LGRPv2

Gene search

Sequence information

Select	Gene	Cds	Cds_length	GC_content	Pep	Pep_length
	Car06g01715	ATGTTCCCTTGGAACATTGCTAAATCGGCGGAAGCCATGTTCTCCCGCTGGGCCCTCAAGAGGGTTTGCAAATTCTTCCTCAAGAAGAAATTGGGACAGTTTATTCTCGGCGACATCGACCTCGACCAGCTCGATGTTCAACTCTCACAAGGCACCATTCAGCTCACCGATCTCGCTCTTAACCTCGACTTCATCAACGCCAAGCTTGGCAAAACTGCATCTATAATGGTAAAAGAAGGATCAATTGGATACCTTTTGGTTAAAATGCCTTGGAGTGGCAAAGGTTGTGAGGTTGAAGTGAATGAGCTTGAACTTGTGGTTTCGCCGTGCAGGGATAAGATTTATACTGCTGAAGATGAAGCTCGTGGTTCGGATGTCGATAACGATAGTTGTCAAATGAAAAATAGCTCAAACAGGACCATTAATGAAATAGATGATGATGCTATGAAGTCAATTTCAATGGATGTTCATGAAGGTGTAAAAACTATTGCAAAGATGATAAAGTGGTTGCTTACAAGCTTCCATGTGAAAGTAACAAACGTGATTGTTGCGTTTGATCCGTCTTTAGACAACAATGAAGGAAAGGAAATGCATTGTCATCGGACTTTAGTTCTTCGGGTTTCAGAGATACAATGCGGAACAAGTTTGTCTGAAGACACTGAGTCTAATGTTGATGTACTTGGTATAAGCCAGTTAACAAACTTTGTAAAGTTTCATGGGGCAGTGCTTGAGATTCTCAAAATAGATAATGAAAATAACCAGTTATCTGTTCAGCATGGGTCAGAAGCTGGTTGTGGTGAACCTGTTTTGGGATCAAATAAATCCATGTATCCAGTCATGACTGGGAAGCAAGGTGGATTTGGTGGAAATGTAAAATTAAGTATTCCTTGGAAGAATGGTTCTTTGGACATTCGCAAGGTGGATGCAGATGTTTGTGTTGATCCCATAGTGTTAAGATTTCAACCTAGCACAATTGAATGGCTATTGAAGTCATGGGGAACTCTTAAAAATTTGAATAAGGATGCGAAAGGTTGCAAGAAGAACAACTTACAAGGACCTTCTCAATTAAATTCTGCGCCGTCGTGTCATACACCAACTTCAGTTTCTACTACCAATGTCACCAGTCAAATGATAAACGGGCATGGTAGTTTGCCCGTCAATTGTGCCTCCTTGACCCAACTAGAAGATCTTGAACCCCTCACAGAAGCTTTACTTCCTGCTGCTAATCTTATTTCAGATTGGGTGCCATATTCTACTCATCTAAATCATACAAATGGTATTCAAGAACCTGACTTTGGAGCGAGTGTGGACCAATTTTTTGAATGTTTTGATGGAATGAGAAATTCTCAATCTGCTCTAGGGAGCAGTGGAATGTGGAATTGGACATGTTCGGTTTTCAGTGCTATCACCGCTGCGTCCAGCCTTGCTTCTGGATCCTTGCAGATTCCCTCTGAACAGCAACACATGGAAACCAATCTCAGGGCTACTTTTTCTGGAATATCTGTTGTTTTGCACTTCTGTGATGATGAACAGAACCAATTTTATGAGCCTAAAACTGGTAACACAGTTGGATCGCATATCGATTATCTTGGTGCAGAGTGCAATGAAATTTCTGTTGCCTTGAAGGTATGTCCTCAAATGATGACTTTCGATGGCATGGTGAAGTATGTAGAAGTCGCTAATTTTTTGAACATAGGAAGTGATGCTGAAAATCAAACTGCTTTGGTTGGACACTTGCAGACCAAGGTCCTTGATGCTCTCCCTTTGTCTACCTCTTACAACCTATATTCAGATTCATTAGTTGGTCCAGCTGCAACAGGCTTTCCATTTGGAAATAAGGATTGCTTACTGAAAGTTACACTGTTTAAAACTTGTGGTGTCACCAGTTGCAAATTTACAGTACAATCAAGTTTGTCAGGTGGTTGCATGACTGGGCTGACATCATTCTCACTAAACCTCCCCCCTTTTATTTTCTGGGTAATCTTTTCGGTGATAAATATGCTCATTCACCTGCTAAAGGAAATCGGAAATTCACTTGAAGTGCATAATAAAACAGAAGAGATTTTGTCTGAAGCCTCAGATGAAAAGTGTGGATTATCTCCAAGTGATGTACCAGGAAGTTTCAGTCCCTGTGTGGCATCCTTCTCAGCAACAGAATGTTTGCATGGTGATATATCAATTTCTAGTGCAAGAGTAATACTGTGTTTTCCTTTTGAAAGTGCTGGAGATTACGCAGCTTCGTTTACCTGGGATAAGTTTATTGCTCTTGATTTTACTTCATTGTCACCTTTGAACAAGGGTAGCACTCCAGATGGTAGCCAAACTTCAAATGCAAGTTCAAAGAAAAGATTTCCTTCTCTAGCAGCACAATCTCTTCAGTTGAATTTCTGTGATCTAGATATATACTTAATCACACCAACAAGTAATGACAGTGGTAGGATGAGCTCCAATGGTGTGAAGAATGAGAAATTTTCTGGCACCTGCTTTCTTTCCATTGCTCGTAGAAGGGGCTGCTTCTCTGTTTTTCGTTTAGTTTGGCAGGAGGGTCAAGTGACTGGTTCTTGGATTGCTAAGAAAGCTAGATTATTTGTTAATTCAGAGCAATCAATGGGAAAAGATGATATTGCCGGAAGAGGGTATGAGTATGCGTCTGCATCAGCCGTGAAAGATTTAGAAGACTGGAAATCTCAAACTCAACAAGAGATGATTCTAAGTTCATCGTTTCTCATGCATGTCTATCTATCTCAAGTTGTGATTAATGTGAATGATTCTCAATATAAAGGCATACACCAGCTTTTACTTCAGATGCTAGATGCAATGACATGTGAGACTTCTCAGGAAGCAAATGTGGATAAAAGTTCTTCAGTCTCACAATCATCAATATTTTTGGAATGCGATTCTGTAGAAGTTCTTATTAGTAGGGATACATCTGAGAGTATCCCAAGTTCAATTAAGAGTGAGCTTCCCGGACAATGGCATCAATTCAAGCTGAGGGTTCAAAGGTTCGAGTTGCTGTCTGTTACTAATACTGGTGGTGTTAAGGCTGCGAGTTTCTTCCGACTAACCCACGGCGATGGCAAGTTGTATGGGTTCATTACTGGAGTTCCTGATCATGAGTTTCTTCTGGTTACTTGCAACAACTCCTCTGTGAAGCGAGGTAATGGGGGAGGTTCTAATGCATTATCTTCTAGATGTGCTGGTTCTGATATCATGTATCTATCTGACCCAGAGATTTCTCATAAAATTACATCTATTGCTGTCAGCTGTGGCACAGTTATTGCTGTAGGTGGTCGTTTGGATTGGTTTGTTGTAATATCATCCTTTTTCAGTTTGCCTGCTTCTAATACAAAAGATGATACTAGTATATCAAAAAGGGGGCTGGATATCTCTTACACGACTTATTTTGTTCTCAACTTGATTGATATTGCTCTGAGTTATGAGCCCTATATGAAAAATCTTTTTGTTCAGAGTGAGGTCCTTAATTCTGAGTCTGGCTTTTCTTGTATCAAAGAAGATATGGGGGAACAATGTGTTTCTTGTCTGTTGGCTGCATCCAGCTTGACTCTTTCAAATTCATCTATGCCAGACTCAGTTGAAAGTGTTTTCCAAATTAGAGTGCAAGATCTGGGGCTTTTGCTTCATTTAATATCAAAGCTTGATTCTCTCCCTGGCACTTATAGTGTAGAACATCTTCAAAAGTCTGGTTATGTTAAAGTTGCCCAGGAGGCTTTTCTGGAGGCAATTTTGAAAACGAACTGTGCCAGTGGTCTTCTTTGGGAACTAGACTTATCTAAATCTCACCTTTATGTGGACACTTGCTATGATACAACTGCTGCTCTAATTCGTTTGGCTGCTCAACTTCAGCAATTATTTGCCCCTGATGTGGAGGAGTCCATTGTGCATTTGCAGAATAGGTGGGATAGTGTTCAACAAGCACAGCAGAGCGATGAATTTAATAATGAAATTAAGCATCTCAGACGTGACTCGATGGCTTCAACTTCTGAACAGTGCTCCCCAAAAACACTTCCAAAGGATGGATCTAGTATAGCTGGCTTGATGGATGAAATATGTGAAGATGCATTTCAAGTAAATGACAATAATACATGGCAATCATATTCTTGTGAATCAGGATTTTACATGCCACTTGATGGAAGCATAATTGAGGTTGGTAAGATGAATTTGGATGAGCATGAAGTTCTCTCTCCTGAATTAATGTCGACCGAGTCAGTGCCTGTAATTGGACCAGAAGGTAGTCATACTGCATTTCTGCAAAACGGGTGCTTTCCAGAGATTATAGAAAGCTATTGTTTGTCTGACTTACGCCCTCTCTCAGAGCTCTCTATAGATATACACTCTGAAGAGCTTTCTAAAATTAATCTGAGGAATCTGGCTCATAGAGAGATTGAAAGAGGAAGTGGTGGATGGTATGGAGGCAAATCTTTAAAAGTATTAGAAAACCACATTTCAGAGGAAAATGAAAAAACTGGACTGATGAAGGCCGAACTTCATGACATGCTTGTCTCTAATGATTGCCCATCTCAAAGCGATGCTTGTGGACGTATACTTCTTAAGAAAATTGATATAAGATGGAAAATGTATGGTGGTTCTGACTTTGTTGATTCAGGGAAAAATGGACAACATTGTGGGAGGAACACATCTGTTTGCTTGGAACTTGCATTGTCTGGGATGAAATTTCAGTATGATACATTTCCAGTTGGTGGACTACATGTATCGAAAATGTCGCTGTCCGTTCAAGATTTTTATCTGTATGACAGAAGCCAAGCTGCACCTTGGATACTGGTGCTAGGATATTATCACTCAAAGGGTCATCCTAGGGAATCTTATTCAAAAGCATTTAAGTTGGACTTGGAGGCTGTTAGACCAGATCCTCTAACTCCCCTCGAGGAGTACAGGTTAAATGTTGCTTTTCTACCTATGCTATTGCATCTACATCAGTGCCAGCTTGATTTTCTTGTTGGTTTCTTTGGGAGGGAAAACTCATTAAATGACCAGTTTCCTAATAATTGTCATGATTTAGAGGGTTCAAAATCATTTCCTGAGAGGAGTAAAGATCATGCATGTCATTCGATTGCACAAGAAGCATTGCTTCCTTACTTCCAGAAGCTAGATATAAGGTCTATCCTTATTCGGGTGGATTACAGTCCGAATCATGTAGATCTAGCAGCATTAAGACGTGGGAAATATGTAGAACTTGTAAATCTTGTTCCTTGGAAGGGTATCGAGCTTAACCTGAAACATGTTCATGCTTCTGGCATCTATGGTTGGGGCAGTGTTTGTGAAGCAGCTTTAGGGGAGTGGTTGGAAGATATATCTCAGAATCAGATTCATAAAATACTGCGCGGGCTTCCTACTGTACGATCGTTAATTTCAGTTGGGGCTGGTGCTGCTAAGCTGATTTCATCTCCAGTAGAGAACTACAAGAAGGAGCGTAGAGTGATCAAAGGTTTGCAGAGAGGTACAATTGCATTTCTTCGAAGCATTTCTCTTGAAGCTGTTGCACTTGGAGTTCACCTAGCTGCTGGAGCCCACGACTTTCTTCTCCAAGCAGAATATAGTCTTTCAAGCATACCTTCTCCAGTTGCTCTGCCTGTAAACGATAAATCAAGGACAGGTGTTCGATCTAATCAACCCAAGGATGCCCAACAAGGAATTCAACAGGCTTGTGAGAGTCTCAGTGATGGCCTGGGAAAATCTGCTGCAGTGTTAGTTCAGAACCCTTTGAAAAAGTTCCAGCGCGGTTCAGGTGCAGGACCTGCCTTGGCCGCTGCTGTTCGAGCAGTTCCTGCAGCTGCCATAGCTCCTGCTTCGGCTTGTGCAAGTGCTGTACACTATGCTCTTCTTGGAGTTAGAAATAGCCTTGATCCTGAACGCAAAAAGGAGTCCATGGAGAAATATTGTCCTACACAACCCTGGGAAGAAGACTGA	5946	0.4102	MFPWNIAKSAEAMFSRWALKRVCKFFLKKKLGQFILGDIDLDQLDVQLSQGTIQLTDLALNLDFINAKLGKTASIMVKEGSIGYLLVKMPWSGKGCEVEVNELELVVSPCRDKIYTAEDEARGSDVDNDSCQMKNSSNRTINEIDDDAMKSISMDVHEGVKTIAKMIKWLLTSFHVKVTNVIVAFDPSLDNNEGKEMHCHRTLVLRVSEIQCGTSLSEDTESNVDVLGISQLTNFVKFHGAVLEILKIDNENNQLSVQHGSEAGCGEPVLGSNKSMYPVMTGKQGGFGGNVKLSIPWKNGSLDIRKVDADVCVDPIVLRFQPSTIEWLLKSWGTLKNLNKDAKGCKKNNLQGPSQLNSAPSCHTPTSVSTTNVTSQMINGHGSLPVNCASLTQLEDLEPLTEALLPAANLISDWVPYSTHLNHTNGIQEPDFGASVDQFFECFDGMRNSQSALGSSGMWNWTCSVFSAITAASSLASGSLQIPSEQQHMETNLRATFSGISVVLHFCDDEQNQFYEPKTGNTVGSHIDYLGAECNEISVALKVCPQMMTFDGMVKYVEVANFLNIGSDAENQTALVGHLQTKVLDALPLSTSYNLYSDSLVGPAATGFPFGNKDCLLKVTLFKTCGVTSCKFTVQSSLSGGCMTGLTSFSLNLPPFIFWVIFSVINMLIHLLKEIGNSLEVHNKTEEILSEASDEKCGLSPSDVPGSFSPCVASFSATECLHGDISISSARVILCFPFESAGDYAASFTWDKFIALDFTSLSPLNKGSTPDGSQTSNASSKKRFPSLAAQSLQLNFCDLDIYLITPTSNDSGRMSSNGVKNEKFSGTCFLSIARRRGCFSVFRLVWQEGQVTGSWIAKKARLFVNSEQSMGKDDIAGRGYEYASASAVKDLEDWKSQTQQEMILSSSFLMHVYLSQVVINVNDSQYKGIHQLLLQMLDAMTCETSQEANVDKSSSVSQSSIFLECDSVEVLISRDTSESIPSSIKSELPGQWHQFKLRVQRFELLSVTNTGGVKAASFFRLTHGDGKLYGFITGVPDHEFLLVTCNNSSVKRGNGGGSNALSSRCAGSDIMYLSDPEISHKITSIAVSCGTVIAVGGRLDWFVVISSFFSLPASNTKDDTSISKRGLDISYTTYFVLNLIDIALSYEPYMKNLFVQSEVLNSESGFSCIKEDMGEQCVSCLLAASSLTLSNSSMPDSVESVFQIRVQDLGLLLHLISKLDSLPGTYSVEHLQKSGYVKVAQEAFLEAILKTNCASGLLWELDLSKSHLYVDTCYDTTAALIRLAAQLQQLFAPDVEESIVHLQNRWDSVQQAQQSDEFNNEIKHLRRDSMASTSEQCSPKTLPKDGSSIAGLMDEICEDAFQVNDNNTWQSYSCESGFYMPLDGSIIEVGKMNLDEHEVLSPELMSTESVPVIGPEGSHTAFLQNGCFPEIIESYCLSDLRPLSELSIDIHSEELSKINLRNLAHREIERGSGGWYGGKSLKVLENHISEENEKTGLMKAELHDMLVSNDCPSQSDACGRILLKKIDIRWKMYGGSDFVDSGKNGQHCGRNTSVCLELALSGMKFQYDTFPVGGLHVSKMSLSVQDFYLYDRSQAAPWILVLGYYHSKGHPRESYSKAFKLDLEAVRPDPLTPLEEYRLNVAFLPMLLHLHQCQLDFLVGFFGRENSLNDQFPNNCHDLEGSKSFPERSKDHACHSIAQEALLPYFQKLDIRSILIRVDYSPNHVDLAALRRGKYVELVNLVPWKGIELNLKHVHASGIYGWGSVCEAALGEWLEDISQNQIHKILRGLPTVRSLISVGAGAAKLISSPVENYKKERRVIKGLQRGTIAFLRSISLEAVALGVHLAAGAHDFLLQAEYSLSSIPSPVALPVNDKSRTGVRSNQPKDAQQGIQQACESLSDGLGKSAAVLVQNPLKKFQRGSGAGPALAAAVRAVPAAAIAPASACASAVHYALLGVRNSLDPERKKESMEKYCPTQPWEED	1981

Annotation information

Select	Seq ID	Length	Analysis	Description	Start	End	IPR	GO
	Car06g01715	1981	PANTHER	AUTOPHAGY-RELATED 2, ISOFORM A	13	1972	IPR026886	GO:0006914\|GO:0030242
	Car06g01715	1981	Pfam	N-terminal region of Chorein or VPS13	19	121	IPR026854	-
	Car06g01715	1981	PANTHER	AUTOPHAGY-RELATED 2, ISOFORM A	13	1972	IPR026849	GO:0006914
	Car06g01715	1981	Pfam	Autophagy-related protein C terminal domain	1880	1972	IPR015412	-

Pathway information

Select	Query	KO	Definition	Second KO	KEGG Genes ID	GHOSTX Score
	Car06g01715	K17906		-	gmx:100805552	2969.1

Event-related genes

Select	Gene_1	Chr_1	Start_1	End_1	Gene_2	Chr_2	Start_2	End_2	Event_name
	Car06g01715	06	16931828	16945000	Car06g01715	06	16931828	16945000	ECH