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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car02g00526 ATGGAGTTGAGTTTATTTTCAAGATGGGTTTTTGTGGTTATGATGATGATGAATGATTGGTATGTGGTGGAAGGAGTTGGTGTGAATTGGGGAACACAAGCAACACATCCATTGAAGGCAGACACAGTTGTAGAAATGTTGAAAGATAATGGAATACAAAAAGTGAAATTATTTGATACAGATGATGCAACTATGAGTGCACTTGGTGGTTCTGGAATTGAAGTTATGGTTGCTATTCCTAATAATCAATTAGCTGAAATGAATAATTATGATCGTGCTTTGCAATGGGTTCGAAAGAATGTCACTCGTTTTACCTTCAAAGGTGGAGTCAACATCAAGTATGTAGCTGTTGGAAATGAGCCATTTTTGAAATCTTACAATAATACATTATTGAATGTAACCTTCCCTGCCTTACAAAACATTCAAAATGCCCTTAATGAAGTTGGATTAGGTGACTCTATAAAAGCCACAGTACCCTTAAATGCTGATATCTATGAATCTCCAATTGAAAATTCTGTTCCATCAGCTGGAATATTTAGGCCAGATTTAATTGGTCTAATGACACAAATAATCCAATTTTTGAACAAAAATAATGCACCATTCACAGTCAACATTTACCCTTTTTTAAGTCTTTATGGAAATGAAAATTTTCCATTTGACTTTGCATTTTTTGATGGAAATTCAAATCCAATAAATGACAATGGAATTTTATACACTAATGTTTTTGATGCAAATTTTGATACTTTAGTCTCAGCATTAAAATCAATTGGATTTGGTGACATGCCAATTTTTGTTGGAGAAGTTGGTTGGCCCACAGATGGTGACAAAAATGCAAATATTGAAAATGCATTAAGATTTTATAATGGGCTTTTTCAAAAAATTGCATCAAATAAAGGTACACCTAAAAGGCCTGGTTACATTGAAATTTATTTATTTGGATTAATTGATGAAGATGCAAAAGCAATTGCTCCTGGAAATTTTGAGAGACATTGGGGAATTTTTAGTTTTGATGGTAAACCAAAGTTTCCAATGCATATTTCTAGTCAAGGTCAAAATAAATTATTAATTGGTGCAAAAAATGTGTATTATCTTGATCCAAAGTGGTGCATTTTTAATCCAAATTCTAATAATTTAACCAAGCTTGCTGAAAATATTGATTATGCATGCACTTATGCTGATTGCACCCCCCTTGGATATGGTTCTTCTTGCAACAATTTGGATGCTAATGGAAATGCTTCTTATGCATTTAATATGTATTATCAAGTGCAAAATCAAGTTGACATGGCTTGCAATTTTGAAGGGTTGGCTATGGTTACTACAAAGAATATTTCAACTCCTACTTGTAATTTTATTATTGAGATTAACCCTTCATCTTCTTCTTATTTGTTTCCATCATTGGTTGCTTTTTTGTTTAGTATGCTACCTTTGATTTTATTGTGGTAG 1443 0.3243 MELSLFSRWVFVVMMMMNDWYVVEGVGVNWGTQATHPLKADTVVEMLKDNGIQKVKLFDTDDATMSALGGSGIEVMVAIPNNQLAEMNNYDRALQWVRKNVTRFTFKGGVNIKYVAVGNEPFLKSYNNTLLNVTFPALQNIQNALNEVGLGDSIKATVPLNADIYESPIENSVPSAGIFRPDLIGLMTQIIQFLNKNNAPFTVNIYPFLSLYGNENFPFDFAFFDGNSNPINDNGILYTNVFDANFDTLVSALKSIGFGDMPIFVGEVGWPTDGDKNANIENALRFYNGLFQKIASNKGTPKRPGYIEIYLFGLIDEDAKAIAPGNFERHWGIFSFDGKPKFPMHISSQGQNKLLIGAKNVYYLDPKWCIFNPNSNNLTKLAENIDYACTYADCTPLGYGSSCNNLDANGNASYAFNMYYQVQNQVDMACNFEGLAMVTTKNISTPTCNFIIEINPSSSSYLFPSLVAFLFSMLPLILLW 480
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car02g00526 480 Pfam X8 domain 367 437 IPR012946 -
Car02g00526 480 SMART X8_cls 367 450 IPR012946 -
Car02g00526 480 Gene3D Glycosidases 24 353 - -
Car02g00526 480 PANTHER GLUCAN ENDO-1,3-BETA-GLUCOSIDASE BG1-RELATED-RELATED 8 467 IPR044965 GO:0004553|GO:0005975
Car02g00526 480 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 26 345 IPR017853 -
Car02g00526 480 Pfam Glycosyl hydrolases family 17 26 343 IPR000490 GO:0004553|GO:0005975
Car02g00526 480 ProSitePatterns Glycosyl hydrolases family 17 signature. 261 274 IPR000490 GO:0004553|GO:0005975
Car02g00526 480 Gene3D - 364 460 - -
Car02g00526 480 PANTHER GLYCOSIDE HYDROLASE, FAMILY 17, X8 8 467 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Car02g00526 Car-Chr2 6246382 6251678 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Car02g00526 5 454 Miscellaneous Gene Families AT1G64760 70.000 0.0 657
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car02g00526 - - gmx:102666963 783.867
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Car03g01847 03 64623644 64628001 Car02g00526 02 6246382 6251678 PCT