Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bva10g00147 ATGGCTCGAGTTCGGTTTCGGCGTCTTCGTTTCTTTTCAATCTTCTTGCTCACCGCCCTCTTCTGGAGGAATAGAGTGTGTGGCAAATCCACGAGCAACGATTCGGACCATGATTTTTCGATAACTGAATTTGATTGGAACGTTTTTCATCAGGATTACTCCCCACCGgctccaccaccacctccaCCACACCCACCGTCAGTTTCTTGCACTGATGATCTTGGCGGGATTGGGTCTCTGGACACAACGTGCAAGATAGTGAACCATGTGAACCTCACCCGCGACGTGTACATAAAAGGGAAGGGCAATTTTTATATCCTACCTGGGGTGAGGTTTCATTGTCCGAGTCCTGGTTGTTTGATAACCATTAACATTACCGGTGATTTTAGTTTAGGTGATAACTCGTCGATTGTTACTGGAGCTTTTGAGTTGGAGGCATATAATGCTAGCTTACTAAATGGTTCGGTGGTGAACACGACGGCTATGGCGGGGCCACCTCCTCCACAGACGAGCGGAACCCCTCAAGGGGTGGATGGGGCAGGTGGAGGGCATGGCGGGAGGGGCGCGTGCTGTTTGACGGACCCAACTAAGCTTCCGGAAGATGTTTGGGGAGGAGATGCTTATTCTTGGTCTTCACTACAGAAACCAGATAGTTTTGGGAGTCGGGGTGGGTCGACGAGCAAGGAATCTGACTATGGGGGGATAGGTGGTGGCCGAGTGATGATGAAGATTTATATGTTTCTTGAGATGAATGCTAGTGTTTTGGCTGATGGGGGCGATGGGGGAATGAAAGGTGGAGGTGGCTCTGGAGGCAGCATCTTTATCATGGCTCACAGAATGACTGGTAGTGGGAGGATAAGTGCTTGTGGAGGTAATGGTTTtgctggtggtggtggtggaagAGTTTCAGTTGATGTTTTCAGTAGGCATGATGAACCCAAAATATATGTTCATGgTGGCAGGAGCTCTGGCTGTCCTGAAAATGCAGGTGGTGCTGGGACTTTGTATGATGCTGTTCCTCGAAGCCTTACAGTTGACAATTATAACATGTCCACTGATACAGAGGCGCTTCTCTTGGAATTTCCTAATCAGCCTCTTTGGACTAATGTTTATGTTCGAAATAAGGCTAGGGCTTTGGTTCCCCTGCTTTGGAGTCGTGTCCAGGTGCAAGGCCAGATTAGTCTCTTGCAGGGTGGAGTATTGAGCTTTGGGTTGCAACACTATGCTTCATCAGAGTTTGAGTTATTGGCTGAAGAACTTTTGATGAGTGATTCTGTGATGAAGGTATATGGAGCTCTACGCATGTCTGTAAAAATGTTCTTGATGTGGAACTCAAAATTGCTCATTGATGGTGGGGGAGATATAACAGTTGCGACTTCTTTGCTTGAGGCCAGTAATTTGGTCGTTCTCAAGGGGTCTTCGGTGATACACTCTAATGCAAACCTCGGAGTCCATGGACAAGGTCTACTTAATTTGTCGGGCCCAGGGGACTGGATTGAGGCACAGCGTTTGGTTCTATCGctattttatagaattaatGTCGGACCTGGATCTGTCTTGCGTGGTCCATTGGAGAATGCAACAACTGACGATGTGACACCAAAACTCTACTGTGACAGCAAAGATTGTCCCAATGAGTTACTTCATCCTCCTGAAGATTGTAATGTGAATTCATCCTTGTCATTCACCCTTCAGATTTGCCGAGTTGAGGACATTGTTGTTGAAGGCCTTATAAAAGGTTCTGTTGTTCATTTCCACCGGGCAAGGACCATAAATGTTGAATCTTCTGGAACAATATCTGCATCTGGAATGGGCTGCACTGGTGGTTTGGGCAGAGGAGATCTTCTAAGTAATGGTATTGGCAGTGGTGGTGGGCATGGTGGGAAAGGTGGGAAAGGGTGTTTCAATGATGATTGTGTTGAGGGTGGCATTACGTATGGAAGTGCTGAACTGCCATGTGAGCTTGGTAGTGGAAGTGGAAATGACAGCTCAGCTGGTATGACATCTGGTGGTGGAATCATAGTTGTTGGATCATTCGAGCATCCTTTGTCAAGTTTGTCCATTCTGGGTTCCGTAAGAGCTGatggacaaaattttaaagggGCAACCAAAGGGGAAATTTTTGCCATATTTGGAGGTTTAAATGGAGATCCTGGGGGTGGATCTGGTGGTACTATACTTGTGTTTCTCCATACCTTGGCCATTGGTCAGTCCGCTATTCTTTCTAGCATGGGGGGATATGGCAGTTCTACTGGgggtggtggtggaggtggTGGAAGAATTCACTTTCATTGGTCTGACATTCCCACTGGAGATGTTTATCAGCCCATTGCCAGTGTGGAAGGATGCATCCATACTGGGGGAGGGAAGGGTAGAGGCCAGGGTGTCGCTGGAGAAAATGGAACTATTACTGGCAAAGCTTGTCCCAGAGGGCTTTATGGTACATTTTGTGAGGAATGTCCAGCTGGCACTTACAAGAACGTTATTGGATCTGATAGATCACTTTGTCGCCCCTGTCCTGTTCATGAGCTTCCGGACCGTGCTGTCTATATTTCAGTCCGAGGTGGTATTGTTGAAACTCCCTGCCCTTACAAATGCATTTCAGATCGATATCACATGCCAAACTGTTATACAGCTCTAGAAGAGTTAATTTACACATTTGGTGGGCCTTGGCTGTTTTGTCTCTTTCTGATGGGTCTCTTAATCCTATTAGCTCTGGTGCTTAGTGTTGCTCGAATGAAATTTGTTGGAGTTGATGAATTACCAGGCCCAGCTCCCACTCAACAGGGTTCTCAAATAGATCACTCTTTCCCTTTCCTGGAGTCACTAAATGAGGTTTTGGAAACAAACAGAGTTGAGGAATCCCAGAGTCATGTGCACAGAATGTACTTTATGGGACCAAATACCTTCAGTGAACCCTGGCATCTTCCGCATGCACCTCCTGAACAAATAAGGGAGATTGTgtATGAGGGTGCATTCCATTCATTCGTGGATGAAATTAATGCTATAGCAACTTATCAGTGGTGGGAGGGAGCAATATATAGCATTCTTTCAGTCCTAGCATATCCCCTTGCATGGTCATGGCAACAATGGCGTCGCAGAATGAAGTTACAACGATTGCGTGAGTTTGTTCGATCAGAATATGATCATGCTTGCCTCTGTTCTTGTCGTTCACGGGCTCTGTATGAGGGGATCAAGgtaGCTGCAACTTCTGATTTGATGCTTGCATATGTGGACTTCTTTCTTGGTGGGGATGAGAAGAGAAGTGACCTTCCTCCTCGATTACATCAAAGGTTTCCTATGTCGCTTCTTTTTGGAGGTGATGGAAGCTATATGGCTGCATTCTCCCTTCACAATGATAATATCCTTACCAGTCTAATGAGTCagTCAGTTCCACCTACTACATGGTATAGACTGGTTGCTGGTTTGAATTCACAGTTGCGGCTGGTTTGCCGTGGACGACTAAGAGTGACATTTCGATATGTCCTCAGATGGCTTGAGACTCATGCCAATCCCGCATTGAAAGTCCACGGTGTGAGGGTTGATCTTGCCTGGTTTCAGGCTACAACTAGTGGTTATTGCCACTATGGACTACTTGTTTATTCAATTGAAGAAGGTAACCCTGTATTTACTAGAGGAAGTCTTGACGGAGCTATAAGAACCGAGGCAACATCAGGGGTTTGGAGCCTTAAGAAGGAACTTCCTTCTGAGCTTCCAAGAGAACACTTAAGCCTTAATGAAAGAATCGAGGAAAACTATGTGAGGCGAAAGACACCTGGAGCTGTTTTAGATTTAAACAGTCTGCGGATGcttgaagagaagagagatatcttttatattctctcttttatacTTCATAATACAAAACCTGTTGGACATCAGGATCTTGTTGGTTTAGTAATCTCGATGCTGCTTCTAGGAGATTTTAGCTTAGTATTACTCACTCTGCTTCAGTTGTATTCAATTTCATTGGTGGAcgtctttcttgttttgttaatattaCCTTTCGCCATTCTTCTCCCATTTCCTGCTGGAATTAATGCTCTCTTCAGCCATGGACCAAGGCGTTCTGCCGGACTTGCACGTGTGTATGCTCTATGGAATCTTACATCCTTCATTAATGTTGTGGTTGCATTTCTTTGTGGATATATTCATTACAACTCTCAGTCTTCCAGTAAAAAACATCCCAACTTTCAGCCATGGAGTTTTAGCGTGGATGAAAGTGAATGGTGGATTTTCCCCGCTGGATTGGTTTTGTGTAAATTGTTCCAGTCTCAACTCATCAATTGGCATGTCGCAAATTTGGAGATTCAAGACCGTTCGTTGTATAGTAATGATTTTGAGCTGTTCTGGCAGTCTTG 