Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car07g02884 ATGGAGCTTCTTCAATTCTCGTTATCACTCATTTCCCTTCTCCTCTTTCCACTCATCAAACACGAATCGGTCCCATTTTTCGTCAATTCTTTGAACTTTCATCCCATCATTCTTCCCCCGTTTCCGCTGTTTCTTGGTCCCCCCAATTACCTTCCTCCGGTCAACTTGCTGCTGCTGCTCAAAATTGCATCTGGGTTTTCAATCATGGTTCTGTCACGTCTAAAGAATGCAGTGCTTGTACAACGTACAAAAGTGGAGACCATCAGATGGACAGGATCAGGGGATGGAATTGTTTCGGGTGGAATGGAAGTCGTTTTCTGGAAAAAGAGTAACCGATGTTGGGAAATCGCATGGAAGTTTAAAGCAGATCTGCCCCAAACACTTGTAAGTGCAACCTGGTCTATCGAGGGCCCTTCAGCAACTGCCGCACATCCTAGTAAAGAACAGATTGAAGGGTCCTTCATCAGTCAAGTAAGCAAATGCGTATTAGTAAGTCAGAGAAATGGACTATCTGAATATTCGAAAGCCGAACTACAGCATCCTCTACCTGTTGTGATGGTTCAATGGAGACCATCTAGTGGAAGGCTATCAAATAGATATGGTAGCTATTCAAAAAGGAATGTATTACTGACATGCTGCTTAGATGGAACTGCAAGGTTATGGAGTGAGATTGATAATGGAAAGGCCAAGAGGGCTGGGAAGAACATTGGGTGCTCTTTTTGTGTTGTTGCTGTTATTGAGATTAATCAGTGTTTAAATGGAATTCTTGGTTCGGATATATTTGTGACATGGGGGACGGAAATCGAGGGGATATTTAGAAGCAGTGATGAAGGAGACAAACAAAAGTTTTCAAAAGAAGGATTTGAGTACGATGTTAGAAAATGTGACTGGTTAGTTGGATTTGGTCCTGGAATGTTGCTTAGCTTTTGGGCTGTCCACTGTCTTGATGATGTTTCTCCACTGAGATTCCCTCGAGTTACATTATGGAGGAAACATGAACTCCGGAGCCACGACATAGAAAATATTTATAAGTTTGACTCATCTGATTTTAAAAACGCATTACTTCTGCATAAAGTCATTATATCAAGAAACTCCTTGTCTGGTCCACCGAGTTTATTCTCTCCACTTCAGCTTTTACCTTGTAATTCCTTAGTTTGGTCATTTTTCCGTGTTCAAGAAATATGTGATGCTGTTGAGAACTCCCTCGGTAACAGTAAAATAGATGAAATGTCGTCCCATTTAAATGGCGGGTCTTTAAACTTAGATGGACACAGTGGGAAAATATTGAAGGTTTCAACTCATCCTTGTATTTTCGAAGCTCAAGTTGCTGCTTCTCTGGATTCTAATGGACTGCTTCTTTTTTGGTCGCTTTCTAATATTTCAAACTCTATTCTGGGATGTCCAACATTGGTTCCTGCTTGGGAACTCTGTGGAAAGCTTGCAACTCAAAACTCATGCTCCTTGTATACAAGCTTGACATGGTCACCTTCAATACTTGATGAGCAACTGGTTTTTTTTATGGGACACACCAGGGGGATTGATTGCTTCATACTCAATATTAGTCGAACTGAAGAAGAAAACATCGAATGTCACTATCTATGCACTATTCCCTTCACTGGTCATGGTCCTTACGAGCATGGCCCGTGCGATATATTTGCAATTCCTTTGAACTCTACATGTAGTAAAACATTTCGTAATAATAAAATTATGCTATTGGCAATTTGGACGGGGAAATTTCAGGCCATATCATGGGAAATTAACTTGCACTCCTTTGACATATCGACAAGCTGTTGTGAATGTAATTTTGATGCTAAAAGCCTTGATGACAACAGTGTTTGGGCATTTGAAAGTACATTTGCTGGTAAAAGATATTGCATTACTGTAATTCCATGTTCGTCCGAGTTTCCGAGTTCCAATGATTTGGTTGCTAGTTTTGCAGTGGCGGATCCTGGCACCCTGAGTCACAGACAAAAGGAGTTTGGCTTTACAAATGATCTTTGTAGCAACTGCCCGGCATATATCATGGCCACAGGCTGCTTTGATGGTAGCTTGAAACTTTGGAAAAGTAACCGTGGCAATCCATTGGCCCTACACTTGCCATGGGAGCTTGTGGGTATGTTTATTGCACATGATGGCCCTGTCAAGGGTATATGTTTTACTAATTGTGGTCAGAAAGTTGCTACATTCTGCAAAAGAACCGATTTGAATGATGTCAATACTGTCCATATATGGGATGCTGTAAATCTGATTATTGCAGGGACTTTTATTTTAGAAGATACACTAAAGCTTGAAAGTGATGTTATTACTCTCAAGTGGTTAACTTTAGGGACTGGTGAGTTTTTGCTTGGAGTTTGTTTGCAAAATGAATTGCAAGTATATGCTCGGAAGCGTTATGACTGTCTGACTTGGTCAAACTCAGTAAATTTTCCGAAATTAAATGTATGGGTTCACATTGCATTTGCTCAAACTTCCCTTCCAATAAATGATTTCTTATGGGGACCTGGGGCTGCTGCAGTGGTGATTCATGGAAATTACTTCAGTATATTTAGTCATTGGTTGTTCCATGTGGATAAAAAGCAAAAGAGTAATTTTCGTTCTTGTGACTGTGAAGCATATGAAGACATCATTTCTGCAGTTTTTACTGATTGTGACACTGGTGCTTTCGGAGAGCTTTCAAATGGAGACAGTAGTGCAGATTGTGGTTCCAAGCAGTCCATCACAAATAATATGAAGGACAATAACCTACACAATAGCTTGTTTCTGGCCAAGGAACAATTAAAGCATGAACTCCTTAACAAGGTTGGTTTGTGGAGCATCCTAGAAGTAGCTGAGCTGATTAGTGGATCTTTGCCTACTTATCACCCTGATGTACTTCTTACCAATATAAGTTCAGGCAACTGGAAACGTGCATATGTAGCTGTTAAGCATTTTGTTGAATGCTTGATTTCTAATAATGATCCTAAAAAGAGACAGATCACCAAAAAGAATGGTCTTCCAAGTATCATATTGTCACATTATCTAGAAGGCCGTTTGTCTAAAGGTTCACAAGATAAGGGATTTAATTGGAGTGGGGACGTTGCTTCAATCAATTCATTTTCTCAGACTCAAAGTAGCTTGATCCAGTTTCCTTATCATTCAGATTCCAGTGCTGAAAATAAAAGCAGTTCTACCTCTACTAGATCTGAACTTAATGGCTTTATTGAATACTTAGAGAATTTTCCTGATGTATCACATTTGATCAACATAGAGAGGACAGAGATTCTCTCAATCATTGATCTGCTCAGTGAAGTTAGTAATCCAGACTCGTCCTCTGCATATCAAAGTCTTGATGAACCTGGACGAAGGTTTTGGGTTGCACTAAGGTATCAGCAACTGCTTTTTCGAAGAAAGTTTGCTAGAGCTGCATCTGTCGAAGAGATGATCATTAACTCCAGGTTGTTCGTATGGGCTTACCACTCTGATTCTGTAGAAAATTTATTTGGTTCTGTCATACCCAATGAACCATCGTGGCAAGAAATGCGTGCTTTGGGTATGGGCTTTTGGTATGCTAGCATACCTCAATTGCGTGCAAGGATGGAGAAATTAGCAAGAGCACAGTATTTGAAGAACAAAAATCCCAAGGATTGTGCATTGTTGTATATTGCATTGAACAGAATTCAAGTTTTAGCTGGCCTTTTCAAAATCAGTAGGGATGAGAAGGACAAGCCTTTAGTGAGTTTTCTCATGCGTAATTTTCAGGATGAGAAAAATAAAGCTGCTGCTTTAAAAAATGCTTATGTCTTATTGGGAAAGCATCAGCTGGAATTGGCTGTTGCTTTCTTTATGCTTGGAGGTGATAATTCTTCTGCTATAAATGTTTGTGCTAAGAACCTTGGGGACGAACAGCTTGCACTAGTCATTTGTTGCCTTGTTGAGGGCCGTGGTGGACCATTGGAGCGTCACTTAATTACAAAGTATATATTTCCGTCTGCAATCGATAGAGGAGACTACTGGCTGGCTAGCCTTCTTGAGTGGGAAATGGGTAATTACTATCAATCTTTTCATAGAATGCTAGAGTTTTCAGTGAACACTGTGGCTCCAGAGTCCTCCATCATGTCCAATTCTGGTTCTTTTATGGACCCTACTGTTGGTTTTTATTGCCATATGCTTGCAGCAAAGAATACCACCCGGAATGCTGTAGGAGAGCAAAATTCTGCCATCCTTTTAAGGTGGGCAACTTTGATGACAGTTACTGCCCTAAAAAGATGCGGTATTCCTCTTGAGGCATTGGAGTATATCTCATCTTCACTGAGCATGCTTGGGACTGCAGATCAAGATAATGAATTGGGTGACAGGCACGATGTTTTGTCCAGTACATTAAAGCCTTTGCCAAGAAAATCCTCTAACTGGTTGTCTGCTGATGTATCTGTGCATCTGGAGTTTCATGTTAAATTGAATTTGTCACTTTGCTACTTATCGAAACTAATAAGAGAGCATCCAAGTTGGCCTGACACTTTCACAGAACCCGATGGAGAAGCCTCTTATTCTGAAGAGTACTTGATACTATATGTGAAATCAAATGAAAATTTTAAACAAAAGTTATATACAGGGCTTGATCTATTGGAACAGAAGTTTTTATTGACTCCGTGCCATCTGATCAGCATGATTTTACTCTTACTTTGCCATTATGGACTATGGTACATTGGGTATGATGTTACAGATGGAAGCACTCTAGGAGAACTGTCTCAAAAGAAGAGTGATATATTTGATGTTTCCGAGTTATCTCATTCTCAGTTCAAACCCCTCTTTAAAACTGCAGAAGAAATCTCCTTTTTGTATTCAAGATTTTTTTCTGCCTGCGGAATGGAATATTCTCAACAGAGTTCAACTCTTGAGCAAGGAGCATCGACTGATATTACATCTAAATTTTTGGATGCTTCAAAATGTCACTTTGAAGGTCTTTTCGTTTCATTGTGGTATTTAAGAGCTGTTTTGAGGAGTCAATTGAGGTATATTAGCAAAGATCTTGTCGAGAAGCATCTTGAAATCCTTGATTTATTTGAATATTATTTACATTTTTCATTAGCTTGGCTTCGTAGAAACGCAGAAGCCCTTTTATTTATGGTGCAATCTTTCTTGATTGCACCTGATGGTTGTAATCCTTATGAGGTTGATATGGTGAATCTGAAGAAGCTTATCCCTGAAGCTGCACAGTTGTTGGCTCAAAATTCTTTCATAACTAATATAAAAAACCTTCAAGTATCCAAATGTGCAGAGGATAAAATAGGTGCAGATATAAAGTGTCCAGTTCCTGATGATGAAAGATGGAAGATTCTAGGGACCTGCTTGTGGCAGCATATGTCTAGATTCATGATATCTAATTTGAATTTGGTTCTTGCTAAACTTGAAGATGAGAAATTATCTGGTTCTTTCTACAGATATAGGGAATCTGCATCTTCTCCCAAAAATATGGATTCTGATAGTATCAGCTTGCCAGAGCAGATTCTATTAGTCACATTTAGCTTATGTGATTTACTGACAACAACAGTTACTCACATTTCTTCTTATCATGTTAAACAACATGCGGAATTTCTGTGGCAGAAATTGGAGAAGGATTCAAATGTTATGACTCTTGAATGGTTAAAACAGACAAGTCAATCAGAATCCAATCAGAATGGAAACCTGGATGTTTCGGAATTGGTGAACAGGAAAGATAACTCTCTCGTTCATCAGTTTTTATGGGATCATTGTGCTGATCCCAAATTGATACGCGACTGCTTTGCACAAGAAAAACTCAATTGGTCAAAGGATTTGGACCATAAGCCTACTAAAGGATGGAATGACCTGTATACAATTATGACAGGATTGCAAAATACTCATGACTCACAGCATGATGAATGCAAAGTTAGCAAAATATCTGCTAATCATGAAGCAGGATCTCCTGTTAAAGGAATGTCTCCAAGTGGTCATGCTTCTCCAAGATCTAACCAGAAAGATATAACTTGTGCAAATATTGAAGACTTTAAGAATCCCAGAGAAATTTACAAGAGAAATGGAGAACTTTTGGAGGCACTGTGTATAAACTCAACCAATCAACATGAAGCTGCAGTTGCTAGCAACCGGAAGGGTATAGTATTCTTTCACTTGGAAGATGGGATTCCTTTTAGTAGTGAAGCAGACCTTTTGTGGACCAAAGCCGATTGGCCACAAAATGGATGGGCAGGTTCAGAATCCACCCCTGCTCCTACTTGTGTTTCTCCTGGTGTTGGCCTTGGGAGCAAGAAAGGGGTACACCTCGGTCTCGGTGGAGCAACTGTCGGTATGGGTTCTTCAGCTTGGCCTAGCAGAGACTTGACAGGCGGTGGAGCATTAGGAGCGCTAGGTTATGCTCGTATTGGTGCCTCTGGACTGGGTTGGGAAACTCAACAAGACTTTGAAGATTTTGTTGATCCACCTGCTACTTTGGAGAATACAAGTACCAGGGCTTTTTCTAGTCATCCAATGAGGCCTTATTTCTTGGTTGGTTCAAGCAATACACACATTTACTTGTGGGAGTTCAATAAGGACAAAGCTACTGCTACATATGGAGTGCTGCCTGCTGCCAATGTCCCTCCGCCTTATGCTCTTGCGTCAATTTCAGCTTTACAATTTGACCACTTTGGACACCGTTTTGCCAGTGCTGCATTGGACGGGACCGTCTGCACATGGCAGCTGGAGGTAGGAGGAAGGAGCAATGTTTGTCCAACAGAATCATCCCTCTGCTTTAATGGCCAGGCATCGGATGTCACGTACTTTTCCTCTAGTGGATCAATAATAGCTGTGGCTGGATATAGTTCTAATAGTGTTAATGTGGTTATATGGGATACTTTAGCTCCACCTTCAACTTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTGGTGCACGCTCCCTTTCTGTATTTGACAATCATCTTGGAAGTGGTTCTGTTTCCCCTCTTATTGTGACTGGTGGTAAAGGTGGTGATGTTGGACTTCACGACTTCCGCTATATAGCTACTGGAAAGGCTAAAAGGAACAAACGTTCCGATAGCATTGGAAAAAGCTCTCTCACATCTTTGTCTTATGACAAGGACCATAATGTAGATGGGATGCTTTGGTATATTCCAAAGGCACACTCAGGGAGTGTCACAAAAATAGCTACCATCCCAAATACCAGCTTGTTTTTGACTGGAAGCACAGATGGAGATGTCAAGCTCTGGGATGCTGAGAGCACCAAGTTAATACATCACTGGTCTAAGATACATGAAAAACACACTTTTCTCCAATCCGGCTCTCGTGGATTTGGCGGCGTTTTTCGGGCTGCTGTTACGGACATTCAAGTTGTTCCCCATGGTTTTCTTACCTGCGGTGGTGATGGAAGTGTAAAGCTTGTACAGTTGAAAAATCACCTGCATGGCTTCAGGGATGAGTAA 7428 0.4048 MELLQFSLSLISLLLFPLIKHESVPFFVNSLNFHPIILPPFPLFLGPPNYLPPVNLLLLLKIASGFSIMVLSRLKNAVLVQRTKVETIRWTGSGDGIVSGGMEVVFWKKSNRCWEIAWKFKADLPQTLVSATWSIEGPSATAAHPSKEQIEGSFISQVSKCVLVSQRNGLSEYSKAELQHPLPVVMVQWRPSSGRLSNRYGSYSKRNVLLTCCLDGTARLWSEIDNGKAKRAGKNIGCSFCVVAVIEINQCLNGILGSDIFVTWGTEIEGIFRSSDEGDKQKFSKEGFEYDVRKCDWLVGFGPGMLLSFWAVHCLDDVSPLRFPRVTLWRKHELRSHDIENIYKFDSSDFKNALLLHKVIISRNSLSGPPSLFSPLQLLPCNSLVWSFFRVQEICDAVENSLGNSKIDEMSSHLNGGSLNLDGHSGKILKVSTHPCIFEAQVAASLDSNGLLLFWSLSNISNSILGCPTLVPAWELCGKLATQNSCSLYTSLTWSPSILDEQLVFFMGHTRGIDCFILNISRTEEENIECHYLCTIPFTGHGPYEHGPCDIFAIPLNSTCSKTFRNNKIMLLAIWTGKFQAISWEINLHSFDISTSCCECNFDAKSLDDNSVWAFESTFAGKRYCITVIPCSSEFPSSNDLVASFAVADPGTLSHRQKEFGFTNDLCSNCPAYIMATGCFDGSLKLWKSNRGNPLALHLPWELVGMFIAHDGPVKGICFTNCGQKVATFCKRTDLNDVNTVHIWDAVNLIIAGTFILEDTLKLESDVITLKWLTLGTGEFLLGVCLQNELQVYARKRYDCLTWSNSVNFPKLNVWVHIAFAQTSLPINDFLWGPGAAAVVIHGNYFSIFSHWLFHVDKKQKSNFRSCDCEAYEDIISAVFTDCDTGAFGELSNGDSSADCGSKQSITNNMKDNNLHNSLFLAKEQLKHELLNKVGLWSILEVAELISGSLPTYHPDVLLTNISSGNWKRAYVAVKHFVECLISNNDPKKRQITKKNGLPSIILSHYLEGRLSKGSQDKGFNWSGDVASINSFSQTQSSLIQFPYHSDSSAENKSSSTSTRSELNGFIEYLENFPDVSHLINIERTEILSIIDLLSEVSNPDSSSAYQSLDEPGRRFWVALRYQQLLFRRKFARAASVEEMIINSRLFVWAYHSDSVENLFGSVIPNEPSWQEMRALGMGFWYASIPQLRARMEKLARAQYLKNKNPKDCALLYIALNRIQVLAGLFKISRDEKDKPLVSFLMRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGKHQLELAVAFFMLGGDNSSAINVCAKNLGDEQLALVICCLVEGRGGPLERHLITKYIFPSAIDRGDYWLASLLEWEMGNYYQSFHRMLEFSVNTVAPESSIMSNSGSFMDPTVGFYCHMLAAKNTTRNAVGEQNSAILLRWATLMTVTALKRCGIPLEALEYISSSLSMLGTADQDNELGDRHDVLSSTLKPLPRKSSNWLSADVSVHLEFHVKLNLSLCYLSKLIREHPSWPDTFTEPDGEASYSEEYLILYVKSNENFKQKLYTGLDLLEQKFLLTPCHLISMILLLLCHYGLWYIGYDVTDGSTLGELSQKKSDIFDVSELSHSQFKPLFKTAEEISFLYSRFFSACGMEYSQQSSTLEQGASTDITSKFLDASKCHFEGLFVSLWYLRAVLRSQLRYISKDLVEKHLEILDLFEYYLHFSLAWLRRNAEALLFMVQSFLIAPDGCNPYEVDMVNLKKLIPEAAQLLAQNSFITNIKNLQVSKCAEDKIGADIKCPVPDDERWKILGTCLWQHMSRFMISNLNLVLAKLEDEKLSGSFYRYRESASSPKNMDSDSISLPEQILLVTFSLCDLLTTTVTHISSYHVKQHAEFLWQKLEKDSNVMTLEWLKQTSQSESNQNGNLDVSELVNRKDNSLVHQFLWDHCADPKLIRDCFAQEKLNWSKDLDHKPTKGWNDLYTIMTGLQNTHDSQHDECKVSKISANHEAGSPVKGMSPSGHASPRSNQKDITCANIEDFKNPREIYKRNGELLEALCINSTNQHEAAVASNRKGIVFFHLEDGIPFSSEADLLWTKADWPQNGWAGSESTPAPTCVSPGVGLGSKKGVHLGLGGATVGMGSSAWPSRDLTGGGALGALGYARIGASGLGWETQQDFEDFVDPPATLENTSTRAFSSHPMRPYFLVGSSNTHIYLWEFNKDKATATYGVLPAANVPPPYALASISALQFDHFGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNVCPTESSLCFNGQASDVTYFSSSGSIIAVAGYSSNSVNVVIWDTLAPPSTSRASILCHEGGARSLSVFDNHLGSGSVSPLIVTGGKGGDVGLHDFRYIATGKAKRNKRSDSIGKSSLTSLSYDKDHNVDGMLWYIPKAHSGSVTKIATIPNTSLFLTGSTDGDVKLWDAESTKLIHHWSKIHEKHTFLQSGSRGFGGVFRAAVTDIQVVPHGFLTCGGDGSVKLVQLKNHLHGFRDE 2475
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car07g02884 2475 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2374 2409 - -
Car07g02884 2475 Gene3D - 2137 2367 IPR015943 GO:0005515
Car07g02884 2475 Pfam RAVE protein 1 C terminal 739 1386 IPR022033 -
Car07g02884 2475 Gene3D - 406 750 IPR015943 GO:0005515
Car07g02884 2475 Gene3D - 2368 2471 IPR015943 GO:0005515
Car07g02884 2475 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 85 756 IPR036322 GO:0005515
Car07g02884 2475 Pfam WD domain, G-beta repeat 2374 2406 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 77 2465 - -
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 650 688 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 2430 2464 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 2241 2281 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 700 745 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 2286 2332 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 171 222 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 2141 2178 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 414 456 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 2195 2230 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 SMART WD40_4 2367 2406 IPR001680 GO:0005515
Car07g02884 2475 PANTHER RABCONNECTIN-3A 77 2465 - -
Car07g02884 2475 MobiDBLite consensus disorder prediction 1970 1990 - -
Car07g02884 2475 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 2154 2462 IPR036322 GO:0005515
Car07g02884 2475 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2374 2415 IPR001680 GO:0005515
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car07g02884 K24155 - gmx:100789935 3747.98