Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bach6g00101 CTCTTCTGTATCTCTCCCTTTCTCTCTCTCTCTTTCTTACTCTCCTACATTTCAATTTCAATTTTGTATCCTTTGTAGACGTGTTTGTCTCTCTCAAGAATTTGCAAGCTTTCCTCACGTTTTCCCTTTCAAGTTCCGTGGTTGTTTTCGTCGACCTAAGATCTGCTGTACGCCTTAAAGGATCCGGAGGTCCTTTTGTATGTTTTGGTTGTTATTCTTCTGGAAGTGAGAAGTTTTGCAGTTTGTTTGAATTTGTTTACGAGGAATGCCGCTTTTGCCAAAGAGCGATTCCATCCAGATTCGCGAGGTGTGGAATGATAATCTGGAAGAAGAATTCGCCTTGATTCGGGATATAGTCGATGATTATCCTTTCATTGCTATGGATACAGAGTTTCCTGGAATTGTTCTTCGTCCCGTGGGCAACTTCAAAAGTAACTATGATTACCATTACCAGACTTTGAAGGACAATGTTGATATGCTGAAATTGATTCAATTGGGCCTCACATTTTCAGATGAGCAAGGAAATTTACCTACATGTGGGACAGACAAGTATTGCATCTGGCAATTCAATTTCCGAGAATTCAATGTGAATGAAGATGTTTTTGCTAATGATTCAATTGAGCTTTTGCGCCAGAGTGGCATCGATTTTAAGAAGAACAATGAAAAGGGTATTGATGCCCAACGTTTTGGTGAGCTCTTGATGTCATCTGGAATTGTTTTGAATGATAATGTTCACTGGGTTACTTTTCATAGTGGATATGATTTTGGATACCTGCTGAAACTCTTGTCATGCCAGAGTTTGCCAGATACGCAAGTGGGGTTCTTTAACCTCATTAACTTGTATTTCCCAACTATCTATGATATCAAGCATTTGATGAAATTTTGCAACAGCCTTCATGGAGGTTTGAACAAGCTTGCTGAGTTGTTGGAAGTCGAGAGGGTTGGCATTTGCCATCAGGCTGGTTCGGATAGTTTGCTCACATCTTGTACATTCAGGAAACTGAAGGAAAATTTCTTTAGCGGCTCTTTGGAGAAATATGCCGGTGTCTTGTACGGTTTAGGCGTTGAAAATGGACAGACTGCCCATTGAATGCCGCTTTTGCCAAAGAGCGATTCCATCCAGATTCGCGAGGTGTGGAATGATAATCTGGAAGAAGAATTCGCCTTGATTCGGGATATAGTCGATGATTATCCTTTCATTGCTATGGATACAGAGTTTCCTGGAATTGTTCTTCGTCCCGTGGGCAACTTCAAAAGTAACTATGATTACCATTACCAGACTTTGAAGGACAATGTTGATATGCTGAAATTGATTCAATTGGGCCTCACATTTTCAGATGAGCAAGGAAATTTACCTACATGTGGGACAGACAAGTATTGCATCTGGCAATTCAATTTCCGAGAATTCAATGTGAATGAAGATGTTTTTGCTAATGATTCAATTGAGCTTTTGCGCCAGAGTGGCATCGATTTTAAGAAGAACAATGAAAAGGGTATTGATGCCCAACGTTTTGGTGAGCTCTTGATGTCATCTGGAATTGTTTTGAATGATAATGTTCACTGGGTTACTTTTCATAGTGGATATGATTTTGGATACCTGCTGAAACTCTTGTCATGCCAGAGTTTGCCAGATACGCAAGTGGGGTTCTTTAACCTCATTAACTTGTATTTCCCAACTATCTATGATATCAAGCATTTGATGAAATTTTGCAACAGCCTTCATGGAGGTTTGAACAAGCTTGCTGAGTTGTTGGAAGTCGAGAGGGTTGGCATTTGCCATCAGGCTGGTTCGGATAGTTTGCTCACATCTTGTACATTCAGGAAACTGAAGGAAAATTTCTTTAGCGGCTCTTTGGAGAAATATGCCGGTGTCTTGTACGGTTTAGGCGTTGAAAATGGACAGACTGCCCATTGAAAAATGAAATTAGAAAGAAAAAAAAAAAAAAGTTGTTCAAATGTTATTAGAAGTTTGTTGTTTAACCTGTACATCTTTTGAATATCCACATCCTACCTCTATGTAAGCCTCCGACATTAAGTGTCTTAAATTATAAATAATTTTTC 2061 0.394 MPLLPKSDSIQIREVWNDNLEEEFALIRDIVDDYPFIAMDTEFPGIVLRPVGNFKSNYDYHYQTLKDNVDMLKLIQLGLTFSDEQGNLPTCGTDKYCIWQFNFREFNVNEDVFANDSIELLRQSGIDFKKNNEKGIDAQRFGELLMSSGIVLNDNVHWVTFHSGYDFGYLLKLLSCQSLPDTQVGFFNLINLYFPTIYDIKHLMKFCNSLHGGLNKLAELLEVERVGICHQAGSDSLLTSCTFRKLKENFFSGSLEKYAGVLYGLGVENGQTAH 274
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bach6g00101 274 PANTHER CCR4-NOT TRANSCRIPTION COMPLEX SUBUNIT 10 266 IPR039637 GO:0004535|GO:0030014
Bach6g00101 274 Pfam CAF1 family ribonuclease 15 136 IPR006941 -
Bach6g00101 274 FunFam Putative CCR4-associated factor 1 7 2 269 - -
Bach6g00101 274 Gene3D - 2 269 IPR036397 GO:0003676
Bach6g00101 274 SUPERFAMILY Ribonuclease H-like 12 265 IPR012337 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bach6g00101 Bach-Chr6 758252 759590 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bach6g00101 K12581 - zju:107409059 538.88