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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Dere08g0570 ATGGAGTCGATACTGGCAAGAGCTTTGGAGTACACCCTTAAGTACTGGCTAAAATCCTTTTCCAGAGATCAGTTCAAGTTGCAGGGTCGGACAGTGCAGCTTTCAAATTTAGATATAAACGGGGATGCATTGCATTCAAGCATTGGATTGCCACCGGCGCTGAATGTAGCAACAGCTAAAGTCGGAAAATTGGAGATAATGCTTCCTTCGGTAAGCAATGTACAAATTGAGCCAATCATTGTGCAAATTGATAGACTTGATTTGGTTCTTGAGGAGAATTCTGATTTTTGTGCATCAGAAACTCCAAAGAGTACTACACCATCTACTCCCGCCAATAAGGGTAGCGGTTATGGTTTTGCTGACAAGATTGCAGATGGAATGACTATACAGATTCATACAGTTAATTTGCTACTTGAAACTCGAGGGGGTGCTTGCCGCCAAGGGGGAGCAACATGGGCACCTCCTATGGCATCTATCACCATCCGTAACCTTTTGCTGTACACCACAAACGAGAACTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAAGCACGGGAATTCTCCAATAACAAGTACATATACGTGTTCAAAAAACTTGAGTGGGGATCTTTGTCTATTGATCTATTGCCACATCCTGACATGTTCACGGATGCTACTTTAGGCTGCTCTCGCGAGGGAGCGAACCTGAGAGATGAAGATGGTGCAAAGCGAGTTTTCTTTGGAGGCGAGCGCTTTATTGAAGGAATTGTGGGAGAAGCATATATCACAATTCAGAGGACTGAATTAAACAGCCCACTTGGGCTTGAGGTTCAATTGCACATTACCGAAGCCGTTTGCCCTGCATTGAGTGAACCAGGACTACGTGCTCTTCTCCGCTTTATGACGGGAATATATGTCTGTCTAAACAGGGGAGATGTTGGTTCTAATGCTCTGCAGAAATCCACAGAAGCAGCTGGGCGTTCTCTTGTTTCTATTGTTGTGGACCATATATTTCTCTGCATTAAAGATACTGAATTCCAGCTTGAGCTTTTAATGCAGTCTCTCTTTTTTAATCGGGCCAGTGTTTCTGAAGGAGGGAATGACAATAACTTGACCAGGATTACGATTGGTGGACTATTTCTGAGAGACACGTTTTCAAGCCCTCCATGTACCTTAGTGCAACCATCAATGCAAACTATCACTAGAGATGCTTTCCATGTACCAGAATTTGCTAGAAGTTTCTGCCCTCCAATATATCCCTTAGGTGATCAGCAGTGGCAACTGATTGGGGGAACTCCTCTAATATGCCTCCACTCCCTTCAGATCAAGCCTTCTCCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTCAAACAGTTGTTGACTGTCAGCCTCTTCTGATTCATCTGCAGGAAGAATCCTGCTTGAGGATATCTTCTTTCTTGACTGATGGTATTATTGTCAATCCTGGTGACATTTTGCCTGATTTTTCAGTGAATTCTTTCATTTTCTGTCTCAAGGCACTAGATGTTACAGTTCCTTTGGATAAGGCCAAATTGGATATGTGTAAGAGCAACACACACAATACAGTTCAGAGCTCCTTCAGTGGAACAAGGCTTCATATTGAAAGCCTTACCTTTATAGTTTCACCCTCTTTGAAACTAAAAATGCTAAACCTGGAGAAGGATCCTGCTTGCTTCTGTCTCTGGGAAGATCAACCAATTGATGCTAGCCAGAAGAAATGGACTGCTAAAGCATCACATCTTACTTTGTCTCTGGAAGCATGTGCTGGTACAAATAGAGATCAGAGATCTCTTGAATGGACTGCAGGATTGTGGAGATGTGTAGACCTGAAGGATGCTTGCATTGAAGTAGCTATGGCAACTGCTGATGGCCATCCATTAATAAAAGTTCCTCCTCCTGGGGGTATCGTTAGAATTGGAATTGCTTGTGAACAGTATATATCTAACACCTCTGTTGAACAATTATTTTTTGTCCTGGATCTCTATGATTATTTTGGGAGAGTTAGTGAGAAAATAGCAGTAGCTGGAAAAAGTAACCGATTGGAGAATGTTAGGGACAAATCTTTTAGTGGAAAGCTGATAGACAAGGTTCCTAGTGACACTGCTGTAAGCTTAGCAGTGAAAGACCTCCAACTTCGATTTCTTGAGCCAACTTCAATGAATGTTGAGGGAATGCCATTAGTACAATTTGTTGGAGATGATCTGTTCATAAGTGCAACTCATAGAACACTTGGTGGTGCTATTGTTGTTTCATCCACTTTACACTGGGAAAGTGTTGAAATAGATTGTGTGGATGCTGAGGGGCACTTGGCGAATGAAAACAGCTTATTATTGAATTCTGCTGAAAATGTTCCCTCAATGAGTGATAATAGAAACCTTCAACTAAGAGCTGTTTTCTGGGTGCATAATAAGGAGAGCCATATATCAAATGAAAATTCTCAGTCAGTTCCTTTTCTGGACATAAGCACGGTGCATGTCATACCATTATATGAACAAGACATGGAGTCTCATAGTTTGAAAGTCTCAGCTTCTGTTTCTGGTGTTCGTCTTGGTGGTGGAATGAACTATGCTGAAACCCTCCTGCATCGATTTGGAATACTTGAACCTGATGGTGGTCCTGGAAAGGGACTTTGTAAAGGGCTAGAAAACTTACAGACAGGACCATTGTCAAAACTTTTTAAGACAACACCTCTCATCATTGATAATTCGGAAAATGACGAAGGTATGCTAGAGGGTAAAGAAACAGGTTTTCCACACTTGAAGCAGCCAGATGATGTGGATGTAGTTATTGAATTGAAAGACTGGTTATTTGCTCTTGAAGATGCTCAAGAGATGGCTGACAGGTGGCGGTTCTCCAGCCATGAAGATGTTAGCAGAGAAGAAAGGTGTTGGCATGCGACTTTTTGTGGTCTACGAGTAAATGCAAAAAGTAACCCAAAGAATGTTCCATATGGAAAAGCAGAATCATGTAGAATACAACAGTATCCTGTAGATCTGGTTACGGTTGGAGTTCGAGGGTTGCAGATCTTGAAGCCTCATATCCAAAAAGGCAATCCTTCATTGGAGTTAATGGCAAATGGCTTTAAAGACTTCATTGACACAGTTGGGGGAGTTGATCTTGAAGTTCGTTTGGTATTATGTGAAAATAATGTTGATGATGACATGGCTAAGTGGGTGGTGGAAAACCTGAAATTCTCTGTTAAACAACCGATTGAGGCGGTTGTAACCAAGGATGAGCTTCAGCACCTCACTCTTTTGTGCAAATCTGAAATTGACTCAATGGGCCGGATAACAGCTGGAATTCTACGACTGTTTAAGCTAGAAGCTTCTGTTGGCCAGTCCGTAATTGATCAATTAAGCAACCTAGGAACTGAAGGCATTGACAAGATTTTCTCTCCACAAAAGCTGGGTTTAGATGGTAGCATTGGTGGTATGGGACTTTCTCCATCACCAAACCTCATAAATGAAAGCCCAAGCAAATCAATGGAACCAACATTAACTTTGCTGGAAGAAGCAGTTTTGGATTCACAAGCCAAGCTCAATGCTTTGATCACTGACGTTGCTACTTCACAGGCTCCCTTTCAGCACCTTCCTGCCGTCAAACAACTCTGTCAAAAGATTGAGACTATGCAAGATTTATTGGCTCAATTACGGAATCAACATTAA 3648 0.4205 MESILARALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHSSIGLPPALNVATAKVGKLEIMLPSVSNVQIEPIIVQIDRLDLVLEENSDFCASETPKSTTPSTPANKGSGYGFADKIADGMTIQIHTVNLLLETRGGACRQGGATWAPPMASITIRNLLLYTTNENWQVVNLKEAREFSNNKYIYVFKKLEWGSLSIDLLPHPDMFTDATLGCSREGANLRDEDGAKRVFFGGERFIEGIVGEAYITIQRTELNSPLGLEVQLHITEAVCPALSEPGLRALLRFMTGIYVCLNRGDVGSNALQKSTEAAGRSLVSIVVDHIFLCIKDTEFQLELLMQSLFFNRASVSEGGNDNNLTRITIGGLFLRDTFSSPPCTLVQPSMQTITRDAFHVPEFARSFCPPIYPLGDQQWQLIGGTPLICLHSLQIKPSPLPPSFASQTVVDCQPLLIHLQEESCLRISSFLTDGIIVNPGDILPDFSVNSFIFCLKALDVTVPLDKAKLDMCKSNTHNTVQSSFSGTRLHIESLTFIVSPSLKLKMLNLEKDPACFCLWEDQPIDASQKKWTAKASHLTLSLEACAGTNRDQRSLEWTAGLWRCVDLKDACIEVAMATADGHPLIKVPPPGGIVRIGIACEQYISNTSVEQLFFVLDLYDYFGRVSEKIAVAGKSNRLENVRDKSFSGKLIDKVPSDTAVSLAVKDLQLRFLEPTSMNVEGMPLVQFVGDDLFISATHRTLGGAIVVSSTLHWESVEIDCVDAEGHLANENSLLLNSAENVPSMSDNRNLQLRAVFWVHNKESHISNENSQSVPFLDISTVHVIPLYEQDMESHSLKVSASVSGVRLGGGMNYAETLLHRFGILEPDGGPGKGLCKGLENLQTGPLSKLFKTTPLIIDNSENDEGMLEGKETGFPHLKQPDDVDVVIELKDWLFALEDAQEMADRWRFSSHEDVSREERCWHATFCGLRVNAKSNPKNVPYGKAESCRIQQYPVDLVTVGVRGLQILKPHIQKGNPSLELMANGFKDFIDTVGGVDLEVRLVLCENNVDDDMAKWVVENLKFSVKQPIEAVVTKDELQHLTLLCKSEIDSMGRITAGILRLFKLEASVGQSVIDQLSNLGTEGIDKIFSPQKLGLDGSIGGMGLSPSPNLINESPSKSMEPTLTLLEEAVLDSQAKLNALITDVATSQAPFQHLPAVKQLCQKIETMQDLLAQLRNQH 1215
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Dere08g0570 1215 Coils Coil 1194 1214 - -
Dere08g0570 1215 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 98 IPR026854 -
Dere08g0570 1215 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1213 IPR026728 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Dere08g0570 Dere-ChrDere08 8725414 8738633 Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Dere08g0570 08 8725414 8738633 Dere08g0570 08 8725414 8738633 ECH