Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car03g02826 ATGGCTTCACCCAATGACCCATTGAATTCCACAACCCTTAAACTCATAAAAACCGAAACTTTAGAAAATATATTTAATTTATCTGACGGAAAATTTAAGATTAGAGGTGTTCCTTTGTTCCATGATGTTCCTAACAATGTTTCTTTCAGTTCGTTCTCATCTATATGTAAATTATCTGAATCCAATGCACCACCTTCAATCCTTCAACGTGTTCTTGATTTTTCTCACAAAGGTGGGTTCTTTGGATTCTCCCATGAAACCCCATCTGATAGATTGATGAATTCATTGGGTAGTTTCAACGGAAAAAACTTTGTGAGTATTTTCAGGTTCAAAACATGGTGGTCTACTCAATGGGTTGGAAATTCTGGTTCAGATTTACAAATGGAAACCCAATGGGTTCTTATTGAAATTCCTGAAATTAAATCCTATGTTGTAATAATTCCTATAATAGAAAATTGCTTTAGATCTTCTCTTAATCCTGGTTTTGATAACCATGTCATGATTTGTGCTGAAAGTGGTTCAACAAAAGTTAAAGAGTCAATTTTTAATGCAATAGCTTATGTTCATTTGTGTGAAAATCCTTATAATTTGATGAAAGAAGCTTATAGTGCTTTAAGGGTTCATCTCAATACTTTTAAGTTATTGGAAGAGAAAACAGTTCCAAATTTAGTTGATAAATTTGGTTGGTGCACTTGGGATGCTTTTTATTTAACTGTTAATCCTATTGGAGTTTGGCATGGTCTTGAGGATTTTTCGAATGCCGGTGTCGAACCGAGGTTTGTTATCATTGATGATGGTTGGCAGAGTATTAATTTGGATGGTTGTGATCCTAATGAAGATGCTAAGAATCTTGTTCTTGGTGGTGAACAAATGAATGGAAGACTTCATAGATTTGATGAATGTGACAAGTTCAAAAATTACAAAAGTGGATTGTTATTAGGTCCTAATTCTCCTCCTTTTAATCCAAAAACAATTAAGGAGTTGATTTCAAAGGGAATTGAACATGAGCATTTGGAGAAGCAAAGACAGGAGGCTATTTTATCAAAAAGTTGTGATTTGGTTGAGATTGAGTCAAAGATCAAGAAGTTGATAAAAGAAATTGATGACCTCTTTGGTGAAGAGAAAACTAGTAGTGATTCAAAAAGTGAATGTGGAAGTTGTTGTAAAGAAAATGAGTTTGGATTGAAGGCTTTCACAAGGGATTTGAGGACTAAGTTCAAAGGTTTGGATGATGTTTATGTTTGGCATGCACTTTGTGGTGCTTGGGGTGGTGTGAGACCAGGAACTACACACCTTAATTGCAAAATAGTCCCTTGTAAACTTTCTCCTGGTCTTGATGGTACAATGGAAGATCTTGCTGTGGTTAACATTGTCAAAGGTTCAATTGGGCTAGTTCATCCTGATCAAGCTAATGACTTTTATAATTCCATGCACTCTTATCTAGCTCAATCTGGTGTCACAGGAGTCAAAGTTGATGTCATTCATACTCTTGAATTCGTGTGTGAGGACTATGGAGGAAGAATTGACCTAGCCAAAGCTTACTATGAAGGGTTGACAAAATCCATTGCTAAGAATTTTAATGGAAATGGAATCattgctagcatgcaacaatgcaatgattttttcttccttggaacagagcaagtttccatgggaagagttgGCGATGATTTTTGGTTCCGAGATCCTAATGGTGACCCAATGGGAGTTTTTTGGCTACAAGGGGTACACATGATTCACTGTTCCTACAATAGCTTGTGGATGGGGCAAATGATTCAACCTGATTGGGACATGTTCCAATCAGACCATTTGTGTGCCAAATTTCATGCAGGTTCAAGAGCTATTTGTGGTGGTCCAATCTATTTGAGTGATAATGTTGGCTCTCATGACTTTGATTTGATTAAGAAACTTGTGTTCCCTGATGGTTCAATACCTAAATGCATACATTTTCCCCTTCCAACTAGAGATTGTCTTTTCAAGAATCCTCTATTTGACCAAACAACTCTTCTCAAAATTTGGAATTTCAACAAGTATGGAGGAGTGATTGGTGCTTTTAACTGTCAAGGGGCAGGATGGGACCCAAAATTGCACAAATTTAGGGGATTCCCAGAATGTTACAAACCAATAACTAGTACTGTGCATGTAACTGAAGTTGAATGGGATCAAAAAAAAGAAGCAACCCATTTGGGTAAGGCAGAAGAATATGTAGTTTATTTCAATCAAGCTGAAGAATTTTGTTTAATGACTCCAAAATCTGAACCAATCAAATTTACAATCCAACCATTAACATTTGAGTTATACAATTTTGTACCAATCACAAAGCTATGCGGTAGAATCAAATTTGCACCAATTGGATTAACAAACATGTTTAATAGTGGTGGTACAATTTTAGATTTGGAATATGTTGAAAGTGGTGTTAAGATTAAGGTTAAAGGTGGTGGGAATTTCCTTGCTTATTCAAGTGAATCACCAAAGAAGTTTCAATTGAATGGTTGTGAAGTGGATTTTCAGTGGATGTGTGATGGAAAATTGTCTCTTATTGTTCCTTGGATTGAAGAGGCTTTTGGGATTTCTGGTTTGGCAATTTTCTTCTAG 2595 0.3491 MASPNDPLNSTTLKLIKTETLENIFNLSDGKFKIRGVPLFHDVPNNVSFSSFSSICKLSESNAPPSILQRVLDFSHKGGFFGFSHETPSDRLMNSLGSFNGKNFVSIFRFKTWWSTQWVGNSGSDLQMETQWVLIEIPEIKSYVVIIPIIENCFRSSLNPGFDNHVMICAESGSTKVKESIFNAIAYVHLCENPYNLMKEAYSALRVHLNTFKLLEEKTVPNLVDKFGWCTWDAFYLTVNPIGVWHGLEDFSNAGVEPRFVIIDDGWQSINLDGCDPNEDAKNLVLGGEQMNGRLHRFDECDKFKNYKSGLLLGPNSPPFNPKTIKELISKGIEHEHLEKQRQEAILSKSCDLVEIESKIKKLIKEIDDLFGEEKTSSDSKSECGSCCKENEFGLKAFTRDLRTKFKGLDDVYVWHALCGAWGGVRPGTTHLNCKIVPCKLSPGLDGTMEDLAVVNIVKGSIGLVHPDQANDFYNSMHSYLAQSGVTGVKVDVIHTLEFVCEDYGGRIDLAKAYYEGLTKSIAKNFNGNGIIASMQQCNDFFFLGTEQVSMGRVGDDFWFRDPNGDPMGVFWLQGVHMIHCSYNSLWMGQMIQPDWDMFQSDHLCAKFHAGSRAICGGPIYLSDNVGSHDFDLIKKLVFPDGSIPKCIHFPLPTRDCLFKNPLFDQTTLLKIWNFNKYGGVIGAFNCQGAGWDPKLHKFRGFPECYKPITSTVHVTEVEWDQKKEATHLGKAEEYVVYFNQAEEFCLMTPKSEPIKFTIQPLTFELYNFVPITKLCGRIKFAPIGLTNMFNSGGTILDLEYVESGVKIKVKGGGNFLAYSSESPKKFQLNGCEVDFQWMCDGKLSLIVPWIEEAFGISGLAIFF 864
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car03g02826 864 PANTHER GALACTINOL--SUCROSE GALACTOSYLTRANSFERASE 4-RELATED 1 864 - -
Car03g02826 864 Pfam Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1 25 846 IPR008811 -
Car03g02826 864 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 223 637 IPR017853 -
Car03g02826 864 Coils Coil 353 373 - -
Car03g02826 864 PANTHER - 1 864 IPR008811 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Car03g02826 Car-Chr3 73646346 73650324 Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Car03g02826 1 864 Glycoside Hydrolase AT4G01970 57.631 0.0 1040
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car03g02826 K06611 - gmx:100815922 1393.64