Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Dere01g2794 ATGGCTTCCGGCAGCTCAATTCCTGCACCTGAGGCCGTCCAGGTGCTGGTGTCGTTACTAGCCGATGATTCTTCCGCCGTCAGGGAGGCTTCCATGGCCTCTCTCAAAGACATTGCTACTCTGAATCCTCTTTTAGTTCTCGACTGCTGTGCGGCCATTTCACGAGGAGGACGTCGGCGATTTGGAAACATGGCCGGTGTTTTTCAAGTGATGGCATTTGGAGTTCGCTCTCTGGACGAAAGAGAAGTCGATGATAATTTTATGGCAAAGCTTGCTAAGATTGCTACAGCTGAAATGATATCCTCTAAGGAAATCAATTCTGATTGGCAACGAGCAGCAACAGGTCTACTTGTTGCAATTGGTTCTCATCTACCTGATCTAATGATGGAAGAAATTTTTCTTCATTTATCTGGGCCAAATTCAGCATTACTGGCTATGGTCCAAATTCTTGCAGAGTTTGCTTCTACTGATCCATTGCAGTTTATTCCTCGGTGGAAAGGTGTACTTTCACGAATTCTGCCGATTCTTGGAAATGTGCGAGATGTGAATCGGCCAATTTTTGCAAATGCATTTAAGTGTTGGTGTCAAGCTGCTTGGCAATATAGTATGGATTTTCCTTCGCGTTCACCCCTTGATGGTGATATCATGTCATTTTTAAATTCTGCTTTTGAGCTTTTGCTGAGAGTTTGGTCAACTTCACGGGATCTAAGGGTTCGTGTAGCATCTGTGGAAGCCCTGGGTCAGATGGTTGGTCTCATAACACGAACACAACTAAAAGCAGCTTTACCAAGGCTTGTTCCTACAATATTGGATTTATACAAGAAAGATCAAGATATTTCTTTTCTGGCAACACAAAGTCTTCACAGTGTCTTAAATGCTTCTCTTTTGTCAGAAAGTGGCCCTCCTATGATTGATTTTGAGGAAGTTACTCCTGTTCTGTCAACACTTCTTTTGGTGGTTTGTATAAATATTGAAGGCAAAGAACAATCAGACTTCTCTACATATAATGAGGTGCAGCATTGCTTTCTGACAGTTGGCTTGGTGTATCCAGATGATTTATTTGTGTTTCTTGTAAATAAATGTAGGTTGAGGGAAGAACCATTGACCTTTAGTGCACTTTGTGTTCTAAAGCATCTTTTGCCCAGGTTGTTGGAAGTTTGGCACAATAAAAGGCCTCTGCTTGTTGAGGCTGTAAAATCCTTGTTTGATGAGGGGAATTTAGGTGTTCAAAAGGCACTTTCAGAGTTGATTGTGGTCATGGCTTCGCACTGTTTCTTGGTTGGTTCATCGGGTGAGTTGTTCATTGAATATCTTGTACGCCATTGTGCTCTGACAGATCAAAATTGGGGTGATATTGAGAGCAGTCATAATAAGAGATTTGAGATGAAAATTGGAACTGTTACTTCAGGGGACTTAAGAGCAATTTGTGAGAAAGGCCTTCTGTTGGTAACTATTACAGTTCCTGAAATGGAGCACATTCTTTGGCCTTTTCTGTTGAAGATGATTATTCCACAGCCCTATACCAGTGCTGTTGCCACGGTTTGCAGGTGCATCTCAGAATTGTGGCGGCATAGATCTTATGGCAATGATATGTTGAGTGAGTGTAAAGGCCGTGCTGATATACCAGCTGTTGAGGACCTTTTTGCTCGTTTGGTGGTGCTTTTGCATGATCCTCTGGCGAGGGAGCAGTTGGCTACTCATATTTTGACTGTTCTTTGTCTTCTCGCACCTTTGTTTCCGAAAAACATAAATTTGTTGTGGCAAGATGAGATTCCAAAGATGAAGGCATATGTTAGTGATACAGAAGACTTGAAACAGGATCTATCATATCAGGACACTTGGGATGACATGATAATCAATTTTCTTGCTGAATCTTTGGATGTCATTCAAGATTCAGATTGGATCATGTCTCTTGGTAATGTTATTACCAAACATTATGAACTTTATGCATCTGATGATGAACATGCTGCACTTCTTCACAGGTGCTTGGGGATGCTTCTTCAAAAGGTTAACGACAGAGCTTATGTTCGTGATAAAATAGATTGGATGTATAAGCAAGCGAACATTGCTATTCCAACAAATAGGCTCGGGTTGGCTAAAGCAATGGGATTGGTTGCTGCATCTCACTTGGATACTGTTTTGGAGAAGCTGAAGGATATTCTGGATAATGTTGGACAAAGCATATTTAATAGGATACTGTCATTCTTCTCTGATAGTTGTAGAACAGAAGAGTCTGATGACATACATGCTGCTTTGGCTCTAATGTATGGATACGCTGCAAAGTATGCCCCATCAACTGTCATTGAAGCCAGAATAAATGCCCTTATTGGGACTAACATGCTCTCAAGGCTTCTACATGTCCGCAACCCCAGGGCAAAGCAGGCTGTCATCACAGCAATTGATTTATTAGGTAATGCTGTTATTAATGCTGCCGAAAGTGGTGCACCATTTCCATTGAAGCGGAGGGACCAATTGCTTGATTATATATTAACTTTAATGGGTCGAGATGACAATGATGGCTTTTGTGATTACAATGAACTTTTGCGTACTCAGGCCCTTGCTTTAAGTGCCTGCACTACATTGGTCTCTGTAGAGCCCAAACTAACAGTTGAAACTAGAAACCATGTAATGAAGGCCACGTTAGGGTTCTTTGCTGTACCAAATGATCCAGTAGATATTGTCGACTCCCTTATAGACAACCTGATCACTCTTTTATGTGCGATTCTTCTCAGTAGTGGAGAGGATGGAAGAAGTCGGGCGGAGCTTCTACTGCATATTCTGAGACAAATTGATCAATTTATATCTTCCCCTGTTGAGTATCAAAGGAAAAGAGGTTGTCTTGCTGTCCATGAGATGCTTCTCAAATTTCGGATGGTTTGTGCTGGTGGGTATTGTGCAGTAGGTTGCCGTGGGATTTGCACACATAACAAGCAGATTGACCGTACTCTATATGGAAACTTTTCAAAGCTTCCAACTGCATTTGTATTGCCAAGCCGTGAAGCTTTGTGTTTGGGAGATAGGATAATAATGTATCTTCCACGTTGTGTCGACACAATTTCTGAAGTTAGGAAATTATCCGCTCAAATTCTTGATCAACTCTTCAGCATCTCTCTCTCTCTTCCACGGCCTGCAGCTTCTTCTATAACTTCTGAAGATATTGAATTGTCCTATGGTGCATTGTCTTCTCTAGAGGATGTTATAGCCATATTAAGGAATGATACTTCCATTGATCCATCAGAAGTTTTCAACAGGATTGTGTCCTCAGTCTGCATTTTGTTGACCAAGGATGAGTTGGTAGCTACACTACATAATTGCTCAGTAGCAATTTGTGATAAGATCAAGCAGTCAGCTGAAGGAGCTATTCAAGCTGTTATTGAGTTTGTTACAAAGAGAGGGAATGAGCTGAGTGAGATTGATATCTTAAGGACAACCCAATCCCTGATCTCTGCCGCAGTTTATGTAACTGATAAGCATCTGCGTTTGGAATCTCTGGGTGCTATATCTTCTATGGCTGAAAACACTAGCCCAAAAATTGTTTTTGATGAGGTCCTAGCTACTGCTGCAAGGGATATAGTCACAAAGGACATATCTAGGCTCCGTGGTGGCTGGCCCATGCAAGATGCATTCTATGCATTTTCTCAGCACATGGTGCTGTCAACGTCATTTCTAGAACATGTTATATCTGTCCTTAGCCAGGCTTCTATCCCTAAAGGTGATTTGGACAGAATTGAGGATAGCCATGTTGACAGCCAGACAGCAGATGGCTTGCTGCAAGCTGCAATATTAGCTCTTACTGCTTTCTTTAGAGGTGGGGGGAAGGTTGGGAAAAGGTCTGTTGAACAAAACTATGCCTCCGTTATATCTGAGCTAACGCTGCAACTTGGAAGCTGTCATGGTCTAGCTAACTCTGGTCAGCAGGAACCATTGCGGGGTCTACTCACTGCATTTCAAGCTTTCTGTGAATGTGTTGGTGATCTTGAGATGGGCAAGATTTTGGCTAGAGATGGAGAACTATCTGAAAATGAGAGGTGGATTAATCTCATTGGAGACGTAGCAGGTTGCATATCTATAAAGAGGCCAAAAGAGGTACAAAGTATTTGTCTATTTTTGTCAAAATCATTGGATCGACCACATAAATTACAGCGGGAAGCTGCAGCTGCAGCATTGTCAGAATTTGTCTGCTATAGTGGTGGAGTTAAATCATTATTGGAGCACATGATTGAGGTTTTATGTCGGCATGTATTTGATGAGTCTTCAACTGTTCGACGCTTATGTTTGAGAGGGCTAGTAAAGACTCCGTCAATTCGTATTCTGGAATATTCAACTCAAGCCTTGGGTGTCATATTAGCTCTGCTGGATGATTCTGATGAATCTGTGCAATTAACTGCTGTGTCATGTTTACTGATGATCGTTGAGTCTTCACCTAGTGATGCAGTTGAGCCCATTTTGCTTAATCTTTCATTACGACTTCGAAATCTTCAGGCAAGCATGAATGCAAAGATGCGAGCTAGTTCTTTCGCAGCATTTGGGATGCTAAGCAATTATGGAGGTGGAGCACAAAAGGAGGCATTTCTTGAGCAGGTACATGCTGCCGTTCCTCGCCTTGTTTTGCATCTGCACGATGAAGATTTTAGCGTCAGGCAGGCCTGTCGGAACACCATGAGGCGGGTTTGCCCATTGATGGAAATTGAAGAATTGCTTGCCCCGTTCAACACACATTGTTTCCTTTCTGATCACCGGAGTAACTATGAGGACTTCCTTAGAGACGTCGCCAAACATTTTATTCAGCATCTACCCTCCAGAGTTGATAATTATATGGCATCAACAGTGCAGGCTTTTGATGCCCCGTGGCCAACAATTCAAGCAAATGCTGTATACTTCTCCAGCAGCATGCTTTCTCTTTCAGAAGATCAGCATATTTTAGCTCTTTACCATACACAGGTATTTGGGATGCTGGTGGGCAAAATGAGTCGATCACCTGATGCAGTTGTCAGAGCAACATGTTCTGCAGCTCTGGGCTTGCTACTAAAATCCGCCAATTCATGTTTATGGGCAGTAGCTCGACTTGATCGAGTGGACTCAGTACGGAGGAATTATGATCCAGAGTCTAACAAGAGTTAG 5121 0.4236 MASGSSIPAPEAVQVLVSLLADDSSAVREASMASLKDIATLNPLLVLDCCAAISRGGRRRFGNMAGVFQVMAFGVRSLDEREVDDNFMAKLAKIATAEMISSKEINSDWQRAATGLLVAIGSHLPDLMMEEIFLHLSGPNSALLAMVQILAEFASTDPLQFIPRWKGVLSRILPILGNVRDVNRPIFANAFKCWCQAAWQYSMDFPSRSPLDGDIMSFLNSAFELLLRVWSTSRDLRVRVASVEALGQMVGLITRTQLKAALPRLVPTILDLYKKDQDISFLATQSLHSVLNASLLSESGPPMIDFEEVTPVLSTLLLVVCINIEGKEQSDFSTYNEVQHCFLTVGLVYPDDLFVFLVNKCRLREEPLTFSALCVLKHLLPRLLEVWHNKRPLLVEAVKSLFDEGNLGVQKALSELIVVMASHCFLVGSSGELFIEYLVRHCALTDQNWGDIESSHNKRFEMKIGTVTSGDLRAICEKGLLLVTITVPEMEHILWPFLLKMIIPQPYTSAVATVCRCISELWRHRSYGNDMLSECKGRADIPAVEDLFARLVVLLHDPLAREQLATHILTVLCLLAPLFPKNINLLWQDEIPKMKAYVSDTEDLKQDLSYQDTWDDMIINFLAESLDVIQDSDWIMSLGNVITKHYELYASDDEHAALLHRCLGMLLQKVNDRAYVRDKIDWMYKQANIAIPTNRLGLAKAMGLVAASHLDTVLEKLKDILDNVGQSIFNRILSFFSDSCRTEESDDIHAALALMYGYAAKYAPSTVIEARINALIGTNMLSRLLHVRNPRAKQAVITAIDLLGNAVINAAESGAPFPLKRRDQLLDYILTLMGRDDNDGFCDYNELLRTQALALSACTTLVSVEPKLTVETRNHVMKATLGFFAVPNDPVDIVDSLIDNLITLLCAILLSSGEDGRSRAELLLHILRQIDQFISSPVEYQRKRGCLAVHEMLLKFRMVCAGGYCAVGCRGICTHNKQIDRTLYGNFSKLPTAFVLPSREALCLGDRIIMYLPRCVDTISEVRKLSAQILDQLFSISLSLPRPAASSITSEDIELSYGALSSLEDVIAILRNDTSIDPSEVFNRIVSSVCILLTKDELVATLHNCSVAICDKIKQSAEGAIQAVIEFVTKRGNELSEIDILRTTQSLISAAVYVTDKHLRLESLGAISSMAENTSPKIVFDEVLATAARDIVTKDISRLRGGWPMQDAFYAFSQHMVLSTSFLEHVISVLSQASIPKGDLDRIEDSHVDSQTADGLLQAAILALTAFFRGGGKVGKRSVEQNYASVISELTLQLGSCHGLANSGQQEPLRGLLTAFQAFCECVGDLEMGKILARDGELSENERWINLIGDVAGCISIKRPKEVQSICLFLSKSLDRPHKLQREAAAAALSEFVCYSGGVKSLLEHMIEVLCRHVFDESSTVRRLCLRGLVKTPSIRILEYSTQALGVILALLDDSDESVQLTAVSCLLMIVESSPSDAVEPILLNLSLRLRNLQASMNAKMRASSFAAFGMLSNYGGGAQKEAFLEQVHAAVPRLVLHLHDEDFSVRQACRNTMRRVCPLMEIEELLAPFNTHCFLSDHRSNYEDFLRDVAKHFIQHLPSRVDNYMASTVQAFDAPWPTIQANAVYFSSSMLSLSEDQHILALYHTQVFGMLVGKMSRSPDAVVRATCSAALGLLLKSANSCLWAVARLDRVDSVRRNYDPESNKS 1706
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Dere01g2794 1706 PANTHER MAESTRO-RELATED HEAT DOMAIN-CONTAINING 52 1685 IPR045206 -
Dere01g2794 1706 SUPERFAMILY ARM repeat 11 726 IPR016024 -
Dere01g2794 1706 SUPERFAMILY ARM repeat 720 1295 IPR016024 -
Dere01g2794 1706 SUPERFAMILY ARM repeat 1020 1683 IPR016024 -
Dere01g2794 1706 Gene3D - 9 427 IPR011989 -
Dere01g2794 1706 Gene3D - 1352 1680 IPR011989 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Dere01g2794 Dere-ChrDere01 42804868 42854778 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Dere01g2794 01 42804868 42854778 Dere01g2794 01 42804868 42854778 ECH