAAAATGTTATAAAGGTCAGCTAACATATCCAAAGGTGCTAATCTCACCACAAGGTACCTTCGTTTCTACTCTGGATTTAACAGGGTGTTTGCATATTTTTAAGCTGGACAAAAAAGGCTTTACACTCTCCCGGTTTGTCTTGGGAGATAGAAATGATTCACTGTTGTCTGATAATTTATCAAATGGAGGGAGAGAATATCTTGTGGATTGTATGGATTTTACGTGGTGGTGTGACCATATCCTTGTCATCGTGGATAGGAATGGTGTTGTTATGTTGATTGACGTCCTTAGTGGTTCAAAACTTCAGGAAGAGGATCCTGCATATTTTTTGCCTGTTTTGGAAAGAGCACGGAATTATAAGGGCTGCCTTTTTCTTTTAGCAAGTCCATCATCCCTTGAAGGGTATAACAATCCTTCAGATTTTGGGACAACAGATGATTTGGATAAAAAAGAGTGGGTAACTGAAGATAGGTTTAATCAATTTCTCTTTTCTAGGTTGCTCTGGTGCCTCATTTCATTTGTTGAGAAATCTATCCCTGAAATGTATGGTATTTTGATTAGCAAGAAAAGATATCAGGCTGCTTCGGACTTTGCTGATAGTCATGGACTGGATAAAGATGAAGTTCTGAAGTCACAGTGGTTGAATTCTAGCCAAGGGATAAATGAAGTAAATATGTTTTTGTCAAATATTAAGGATAGAGATTTTGTACTCTCTGAATGTGTTGATAGAATTGGACCAACAGAAGATGCTGTGAAGGCTTTGCTTGCCTATGGTCTCCTCATCACTGACCATCATAGATTCTCAGAAGTAGATGATGATAATTCCAGTCAAGTATGGGATGTTCGCTTGACCAGGCTTCAAATTTTGCAATTTAGAGACAGGCTGGAAACATATCTCGGAATAAACATGGGAAGGTTTTCTGTGCAGGAATATAGCAAATTTCGTGTTATGCCTATCAATGAAGCTGCTGTAGCACTTGCTGAAAGTGGAAAAATTGGTGCCTTAAACTTGCTATTCAAGCGTCATCCATATTCTTTGTCTCCCTTTATGCTGGACATTTTAGCTGCCGTCCCAGAAACAGTTCCTGTCCAAACTTATGGGCAGCTTCTTCCTGGGAGGTCTCCCCCTTCAGGTGTTGCTGTAAGGCATGATGATTGGGTTGAATGCAAGAAGATGGCTCACTACATTAATGTGTCAGTTAAAAATCGTGACATTCAAATCCAAGCCAAAACTGAACCTCTTGTTAACTATTCTCTTGGATATTTTTGGCCATCAGTGGATGAGCTTTCAAATTGGTATAAAGATAGAGCTAAAGCTATGGATGATTTTAGTGGGCAGCTCGATAATTCCTTCAGTCTTCTTGAGTTTGCTCTTCGAAAAGGTATATCTGAGTTGCAGCAGTTTCATCAGGATGTCTTATACTTGCATCAGATTATTTATTCTGATGCCTATGATGGTGAAATAAGCTTCCATATGAGTCTTTCCAAGTGGGGAGAATTGTCAGACTATGATAAATTTAAATTTATGCTCAAGGGAGTCAAAGAGGAAAATGTAACTGAAAGATTACACAATAGAGCTATTCCATTTATGCGTGAAAAGTTTCACAGGGTATCCTTAGTTGGAGACGTCATGTTTTCTGATTCTGCAAGTCAAAATATGGAGGAATCATTTCTTGTCAGATGGTTGAAGGAAACTGCTTCGGAGAATAAGTTGGACTTATGTTTGGTGGTAATTGAGGAAGGATGCAGAAACTTCCAAAGTGATATCTATTTCATAACTGAGGTTGAAGCTGTTGATTGTGCTTTGCAATGCATATATTTGTCCACAGTGACAGATAGGTGGAATATCATGGCAGCCATTCTATCTAAACTTCCTAAACTACACGATGGTGCAATTGAAATTGAGAACCTAGAGAGAAGACTTAGAGTTTCTGAAGGTCATATTGAAGCAGGAAGGCTTTTGGCATTGTACCAGGTCCCAAAGCCGTTAAACTTTTTCTTAGGGGCTCAATCAGATGAAAAGGGTGTAAAGCAGATGATTCGCCTTATTCTTTCTAAATTTATTCGTCGTCAACCTAGTCGATCAGATAGTGAATGGGCCAGTATGTGGCGTGATATGCAGTACTTGAGAGAAAAGGCATTTCCTTTTCTGGATTTGGAATATATTTTGATTGAATTTTGCAGAGGACTGCTGAAAGCTGGGAAGTTTTCTCTCGCAAGAAACTATTTGAAGGGTACAAGTTCAGTTGCGTTGGCATCAGAGAAGGCAGAAAATCTTGTCATTCAAGCAGCTAGAGAGTACTTTTTCTCAGCTTCAAGTCTTTCTTGTTCTGAAATCTGGAAGGCTAAAGAATGTCTTAATCTATATCCAATTAGTGGAAATGTGAAGAAAGAGGCAGATATTATTGATGCACTTACAGTTAAGCTTCCAAACCTTGGGGTGAATATTTTGCCCATGCAGTTCAGGCAAATAAAAGATCCAATGGAAATTGTAAAAATGGCAATTACAAGTCAAGCTGGAGCATATTTTCATGTTGATGAACTTATTGAGGTTGCAAGACTTCTTGGCTTGAGGTCTGCTGATGACATATCGGCTGTTGAAGAAGCTATTGCTAGAGAAGCTGCAGTTTCTGGTGATTTGCAATTGGCATTTGATCTTTGTCTTGTTTTGACCAGAAAAGGACATGGTTATGTATGGGATTTATGTGCTGCAATTGCAAGAGGTCCTGCCCTTGAAAATATGGATGTGGATTCTAGAAAGCAGCTATTAGGGTTTGCTTTGAGCCACTGTGACGAGGAATCCATTGGTGAGCTCCTCCACGCATGGAAAGACCTAGATATGCAAGGTCAGTGTGAAACATTAATGATGTCAACAGGGACCAATTCTTCAAAGTTTTCAGCACAAGGTTCATCTGTAAACTCAATTCCAGGGCAAAGTATGCAAAACATGCTAGATCGAAATGGCTGCTTTCAAGAATTTCACAGTACTAGCACTGACAATCAGGATGTTCATCTGGAGAAAATTAGAGACATGCTTGCCATTGTTGCTAAAACCTTGTCTGTTGGGGATAAAACAGATTGGGCGGCATGTTTGACTGAAAATGGAAAAGTTCTGTCTTTTGCTGCTTTACAACTCCCTTGGCTGCTTGAATTGAGTAGGAAAGGAGAACATGATATGAAACATAGTACTGGGAATAAATATTTGAACACCAGAACACAGGCTGTGGTGACCATCTTGTCTTGGTTGGCTAGAAATGAATTTGCCCCCAGAGACAATCTTATTGCTTCTCTAGCACAATCAATTATGGAACAACCTGTTACCGAAGAGGGAGATATAATGGGGTGCTCCTATCTTTTGAATCTTGTAGATGCCTTTAGTGGGGTAGAAGTTATAGAAGAACAACTCAAAATAAGAAAAGACTACCATGAAATTTGTAGTATCATGAATGTTGGGTTGGCGTACAGCTTAGCACACAACTCTGGAATAGGGGCTGACCCTGCTCGGAGGAAGGAGCTATTGCAGAAAAGGTTTAAGGAAAAGCATGCGTCATCCAGTTCTGATGAAATTGATAAACTTGGCAAGGTACAGTCTTCATTTTGGAGAGAGTGGAAACTGAAGCTAGAAGAGCAAAAGCGTTTGACTGAGCATTCCAGAGCACTAGAGAAAATAATTCCTGGGGTTGAAACAGAGCGCTTTTTGTCCGGGGACTCCATTTATATTAAGAATGTTGTCGTCTCTCTTATTGAGTCAATAGAGTTTGAGAAAAAGCACATTTTGAAGGACATCTTAAAATTGGCTGATACTTATGACTTGAGCTATACCGAGGTGCTATTGCGGTACTTAGGTGCAGTACTTGTTTCTGATGTTTGGACAAATGATGATATTGAAGTTGAAATTGAAGGTTATAAAGGAGAAATAATTGGTAATAGTGCCAAAACCATTGAAATCATCTCAACAATTGTATACCCTGCAATTGATGGATGCAACAAACTTCGTCTTGCTTATGTGTACGGCCTGTTGTCAGAGTGCTACTTGCAGCTGGAAAATACCAAAGATTTATCACCAATTATACAGTCTGATCATGCAAATACCAATATAAGATTTAGTCACTATTACAAGGTTGTTGAGGAAGAATGCAAAAATGTATCCTTTATTAATAACCTGAACTTCAAAAATATAGCTGGGTTACATGGTTTGAACTTTGAGTGCTTTTGTGATGAAGTTTATGCATGTATTGAGGAGAGTAGCTTGTCAGCTTTGTCAAAAATGGTACAGGCTCTTGGTAACATTTATGGCGATTCATTGCCTGACGGTTTCATGTCATGGCAGGATGTCTACAAGTATTACATCCAGAGTTCGCTGAGAGCTTTGGTGACTAAAGCTTCAATTGATTCTAGTATTAGAACTCCTGAATACATTCAAGGCTTTATAAGCAATCTTGAGCAGAGCTATGGCTTGTGTCGAATGTATATTAGACTCTTGGCTCAGCCTGATGCTTTGGGGATCATGAAGCATTACTTCACTGTAATCATGCCTCTGTACAGTTCATATGGATCTCTACCTGACAATTCAACATGGCAAGACTGCCTCATTATTCTTCTAAATTTCTGGACGAGATTGACAGATGATATGAAAGAAATTGCATTGAAGGAGAATTCAGGGGAAACTATTAGCTTCAATCCAGAATGTTTAATGAGTTGTGTGAAGGTTTTCATGAAATTGGTGATGGAGGATATCATCTCCCCCAGTCAGGGTTGGGGCAGCATATATGGCTTTGTCAATTTCGGTTTATGTGGAGATTCTGCTGTAGAAATTTATAATTTCTGCAAAGCTATGATTTTTTCTGGTTGTGCGTTTGGTGCTGTTGCGGAGGTTTTTTCTGTTGCATCATCAGAAACTGGTTTAGCTTCAGATTGCAGCACGGGTTCCCATAATCTTCCTGATTTCTATTTAGGTATTATGGAGGATGTTCTGCAGGAATTGGTCACTGGATCCCATGAGAACCAAAACTTGTATCATATATTGTCATCATTAAGCAAACTTGAAGGTGATTTAAAAGTTCTGCAATGTGTTAGACAAGTAATTTGGGACAGAATGGTCCAGTTCTCTGACAATTTACAGTTGCCAAGTTCCATCAGAGTTTATGTGCTAGAGCTTATGCAATTTATCTCAGGTAAAAGTATTAAGGGTTTCTCTACAGAAATAGAAGCCAATGTCCAACAATGGGAGGAATGGAATGAGTTGCTTTATGCAAATAGAAAGAGTGAAACTGATGTTGACCAGCAGTTGCCAGATGATCACAAAGACTCTTCTAGTCGGTTTACGAATACTTTGGTTGCTCTAAAATCTTCACAGCTTGCGACATCAATCTCTCCTAGCATAGAAATCACCCCTGATGATCTAGTGAATGCAGACATGGCTGTTTCTTGTTTTTTGAGATTGTGTGGAGAAGCTCGTACAGATCTCCACTTTGATGCTCTTCTAGCCATTTTGGAAGAGTGGGGTGGACTTTTCAATACAAAGAAAGATGGAGAGACCACTGCTAAAGCTTCTGATGGCGAAAATGACTGGAACACTGACGATTGGGATGAGGGGTGGGAAAGTCTTGAGGAAGTAGACAATATTGAGAAAGAAAAGAAAGAAGATGGCTCTGTTTCTGTTCACCCTTTGCATGTGTGTTGGACGGAGATTTTCAGAAAACTAATAAACCAATCAAGATTTAGTGATGTGTTGAAACAAATTGATCAATCATCATTAAAACCTAATGTTTTGTTGCTCGATGAAGATGATGCCCAGAGCTTAAACCAGATAGCACTTGGCATAAATTGCTTTCTGGCTTTGAAGATAATGCTATTGCTGCCGTACAAAACATTACAGTTGCAGTGCCTGGGCGCAGTTGAGGATAACTTGAAACAAGGCATCCCTGAAACAAGGAGCACGGATTATGAGTTGTTAATTCTTATTTTATCTTCTGGGATTATCACTTCTATCATCACTGACTCTACCTTCGGTACTACTTTCTCTTATATCTGCTATTTGATTGGAAACTTTTCCTATCAATGTCAACAAGCTCTGGTATCGGGTACCAGAATTAATAATAGTGAAGATGAAGAAAACCAGTTGCTTCTTTTCAGAAGAATTCTATTCCCCAATTTCTTATCAGAATTTGTGAAGGCTGATCAACATGTTCTAGCTGGATTTCTTGTCACAAAATTTATGCACACTAATGAAGCACTCAGTCTGATTAACATTGCCGAGACTAGTCTTAATAGATATCTGGAAATGCAGCTCCACATGCTACAGGTGAATGAGTTCCCTGTTGACAAGACATGTCAAACATTGAAGAATACTGTTAGCACCTTGAGAGGCAAGTTGAGCAATTTGATCCAATCCACATTGTCCTTGCTCTCTTCTACTCTTAGATGA 7224 0.3927 MGEVPLYETRRHASSSPHHSSNLNYPQHLIPLQHQPNQASTGTFLSSLSIPGVSQLKEKWSEYNQPKRLRRLVSLFVSHSAKHVAVAAGNQITILSKEDDYQEPCGVFTNCSPSTFSVGAWSEDDDILGVADDSDTLYFIKLNGEVVTKIMKKQLKFSSLIVGLFSDNNLDRQKSYSFTIVTSDGSFQQIEIDYGQSGSTFPKCISNHKNSLCNNIFYLDWHHELNLFVAVHKNSGSCHLSLWHNNSSTELEQLSSLQLEGLYSKPKCYKGQLTYPKVLISPQGTFVSTLDLTGCLHIFKLDKKGFTLSRFVLGDRNDSLLSDNLSNGGREYLVDCMDFTWWCDHILVIVDRNGVVMLIDVLSGSKLQEEDPAYFLPVLERARNYKGCLFLLASPSSLEGYNNPSDFGTTDDLDKKEWVTEDRFNQFLFSRLLWCLISFVEKSIPEMYGILISKKRYQAASDFADSHGLDKDEVLKSQWLNSSQGINEVNMFLSNIKDRDFVLSECVDRIGPTEDAVKALLAYGLLITDHHRFSEVDDDNSSQVWDVRLTRLQILQFRDRLETYLGINMGRFSVQEYSKFRVMPINEAAVALAESGKIGALNLLFKRHPYSLSPFMLDILAAVPETVPVQTYGQLLPGRSPPSGVAVRHDDWVECKKMAHYINVSVKNRDIQIQAKTEPLVNYSLGYFWPSVDELSNWYKDRAKAMDDFSGQLDNSFSLLEFALRKGISELQQFHQDVLYLHQIIYSDAYDGEISFHMSLSKWGELSDYDKFKFMLKGVKEENVTERLHNRAIPFMREKFHRVSLVGDVMFSDSASQNMEESFLVRWLKETASENKLDLCLVVIEEGCRNFQSDIYFITEVEAVDCALQCIYLSTVTDRWNIMAAILSKLPKLHDGAIEIENLERRLRVSEGHIEAGRLLALYQVPKPLNFFLGAQSDEKGVKQMIRLILSKFIRRQPSRSDSEWASMWRDMQYLREKAFPFLDLEYILIEFCRGLLKAGKFSLARNYLKGTSSVALASEKAENLVIQAAREYFFSASSLSCSEIWKAKECLNLYPISGNVKKEADIIDALTVKLPNLGVNILPMQFRQIKDPMEIVKMAITSQAGAYFHVDELIEVARLLGLRSADDISAVEEAIAREAAVSGDLQLAFDLCLVLTRKGHGYVWDLCAAIARGPALENMDVDSRKQLLGFALSHCDEESIGELLHAWKDLDMQGQCETLMMSTGTNSSKFSAQGSSVNSIPGQSMQNMLDRNGCFQEFHSTSTDNQDVHLEKIRDMLAIVAKTLSVGDKTDWAACLTENGKVLSFAALQLPWLLELSRKGEHDMKHSTGNKYLNTRTQAVVTILSWLARNEFAPRDNLIASLAQSIMEQPVTEEGDIMGCSYLLNLVDAFSGVEVIEEQLKIRKDYHEICSIMNVGLAYSLAHNSGIGADPARRKELLQKRFKEKHASSSSDEIDKLGKVQSSFWREWKLKLEEQKRLTEHSRALEKIIPGVETERFLSGDSIYIKNVVVSLIESIEFEKKHILKDILKLADTYDLSYTEVLLRYLGAVLVSDVWTNDDIEVEIEGYKGEIIGNSAKTIEIISTIVYPAIDGCNKLRLAYVYGLLSECYLQLENTKDLSPIIQSDHANTNIRFSHYYKVVEEECKNVSFINNLNFKNIAGLHGLNFECFCDEVYACIEESSLSALSKMVQALGNIYGDSLPDGFMSWQDVYKYYIQSSLRALVTKASIDSSIRTPEYIQGFISNLEQSYGLCRMYIRLLAQPDALGIMKHYFTVIMPLYSSYGSLPDNSTWQDCLIILLNFWTRLTDDMKEIALKENSGETISFNPECLMSCVKVFMKLVMEDIISPSQGWGSIYGFVNFGLCGDSAVEIYNFCKAMIFSGCAFGAVAEVFSVASSETGLASDCSTGSHNLPDFYLGIMEDVLQELVTGSHENQNLYHILSSLSKLEGDLKVLQCVRQVIWDRMVQFSDNLQLPSSIRVYVLELMQFISGKSIKGFSTEIEANVQQWEEWNELLYANRKSETDVDQQLPDDHKDSSSRFTNTLVALKSSQLATSISPSIEITPDDLVNADMAVSCFLRLCGEARTDLHFDALLAILEEWGGLFNTKKDGETTAKASDGENDWNTDDWDEGWESLEEVDNIEKEKKEDGSVSVHPLHVCWTEIFRKLINQSRFSDVLKQIDQSSLKPNVLLLDEDDAQSLNQIALGINCFLALKIMLLLPYKTLQLQCLGAVEDNLKQGIPETRSTDYELLILILSSGIITSIITDSTFGTTFSYICYLIGNFSYQCQQALVSGTRINNSEDEENQLLLFRRILFPNFLSEFVKADQHVLAGFLVTKFMHTNEALSLINIAETSLNRYLEMQLHMLQVNEFPVDKTCQTLKNTVSTLRGKLSNLIQSTLSLLSSTLR 2407
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal17g0586 2407 Coils Coil 2406 2407 - -
Lal17g0586 2407 PANTHER NEUROBLASTOMA-AMPLIFIED SEQUENCE 4 2359 - -
Lal17g0586 2407 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 70 368 IPR036322 GO:0005515
Lal17g0586 2407 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 25 - -
Lal17g0586 2407 MobiDBLite consensus disorder prediction 2108 2128 - -
Lal17g0586 2407 Pfam Secretory pathway protein Sec39 935 1211 IPR013244 GO:0006890
Lal17g0586 2407 Pfam Secretory pathway protein Sec39 589 879 IPR013244 GO:0006890
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal17g0586 K20473 - gmx:100818814 3808.84
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lal17g0586 17 4188127 4203489 Lal17g0586 17 4188127 4203489 ECH