4361 0.4384 MARVRFRRLRFFSIFLLTALFWRNRVCGKSTSNDSDHDFSITEFDWNVFHQDYSPPAPPPPPPHPPSVSCTDDLGGIGSLDTTCKIVNHVNLTRDVYIKGKGNFYILPGVRFHCPSPGCLITINITGDFSLGDNSSIVTGAFELEAYNASLLNGSVVNTTAMAGPPPPQTSGTPQGVDGAGGGHGGRGACCLTDPTKLPEDVWGGDAYSWSSLQKPDSFGSRGGSTSKESDYGGIGGGRVMMKIYMFLEMNASVLADGGDGGMKGGGGSGGSIFIMAHRMTGSGRISACGGNGFAGGGGGRVSVDVFSRHDEPKIYVHGGRSSGCPENAGGAGTLYDAVPRSLTVDNYNMSTDTEALLLEFPNQPLWTNVYVRNKARALVPLLWSRVQVQGQISLLQGGVLSFGLQHYASSEFELLAEELLMSDSVMKVYGALRMSVKMFLMWNSKLLIDGGGDITVATSLLEASNLVVLKGSSVIHSNANLGVHGQGLLNLSGPGDWIEAQRLVLSLFYRINVGPGSVLRGPLENATTDDVTPKLYCDSKDCPNELLHPPEDCNVNSSLSFTLQICRVEDIVVEGLIKGSVVHFHRARTINVESSGTISASGMGCTGGLGRGDLLSNGIGSGGGHGGKGGKGCFNDDCVEGGITYGSAELPCELGSGSGNDSSAGMTSGGGIIVVGSFEHPLSSLSILGSVRADGQNFKGATKGEIFAIFGGLNGDPGGGSGGTILVFLHTLAIGQSAILSSMGGYGSSTGGGGGGGGRIHFHWSDIPTGDVYQPIASVEGCIHTGGGKGRGQGVAGENGTITGKACPRGLYGTFCEECPAGTYKNVIGSDRSLCRPCPVHELPDRAVYISVRGGIVETPCPYKCISDRYHMPNCYTALEELIYTFGGPWLFCLFLMGLLILLALVLSVARMKFVGVDELPGPAPTQQGSQIDHSFPFLESLNEVLETNRVEESQSHVHRMYFMGPNTFSEPWHLPHAPPEQIREIVYEGAFHSFVDEINAIATYQWWEGAIYSILSVLAYPLAWSWQQWRRRMKLQRLREFVRSEYDHACLCSCRSRALYEGIKVAATSDLMLAYVDFFLGGDEKRSDLPPRLHQRFPMSLLFGGDGSYMAAFSLHNDNILTSLMSQSVPPTTWYRLVAGLNSQLRLVCRGRLRVTFRYVLRWLETHANPALKVHGVRVDLAWFQATTSGYCHYGLLVYSIEEGNPVFTRGSLDGAIRTEATSGVWSLKKELPSELPREHLSLNERIEENYVRRKTPGAVLDLNSLRMLEEKRDIFYILSFILHNTKPVGHQDLVGLVISMLLLGDFSLVLLTLLQLYSISLVDVFLVLLILPFAILLPFPAGINALFSHGPRRSAGLARVYALWNLTSFINVVVAFLCGYIHYNSQSSSKKHPNFQPWSFSVDESEWWIFPAGLVLCKLFQSQLINWHVANLEIQDRSLYSNDFELFWQS 1453
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bva10g00147 1453 SMART GCC2_GCC3_2 814 862 - -
Bva10g00147 1453 MobiDBLite consensus disorder prediction 162 184 - -
Bva10g00147 1453 PANTHER - 31 1452 - -
Bva10g00147 1453 PANTHER EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 31 1452 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bva10g00147 Bva-Chr10 3017647 3027879 Dispersed/Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bva10g00147 - - gmx:100804207 2291.54
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Bva10g00147 10 3017647 3027879 Bva10g00147 10 3017647 3027879 ECH
Bva10g00147 10 3017647 3027879 Bva06g02583 06 16304602 16314393 ECH