Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Glsi05g0448 ATGACCTCCAAAGGTCCACCGAAAGCGACTGCGTGGCAAATCAGGACACAAGAATTACTCTGCCTTGCTCTTTTTCTTCTACGGTTCTATCCACTGTGGCCCTTTATCCTACTTGATCTCTACGATGTTCCTCCATCGCTCACAATGACGGACTCTAATTCTTTCTCATCCACCTCCTCCGATTTTGGTTCCACCAACACCGCCGATCAGAATGTGGGGCGGAGTCGGAGAAGTGGTGGCGCTAGTGAAGCCGTGACCTCAGAGCAGTCACGTCGGTGGCATGACGTTTTTTGGTTAGGAATATTTGTAATTCATTTGATTGGCCTTGGAATCCTTCTGGGGCTTCTCGGCCTCAATAGGTTTAAGAAGAAGAATAGACTTAATATTGATAAGTATACTGCTCGGTTTTCGGAGAATGAAGCAGGCTTGACCGAGGATTACTGGCCACTCTATGCTGTTGCTGGTGGAGTTGGGACTCTTCTTGGATGGAGTTGGTTGTTGTTCTTGGGTTCTTGTGGTAGTCAAATGTTGAAGGTCTCGGTTCACATCCTCACCACCTATCTTGCGGTGATCAGTGTCTTGTGTTTCTGGGCTGAACAGTTTTTCTGGGGAGTCGCTTTTGCCATTGGAGCAGCACTGCAGTTCTTGTACGTGATATCGGTCATAGACAGACTTCCATTTACCATGTTGATTCTGCGAAAGGCTGTAAAGATGGTATGGAATCTTCCTGAGGTTATGAGATTGGCATATGCATTTATGCTTCTTGTGCTTTTATGGATGGCCTTATGGTCTTTTGGAGCAGCTGGTGTTGTGGCTTCAAGCATGGGTGATGGTGGACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTTCTCTCTGTCAGCTTATTCTGGACGGGTGCAGTACTTTGTAATACTGTACATGTCATAGTGTCTGGGATGGTGTTTCTTGTTCTTATCCATGGTGGTAGAGAGGCAGCATCAATGCCTGCTAATTCTCTATTGAAATCTCTTCAGTATGCTCTAACAACATCTTTTGGCAGCATTTGTTATGGCTCATTATTTACAGCTGCTATTAGGACACTCCGTTGGAAGATTAGGGGATTCCGGTCAAAGATTGGAAACAATGAGTGTTTGCTTTGCTGTGTTGATTTCCTTTTCCATCTTGTGGAGACTCTTGTCCGTTTCTTCAACAAGTATGCCTATGTTAAGATAGCTGTTTATGGTAAAAGCTTTAACCATTCAGCTAGAGATGCATGGGAGTTATTCCAGTCAACTGGAGTTGAAGCACTCATAGCTTATGATTGTTCTGGTGCTGTCCTGCTAATGGGCATCATTTTCGGTGGGCTGATTACTGGAACTTGCTCTGGTGTTTGGGCATGGATCAAATGGAGTGACAGAGTAATTATGATTGGCTCCACATCGATGTTGATGGGAATGGTCTTGGTTGGAGTGGCAATGGTTGTGGTGGAAAGTGCTGTGACATCCATTTATATCTGCTATGCAGAAGACCCCTTGTTGATTCATAGATGGGACGCCGAATTTTTCAACCAGATTTCAGAGACATTACACCAGCGACTTCAACATCGGAGCTCCCGGGCTAGGGAAGTTTTAACCCACCATCGGCTTGATGGTAGTGTACAAGAAAACGCTGCTATCTGA 1647 0.4542 MTSKGPPKATAWQIRTQELLCLALFLLRFYPLWPFILLDLYDVPPSLTMTDSNSFSSTSSDFGSTNTADQNVGRSRRSGGASEAVTSEQSRRWHDVFWLGIFVIHLIGLGILLGLLGLNRFKKKNRLNIDKYTARFSENEAGLTEDYWPLYAVAGGVGTLLGWSWLLFLGSCGSQMLKVSVHILTTYLAVISVLCFWAEQFFWGVAFAIGAALQFLYVISVIDRLPFTMLILRKAVKMVWNLPEVMRLAYAFMLLVLLWMALWSFGAAGVVASSMGDGGRWWLLVVLSVSLFWTGAVLCNTVHVIVSGMVFLVLIHGGREAASMPANSLLKSLQYALTTSFGSICYGSLFTAAIRTLRWKIRGFRSKIGNNECLLCCVDFLFHLVETLVRFFNKYAYVKIAVYGKSFNHSARDAWELFQSTGVEALIAYDCSGAVLLMGIIFGGLITGTCSGVWAWIKWSDRVIMIGSTSMLMGMVLVGVAMVVVESAVTSIYICYAEDPLLIHRWDAEFFNQISETLHQRLQHRSSRAREVLTHHRLDGSVQENAAI 548
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Glsi05g0448 548 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 66 529 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
Glsi05g0448 548 MobiDBLite consensus disorder prediction 55 83 - -
Glsi05g0448 548 Pfam Plasma-membrane choline transporter 206 500 IPR007603 GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Glsi05g0448 Glsi-ChrGlsi05 54106770 54115940 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Glsi05g0448 05 54106770 54115940 Glsi05g0448 05 54106770 54115940 ECH