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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Arst8g02545 ATGGAGTCAATACTAGCTCGTGCTCTAGAGTACACACTCAAGTATTGGCTCAAATCCTTCTCCAGAGAGCAGTTCAAGCTTCAAGGCCGCACTCTAAGTCTCTCCAATTTAGATATCGATGGTGATGCCTTGCATTCCAGCTTGGCCTTGCCACCTGCGCTTAACGTTTCCACCGCTAAAGTTGCCAAATTGGACATCATGCTTCCTTCCGTGAGTAATGTGCAAGTAGAGCCGATCATTGTGCAAATTGATCGGCTTGATCTAGTTCTGGAGGAGAATTCTGATTTTGATGCATCTGTTAGTAGTAACAACAGTGCCACTTCATCGGCTGCCACCTCGAAGGGTAGTGGTTATGGTTTTGCTGATAAGATTTCTGATGGCATGACTATACAAATTCACACAGTTAATCTATTACTTGAAACTCGTGGTGGTGGGGGGGCGCGTCGAAAAGTGGGAGCAACATGGGCACCACCAATGGCATCTATCACAATACATAACCTTTCGCTGTATACCACAAATGAAAGCTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAAGCACGGGAATTCTCCAGTAACAAGAAATATATATATGTCTTCAAAAAACTAGAATGGGAATCTTTGTCTATTGATCTTTTGCCTCATCCTGACATGTTCGCGGATGCTGCATTAGGCTTCTCTGAAGAGGGATCAAACCTGAGAGATGATGATGGTGCAAAGCGAGTATTCTTTGGAGGAGAGCGTTTTATTGAAGGAATATCAGGAGAAGCATATATAACAGTTCAGAGAACTGACTTGAACAGTCCACTTGGGCTTGAGGTTCAGTTGCACATCAATGAAGCTGTTTGCCCTGCACTAAGTGAACCTGGCCTACGCGCACTTCTCCGCTTTATGACAGGATTATATGTCTGTCTAAACAGGGGCGATGTTGATTTAAAGACTCAGCAGCAGCGATCAACTGAAGCTGCTGGGCGTTCTCTGGTCTCGATTGTTGTAGATCATATATTTCTTTGCATTAAAGATACTGAATTCCAGCTTGAGCTTTTGCTGCAGTCCCTCTTTTTCTCTCGGGCCAGTCTTTCTGAAGGAGAGAATGACAATAACTTGACCAAGATTACAATTGGTGGAATAATTTTAAGGGACATCTATTCATCTCCGCAGTGTACACTAGTGCAACCATCGATGCAAGCTGTCACAAAAGATGCTTTCCATGTGCCTGAATTTGCTAGAAGCTTTTGCCCTCCAATATACCCTCTAGGAGAACAGCAGTGGCAAGTGATTGAGGGAATCCCTCTAATATGCCTCCATGCACTTCAAGTCATGCCTTCACCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTCAGACAGTTATTGATTGTCAGCCTCTTATGGTTCATCTTCAGGAGGAAACATGCCTGAGGATATCCTCATTCTTAGCTGATGGTATTGTTGTCAGTCCTGGTGACATTCTACCGGACTTCTCAATAAAATCTTTTATTTTCAGTCTCAAGGGGCTTGACCTTACAGTTCCACTAGACAACATTGAAACTGATATTTCTAAAATCTACATGGATAATAATACAGTTCAGACCTCCTTCACTGGAGCAAGACTCCATATTGAAAACCTTTTCTTTTCTGATTCACCCTCATTGAAACTAAGAATGCTGAACCTTGAAAAGGATCCTGCTTGTTTTAGTCTTTGGGAAGGTCAACCGATCGATGCTAGCCAGAAGAAGTGGACTGCCAGAGCATCGCAGCTTACTTTGTCCCTGGAGGCATGTAATGACAAAATCAAACTTCAAAATTACCTTGGACAAACTGGAGGACTGTTGAGATGTGTTGATCTCAAAGATGCTTGCATTGAAGTAGCTATGGCAACTGCTGATGGCAGTCCACTGTTACATATTCCTCCTTCAGGGGGTATTGTCAGGGTTGGAGTTGCTTGTGGCCAGTATCTATCCAACACTTCTGTTGAACAATTATTTTTTGTCCTGGACGTCTATGGTTATTTTGGGCGAGTTAGTGAGAAAATAGCTATGGTTGGGAAAAGGAAACAATTAGAGGACATTAGAGACAAGTCTTTTAGTGGAAAGCTGATGGACAAGGTTCCCAGTGATACTGCTGTGAGTTTAACAGTAAAGGACCTCCAACTTAGATTTCTAGAGTCTTCGGTGAATGTTGAGGGAATGCCTTTAGTACAGTTTATCGGAGATGATCTATTCATTAATGCCGCCCATAAAACCCTTGGAGGGGCTATTGTTGTTTCATCTACTTTACGGTGGGAGAGTGTCCAGATAGATTGTGTGGATGCTGAGGGGCACTTACCATGTGAAAATGGATCATTCTTGAGTCCTAGCGAAAATGTTCCCTCACCAAGTGATAATGGATATCCTCATCTAAGAGCTGTTTTTTGGGTAGATAAGAATAAGAAACATCCAATGAATGGAAATGCTCATTCAATCCCTTTTCTAGACATCAGTATGGTTCATGTCATTCCACTATTCGAGCAAGATATGGAGTCTCATAGTTTAAATGTGTCAGCTTCTGTTTCTAGTGTTCGACTTGGTGGAGGAATGAACTATGCTGAAGCCCTCCTGCATAGATTTGGAATACTTGGACCTGATGGAGGCCCTGGGACAGGCCTTTCAAAAGGGTTGGAAAACTTACAAAAAGGACCCTTATCAAAACTTTTTAAGACAACACCTCTCATGGTTGATAATTCAGAAGATGCTGAAAGTATGAGACAAGGGGAGGAAACCAGTTTTCCACACCTGAAGAAGCCAGATGACGTGGATGTAACTATAGAATTGAGAGACTGGTTATTTGCTCTTGAAGGTGCAGATCAGATGGCTGAACAGTGGTGGTTCTCCAGTCTTGAGGTTGTAGACAGAGAAGAGAGGTGTTGGCACACAACTTTCCGTGGTTTACGAGTAAATGCAAAAAGTAGCCCAAAGAAGGTTCTAGATGGCAAAGCACAATTGCGGCGGATAAAACAAAATCCAATAGAGCTTGTTACGGTAGGAATTGAAGGGCTACGAATATTAAAGCCTCATATCCAAAAGGGCAATCCTCCATCAATGTTAATTGCAAACGGGGATAAAGAAAATAGTAACACAATTGAGGGAGTTGGTCTTGAAGTTCGCTTGATATTATGTGAGGACAACCCTGATGACATAGTGAATTGGGAAGTGGAAGACATAAAGTTCGCTGTTAAACAACCGATTGAAGCAGCAGTAACCAAGGATGAGCTTCAGCACCTCACTTTGCTGTGCAAATCTGAAATTGATTCGATTGGCCGAATCACTGCTGGAGTTTTGCGGCTGCTTAAGCTGGAAGGTTCTGTTGGTCAGGCTGTAATAGATCAACTTGGTAATCTAGGAAGCGAGGGCATTGACAAGATTTTCTCTTCTGAAAAGGTTACCAGAGATGGTAGTGTTGTTGGTAATAGAGGACATTCTCCCTTACCAAGCGGGGTTAATGAAGGACCACACAAAACCATGGAAGAGACATTAACTCAGCTTGAGGAAGTGGTTGTAGAGTCACAGGCTAAACTCAGTGAACTAATCACTCATGTTGGTACTTTGGACTCTTCTTCCACTCAGCACCGTACCATTGTCAAACTAAGTCAAAAGATTGAGACCATGCAGGGCCTATTGATGCAGTTGAGGAATCAACTTTAA 3663 0.4275 MESILARALEYTLKYWLKSFSREQFKLQGRTLSLSNLDIDGDALHSSLALPPALNVSTAKVAKLDIMLPSVSNVQVEPIIVQIDRLDLVLEENSDFDASVSSNNSATSSAATSKGSGYGFADKISDGMTIQIHTVNLLLETRGGGGARRKVGATWAPPMASITIHNLSLYTTNESWQVVNLKEAREFSSNKKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFADAALGFSEEGSNLRDDDGAKRVFFGGERFIEGISGEAYITVQRTDLNSPLGLEVQLHINEAVCPALSEPGLRALLRFMTGLYVCLNRGDVDLKTQQQRSTEAAGRSLVSIVVDHIFLCIKDTEFQLELLLQSLFFSRASLSEGENDNNLTKITIGGIILRDIYSSPQCTLVQPSMQAVTKDAFHVPEFARSFCPPIYPLGEQQWQVIEGIPLICLHALQVMPSPLPPSFASQTVIDCQPLMVHLQEETCLRISSFLADGIVVSPGDILPDFSIKSFIFSLKGLDLTVPLDNIETDISKIYMDNNTVQTSFTGARLHIENLFFSDSPSLKLRMLNLEKDPACFSLWEGQPIDASQKKWTARASQLTLSLEACNDKIKLQNYLGQTGGLLRCVDLKDACIEVAMATADGSPLLHIPPSGGIVRVGVACGQYLSNTSVEQLFFVLDVYGYFGRVSEKIAMVGKRKQLEDIRDKSFSGKLMDKVPSDTAVSLTVKDLQLRFLESSVNVEGMPLVQFIGDDLFINAAHKTLGGAIVVSSTLRWESVQIDCVDAEGHLPCENGSFLSPSENVPSPSDNGYPHLRAVFWVDKNKKHPMNGNAHSIPFLDISMVHVIPLFEQDMESHSLNVSASVSSVRLGGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGTGLSKGLENLQKGPLSKLFKTTPLMVDNSEDAESMRQGEETSFPHLKKPDDVDVTIELRDWLFALEGADQMAEQWWFSSLEVVDREERCWHTTFRGLRVNAKSSPKKVLDGKAQLRRIKQNPIELVTVGIEGLRILKPHIQKGNPPSMLIANGDKENSNTIEGVGLEVRLILCEDNPDDIVNWEVEDIKFAVKQPIEAAVTKDELQHLTLLCKSEIDSIGRITAGVLRLLKLEGSVGQAVIDQLGNLGSEGIDKIFSSEKVTRDGSVVGNRGHSPLPSGVNEGPHKTMEETLTQLEEVVVESQAKLSELITHVGTLDSSSTQHRTIVKLSQKIETMQGLLMQLRNQL 1220
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Arst8g02545 1220 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 105 IPR026854 -
Arst8g02545 1220 Coils Coil 1199 1220 - -
Arst8g02545 1220 MobiDBLite consensus disorder prediction 1137 1158 - -
Arst8g02545 1220 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1218 IPR026728 -
Arst8g02545 1220 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1218 IPR026728 -
Arst8g02545 1220 Coils Coil 1158 1178 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Arst8g02545 Arst-Chr8 34752529 34760126 Dispersed/Tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Arst8g02545 - - adu:107490943 1911.35
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Arst8g02545 8 34752529 34760126 Arst8g02545 8 34752529 34760126 ECH
Arst8g02545 8 34752529 34760126 Arst3g02123 3 25937497 25945699 PCT