Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Dere11g1205 ATGGCGGAGACAAGCTCGGGTTCTCAAAGCCCACCTTCTTGCACCATCAATCCCATTGATCACCTTCCACTCCGCCTTCATAGATCCGAGATCGTCGCACCCGCTCCCACTGGTTCCCAATCCACCATCGATTGGCTTCCGGATTTTTCCGGGTATACATGGATCGCTTACGGAGCGGCTTCACTCTTAGTCATCTGCCACTTTCCCTCTCCTCTCTCTGCCGAAGAATCTCGTATTGGTCCCATTTTCCGGCAAGTCTTCGAGCTCTCTGGGGACCCCTCGTCCGTCGTCGCCGCCGTTTCTTGGTCCCCGGAGACGCCGTCAATTGGGGAGCTGGCTGCCGCAGCTGCAAATTGCATCTGGCTTTTCTCCCACGATTCATCTAAGCGTAAAGGTTCTTTTTGTTGGAGCCAGACTGCAGTGCTTGCACATCATATGAAGGTTGAAACTATCAGATGGACGGGATCTGGAGATGGTTTAATATCTGGTGGAATGGAGGTGGTTTTATGGAAAAAGAGCAACAAGTGTTGGGAAATGGCTTGGAAGTTTAAAGCAGATGAACCCCAAACTCTTGTTTGTGCAACCTGGTCTATTGATGGCCCTTCAGCAACTGCGGCACATCCTAGTAAACAACATATTGAAGAGTCTTTAATTAATGAGGTAAGCAAATGCGTGTTAGTATGTCAATGCAATGGACTATCTGAATATTCAAAATCTAAGCTACATCATCCTCTACCTGTAATAATGATTCAATGGAGACCATCAAGAGGTATACTATCAAACAGAAATGGTAGACACTCAGCTAGGCATGTATTACTGACATGCTGCTTAGATGGAACTTTAAGGTTATGGAGTGAGACTGATAATGGAAAGGTCAGGAAAACTGGTAAGGATGCCTATGATCAGAAGAGCATGGGTCATTCTTATTGTGTTGTTGCTGTCATTGAGATTAATCAAACCTTAAATGGAACTCTTGGTTTAGATATATTTGTGACATGGGGAACAGAAAGTGGGGGGATATTTCAAACTGGCGAAGGAGCCAACCGAGTCTTCTCCAAAGAAGGATTTGACCATGAAGTTGGTAAATGTGATTGGCTAGTTGGATTTGGTCCTGGAATGTTGCTTAGCTTTTGGGCTATCCACTGTCTTGATGACCTCTCACCAGTTAGATTTCCCCGAGTTACGTTATGGAAAAGGCATGAACTCCAAGGCTTTGATACAGGAAATGTTTATAGGTTTGACTCATCTGATGTTGGGAAGGTATTACATCTGAATAAAGTCATTTTATTGAGGAACTGCTGGTCGGGTCCACCAGTTATATGCTCACCAGTCCAGTTATTACCGTGTAATTCCTTAATTTGGTCATTTTTCCATACTCATGCATTACATGATGCTGTGGAGAACTCACTTGATACAGCCAACACTAAGAATTTTTCACATTTGAATGGTGGAGTTTTAAATTTGGATGGTCATGTTGGTAGAATTTTAAAGGTTTCTATTCATCCTTGTATATGTGAAGTTCAAATTGCTGCTTCTCTGGATTCTAATGGACTGCTACTTTTTTGGTCACTTTCTAGGATATCAAACTGCACTGTGGGATGTCCAACTTTGATTCCCACTTGGGAACTTTGTGGAAAGCTTGTAACTCAGGACTCTTGTTCCATGTATACAAGCTTGAGGTGGGCACCTTCAGTATTTCATGATGAACAGGTTCTTTTTATGGGACATGCCAGAGGTATTGATTGCTTCATAGTCAAATTTTGTCAAACCGAGGAAGAAAACATAGAATACCACTACTTTTGCACTATACCTTTCAGTGGTCATGGTCCTTATGAGGATGGCCCCACTGATATCTTTGCAATTTCTTTGTGCTCTACTTGTAATAAAACATTTTCTGACAATAAGCTTTTGCTTTTGGCAATTTGGATGCGGGGATTTCAGGCCCTGTCATGGGAAATTACCTTGCACACATTTGACATGTCAACAAGCTATTGTGAATGCCATATTGATGCTAAGAGTCTTGCTGACCACAGTATGTGGGCATTTGAAAGTACTTTTGCTGGTAAAAGATATTGCATTACTGTTGATCCTTGTTCATCCAAGTTTCCAAGTACTCTTGCCAATGATCTAGTTACTAGTTTTGCTGTGGCCTGTCCAGCTACTCTTAGCCAAAGACAACAGAAATTTGGTATTGCCAATGATCTTTATAGTTGTTATCCTGCATATATCCTGGTCACAGGCTGCTCTGACGGCAGCTTGAAACTGTGGAGAAGTAACCCTGGTAACCGATCAGCCTTGCACTTGGAATGGGTGCTTGTGGGTATGTTTGCTGCGCATCAAGGTCCCATCAATGGTATATGTTTGACTGATTGTGGTCAGAAGATTGCTACATTCTGCAACAGTAGTAATTCAAATGCTGTCAGTGCCATCCATATATGGCATGCTGTAAACTTGACCAGTGCAGGGACTTTTATTTTGGAAGATAAGCTAACACTTGATAGTGATGTTATTACTCTAAAATGGTTAACTTTAGGTACTGGTCAGTTATTGCTTGGAGTTTGCTTGCAAAATGAATTGAAAGTATATTCTCAGAGACGTTATGATGGTCTGACTATGTTAAACTCTGGAAACTTTTCCAAAATGAATATATGGGTTTGCATTGCATCTGCTCACACTTCCCTTCCCATTTATGATTTCTTATGGGGGCCCAAAGCCACAGCAGTGGTAGTTCATAGAAATTACTTTAGTATATTTGGTCACTGGTTGTTCCATGTGGATAAAAGGCAACAGAGTAATTTTCATTCATGTAATTCGAAGGCAAATCTCTATGATTGCGAGGGTGATATATTTGGAGGCCTGCTCTCTGCAGTTTTCTTTGATGGTGACATTGGTACGTTCAAAGAGTTGTCAATTAGGGATCATAGTGGAGACTCTGAGTATATGCAGCCTATCAAAAGTAATATTAAGGACAGTGAGCCTTATAGTAGCTTCTTTCTAGCCAAGGCTCAATTAGAAGCTCAACTTAGCACCTACACTGGGTTGTGGAGCATCTTTGAAGTTGTGGAGAAATTAAGTGGATCCTTGCCTTTTTATCACCCTGATATACTTCTTATTAATATAAGTTCAGGCAACTGGAAACGTGCATATGTGGCTCTGAGGCATCTTTTTGAATTTATGACTTCTAATAATGCTCCTGAAGAGAGTTACATCTCCAAAAGAAGTCCTCCTGAGATCTTATTGTCAAACTATTTAGAGGGACTTATTTCAAAATGTTCCCAAGATAAGGGATTTCAATGGAGTGGGGACGCTGCGATTGCATCAGTTTCACTGTCTCAAAGTAGCTTTACGCAGTTCCCATATCATTCAGGTTCCACTGCTGAAAATTCATCCTCAACAGGGTCTGAGCTTAACGGCTTTATTGAATCTCTTGAAAATTTGCCTGACTTAGCAGCTATGTTCAACATAAGAAAGACAGAGATTCTTGCAGTTATTGATCTGCTCAGTGAAGTTAATAGTTCACAGTTGTCTTCTGCGTATCAAAGTCTTGATGAACCTGGACGAAGGTTTTGGGTTGGATTAAGGTTTCAGCAACTACTTTTTGTCCGGACTTTTGGTAGAGTTGCATCTGTTGAAGAGTTGATTGTTAACTCAAAGTTGTTTGTATGGGCTTATCACTCTGACTGCCAAGAAAACTTATTTGGTTCTGTCATACCTAATGAACTGTCTTGGCAAGAAATGCGAGCTTTGGGTATTGGCTTTTGGTTTGCTAATGTAACTCAACTGCGTACAAGGATGGAGAAACTGGCAAGAGCACAGTATTTGAAGAACAAAAATCCTAAGGATTGTGCACTACTGTATATCGCACTAAACAGAAATCAAGTATTGGCTGGCCTTTTCAAAATTAGTAAGGATGAGAAGGACAAACCTTTGGTGGGATTTCTTTCTCGCAATTTTCAGGATGAGAAAAATAAAGCAGCTGCTTTAAAAAATGCTTATGTCTTGTTGGGGAAGCATCAGCTGGAACTGGCTATTGCTTTCTTCTTGCTGGGTGGTGATAATGCTTCTGCAATAAATATTTGTGCAAAAAACCTTGGAGACGAACAACTTGCACTAGTTATATGTCGACTAGTTGAGGGCCATGGTGGACCATTGGAGCGTCACCTAATAACGAAGTATATACGTCCATCTGCAATTGAAAGGGGAGACTACTGGCTTGCAAGCCTGCTAGAGTGGGAAATGGGTAATTACTATCAATCTTTCCAGAGAATGCTAGATGTTTCAATAAATCCTGTGGCTCAGGACTCCATTGTTGTCTCCAATTGTGGTCCATTTTTGGACCCAAATGTTGGCTTTTATTGCCAAATGCTAGCAACAAGGAATAGCATAAAGAATGCTGTAGGGGAGCAAAATTCTGCCATCCTTCTAAGATGGGCTACTTTGATGACAGCTACTGCCCTAAATAGATGTGGTACTCCTCTTGAAGCATTGGAGTGTTTTGCATCTTCGCTGAGCATGCTTGGGACTGCAGATCAAGGGAGTGAGTTAAATGCTGGACATGAGGTGCTGTCTAATAATTTTAATCCTTTGCCAAGAAAATCTGCTAACTGGCTTTCTGCTGATGTGTCTGTGCATTTGGAGTTTCATACTAAATTGAACTTGGCACTTCAGTACTTATCAAAATTGATAAGAGAGCATCCAAGTTGGCCATACAATGTTGCAGGATCCTATGGCAAAGTTGCATATTCTGATGAGTACATTATGCAATATGACAAATCACTTGAAAATCTAAGGCATAAATTGTACACTGGGCTTGCTCTGTTTGAACAGAGGTTCTTACTGGCTCCATCCTGTTTACTAGGAATGATTTTACTCTCACTTTGCCATCAAGGATTATTGAACATAGGATATGATATAGCATATGGATGTGCTTCAGGAGATCAATCTCAAAAGAACAGTGATATAGTTGACGCTTCTATATTGTATCACTCCTGGCTTAGACCTCTCTATAAGACTACAATAGAAGTCTCTTATTTCTTTTCAAGATTTATTTCTGCCTGCAGTATGGATTATTCTCAAAAAAGTTTAACTTTTTCTGAGAAGGGTGCATATATTGAAAGTAGATTGAAGTTGTCAAATGCTTGGCAGTCTCACTTTGTTGAAGGTCTTCTGATTTTACTTTGGTATTTAAGATCCATTTTAAGGATCCGGGCTGATTCTTTCAGCAAAAATCTTATGACCAAAACTCTTGATATTGTTAATTTGTTCGAGTATTATTTGCACTTTTCATTAGCCTGGCTTCAAAAAAACCCAGAGGCTCTTCTTTTAATGGTTCAACCTTTCTTGATTGCACATGCCAATGGCCATAATCCTTGTGAGGTTGATATGATCAATCTGAAGAAACTTATACCTAAAGTTGTGGAATTGGTGGTTCACTATTCTCCGGTAGACAATACATCAAGAAGTGGACATGATATAAAAGTTGCAGATGTAAAGCAATCGATTCCTGATGATGAAAAATGGATGATTTTGGGGGCCTGCTTGTGGCAGCACATGTCTAGATTCATAATATATAATTTGAATATGGTTCTGGATACACTTGAAGATCATAATTTGTCTGGTTCTTTCCATAGAAAATATGATTGTAGGGCATCAACTCTCCTGGCTCTGGATTCTGATAGTATCAATTTGCCAGAGCAGATTAGGTTGGTCTCATTGAGCTTATGTGAGTTACTGAAGACAACGGTTACACATAGTTCCTCTTATCATAATAAACAACTTGCAGCATTTCTCTGGCAGAAATTGGAAAATGATTTGAGCACAATGACTCTTGAGTGGTTAAAAAGACCTAGTGTGTCAGAATCCAATCAGGATCTAAGTCAAGAGATTACTAATTTGGAATTGGTGAACACGAAAGATAAATACTTGGTCTTTCAACTGCTATGGGATCACTGTGCTGATCCAAAATTGATATCTGACTGCTTTGCACAGGAAAAACTTGATTGTTCAAATTATTTGGATCATTTGCCTACTAAAGGGTGGAATGGCGTGTATATAAATTTGACAGGGCTACATAAATCTGATGATACACATGATAATGGATGTAAAGTTAGCAATGGTTCTTCTAGTCATGAAGTTGGATCACCTGTTAAAAGAACGTTTCAAGGTGCCCATGCTTCTATAAGTTCCCACCAGAATAATACAACTAGTAGAAATATTCCACTTTTCCAGAGTCCCAGAGAAATACACAAAAGAAATGGGGAACTAGTGGAGGCATTGTGTATAAACTCTACTGATCAACAGGAAGCTGCACTTGCTAGCAATCGGAAGGGCATAATATTCTTTCATCTGGATGACGGGATTCCTTCTGGTGATAAATCAGTTCATTTGTGGTCTGAGGCTGATTGGCCACAAAATGGGTGGGCAGGTTCAGAATCCACCCCAGCTCCAACATGTGTTTCTCCTGGTGTTGGTCTTGGGAGCAAGAAAGGGGCACACCTTGGGCTGGGTGGAGCAACTGTTGGTGTGGGTTTTTCAGCAAGGCCTGGCAGAGACTTAACTGTAGGTGGAGCTTTTGGAATTCCAGGATATGCTGGTATTGGTGCCTCTAGATTAGGTTGGGAAATTCAACAGGACTTTGAAGATTTAGTTGATCCACCGGCCACTGTGGAAAACATAAGTACAAGGGCTTTGTCTAGTCATCCATTGAGGCCTTTCTTCTTGGTTGGTTCAAGCAATACACATATTTACTTGTGGGAGTTCAATAAGGATAAAGCTACAGCTACATATGGAGTTCTGCCTGCTGCTAATGTGCCTCCACCTTATGCTCTCGCATCTGTATCAGCTTTACAGTTTGACCACTGTGGACACCGATTTGCTAGTGCGGCATTAGATGGAACTGTCTGCACATGGCAGCTGGAGGTAGGAGGAAGGAGCAATATTCGTCCGACTGAATCATCCCTATGCTTCAATGGTCATGCATCGGATGTCACTTACTTTTCTTCCAGCGGATCAATAATAGCTGTGGCTGGATATAGCTCAAATAATTTCAATGTGGTTATATGGGATACTCTCGCTCCCCCTACAACTTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCACGAAGGTGGTGCTCGCTCCCTTTCTGTATTTGATAACGATGTAGGAAGTGGTTCTATTTCCCCGTTCATTGTGACTGGTGGAAAAAGTGGTGATGTTGGAATTCATGACTTCCGTTATATAGCTACTGGAAAAGCTAAAAGGCACAGGTATGCTTATAATGTTGAACAAAGCTCCAGCACGTCTTTGAATTCTGACAAGGACAAGAATGTAAATGGAATGCTTTGGTATATTCCAAAGGCTCACTCAGGGAGCATCACAAAAATAGCTACCATCCCAGATACCAGCTTGTTTTTGACCGGAAGTAAGGATGGAGATGTCAAACTCTGGGATGTCAAGAGCACTAAGTTAGTCTGTCAATGGTCAAAATTGCATGAAAAGCACACCTTTCTGCAGCCAAGCTCTCGTGGATTTGGCAGTGTTGTTCGGGCTGCTGTTACGGACATACAAGTCGTTTCACATGGTTTTCTTACATGTGGTGGGGATGGAACTGTAAAGTTGGTACCCCTGAATAGGCAAGTGCTTGGGCATGAAGTTAAACTATGA 7653 0.4102 MAETSSGSQSPPSCTINPIDHLPLRLHRSEIVAPAPTGSQSTIDWLPDFSGYTWIAYGAASLLVICHFPSPLSAEESRIGPIFRQVFELSGDPSSVVAAVSWSPETPSIGELAAAAANCIWLFSHDSSKRKGSFCWSQTAVLAHHMKVETIRWTGSGDGLISGGMEVVLWKKSNKCWEMAWKFKADEPQTLVCATWSIDGPSATAAHPSKQHIEESLINEVSKCVLVCQCNGLSEYSKSKLHHPLPVIMIQWRPSRGILSNRNGRHSARHVLLTCCLDGTLRLWSETDNGKVRKTGKDAYDQKSMGHSYCVVAVIEINQTLNGTLGLDIFVTWGTESGGIFQTGEGANRVFSKEGFDHEVGKCDWLVGFGPGMLLSFWAIHCLDDLSPVRFPRVTLWKRHELQGFDTGNVYRFDSSDVGKVLHLNKVILLRNCWSGPPVICSPVQLLPCNSLIWSFFHTHALHDAVENSLDTANTKNFSHLNGGVLNLDGHVGRILKVSIHPCICEVQIAASLDSNGLLLFWSLSRISNCTVGCPTLIPTWELCGKLVTQDSCSMYTSLRWAPSVFHDEQVLFMGHARGIDCFIVKFCQTEEENIEYHYFCTIPFSGHGPYEDGPTDIFAISLCSTCNKTFSDNKLLLLAIWMRGFQALSWEITLHTFDMSTSYCECHIDAKSLADHSMWAFESTFAGKRYCITVDPCSSKFPSTLANDLVTSFAVACPATLSQRQQKFGIANDLYSCYPAYILVTGCSDGSLKLWRSNPGNRSALHLEWVLVGMFAAHQGPINGICLTDCGQKIATFCNSSNSNAVSAIHIWHAVNLTSAGTFILEDKLTLDSDVITLKWLTLGTGQLLLGVCLQNELKVYSQRRYDGLTMLNSGNFSKMNIWVCIASAHTSLPIYDFLWGPKATAVVVHRNYFSIFGHWLFHVDKRQQSNFHSCNSKANLYDCEGDIFGGLLSAVFFDGDIGTFKELSIRDHSGDSEYMQPIKSNIKDSEPYSSFFLAKAQLEAQLSTYTGLWSIFEVVEKLSGSLPFYHPDILLINISSGNWKRAYVALRHLFEFMTSNNAPEESYISKRSPPEILLSNYLEGLISKCSQDKGFQWSGDAAIASVSLSQSSFTQFPYHSGSTAENSSSTGSELNGFIESLENLPDLAAMFNIRKTEILAVIDLLSEVNSSQLSSAYQSLDEPGRRFWVGLRFQQLLFVRTFGRVASVEELIVNSKLFVWAYHSDCQENLFGSVIPNELSWQEMRALGIGFWFANVTQLRTRMEKLARAQYLKNKNPKDCALLYIALNRNQVLAGLFKISKDEKDKPLVGFLSRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGKHQLELAIAFFLLGGDNASAINICAKNLGDEQLALVICRLVEGHGGPLERHLITKYIRPSAIERGDYWLASLLEWEMGNYYQSFQRMLDVSINPVAQDSIVVSNCGPFLDPNVGFYCQMLATRNSIKNAVGEQNSAILLRWATLMTATALNRCGTPLEALECFASSLSMLGTADQGSELNAGHEVLSNNFNPLPRKSANWLSADVSVHLEFHTKLNLALQYLSKLIREHPSWPYNVAGSYGKVAYSDEYIMQYDKSLENLRHKLYTGLALFEQRFLLAPSCLLGMILLSLCHQGLLNIGYDIAYGCASGDQSQKNSDIVDASILYHSWLRPLYKTTIEVSYFFSRFISACSMDYSQKSLTFSEKGAYIESRLKLSNAWQSHFVEGLLILLWYLRSILRIRADSFSKNLMTKTLDIVNLFEYYLHFSLAWLQKNPEALLLMVQPFLIAHANGHNPCEVDMINLKKLIPKVVELVVHYSPVDNTSRSGHDIKVADVKQSIPDDEKWMILGACLWQHMSRFIIYNLNMVLDTLEDHNLSGSFHRKYDCRASTLLALDSDSINLPEQIRLVSLSLCELLKTTVTHSSSYHNKQLAAFLWQKLENDLSTMTLEWLKRPSVSESNQDLSQEITNLELVNTKDKYLVFQLLWDHCADPKLISDCFAQEKLDCSNYLDHLPTKGWNGVYINLTGLHKSDDTHDNGCKVSNGSSSHEVGSPVKRTFQGAHASISSHQNNTTSRNIPLFQSPREIHKRNGELVEALCINSTDQQEAALASNRKGIIFFHLDDGIPSGDKSVHLWSEADWPQNGWAGSESTPAPTCVSPGVGLGSKKGAHLGLGGATVGVGFSARPGRDLTVGGAFGIPGYAGIGASRLGWEIQQDFEDLVDPPATVENISTRALSSHPLRPFFLVGSSNTHIYLWEFNKDKATATYGVLPAANVPPPYALASVSALQFDHCGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNIRPTESSLCFNGHASDVTYFSSSGSIIAVAGYSSNNFNVVIWDTLAPPTTSRASILCHEGGARSLSVFDNDVGSGSISPFIVTGGKSGDVGIHDFRYIATGKAKRHRYAYNVEQSSSTSLNSDKDKNVNGMLWYIPKAHSGSITKIATIPDTSLFLTGSKDGDVKLWDVKSTKLVCQWSKLHEKHTFLQPSSRGFGSVVRAAVTDIQVVSHGFLTCGGDGTVKLVPLNRQVLGHEVKL 2550
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Dere11g1205 2550 Gene3D - 2223 2529 IPR015943 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 2228 2536 IPR036322 GO:0005515
Dere11g1205 2550 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 28 2539 - -
Dere11g1205 2550 FunFam Transducin family protein / WD-40 repeat family protein 2221 2498 - -
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 234 285 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 135 171 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 82 124 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 2441 2480 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 2315 2355 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 769 814 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 481 523 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 699 757 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 2215 2252 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 2492 2538 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 2360 2406 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SMART WD40_4 2269 2304 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 Gene3D - 38 371 IPR015943 GO:0005515
Dere11g1205 2550 Pfam WD domain, G-beta repeat 2448 2480 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 95 862 IPR036322 GO:0005515
Dere11g1205 2550 Gene3D - 556 914 IPR015943 GO:0005515
Dere11g1205 2550 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2448 2489 IPR001680 GO:0005515
Dere11g1205 2550 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2448 2483 - -
Dere11g1205 2550 Pfam RAVE protein 1 C terminal 821 1434 IPR022033 -
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Dere11g1205 11 23153159 23173242 Dere11g1205 11 23153159 23173242 ECH