LGRPv2

Gene search

Sequence information

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	Bva02g01926	atgtcttttttcaaattcagTCCGATTCTCAGCTTTTTCGtgctctttttttgtttctttgggCTCTGCTGTGCAAATGATGAACTGGGTTCTGATGATACCTTTACTGTTTCCAGCTTCAGCTATCCTGAAACTACTCTCAGGCCCTTTGATTTGCGGTACATCAGAGTTGATTTGCCACAGTGGTTTTCTGCAGTGTCTATAGCATTAAACTCAGATGTACATCTTGATGTTGAAAGGGTTGAAAGAATTCCCGAAAGCGCACTTCCAATAATATGCTTTAGAGATGGCAGCCCTCCACTGCCAGATGCCTTAAACACTTCTCTGAAAGATTCAGCCATCTCCGGAATAAGCGGTCTTGATGTGGAGCAGTGCTTTCCCatgcagaaaaatataacaatgaaATTGACAAATGAGCAGATATCTCCAGGTGTTTGGTACATTGGTCTTTTCAATGGCATTGGCGCTACAAGGACACAATCGAAGATGATTGTACGAGGTTCATCATATTCATTCAGTGCCAATGTAAGTGTAGAAGCCTGCACAAATTCAATAATGTGGGGACAGTTCTGCAACAGCACGATCCATTCACTTTCATGCACAGCATCTAATGCTCAGAATGCTTCCAATGCAACAGCAAGCAAGCCAATGATGGGAAGTATAATGTACTGCAGAAATAGCCTTGACAGTTTATGTGTTCAGGAGGGTGTACCAAATTTGTACTCATTGGATATAATGAATGTGGCTGAAGAGCTGACAATTACAGCCGCAAGTGTCAGATTCAATGCTACACCTTCAAATAATACTCCTGGTGCAAGTGATGTTAATCTAATGTGTTATGTTCGTCATGGCGCAATACCTTCAGCATCTTTGCATGATTATTCCAGTAACTTAAATAAAGCTCCCTTGGTTATTCGCTCGCCACTAATTGGTCGTTGGTACATTAGTATATTGCCGGTTAATCTTACAACAAAATTGGGAGGGACTCCAGAAAGTGATTTAAGAGTTTGTTATGTTTTGGAATCACAAGTGCTTGAATGCCCATATGGGAAAGCTGGACCAAATTGTACAACAGAAATCTACATACTTCAGACAGTTCTAAGGAGTGGTTCATTCCCCTttgaatcatattatttaCCAGTTGGTGGAGAAGTGTCCTCCAATTCAGCCAATTTCCCTCTTGAGCTACTTTTAAGCAACTCATCATACATTGGGGAGCTTGATGACATTTGGACTTACTTTCTTTTGGACATTCCACGTGGTGCAGCTGGAGGTAATATTCATGTACGACTATCCTCAGATGTGAAGATCAGTTATGAAGTATATGCTAGATTTGGTGGATTACCATCCATTGATAGCTGGGACTATTATTATGCCAACAAGACAAGGAGGAGTGATCAATCTATGTTCTTTATCCTGTATGATTCAAGTGATGATAAGGTTGActtttacattatatatgCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTTGGTCTAAGACATCTTAATACTGGAATTACTACATCAAATGGTCAGACCGTCATGTCTCTTTCACTTGAACGATGCCCGAAACGATGCTCCTTTCATGGGAGctgcaaattttcttttgatgctaGTGGATTGACATCATACAGCTTCTGCTCTTGTGACCGAGACCATGGAGGCTTTGACTGTAGCATTGAAATTGTAACACATCAAGGGCACATACGGCAgtcaatttttcttattgcaTCAAATGCTGTGGCCTTACTTCCTGCTTATTGGGCCCTCCGACAGAAGGCATTTGCAGAATGGATTTTGTTCACATCCAGTGGAATTTCCAGTGGACTATATCACGCTTGTGATGTAGGCACATGGTGTGCATTGGGCTACAATGTTTTACAGTTCATGGACTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTTATTAGCACTTTTGTCTACCTAGCTACCATTGATGAAGTATATAAGAGGGCAATTCACACAGCTGTTGCTATCCTTACGGCCCTGATGGCTTATACTCAGGCAACCAGGTCTTCCAATATTGTTCTTGTCATAGTGATTGGGGCTCTTGGTCTTCTTATTGGATGGTTGATAGAGATCTCTACAAAGTATAGGTcactttccttttcaattggATTTTCACTAAATTTCAGTAACAGCTGGCAAACAATAAAGCGATGGAGCTGTAATCTTGTTAAGACACTTCTAAGACGGTTCCGTTGGTATTTTGCCCTTGCTGGTTTTTTAGCACTGGCCATGGCAGCAATGAGCTGGACACTCGAAACCAGTGAAACCTACTGGTTTTGGCACagTGTTTGGCATATTACAATATACAtatcttccttcttcttcctttgttcaAAAGTAAATATTGTCAATAGTGAGAATCAGCTGGCTGCAAATGGAAACTATGAATTGACTCGTCAGGATTCATTTCCAAGAAGTAACTA	2438	0.386	MSFFKFSPILSFFVLFFCFFGLCCANDELGSDDTFTVSSFSYPETTLRPFDLRYIRVDLPQWFSAVSIALNSDVHLDVERVERIPESALPIICFRDGSPPLPDALNTSLKDSAISGISGLDVEQCFPMQKNITMKLTNEQISPGVWYIGLFNGIGATRTQSKMIVRGSSYSFSANVSVEACTNSIMWGQFCNSTIHSLSCTASNAQNASNATASKPMMGSIMYCRNSLDSLCVQEGVPNLYSLDIMNVAEELTITAASVRFNATPSNNTPGASDVNLMCYVRHGAIPSASLHDYSSNLNKAPLVIRSPLIGRWYISILPVNLTTKLGGTPESDLRVCYVLESQVLECPYGKAGPNCTTEIYILQTVLRSGSFPFESYYLPVGGEVSSNSANFPLELLLSNSSYIGELDDIWTYFLLDIPRGAAGGNIHVRLSSDVKISYEVYARFGGLPSIDSWDYYYANKTRRSDQSMFFILYDSSDDKVDFYIIYAREGTWGFGLRHLNTGITTSNGQTVMSLSLERCPKRCSFHGSCKFSFDASGLTSYSFCSCDRDHGGFDCSIEIVTHQGHIRQSIFLIASNAVALLPAYWALRQKAFAEWILFTSSGISSGLYHACDVGTWCALGYNVLQFMDFWLSFMAVISTFVYLATIDEVYKRAIHTAVAILTALMAYTQATRSSNIVLVIVIGALGLLIGWLIEISTKYRSLSFSIGFSLNFSNSWQTIKRWSCNLVKTLLRRFRWYFALAGFLALAMAAMSWTLETSETYWFWHSVWHITIYISSFFFLCSKVNIVNSENQLAANGNYELTRQDSFPRSN	812

Annotation information

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	Bva02g01926	812	ProSitePatterns	EGF-like domain signature 1.	545	556	IPR000742	-
	Bva02g01926	812	PANTHER	FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83	10	812	IPR021910	GO:0016021
	Bva02g01926	812	PANTHER	TRANSMEMBRANE PROTEIN-LIKE PROTEIN	10	812	-	-
	Bva02g01926	812	Pfam	Protein of unknown function (DUF3522)	566	771	IPR021910	GO:0016021

Duplication type information

Select	Gene	Chromosome	Start	End	Duplicated_type
	Bva02g01926	Bva-Chr2	20710639	20717321	Dispersed/Wgd

Pathway information

Select	Query	KO	Definition	Second KO	KEGG Genes ID	GHOSTX Score
	Bva02g01926	-		-	gmx:100778959	1246.11