Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Gso17g1730 ATGAGTCTGAAAAACCACACCTTGTTTTTCTGGACAAGTCTGCATGGTTCTTTGGAAAGCGGCACCACCGGCAAGAGGAACCCTTTTCGTTTGGACAAGAGGAAGTTGTTGCTGCAGAAGAATGGTCTCTGCAGTTGCACGTGCTGCGTCTCCCCAAAACGGTGTCGTTTGGTAAGCCAAGCGTTACGGTTTTCATCTTTTTCGGGGCAAAAAAACGTGGGGTTATTGGGAAAAGACGTGATTTTGAGAAGTGAGTCGAGGTTAGAATGTGCCAGGGAACCTTATTTTAGGGGTGAGTCATTGGTTAGTTATTTGACACCGTTGTGGGAAGAGGGGCTTTTTCTGATAAGGGCTTCTGTTTACACTGCTGTTATTGCTGGGGTGTGTATGTTGGTGTGGTATGGACAGAACAAAGCAAAGGGTTTCATTGAGGCCAATTTGTTGCCTTCTGTTTGTGCAGCAATCAGTGAGCACATTCAGCGTGACCTTGTGTTTGGCAAGGTTCGGCGGATTTCGCCGTTGAGCATCACGTTGGAGTCGTGCTCGTTTGGGCCTCACAAGGAGGAGTTTTCGTGTGGTGAGGCTCCCACGGTTAAGCTCCGCCTCCGTCCCTTTGTGAGCTTGAGGAGGGGGAAGTTGGTGATTGATGCAGTTTTGTTGCATCCAAGTTTCTTGGTGGTGCAGAGGAAGGACTTTACTTGGTTGGGAATACCCTTCAATGAAGGAGGCAGGGAGAGAAGTTTCTCGGCTGAAGAGGGGATAGATTATCGCACGAGAACTAGGAGGCTTGCACGAGAGGAAGCCTTTGCTCAGTGGGAAAGAGAAAGGGATGGTGCAGCTAGGGAAGCTGCTGAGGTGGGGTACTTTGTTTCTGAGCGGAGTTGTGGTCTATCCAAAGGTGATGATGGTTTAAAGGAGATTGAAACTCGATCGTTGGAGTCAACTGAGTCTGCGCCCTTTTTCTGTATGAATGATGGGAAGCACGATCATTGGTTGATGGACAAAGGTGTTAATTATGATACGAAACACACAGCTTTGGAAAAATCATTTGGAGTAAGATTTCCTGGATTGGGACTTCGATTTTGGTCCAGAGTAATATCAGGGCTTAGGAAACACAAGTTGAATAGGAAGGCTAATGGGAGTAACATCTTTGCATCTGGTGGTGCTATCAAAAAGATAATATTGGAACGTAGTGCATCAGCTGCTCATGCATACTTTTGTGATCAACCACAATGGAAGTTTGAGGAGCCTTCATCACCTTCTGAAAGTTATGGTTTTATGAGTCATGATATGCATTTGGTGAAAAGTGAGGTTGACAGAAATACAATATCTGTTATTGTTAGTGATGAAAATAGAAGTGATGATAACCAAAGTGGAACACAATTCAAAGATCTGGGATTCCAGTCCCCCTTAGTAAATGAAAATGTTAGCAGTCAATCAGATTATTTAAAGTTTGTCTGTGATTCAACTTTACGGACAAGAGAGAGTGAAATTGAAAATTTGCAATCTAGTGATGATGTTGCAAAACCTGCTAATCCAAATAGTAGTACAGTGAAAAATGAGGAGTTTGTACCATATGTTGCTGAGAATCAAATTGATGATAATGATAGTTCATCAGGGGGCCAACAGGGTTTGCCATCTGAAGATTTGGGTATTGTGAAGCCTGAGCCTCAGTTGGCAACTTATTTTCAAAATCCATTTGAGCACTTGCTCGTGAAATTTGGCTTAACCTCATTTTTAAAAAATATTGAAGAGTTGATATCTCATTTTCTTTCTGGTTCCATTGAAATGTTGAAGTCTGATGTGGGTCTGAAAGTTGAAGATATTGTTTCAGAACATGTTGATGGGGTAGATTTTGTGCAGTCTGAAGGCGTTACGAAGACTCTGCCTGTTACGCTGGATTCAGTTCATTTCAGAGGTGCAACACTGATGCTACTTGCATATGGTGACAAGGAAGTTAGGGAGATGGAGAATGTCAATGGAAATGTAAAGTTCCAAAACCACTATAGTCGCATACATGTGGATCTGAGTGGAAATTGTAATACCTGGAGATCAGATATTATATCTGAAGATGGAGGCTGGTTGTCTGCCAATGTTTTTGTTGACACTATTGAGCAGAATTGGCATGCTAATTTAAAAATTGATAATCTTTTTGTCCCGCTGTTTGAAAGGATCCTTGAAATTCCAATTACATGGTCTAAAGGGTGGGCTAGTGGCGAGGTTCACTTGTGCATGTCAAAGGGGGAGACTTTTCCAAATTTTCATGGACAACTTGATGTTAGAGGGTTGGATTTCCAACTGTTGGATGCTCCATCATCTTTTTCTAACATATCAGCGAGTTTATGTTTTCGTGGTCAAAGAATATTTTTACACAATGCAAGTGGCTGGTTTGGTAGTGTTCCTTTAGAAGCATCAGGAGACTTTGGCATTCATCCCGAAGAAGGAGAGTTTCATCTTATGTGTCAGGTTCCTGGTGTTGAAGTGAATGCTTTGATGAGAACTTTCAAGATGAAACCTCTTCTCTTCCCGCTAGCTGGATCAGTAACTGCTCTATTTAATTGTCAAGGCCCACTGGATACTCCTGTATTTGTTGGCACTGGAATGGTTTCTAGGACATTCTCTTATTTACAGACTGAGAGCACTGCATCTGTAGCATCTGAAGCACTTGCTACGAGTAAGGAAGCTGGAGCGCTGGCAGCATTTGATCGTGTTCCATTCTCATATGTATCTGCTAATTTCACTTTCAACACTGATAACTGTGTTGCTGATTTATATGGAATTAGGGCATGCCTTGTAGATGGAGGTGAAATTCGTGGGGCTGGGAATGCATGGATATGCCCAGAGGGTGAAGAGGATGAGACATCAATAGATGTGAATTTTTCTGGAAGTTTGGCCATCGATAACATTGTGCTTCGTTATATACCAAGTTCTTATCATCAGATGCCACTTAAATTAGGGGTATTAAATGGAGAAACAAAACTTTCAGGATCTCTTTTAAGACCAAGGTTTGATATAAAATGGACTGCACCTACAGCAGAAGGGTCTTTCAATGATGCTCGAGGAGACATCATAATCTCACATGATTATATTACTGTGAATTCTGCTTCTGCTGCATTTGATCTGTATATGAGAGTTCAAACATCTTATCCTGATGATTTCCATCATAAAAGAGAAGAGTATAATATTCCAAGAGCTATTCCGCTTACTATTGATGGAGTTGAGTTGGATTTACGTATGCGTGGGTTTGAATTCTTCAGTTTGGTTTCTGCATACGCTATGGATTCCCCAAGGCCTTTGCATTTGAAAGCATCTGGAAGGATCAAGTTTCAGGGAAAGGTTTTAAAACCTAATGGCAATATTAGCGAACAAAATTTTGAAATGACAAGGCAGCATGTGCAAATGTTGGAGAAAGGAATTGCAGATAGTCTCATTGGCGAGGTTTCAATCTCTGGTCTCAAACTGAATCAACTGATGCTTGCACCTCAGTTGTCTGGGTTGCTGAGGCTTTCTCCTGGGGGTATCAAGCTGGATGCCTCTGGTAGAACTGATGAAAGTCTTGCAGTGGAGTTTGTTGGGCCACTACAGCCCAGTAGCGAAGATGGTCTGCAAAGTGGGAAACTGTTGTCTATTTCCCTTCAGAAAGGGCAATTGAGGGCTAACATTTGTTTTCAACCATTTCATTCTGCTAACTTGGAGGTACGGCATTTTCCACTTGATGAATTAGAGCTCGCTTCTCTCAGGGGAACTATACAGAGAGCAGAAATCCAGCTTAATCTTCAAAAAAGAAGAGGACATGGAGTCCTGTCTGTACTTCAGCCAAAATTCAGTGGCGTGCTCGGCGAAGCCCTAGATGTGGCAGCTAGGTGGAGTGGAGATGTTATCACTATTGAAAAAACAGTTTTGCAACAAAACTACAGTTGTTATGAACTTCAAGGCGAATATGTGTTGCCCGGCACCCGAGATCGTAATCCCATTGACAAAGGTGGCCTTATAAAAAGACTAATGTCTGGTCATATTGGTAATGCTATATCCTCGATGGGCAGGTGGAGAATGAAACTTGAAGTTCGTAGAGCTGAGGTTGCTGAGATGCTTCCCCTTGCTAGGCTTCTTTCTCGAAGTATGGATCCTGCTGTTCAGTCAAGATCTAAGGATTTCTTCATGCAAAGTTTGCAGTCAGTAGGATTATATACCGAAAGCCTTCAACAATTGCTTGAGACAGTGAGGGGGCTTCATGCTCCATCAAATGATGTTGTTCTTGAAGACTTAAGTCTGCCTGGTTTATCTGAACTCAAAGGTCACTGGCATGGATCTCTTGACGCTAGTGGTGGGGGAAATGGAGACACCCTGGCAGAATTTGACTTTCATGGGGAGGACTGGGAATGGGGAGACTACAAAACTCAGCGTGTGTTGGCAGTTGGTGCTTACAGTAATGATGATGGTATGTACCTGGAGAGAATTTTTATCCAGAAGGATAATGCCACCATCCATGCAGATGGAACATTGCTAGGACCTAAAACCAACCTCCATTTTGCGGTATTAAATTTTCCTGTTAGTCTGGTCCCAACTGTAGTCCAGATCATTGAATCTACAGCAATGGATGTTGTCCATTCTCTGCGACAGTTGTTGGCACCCATTAAGGGTATATTGCATATGGAAGGAGATCTTAGAGGAAGTTTAGCAAAACCAGAATGTGATGTGCAAGTAAGGCTCCTGGATGGTTCCGTTGGTGGTGTTGATCTTGGAAGAGCCGAAGTTGTTGCTTCTCTAACCTCAACCAGTCGTTTTCTATTCAATGCAAAATTTGAGCCTACAACCCAAAATGGTCATGTACTCATTCAGGGTAGCATTCCTGTTGCATTTGTGCAAAATAACACGTTACAGGAGGATGTAGAATTAGATAAGAGTCAGGTTACTTGGGTTCCTGATTGGGTGAAGGAGAAGAATAGAGGGACCGTTGATGATGCCAGCGACAAAAAAGTTTCTAGAGATAGAAACGAAGAAGGTTGGAATACTCAATTAGCAGAAAGCCTTAAAGGTTTAAATTGGCAAATTTTAGATGATGGAGAAGTCAGGATTGATGCTGATATAAAAGATGGGGGAATGACATTGGTTACAGCTTTATCTCCTCATGTGAATTGGCTTCATGGCAATGCGGATTTGAAGCTAGAGGTCAGAGGTACAGTTGATCAACCAGTACTTAATGGACACGCATCTTTCCACAGGGCATCTATTTCTTCACCAGTGCTCCAAAAACCACTAACCAACTTTGGTGGAAATGTTCATGTGCAATCAAACAGGTTATGCATCACCTCACTGGAGAGTAGGGTAAGCAGAAAAGGAAAGCTTCTTGTAAAAGGGAACCTGCCACTCAGAACTAGTGAAGCAGCCCCAGATGACAAGATTGAATTGAAGTGCGAAGTTCTGGAAGTACGGGCACAAAAAGTATTAAGTGGTCAGGTTGATTCTCAGTTGCAAATAACTGGTTCAATATTGCAACCAAACATATCTGGGAATATCAAAATAAGTCAGGGAGAAGCATATTTGCCTCATGACAGAGGTGGTACTCCTGCTTCTAATAGATTTCCATCAAATCAGTCTGTGCTTCCTACTGCTGGTGTTAGTCGCATGTTTGCTTCGAGATATGTTTCAAGATTTCTCAACTCAGAATCTGCTTCTTCAAGGGAAAAAGTATCTCAATCCTCTGGCTCTGTGCCAGTTAATAAGTCAACTCAGGTTGAAAAGCAGATGGAGCAAGTGCAGATTAAACCAAATGTAGAAATCTGTCTCAATGATTTGAAGCTTGTGCTTGGACCAGAGTTGAAGATAGTTTATCCTTTGATTCTTAATTTTGGTGTAAGTGGAGAGCTTGAGTTAAATGGTCCGGCCCATCCCAAATGGATAAAACCTAGAGGCATACTGACATTTGAGAATGGTGAAGTTGATCTAGTTGCAACACAGGTGAGGTTAAAACGAGAGCATTTAAACATTGCAAAGTTTGAGCCTGAATATGGACTAGATCCAATGCTTGATTTAGCTTTGGTTGGATCTGAGTGGCAATTCAGAATTCAAGGTAGAGCTAGCAATTGGAAGGACAAACTTGTGGTGACCTCAACACGTTCTGTGGAGCAGGATGCACTCTCGCCCACTGAGGCTGCCAGAAGATTTGAGAGTCAGTTGGCTGAATCCATTTTGGAAGGCAATGGTCAGCTTGCTTTTGAAAAGCTTGCAACTGCAACTCTGGAAAAATTGATGCCACGAATAGAAGGGAAGGGAGAGTTTGGCCAGGCTAGGTGGAGGCTAGTGTATGCACCTCAGATTCCTAGTTTAGTTTCTGTTGATCCTACAGCAGATCCTCTAAAGTCACTCGCCAGTAATATATCTTTTGGTACAGAAGTTGAAGTTCAGCTTGGGAAACGTCTTCAGGCCACAATCGTTAGGCAAATGAAGGAGTCCGAGATGGCAATGCAATGGACATTGAGCTATCTGCTTACAAGTCGTTTGCGAGTGCTCCTACAATCTGCTGCATCCAAACGCCTTCTTTTTGAATATTCTGCCACATCCCAGGATTGA 6570 0.4256 MSLKNHTLFFWTSLHGSLESGTTGKRNPFRLDKRKLLLQKNGLCSCTCCVSPKRCRLVSQALRFSSFSGQKNVGLLGKDVILRSESRLECAREPYFRGESLVSYLTPLWEEGLFLIRASVYTAVIAGVCMLVWYGQNKAKGFIEANLLPSVCAAISEHIQRDLVFGKVRRISPLSITLESCSFGPHKEEFSCGEAPTVKLRLRPFVSLRRGKLVIDAVLLHPSFLVVQRKDFTWLGIPFNEGGRERSFSAEEGIDYRTRTRRLAREEAFAQWERERDGAAREAAEVGYFVSERSCGLSKGDDGLKEIETRSLESTESAPFFCMNDGKHDHWLMDKGVNYDTKHTALEKSFGVRFPGLGLRFWSRVISGLRKHKLNRKANGSNIFASGGAIKKIILERSASAAHAYFCDQPQWKFEEPSSPSESYGFMSHDMHLVKSEVDRNTISVIVSDENRSDDNQSGTQFKDLGFQSPLVNENVSSQSDYLKFVCDSTLRTRESEIENLQSSDDVAKPANPNSSTVKNEEFVPYVAENQIDDNDSSSGGQQGLPSEDLGIVKPEPQLATYFQNPFEHLLVKFGLTSFLKNIEELISHFLSGSIEMLKSDVGLKVEDIVSEHVDGVDFVQSEGVTKTLPVTLDSVHFRGATLMLLAYGDKEVREMENVNGNVKFQNHYSRIHVDLSGNCNTWRSDIISEDGGWLSANVFVDTIEQNWHANLKIDNLFVPLFERILEIPITWSKGWASGEVHLCMSKGETFPNFHGQLDVRGLDFQLLDAPSSFSNISASLCFRGQRIFLHNASGWFGSVPLEASGDFGIHPEEGEFHLMCQVPGVEVNALMRTFKMKPLLFPLAGSVTALFNCQGPLDTPVFVGTGMVSRTFSYLQTESTASVASEALATSKEAGALAAFDRVPFSYVSANFTFNTDNCVADLYGIRACLVDGGEIRGAGNAWICPEGEEDETSIDVNFSGSLAIDNIVLRYIPSSYHQMPLKLGVLNGETKLSGSLLRPRFDIKWTAPTAEGSFNDARGDIIISHDYITVNSASAAFDLYMRVQTSYPDDFHHKREEYNIPRAIPLTIDGVELDLRMRGFEFFSLVSAYAMDSPRPLHLKASGRIKFQGKVLKPNGNISEQNFEMTRQHVQMLEKGIADSLIGEVSISGLKLNQLMLAPQLSGLLRLSPGGIKLDASGRTDESLAVEFVGPLQPSSEDGLQSGKLLSISLQKGQLRANICFQPFHSANLEVRHFPLDELELASLRGTIQRAEIQLNLQKRRGHGVLSVLQPKFSGVLGEALDVAARWSGDVITIEKTVLQQNYSCYELQGEYVLPGTRDRNPIDKGGLIKRLMSGHIGNAISSMGRWRMKLEVRRAEVAEMLPLARLLSRSMDPAVQSRSKDFFMQSLQSVGLYTESLQQLLETVRGLHAPSNDVVLEDLSLPGLSELKGHWHGSLDASGGGNGDTLAEFDFHGEDWEWGDYKTQRVLAVGAYSNDDGMYLERIFIQKDNATIHADGTLLGPKTNLHFAVLNFPVSLVPTVVQIIESTAMDVVHSLRQLLAPIKGILHMEGDLRGSLAKPECDVQVRLLDGSVGGVDLGRAEVVASLTSTSRFLFNAKFEPTTQNGHVLIQGSIPVAFVQNNTLQEDVELDKSQVTWVPDWVKEKNRGTVDDASDKKVSRDRNEEGWNTQLAESLKGLNWQILDDGEVRIDADIKDGGMTLVTALSPHVNWLHGNADLKLEVRGTVDQPVLNGHASFHRASISSPVLQKPLTNFGGNVHVQSNRLCITSLESRVSRKGKLLVKGNLPLRTSEAAPDDKIELKCEVLEVRAQKVLSGQVDSQLQITGSILQPNISGNIKISQGEAYLPHDRGGTPASNRFPSNQSVLPTAGVSRMFASRYVSRFLNSESASSREKVSQSSGSVPVNKSTQVEKQMEQVQIKPNVEICLNDLKLVLGPELKIVYPLILNFGVSGELELNGPAHPKWIKPRGILTFENGEVDLVATQVRLKREHLNIAKFEPEYGLDPMLDLALVGSEWQFRIQGRASNWKDKLVVTSTRSVEQDALSPTEAARRFESQLAESILEGNGQLAFEKLATATLEKLMPRIEGKGEFGQARWRLVYAPQIPSLVSVDPTADPLKSLASNISFGTEVEVQLGKRLQATIVRQMKESEMAMQWTLSYLLTSRLRVLLQSAASKRLLFEYSATSQD* 2190
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Gso17g1730 2189 PANTHER EMBRYO DEFECTIVE 2410 1 2189 - -
Gso17g1730 2189 MobiDBLite consensus disorder prediction 531 545 - -
Gso17g1730 2189 Pfam TamB, inner membrane protein subunit of TAM complex 1772 2173 IPR007452 GO:0005887|GO:0009306
Gso17g1730 2189 Coils Coil 1243 1263 - -
Gso17g1730 2189 MobiDBLite consensus disorder prediction 498 551 - -
Gso17g1730 2189 MobiDBLite consensus disorder prediction 503 521 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Gso17g1730 Gso-Chr17 33071416 33118093 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Gso17g1730 - - gmx:100788741 4309.6
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Gso14g1049 14 17764024 17864289 Gso17g1730 17 33071416 33118093 GST