Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Gso16g0190 ATGAGAGAAGCAGAGAAGATGAATCCCATCGATCATCTTCCCCTCCGTCTCCTCAGATCCGACACGGTCCCGCCCGCCCCAACCTTGTCCGAATCCACGGTGGATTTTCTCCCTGACTTCTCCGGCTACTCCTGGATCGCCTACGCCGCTTCTTCACTTCTCACCATCTCCCACTTCCCTTCCCCTCTTTCCCCTCACCAAACCCGCATCGGCCCCATTTTCCGCCAATCCTTCCAGCTCTCCGCCGATCCCCTCGCCGCCGTCGCCTGGTCCCCTAGTTCCCCCTCCTCCGGCGACCTCGCCGCCGCCGCCGATAACTGCATCTCGCTTTTCCGCCACGACTCCGCCACCGCTAAAGGTTCTTTTTGTTGGAGCCAGAATGCAGTGCTTGTACAACATACGAAAGTGGCAAACATCAGATGGACAGGATCGGGAGATGGAATAATTTCTGTTGGAATGGAGGTGGTTTTCTGGAAAAAGAGTAACAAATGTTGGGAAGTTGCTTGGAAGTTTAAAGCAGATCAACCCCAAACTCTTGTTTGTGCAACTTGGTTTATTGAGGGCCCTTCAGCAACTGCAGCACATCCTAGTAAAGAGCACATTGAAGGGTCCTTGACCAATGAGAAAAGCAAATGTGTATTGGTATGTCAAAGCAACGGACTATCTGAATATTCAAAAGTCAAACTACATCATCCTTTACCTGTCGTAATGATTCAATGGAGACCATCAAGAGGAAAGCTATCAAACAGATATGGTAAGTGTTCAGTAAGGCATGTCCTGTTGACATGCAGCTTAGATGGGACTGCAAGGTTATGGAGTGAAATTGATAATGGAAAGGCCAGGAGAACTGGGAAGGACATCAATGATCAGAAGAACACGGGATGCTCTTTTTGTGTTGTTGCTGTTATTGAGATTAATCAGTCCTTAAATGGAACTCTTGGTTCAGATATATTTGTGAGATGGGGGACAGACTTTGAGGGAATATTTAGAACTGGCGAAGAGGCCGCCAAACAAGTTTTTTCCAAAGAAGGATTTGAGCATGATGTTAGAAATTGTGATTGGCTTGTTGGGTTTGGTCCTGGAATGTTGCTTAGCTTTTGGGCTGTCCAATGTCTTGATGATGTTTCTCCGCTGAGATTCCCCCGAGTTACGTTATGGAACAAACATGAAATCCAGAACCACGACATAGCAAATGTTTACAAGTTTAACTCATCTGATTTTAAAAATGCATTTTTTCTTCATAAGATCATTATATTGAGAAGTTCCCTGTCTGGTCCACCGATTATATGCTCTTCACTTCAGCTATTGCCTTGTAATTCCTTAGTTTGGTCAAATTTTCGTATTCAAATGATACATGATGCTGTGGAGAAATCCATTGATAATGTTAACACAGATAACATATCCTCCCATTTGACTGGTGGTGTTTTAAACTTAGATGGTCATAGTGGGAGAATCTTAAAGGTTTCACTTCATCCTTGTACAAGCAAAGTTCAATTAGCTGTTTCTCTGGATTCTAATGGACTGCTTCTTTTTTGGTCACTTTCTAACATTTCAAACTGCATTTTGGGATGTCCAACTTTGGTTCCTACTATGGAACTCTATGGAAAGCTTGCAACTCAAGACTCATGTTCCTTGTACACAAGCTTGACATGGGCACCTTCAATACTTGATGACAAGCTGGTTTTTTTTATGGGGCATACTCGGGGGATTGATTGCTTCATTGTCAACATTTGTCAAAGTGAAGAAGAAAACATAGAATGTCACTACTTATGTACTATTCCTTTCAGTGGTCATGGTCCTTATGAGGATGGCCCTTTTGATATCTTTACAATTCCTTTAAATTCCACTTGTGACAAAACTTTCCGTAATAATAAACTTATGTTATTGGCAATATGGATGGGGAGATTTCAGGCCCTATCATGGGAAGTAAACTTGCACTCATTTGACATGTCAACAAACTGTTGTGAATGCAATTTTGATGTTAAAAGCATTGATAACTGCAGTGTTTGGGCATTTGAAAGTACATTTGCTAATAAAAAATATTGCATTACTGTAAATCCATGTTCATGTGAGTTTCTAAGTTCCAATGATCTGGTTACTAGTTTTGCGGTGGCTGATTCAGGCACTCTAAGCCATAGGCAACAAGAGTTTGGCCTTGCGAATGATCTGTGTAGTAGTTATCCTGCATATATCTTGGCCACAGGCTCCTCTGATGGCATCTTGAAACTCTGGAAAAGTAAACCTGGCAACTCATTGACCCAGCACTTGCCATGGGAGCTTGTGGGTTCGTTTGTTGCACATGATGGTCCCATCAAGGATATATGTTTAGCTGATTGTGGTGAGAAGATTGCCACATTCTGCTACGAAAGCAATTCAAATGCTATCAATACCATCCATATATGGGATGCTGTACCACTAATCAGTGCTGGGACTTTTATTTTGGAGGATAAAATAAAGACTGAAAGTGATGTTATTGCTCTAAAGTGGTTACCTTTAGGAACTGGGGAGTTATTGCTTGGAGTTTGTTTGCAAAATGAATTACATGTGTATGCTCCTAAGCGTTGTGTTGGTACAACATTGTCAAACTCTGTAAATTTTCCAAAAAAGAATATATGGGTTCGCATTGCATATGCTCACACTTCCATTCCAATTTATGATTTCTTGTGGGGACCCAGAGCTGCAGCAGTGGTGATTCATGGAAATTACTTTAGTATATTTAGTCATTGGTTGTTCCATGAGGATAAAAGGCAAGGGAGTAAATTTCGTCCCGGTGATTCAAAGCCTAATACCTATAATTGCGAGGATGAAATATATGAAGACATACTTTCTTCAGTTTTTACTGAATATGACATTGGTGCTTTCAGAGAACAGTCACTTGGAGACAGTCATGCAGATTTTGATTCTGTGCAGTCCAGCAAAATCAATATGAAGGACAATTCCAGTAGCTTGTTTCTGGCCAAGGAACAATTAAAATCTGAACTTCTTACCAAGGTTGGTTTATGGAGCATCTTAGAAGTAGCTGAGATAATTAGTGGATCATTGCCTACTTATCACCCTGATGTACTAATTACTAATATAAGCTCAGGAAACTGGAAACGTGCTTATGTAGCTGTGAGGCATCTTGTTGAATGCCTGACTAGTTATGATACTAAAAAGAGACACATCTCCAAGAGAATTGGCCTTCCAAATATTTTATTGTCATATTATCTAGAAGGCTGTATATCAAAAGGTTCCCAACCTAAGGGATTCCAGTGGGGCGGTGACACTACATCAATCACATCAATTTCACAGGCTCAGGGTAGCTTGTTCCAGTTTCCATATCACTCAGGTTCCATTGTTGAAAATGAAAGCATTTCCTCCTCAACAAAATCTGAGCTTAATGGCTTTATTGAATCTCTTGAGAAATTTCCTGATTTACCATTTTTGATCGACATAGAGAAGATGCAGATTCTTGCAATTATAGATCTGCTTAGTGAAGTTAGTAGTCCTCACTCATCTTCTGCATATCAGAGTCTTGATGAACCTGGACGGAGGTTTTGGGTTGCACTAAGATTTTGGCAACTGCTTTTTCTCCGAAAGTTTGCCAGAGCTGCATCTTTTGAAGAGTTGCCCGCTGACTCAAGGTTATTTGTATGGGCTTATCATTCTGATTGCCTAGATAATTTATTTGGTTCTGTCATACCCAATGAACCATCATGGCAAGAAATGCGTGCTTTGGGTATGGGCTTTTGGTATGCTAATATACCTCAATTGCGTGCAAGGATGGAGAAATTGGCAAGAGCTCAGTATTTGAAGAACAAAAATCCTAAGGATTGTGCTTTGCTGTATATTGCACTGAATAGAGTTCAAGTTTTGGCTGGCCTTTTCAAAATCAGTAAGGATGAGAAGGATAAGCCTCTAGTGGGCTTCCTTTCTCGCAATTTTCAGGATGAGAAAAACAAAGCTGCTGCTTTAAAAAATGCTTATGTCTTACTTGGAAAGCATCAGCTGGAATTAGCAATTGCTTTCTTTTTGCTTGGAGGTGATCACTCTTCTGCTATAAATATTTGTGCTAAGAATCTTGGGGATGAACAGCTTGCCCTAGTCATTTGTCGTCTTGTTGAGGGTCATGGTGGATCATTGGAGCATCATCTAATTACAAAGTACATACTTCCATCTGCAATTGATAAAGGAGACTACTGGCTTGCAAGCCTTCTGGAGTGGGAAATGGGTAATTACTACCAATCTTTTTATAGAATGCTAGAGTTTTCAGTAAACCCTGTGCCTTGGGAGTCCACTGTCATGTCCAATTGTGGTCCTTTTCTGGACCCCACTGTTGGTTTTTATTGCCAAATGTTAGCAACAAAGAATAGCATGCGGAATGCAGTGGGGGAGCAAAATTCTGCAATTCTTTTAAGATGGGCGACTTTGATGACAGTTGCTGCCCTAAAAAGATGTGGTAATCCTCTTGAGGCGTTGGAATATTTCTCGTCTTCACTGAGCATGTCTGAGACTGCAGATCAAGAGAGTGAATTAGGTGACAGTCATGATGTGCTGTCCAGTACTCTTAAGCCTTTGCCAAGAAAATGCTCTAACTGGTTGTCTGCTAATGTGTCTGTGCATCTCGAGTTCCATATTAAATTGAATTTGGCACTTTGCTACTTATCAAAATTGATAAAAGAGCATCCAAGCTGGCCTGACACTTTTGCAGAATATAATGGAGAAGCTTCTTATTCTGACGAGTACATGATGCAATATGCGAAATCAGTTGAAAGTTTTAAACAAAAGTTATACACAGGACTTGCTCTATTTGAACAGAGGTTTTTATTGGCTCCCCACTGTCTAATCAGTATGATTTTACTCTTACTTTTTCATCATGGATCATTGTACATTAGATATGATATGACTGATGGATGCATTCAAGGAGAACTGTCTCAAAAGAAGAGCAATATATTTGATGATTTCAATTTATATTACTCTTGGATTAAACCCCTGTTTAAGACTGCAGAAGAAGTCTCCTTTTTCTATTCAAGATTTTTTTGTGCCTGCAGTATGGAAAATTCGCAACAAAATTCATCTATTGATAGTAAACCTAAGTTTTTGGATGCTTTGCAATGCCGCTTTGAAGGTGTTTTGATTTCATTGTGGTTTTTTAGAGCAATTTTGAGGATCCAGTTGAGTTCTATTTGCAAAGATCTTGTCAAAACACATCTTGATATCCTGGATTTGTATGAATATTATTTACATTTTTCATTAGCTTGGCTTCAAAAAAACTCGGAAGCGCTTTTGTATATGTCGGAACCATTCTTGGTTGCACAATCTAATGGTCGTAATCCTTATGACATTGATATGGTGAATCTGAAGAAGCTTATCCCAAACATTGGGCAGTTGTTGGCTCAAACTTCTTTAATGTCTAATATAGAAAACCTTCAACTATCCAAATGTGCAGAAGATAAACTAGTTGCAGATCTAAAGCATTTAATTCCTGACGATGAAAGATGGAAGATTTTAGGGACCTGCTTGTGGCAGCATTTCTCTAGATTCATGATATCTAATTTGAATCTGGTTCTTGCCAAACTTGAAGATGGTAATTTATCTGGGCCTTTCCACAGAAAATATACTTATGGGGAGTCTTATCTCATAAATATGGATTCTGAAAGCATCAGCTTGCCAGAGAAGATTCGGTTAGTCTCATTTAGCCTATGTGATCTACTGATGACAACGGTTACTCACATTTCTTCTTATCATGTTAAACAACATGCAGAATTTCTGTGGCAGAAAGTAGGGAATGATTTGAATGTAATGACTCTTAAATGGTTAACACAAAAATCAGAATTCAGTCAGAACCAAAACCTGGACATTTTAGAACAGGGGAACAGGAAAGATAACTATTCAGTTCATCAGTTATTATGGGATCACTGTGCGGATCCCAAATTGATATCTGATTGCTTTGCACAGGAAAAACTCAATTGGCCTAATGACTTGGATCAGATGAATACTAAAGGTTGGAATGACTTGTCTATAATTATGACAGGACTGCATAAAACTGATGATACATGTGGTGATGGATGTAAATTTAGCACTGGATCTTCTAATCATGAAGTTGGAACTCCTGTTAAAGGAACATCTCTAAGTGGCCATGCTTTTGCAAGAACAAACCAGAAAGATATATCTTATACAAATTTTGCAGTTTTCCAGAGTCCCAGAGAAATGTACAAGAGAAATGGAGAACTTTTGGAGGCATTGTGTATAAACTCTACTGATCAACGGGAAGCTGCAGTTGCTGGCAATAGGAAGGGTATAATGTTCTTTCATCTGGAAGATGAGATTCCTTTTAGTGCTAAATCAGATGATCTTTTGTGGGCTACAGCTGATTGGCCTCAGAATGGATGGGCAGGTTCAGAATCCACCCCTGCTCCAACATGTGTTTCTCCTGGTGTTGGCCTTGGGAGCAAAAAAGGGGCACACCTTGGGCTGGATGGAGCAACTATTGGCGTGGACTCTTCAGATTGGCCCAGCAATGACTTGACAGGTGGCAAAGTATTAGGAAGGCTAGGTTACACTGGTATTGGTGCCTCTGGATTAGGTTGGGAAGTTCAACAAGATTTTGAAGATTTTGTTGATCCACCTGCCACTTTGGAGAACATAAGTACCAGGGCTTTGTCTAGTCATCCAATGAGACCTTTCTTCTTGGTTGGCTCTAGCAATACACACATTTACTTGTGGGAGTTCAACAAAGACAAAGCTACTGCTACATATGGAGTGCTGCCCGCTGCCAATGTCCCTCCACCTTATGCCCTTGCATCAATTTCAGCCTTACAGTTTGACCACTTTGGACACCGATTTGCCAGTGCTGCATTAGATGGAACTGTCTGCACGTGGCAGCTGGAGGTTGGAGGAAGGAGCAATGTTCGTCCAACAGAATCATCTCTTTGCTTTAATGGTCATGCATCGGACGTCACATATTTTTCCTCAAGTGGATCGATAATAGCTGTGGCTGGATATAGCTCTAATGGTGTTAATGTGGTCATATGGGATACTTTAGCTCCACCCACTACTTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTGGTGCACACACCGTGTCTGTTTTTGATAATCATGTGGGAGGTGGTTCTGTATCCCCCCTTATTGTGACTGGTGGTAAAGGTGGTGATGTTGGACTTCATGACTTCCGCTATATAGTTACTGGAAAGGCTAAAAGGCATAAGCGTGCTGATAACATTGGGCAAGGCTCTGTCTCATCTTTGACTTGTGATAAAGATCCGAATGTAGATGGGATGCTTTGGTACATTCCAAAGGCTCACTCAGGGAGTGTAACAAAAGTAGTTACCATACCAAATACCAACTTGTTTTTAACTGGAAGCACAGATGGAGATGTCAAACTCTGGGATGCCCAGAGCACAAAGTTAATACATCACTGGTCAAAGATACATGAAAAGCACACCTTTCTGCAGCCAAGCTCTCGTGGATTTGGTGGTGTTGTTCGGGCTGCTATTATGGATATACAAGTTGTTCCCCATGGTTTTCTTACATGCGGTGGGGATGGAATTGTAAAGCTGGTACGGCTGGAAAATAACTTGCTTGGCCATGGAATTGAGTTATGA 7605 0.4074 MREAEKMNPIDHLPLRLLRSDTVPPAPTLSESTVDFLPDFSGYSWIAYAASSLLTISHFPSPLSPHQTRIGPIFRQSFQLSADPLAAVAWSPSSPSSGDLAAAADNCISLFRHDSATAKGSFCWSQNAVLVQHTKVANIRWTGSGDGIISVGMEVVFWKKSNKCWEVAWKFKADQPQTLVCATWFIEGPSATAAHPSKEHIEGSLTNEKSKCVLVCQSNGLSEYSKVKLHHPLPVVMIQWRPSRGKLSNRYGKCSVRHVLLTCSLDGTARLWSEIDNGKARRTGKDINDQKNTGCSFCVVAVIEINQSLNGTLGSDIFVRWGTDFEGIFRTGEEAAKQVFSKEGFEHDVRNCDWLVGFGPGMLLSFWAVQCLDDVSPLRFPRVTLWNKHEIQNHDIANVYKFNSSDFKNAFFLHKIIILRSSLSGPPIICSSLQLLPCNSLVWSNFRIQMIHDAVEKSIDNVNTDNISSHLTGGVLNLDGHSGRILKVSLHPCTSKVQLAVSLDSNGLLLFWSLSNISNCILGCPTLVPTMELYGKLATQDSCSLYTSLTWAPSILDDKLVFFMGHTRGIDCFIVNICQSEEENIECHYLCTIPFSGHGPYEDGPFDIFTIPLNSTCDKTFRNNKLMLLAIWMGRFQALSWEVNLHSFDMSTNCCECNFDVKSIDNCSVWAFESTFANKKYCITVNPCSCEFLSSNDLVTSFAVADSGTLSHRQQEFGLANDLCSSYPAYILATGSSDGILKLWKSKPGNSLTQHLPWELVGSFVAHDGPIKDICLADCGEKIATFCYESNSNAINTIHIWDAVPLISAGTFILEDKIKTESDVIALKWLPLGTGELLLGVCLQNELHVYAPKRCVGTTLSNSVNFPKKNIWVRIAYAHTSIPIYDFLWGPRAAAVVIHGNYFSIFSHWLFHEDKRQGSKFRPGDSKPNTYNCEDEIYEDILSSVFTEYDIGAFREQSLGDSHADFDSVQSSKINMKDNSSSLFLAKEQLKSELLTKVGLWSILEVAEIISGSLPTYHPDVLITNISSGNWKRAYVAVRHLVECLTSYDTKKRHISKRIGLPNILLSYYLEGCISKGSQPKGFQWGGDTTSITSISQAQGSLFQFPYHSGSIVENESISSSTKSELNGFIESLEKFPDLPFLIDIEKMQILAIIDLLSEVSSPHSSSAYQSLDEPGRRFWVALRFWQLLFLRKFARAASFEELPADSRLFVWAYHSDCLDNLFGSVIPNEPSWQEMRALGMGFWYANIPQLRARMEKLARAQYLKNKNPKDCALLYIALNRVQVLAGLFKISKDEKDKPLVGFLSRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGKHQLELAIAFFLLGGDHSSAINICAKNLGDEQLALVICRLVEGHGGSLEHHLITKYILPSAIDKGDYWLASLLEWEMGNYYQSFYRMLEFSVNPVPWESTVMSNCGPFLDPTVGFYCQMLATKNSMRNAVGEQNSAILLRWATLMTVAALKRCGNPLEALEYFSSSLSMSETADQESELGDSHDVLSSTLKPLPRKCSNWLSANVSVHLEFHIKLNLALCYLSKLIKEHPSWPDTFAEYNGEASYSDEYMMQYAKSVESFKQKLYTGLALFEQRFLLAPHCLISMILLLLFHHGSLYIRYDMTDGCIQGELSQKKSNIFDDFNLYYSWIKPLFKTAEEVSFFYSRFFCACSMENSQQNSSIDSKPKFLDALQCRFEGVLISLWFFRAILRIQLSSICKDLVKTHLDILDLYEYYLHFSLAWLQKNSEALLYMSEPFLVAQSNGRNPYDIDMVNLKKLIPNIGQLLAQTSLMSNIENLQLSKCAEDKLVADLKHLIPDDERWKILGTCLWQHFSRFMISNLNLVLAKLEDGNLSGPFHRKYTYGESYLINMDSESISLPEKIRLVSFSLCDLLMTTVTHISSYHVKQHAEFLWQKVGNDLNVMTLKWLTQKSEFSQNQNLDILEQGNRKDNYSVHQLLWDHCADPKLISDCFAQEKLNWPNDLDQMNTKGWNDLSIIMTGLHKTDDTCGDGCKFSTGSSNHEVGTPVKGTSLSGHAFARTNQKDISYTNFAVFQSPREMYKRNGELLEALCINSTDQREAAVAGNRKGIMFFHLEDEIPFSAKSDDLLWATADWPQNGWAGSESTPAPTCVSPGVGLGSKKGAHLGLDGATIGVDSSDWPSNDLTGGKVLGRLGYTGIGASGLGWEVQQDFEDFVDPPATLENISTRALSSHPMRPFFLVGSSNTHIYLWEFNKDKATATYGVLPAANVPPPYALASISALQFDHFGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNVRPTESSLCFNGHASDVTYFSSSGSIIAVAGYSSNGVNVVIWDTLAPPTTSRASILCHEGGAHTVSVFDNHVGGGSVSPLIVTGGKGGDVGLHDFRYIVTGKAKRHKRADNIGQGSVSSLTCDKDPNVDGMLWYIPKAHSGSVTKVVTIPNTNLFLTGSTDGDVKLWDAQSTKLIHHWSKIHEKHTFLQPSSRGFGGVVRAAIMDIQVVPHGFLTCGGDGIVKLVRLENNLLGHGIEL* 2535
