Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car07g02215 ATGGAGAACCCGATCGCAGCCGATGATTTCAACTACCTATCCGGCTTCGGTAACCACTTCTCCTCAGAGGCCATCGCCGGAGCTCTCCCGGTCGGACAGAACAGCCCCCTCATATGCCCCTTCGGTCTCTACGCCGAACAAATTTCCGGCACCTCCTTCACCACTCCTCGCACCCTCAACCTCTTCAGTTGGCTCTATCGGATTAAACCTTCGGTGACTCACGAACCGTTCAAGGCTCGGGTTCCTTCTAATGGGAAAATTTTGAGTGAGTTCAACGACTCAAACAGTTCCGCAAACCCAACTCAGCTTCGATGGAAACCAGAAGATATACCTGATTCACCTACGGATTTCATTGATGGGTTATCCACTGTTTGTGGTTCTGGTAGTTCCTTCATGCGCCATGGTTATGCTATTCACATGTACACTGCTAACAAATCAATGGACAATTGTGCCTTTTGCAATGCTGATGGAGACTTCTTAATTGTTCCTCAACAAGGAAGACTACTTATCACAACTGAATGTGGACGATTGAAAGTTTCTCCTGGTGATATTGCTATAATACCTCAAGGTTTTCGTTTTAATGTGAACTTGCCTGATGGTCCTTCCCGTGGCTATGTTGCTGAAATTTTTGGTACTCATTTTCAACTTCCTGATTTGGGACCAATAGGTGCTAATGGTCTTGCTGCGCCAAGGGATTTCCTTGTTCCTACAGCATGGTTTGAAGATAAATCATATCCTGGATACACTATAGTGCAAAAGTTTGGTGGTGAACTATTTACTGCAGTACAAGATTTCTCTCCCTTCAATGTTGTTGCTTGGCATGGTAATTATGTTCCATATAAGTATGACCTAAGCAAATTCTGCCCTTATAATACAGCGCTGTATGATCACAGTGATCCATCAATTAATACTGTGTTGACAGCACCGACTGATAAACCTGGAGTGGCATTGCTTGATTTTGTCATTTTTCCACCGAGGTGGCTTGTTGCTGAGCATACCTTCCGGCCTCCATATTATCATCGCAATTGCATGAGTGAATTTATGGGTCTCATCCATGGTAACTATGAGGCAAAGGTTGATGGATTTCTTCCAGGCGGTGCAAGTCTTCATAACTGTATGACTCCCCATGGTCCGGATACCAAGTCGTATGAGGCCACCATTGCTCGCGGGGACAATGTTGGACCTCACAAGATCACCGACACACTGGCTTTTATGTTTGAATCGAGTTTGATTCCCCGTATCAGCCGATCGGCTCTTGAATCCCCGTTCTTGGATCATGATTATTACCAATGTTGGATTGTTGTTTTGTTtgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatAAATTTTga 2850 0.2067 MENPIAADDFNYLSGFGNHFSSEAIAGALPVGQNSPLICPFGLYAEQISGTSFTTPRTLNLFSWLYRIKPSVTHEPFKARVPSNGKILSEFNDSNSSANPTQLRWKPEDIPDSPTDFIDGLSTVCGSGSSFMRHGYAIHMYTANKSMDNCAFCNADGDFLIVPQQGRLLITTECGRLKVSPGDIAIIPQGFRFNVNLPDGPSRGYVAEIFGTHFQLPDLGPIGANGLAAPRDFLVPTAWFEDKSYPGYTIVQKFGGELFTAVQDFSPFNVVAWHGNYVPYKYDLSKFCPYNTALYDHSDPSINTVLTAPTDKPGVALLDFVIFPPRWLVAEHTFRPPYYHRNCMSEFMGLIHGNYEAKVDGFLPGGASLHNCMTPHGPDTKSYEATIARGDNVGPHKITDTLAFMFESSLIPRISRSALESPFLDHDYYQCWIVVLFDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDKF 949
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car07g02215 949 Pfam Homogentisate 1,2-dioxygenase N-terminal 11 284 IPR046452 -
Car07g02215 949 TIGRFAM hmgA: homogentisate 1,2-dioxygenase 10 433 IPR005708 GO:0004411|GO:0006559|GO:0006570
Car07g02215 949 Pfam Homogentisate 1,2-dioxygenase C-terminal 285 433 IPR046451 -
Car07g02215 949 SUPERFAMILY RmlC-like cupins 9 432 IPR011051 -
Car07g02215 949 MobiDBLite consensus disorder prediction 439 949 - -
Car07g02215 949 PANTHER HOMOGENTISATE 1,2-DIOXYGENASE 8 434 - -
Car07g02215 949 CDD cupin_HGO_N 103 211 - -
Car07g02215 949 Gene3D Jelly Rolls 273 410 IPR014710 -
Car07g02215 949 PANTHER HOMOGENTISATE 1,2-DIOXYGENASE 8 434 IPR005708 GO:0004411|GO:0006559|GO:0006570
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car07g02215 K00451 - gmx:100801346 842.417
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Car07g02215 07 31919885 31927622 Car07g02215 07 31919885 31927622 ECH