Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Glsi09g1474 ATGGATTCTCCCTCTTTCTCATCCTCCTCCTCCGATTTCGGTCCTATCGCCACCGCTGAGCAGAATGCGGGACGAAGTGGGAGAAGTGGCGACGCTAGTGAAGCTGTGACCTCAGAGCAATCGCGTCGGTGGCATGATGTTTTCTGGTTAGGACTATTTGTAATTCATTTGATTGTCCTGGGACTCGTTATGGGGGTTTTTGGCCTCAATAGTTTCAAGAAAAGGAATAGACTAAACATTGATAGGTACATCGGTCAACTTTCAGAGGATAAATCTGGGTTGACCGAGGATTACTGGCCGCTCTATGCTGTTGCTGGTGGAGTTGGGACCGTTCTTGGGTGGAGTTGGTTGTTGTTGTTGGGTTCTCGCGCAAATCAAATGATGAAGGTGTCTGTTCACATTCTGACCACTTATCTTGCTGTGATCAGTGTTTTGTGTTTCTGGGCTGAACAGTTTTTCTGGGGGGTTGCTTTTGCCATTGGAGCAGCTCTGCAGTTCTTGTACGTGATATCGGTCATAGACAGACTCCCCTTTACCATGCTGGTTCTGCAAAAAGCTGTGAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGAGTGGCATATGCTTTTATGCTTGTAGTGCTATTATGGATGGCCTTATGGTCTTTTGGAGCAGCAGGCATTGTGGCTGCAAGCATCAGTGACGGTGGAAGCTGGTGGCTTATTGTGGTTTTCTCTGTAAGCTTATTTTGGACAGGTGCAGTACTGTGTAATACTGTGCATGTCATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGATCTTATCCATGGTGGTGGAGATCAGGCAGCTTCTATACCTGCTAAATCCTTAATGAAATCTTTACAGTATGCTTTAACAACGTCTTTTGGCAGCATTTGCTATGGCTCATTATTTACAGCTGCTATCAGGACACTCCGATGGGAGATAAGGGGGTTCCGGTCAAAGATCGGCAACAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTCTTTAACAAGTATGCCTATGTTCAGATTGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCGTTCAGCTAGAGATGCCTGGGAGCTACTCCAGTCAACTGGGGTTGAAGCACTTGTGGCCTATGACTGTTCAGGTGCTGTCCTTCTAATGGGCACCGTTTGCGGTGGTTTGATAACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGTTTAAATGGAGTGATAGAGTGATTATGATAGGTTCCACGTCTATGCTGATGGGAATGGTCTTGGTTGGAGTGGCAATGGTGGTGGTGGAAAGTGCTGTTACATCCATCTATATCTGCTATGCAGAAGACCCCTTATTGATTCGTAGGTGGGACACTGAATTTTTCAACCACATATCTGAGACACTACACCAAAGACTTCAACATAGAAGTGCACGACCGAGGGAAGTTTTAACCCACTATCAACTTGATTATGGTGTTCGAGAAAACGTCTCTATTTGA 1503 0.4538 MDSPSFSSSSSDFGPIATAEQNAGRSGRSGDASEAVTSEQSRRWHDVFWLGLFVIHLIVLGLVMGVFGLNSFKKRNRLNIDRYIGQLSEDKSGLTEDYWPLYAVAGGVGTVLGWSWLLLLGSRANQMMKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLVLQKAVKMVWNLPEVMRVAYAFMLVVLLWMALWSFGAAGIVAASISDGGSWWLIVVFSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLDLIHGGGDQAASIPAKSLMKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWEIRGFRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVQIAVYGKSFNRSARDAWELLQSTGVEALVAYDCSGAVLLMGTVCGGLITGTCSGVWAWFKWSDRVIMIGSTSMLMGMVLVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIRRWDTEFFNHISETLHQRLQHRSARPREVLTHYQLDYGVRENVSI 500
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Glsi09g1474 500 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 32 479 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Glsi09g1474 500 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 34 - -
Glsi09g1474 500 Pfam Plasma-membrane choline transporter 157 452 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Glsi09g1474 Glsi-ChrGlsi09 11176450 11180984 Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Glsi09g1474 09 11176450 11180984 Glsi09g1474 09 11176450 11180984 ECH