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Gso16g0190 2534 Gene3D - 41 366 IPR015943 GO:0005515
Gso16g0190 2534 Pfam WD domain, G-beta repeat 2432 2464 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2432 2467 - -
Gso16g0190 2534 PANTHER RABCONNECTIN-3A 19 2523 - -
Gso16g0190 2534 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 2212 2520 IPR036322 GO:0005515
Gso16g0190 2534 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2432 2473 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 Gene3D - 456 852 IPR015943 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 2299 2339 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 471 513 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 811 851 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 2253 2288 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 2425 2464 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 222 273 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 757 802 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 2344 2390 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 2476 2522 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 2199 2236 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 71 112 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 SMART WD40_4 685 745 IPR001680 GO:0005515
Gso16g0190 2534 Pfam RAVE protein 1 C terminal 796 1408 IPR022033 -
Gso16g0190 2534 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 19 2523 - -
Gso16g0190 2534 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 81 838 IPR036322 GO:0005515
Gso16g0190 2534 Gene3D - 2208 2513 IPR015943 GO:0005515
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Gso16g0190 Gso-Chr16 2185632 2203405 Dispersed/Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Gso16g0190 K24155 - gmx:100789935 4830.39
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Gso7g0484 7 4821510 4838052 Gso16g0190 16 2185632 2203405 GST