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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cca04g01271 ATGGAGTCGATCCTGGGAAGAGCTCTTGAGTACACTCTCAAGTACTGGCTCAAATCATTCTCCAGAGACCAGTTCAAGTTGCAGGGTCGCACCGTTCAGCTCTCCAATCTAGATTTGAACGGGGATGCACTGCATTCCAGCGTTGGATTTCCGCCCGCGCTCAATGTCACCACCGCCAAAGTTGCCAAATTGGAGATCACGCTGCCGTCCATGAGCAATGTACAGATAGAGCCAATCATTGTGCAAATTGATAGGCTCAATTTGGTTCTTGAGGAGAATTCTGATTTTGAGCCATCTGAATCTCCAACCAGGTACACCCCATCAAGTGCCTCTGGAAAGGGTAGCGGCTATGGTTTTGCTGATAAGATTGCAGATGGAATGACTATACAGATTCATACTGTTAATCTATTACTTGAAACTGGTGGAAGTGCTCGTTGCCAAGGGGGAGCAACATGGACACCACCTATGGCATCTATCACGATACACAACCTTTTACTGTATACCACAAATGAAAGCTGGGAGGTTGTAAATCTTAAAGAGGCACGGGAATTCTCCACTAATAAGAAGTATATATACGTCTTCAAGAAACTAGAATGGGAATCTTTGTCTATTGATCTTTTGCCTCACCCTGACATGTTCACGGATGCTACTTTAGGCCGTTCTCAAGAGGGAGCCAACCTGAGAGATGAGGATGGTGCAAAGCGAGTACTGTTTGGAGGCGAGCGTTTTATAGAAGGAATATCAGGAGAAGCATATATCACGGTTCAGAGAACTGAATTGAACAGTCCACTTGGGCTTGAAGTTCAGTTACATGTCACAGAAGCTGTTTGCCCTGCATTAAGTGAACCTGGGTTGCGTGCGCTTCTCCGCTTTATAACAGGATTATATGTCTGTCTAAACAGGGGAAATGTAGATTTCAAGGCTCAGCAGCGATCAACTGAAGCTGCTGGTCGTTCTCTTGTCTCAATTGTTGTGGACCATATATTTCTTTGCATTAAAGATTCTGAGTTCCAGCTTGAGCTTTTAATGCAGTCCCTCTATTTTTCACGGGCCAGTCTTTCTGAAGGAGATAGTGACAGTATCCTGACCAAAATTACGATTACAGGGCTGTTTTTAAGGGACACCTTTTCATTTCCTCCATGTACCTTAGTGCAGCCATCGATGCAATCTGTCACAGGAGATGCTTTTGAAGTGCCAGCATTCGCTCGAAGCTTTTGCCCTCCAATATATCCTCTAGGGGAACAGCCATGGAAATCAACTCTGGGAACTCCTCTAATATGCCTCCATTCCGTTCAGATTGCTCCTTCTCCAGTTCCACCATCCTTTGCCTCTCAAACAGTTATTGGTTGTCAACCTCTTATGATTCACCTCCAGGAAGAATCCTGCCTGACAATTTCATCATTCTTAGCTGATGGTATTGTTGTCAATCCGGGTGACATTTTACCAGATTTCTCAGTAAAATCTTTTATTTTCACTCTCAAGGCGTTGGATCTTACAGTTCCTCTGGGTAAGACCCAAATGGATATTTCGGAAACCAATATGGACAATTCAGTCAACACCTCCTTTGCTGGAGGAAGGCTTCATATTGAAAATGTTTTCTTTTTAGATTCACCCTCAATGAAACGGAGTATATTGAACCTCGAGAAGGATCCTGCTTGCTTTTGTCTTTGGGAGGATCAACCAATTGATGCTAGTCAAAAGAAGTGGACTGCCGGGGCATCCCAGCTTACTTTATCTCTGGAAGCAAGTACTGGCAAGCTTGGACATCAGAATTCTCTTGGATGGACTTCTGGATTGTGGAGATGTGTTGACCTGAAAGATGCTCGCATAGAAGTAGCTATGGTAACTGCTGATGGAAGTCCATTGTTAAAGGTTCCTCCTCCAGGGGGTATTGTAAGGGTTGGCATTGCTTGTAAACAGTATCTATCCAACACTTCAGTTGAACAGTTATTTTTTGTCCTTGATCTCTATGCTTATTTTGGGAGAGTTAGTGAGAAAATAGCGGTAGCTGGAAAAAAGAAACAATTGAAGGATGTCAAGAACAAATCTTTTAGTGGAAAGCTGACGGACAAGATTCCCAGTGACGCTGCTGTAAGTTTGGCAGTAAACAATCTCCAACTTCATTTTCGTGAGTCATCTTCTATGATTGCCGAGGGAATACCCCTATTACAATTTGTCGGAGATGATTTGTCTGTTAGTGCCACTCATAGAACCCTCGGTGGTGCTGTTGTTGTTTCATCCACTTTAAATTGGGAGAGTGTTGAGATAAATTGTATGGATTCTCAGGATAACTTGACATGCGAAAAGGACTTGCATATTAGTACAGGAGAAGTTCCTTCAATAAGTGATCATGGATACCCTCAACTGAGACCTGTTTTCTGGGTGCATAACAGCAAAAAACAACTACTTAATGGAAATGCTCATTCATCCCCGTTTCTGGACATAAATATGGTGCATGTCATACCATTTTGTATGGTAGACATGGAGTCACATACTTTGAATGTCTCAGCTTCTGTATCTGGTGTTCGTCTTGGTGGGGGAATGAACTACTCTGAGGCCCTTCTGCATCGATTTGGAATACTTGGACCTGATGGTGGTCCAGGGAAGGGTCTATCTAAAGGGTTGGAGAACTTACAGACTGGGCCAGTGGCAAAACTTTTTAAGACAACACCTCTGACTATTGATAATCCAGAAAATGTTGAAAGTACGAGAGAAGGGAATGATACTGGTTTCGCACACTTGAAGAAGCCAGATATTGTGGATATAACTATAGAATTGAGAGACTGGTTATTTGCTCTCGAAGGTGCTCGAGATATGGCTGAAAGATGGTGGTTCTCAAGCCTTGAAAATGTAAAAAGAGAAGAGAGGTGTTGGCACACAACTTTCAATTCCTTGCGAGTAAATGCAAAATGTTGCCCAGAGACTGTTCCAGACGGAAAAACACAATCACGTAGAATACAGCCATATCTTGTGGAACTGATTACGGTTGGAGTTCAAGGGCTGCAGATCATGAAGCCCCAAACCCAAAATAACATTCCTTCCTCGATGATAGCTGCAAATGGAGTTAAAGAATTCAATGACGAAGTTGGGGGTATTGATCTTGAAATAGGATTTATATTATGCGAGGATAATGAAGGTGATGAAACGGTTAATTGGAAAGTGGAAAACCTAAAATTTTCTACAAGGCAACCGATTGAGCTAGTTGTAACCAAGGATGAGGTCCAACACCTCACTTTTCTGTGTAAATCTGAAATTGATTCCATGGGCCGGATAACAGCTGGAATTTTACGGCTATTCAACCTAGAAGGTTCTGTTGGCCAGTCTGTAATTGATCAGCTTGCCAACCTAGGAAGTGAAGGAATTGAGAAGATTTTTTCTCCAGAGAAGCTCAGCTTAGATGGTAGTGTTTGTAGCGAAGGACTCTCTCCACACAAATCTATGGAACCCACATTTACTTTGCTTGAGGAAGCAGTTGCAGATTCACAGGCTAAGATTAATGCTCTGGTCACTGATATTGGTACTTCCGAGTCTTCGTTTGAGCACCTTACTGTCGTCAAACAGCTCAGTCAAAAGATTAAGTTGATGCAGGATTTAGTGGTGCAATTGCAGAGCCAACTTTAA 3621 0.4281 MESILGRALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGRTVQLSNLDLNGDALHSSVGFPPALNVTTAKVAKLEITLPSMSNVQIEPIIVQIDRLNLVLEENSDFEPSESPTRYTPSSASGKGSGYGFADKIADGMTIQIHTVNLLLETGGSARCQGGATWTPPMASITIHNLLLYTTNESWEVVNLKEAREFSTNKKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFTDATLGRSQEGANLRDEDGAKRVLFGGERFIEGISGEAYITVQRTELNSPLGLEVQLHVTEAVCPALSEPGLRALLRFITGLYVCLNRGNVDFKAQQRSTEAAGRSLVSIVVDHIFLCIKDSEFQLELLMQSLYFSRASLSEGDSDSILTKITITGLFLRDTFSFPPCTLVQPSMQSVTGDAFEVPAFARSFCPPIYPLGEQPWKSTLGTPLICLHSVQIAPSPVPPSFASQTVIGCQPLMIHLQEESCLTISSFLADGIVVNPGDILPDFSVKSFIFTLKALDLTVPLGKTQMDISETNMDNSVNTSFAGGRLHIENVFFLDSPSMKRSILNLEKDPACFCLWEDQPIDASQKKWTAGASQLTLSLEASTGKLGHQNSLGWTSGLWRCVDLKDARIEVAMVTADGSPLLKVPPPGGIVRVGIACKQYLSNTSVEQLFFVLDLYAYFGRVSEKIAVAGKKKQLKDVKNKSFSGKLTDKIPSDAAVSLAVNNLQLHFRESSSMIAEGIPLLQFVGDDLSVSATHRTLGGAVVVSSTLNWESVEINCMDSQDNLTCEKDLHISTGEVPSISDHGYPQLRPVFWVHNSKKQLLNGNAHSSPFLDINMVHVIPFCMVDMESHTLNVSASVSGVRLGGGMNYSEALLHRFGILGPDGGPGKGLSKGLENLQTGPVAKLFKTTPLTIDNPENVESTREGNDTGFAHLKKPDIVDITIELRDWLFALEGARDMAERWWFSSLENVKREERCWHTTFNSLRVNAKCCPETVPDGKTQSRRIQPYLVELITVGVQGLQIMKPQTQNNIPSSMIAANGVKEFNDEVGGIDLEIGFILCEDNEGDETVNWKVENLKFSTRQPIELVVTKDEVQHLTFLCKSEIDSMGRITAGILRLFNLEGSVGQSVIDQLANLGSEGIEKIFSPEKLSLDGSVCSEGLSPHKSMEPTFTLLEEAVADSQAKINALVTDIGTSESSFEHLTVVKQLSQKIKLMQDLVVQLQSQL 1206
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cca04g01271 1206 MobiDBLite consensus disorder prediction 95 114 - -
Cca04g01271 1206 Coils Coil 1185 1205 - -
Cca04g01271 1206 PANTHER AMINO-TERMINAL REGION OF CHOREIN, A TM VESICLE-MEDIATED SORTER 1 1205 - -
Cca04g01271 1206 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 101 IPR026854 -
Cca04g01271 1206 MobiDBLite consensus disorder prediction 95 113 - -
Cca04g01271 1206 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1205 IPR026728 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Cca04g01271 Cca-Chr4 15588370 15604216 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cca04g01271 - - gmx:100782617 1808.11
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Cca04g01271 04 15588370 15604216 Cca04g01271 04 15588370 15604216 ECH