Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Arst6g01394 ATGACATCAATTGATGAAGTTCTTCTTCTCTCCCAAGTATATAACCGAAAGGATTGTGAGCCTGGAGTTGTTCTAGTTGAGTTTGTCTTCTCAATTGTTTGGCAGTTACTTGAAGCATTACTAGATGATGAAGGATTACTGGATCATGCATCGGAGGATAATCCTAGATGGCTAAGGAGGTCAGATGATATGAATATTGGAAGTCCTGATTGCTTCGCTGGAAAAAAAACTGAGCAAAGGGGGGAATTGCAGAGAGAAAATACAGCAATGGCTATTGAGATCGTTGCAGAATTTTTGCAAAACAAAATTACTTCAAGGATCCTTTCCTTAGTTCATCAAAACATGCCATCTCATTGGGGATTTTTCATTCGCCAAATGCATCTGCTTGTATCAAACTCTTCAGTTTTGAGGAGCTCAAAACATATTACTCCGGAGGCCCTTTTGCTTTTAATGGAAAATATCTATAAAGGCATATCTCATCAAAGCAAAACAACATCTAAGGCTAATGTGTTCATGGTTGCTGGTTCTCAGATCTGTTTTGCTGGTCAATCTTTTGGTGATAGTTGTTCTTTGCAATGGCTTCCTATTGATCTTATCCTTGAAGATGCTTTGGGTGGAGCTAATGTCTCAGCACTTAGTGCTATTAAAATTGTTACTGGTTTGGTGAAGGTTTTACATGCTGTAAATGGAAGTACTTGGCACAGTGCATTTTTAGGTTTATGGATTGCAGCATTGCGGTTGGTTCAAAGGGAGAGGGATTCAACTGAAGGTCCTGTACCTCACCTTCATACTTGCATGTGTATGTTATTGAGCATTATAACCCTTGTGGTCGCTCATATTATTGACGAAGAGGAAAGTTTGATTGAGGAAGCTGAATGTAGCCCTGCCAATCAAAGAAAAGATAAACCAACTTTGGGGAAGTGTCGTGGAGAATTGATTGCCAGCTTACAGCTATTGGGTGATTATGAGTTCTTACTGACTCCACCTCAATCTTTTCTTTCGGAAGCCAATAAAGCTGCTGCCAAGGCTATTATGTTCTTAGCTGGAAACTCCGTTGGCAGTGAGGTCTTGGAGAGTATAAGCGTGAATGACTTACCGACAAAATGCTCTGGCAACTTATGGCATCTAATCGTTGAGGCTTGCATTGCAAGAAACCTACTTGATACATCAGCTTATTCTTGGCCTGGCTATGTCAATGCATGCAGCAATCAAATTCCTTGTAGCACGTCTAGCCAGGTGGCTGGGTGGTCTTCATTAATGAAGGGATCACAGCTAACTCCTGAATTGGTTGATGTACTAGTTGTAACTCCAGCTTCCAGCTTAGCAGAGATTGAGAAAATATATGAAATTGCAACCAATGGTTCAGACGAAGAGAAGATATCTGCTGCCACTATCCTCTGTGGGGCATCTTTAGTACGAGGATGGAATGTACAGGAGCACACCATTCTTTTTATGACAAGTTTGCTCTCACCTCTGGTTCCTCCAACTGAAAGCCATTTGATCAGCCAAGCTCAATTTCTCAATGTTCTTCTTATTGGAATTTCATCACTAGATTGTGTTCATATTTTCTCTCTTCATGGTTTGGTTCCATTACTTGCAGCAGGGTTAATGCGAATATGTGAGGTTTTTGGATCATGTGTTCCCGATGTCTCACAAACTCTTTCAACTGGAGAAGAACTCTCTTTTCATGAGGTGTTCTCAAATGCATTCACTCTTTTGCTGAGGTTCTGGCGGTTTGATGTTCCATCTATTGAACATGTGCGGAGGGATTCTGCTACTCCACCACTTGGGTCACTATTTTGTCCTGATTCCCTTTTATTGGTTCGAAACTTTCTATTGGCATCTTTTGGAAGATCAGCAAAGGATCAAATAACGCGCAAAAGATTTTCAAAATATATAACCTTTCCTACTGAACCAGTATTTTTGGATTCCTTTCCAAAATTCAACTTCTGGTATCAACAACATCAGGAATGCATTGTTTCAATCCCGTCTGGTCTTGTCCCTGGAGGGCCTGTGCATCAGATTGTTGATGTTCTACTATGCACGTTATTTAGGAAGATAAATAGTTGTGATGAACCTTTGGCATGTAGCAATTCAGGAAGCAGCGGTTCACCTGGGTCTGCACTGAATGAAGCTATCATGAAACTAAAGGTACCTGCGTGGGATATACTTGAGGCCATTCCGTTTGTGCTGGATGCTGCTTTGACGGCTTGTGCTCATGGAAGACTTTCTACACGTCAACTAGCTACAGGCCTCAAAGATCTGGCTGATTTTCTGCCAGCATCTTTGGTTACAATTGCAAGCTATTTATCAGCTGAAGTTAGACGCGGAATATGGAAGCCAGGTTTTATGAATGGAACTGATTGGCCTAGCCCTGCTGCAAATTTATCCCTTGTTGAGCAGCAGATAAAGAAAATTTTAGCCACCACAGGTGTTGATGTTCCAAGCCTTGCTGTAGATGGGGACTTTCAAGCTACATTGCCTTTGCCTTTGGCAGCTTTTGTAAGCCTCACATTAACATATAAACTTGACAAAGACACTGGGCGGTTCCTTAGCCTGATTGGCCCAGTTATGATTGCTCTTGCTTCTAGTTGCCCCTGGCCGTGCATGCCCATTGTAGCTTCTTTGTGGGTCCAGAAAGTGAAGCGTTGGAGTGATTACCTTGTGCTCTCTGCTTCCAGAACAGTCTTCCACTGCAACAAGGATGCTGTAGTTCAACTACTAAGAAGTTGCTTCAAATCCACACTTGGGCTTGGCTCTGCCTGTTTACATAATAATGGTGGTGTTGGTGCTCTCCTTGGTCATGGTTATGGCGTTGGTGTCAATTCCAAAACATCTGACGGGGTCTCTCCGATTGCTCCAGGAACTATTTGCTTGAAAGTGTACCAGTATATTGGAGATACCAGGTACTTGTCTGAAGAAATTGTCTCTATTCTAATGCAAACAGTGAGAGATATAGTAAGTAATCAGTTACTCAAGGGGGATGGTAAGAAGCAGAAGAAAATCAAGTATGGAACGACACATGGACAGGTTTCTCTTGCTAGATCCAAGGCACGGGTCAAGCATGCTGCTCTACTGGCAGCTTCATTGGTTTGGATATCGGGTGGAATAAAGTTGGTTCAATATTTCATAAAAGAGACTATTCCTAAATGGTTCTTTTCTTCTAGTATGTTGGAGCTGGATGGTGAAGAATCCAGTGCCTTGGTTGCTATGCTTAGAGGTTATGCATTAGCACTTTTTGTCATGCTCAGTGGGGCATTTGCCTGGGGTATTGACCATTCACTTCTATCAAGACAAAGAGGAAAGGTTATGGGGCTGCATTTTGAATTCATTGCAAGTGTCCTTCAGAAGAATATACCACTGCGTTGTCAGGATGCTACTTGGCGAGCCTATGTGTCAGGATTTCTGAGCCTGATTGTGAGTTGCACTCCATTGTGGGTCAGCGAAATCAATGTCGATATATTGAAGAGACTAAGCAAGGGATTAATACAGATGAATGAGCATGAGTTGGCTCTTAGGCTTTTGGAGAAAGGAGGGATTGGCGCCATGGGTGCAGCAGCTGAAATGATTGTTGCATTTCAACATAGATTTTAA 3594 0.4213 MTSIDEVLLLSQVYNRKDCEPGVVLVEFVFSIVWQLLEALLDDEGLLDHASEDNPRWLRRSDDMNIGSPDCFAGKKTEQRGELQRENTAMAIEIVAEFLQNKITSRILSLVHQNMPSHWGFFIRQMHLLVSNSSVLRSSKHITPEALLLLMENIYKGISHQSKTTSKANVFMVAGSQICFAGQSFGDSCSLQWLPIDLILEDALGGANVSALSAIKIVTGLVKVLHAVNGSTWHSAFLGLWIAALRLVQRERDSTEGPVPHLHTCMCMLLSIITLVVAHIIDEEESLIEEAECSPANQRKDKPTLGKCRGELIASLQLLGDYEFLLTPPQSFLSEANKAAAKAIMFLAGNSVGSEVLESISVNDLPTKCSGNLWHLIVEACIARNLLDTSAYSWPGYVNACSNQIPCSTSSQVAGWSSLMKGSQLTPELVDVLVVTPASSLAEIEKIYEIATNGSDEEKISAATILCGASLVRGWNVQEHTILFMTSLLSPLVPPTESHLISQAQFLNVLLIGISSLDCVHIFSLHGLVPLLAAGLMRICEVFGSCVPDVSQTLSTGEELSFHEVFSNAFTLLLRFWRFDVPSIEHVRRDSATPPLGSLFCPDSLLLVRNFLLASFGRSAKDQITRKRFSKYITFPTEPVFLDSFPKFNFWYQQHQECIVSIPSGLVPGGPVHQIVDVLLCTLFRKINSCDEPLACSNSGSSGSPGSALNEAIMKLKVPAWDILEAIPFVLDAALTACAHGRLSTRQLATGLKDLADFLPASLVTIASYLSAEVRRGIWKPGFMNGTDWPSPAANLSLVEQQIKKILATTGVDVPSLAVDGDFQATLPLPLAAFVSLTLTYKLDKDTGRFLSLIGPVMIALASSCPWPCMPIVASLWVQKVKRWSDYLVLSASRTVFHCNKDAVVQLLRSCFKSTLGLGSACLHNNGGVGALLGHGYGVGVNSKTSDGVSPIAPGTICLKVYQYIGDTRYLSEEIVSILMQTVRDIVSNQLLKGDGKKQKKIKYGTTHGQVSLARSKARVKHAALLAASLVWISGGIKLVQYFIKETIPKWFFSSSMLELDGEESSALVAMLRGYALALFVMLSGAFAWGIDHSLLSRQRGKVMGLHFEFIASVLQKNIPLRCQDATWRAYVSGFLSLIVSCTPLWVSEINVDILKRLSKGLIQMNEHELALRLLEKGGIGAMGAAAEMIVAFQHRF 1197
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Arst6g01394 1197 PANTHER OS07G0681500 PROTEIN 1 1192 IPR039638 GO:0016592|GO:2000762
Arst6g01394 1197 PANTHER OS07G0681500 PROTEIN 1 1192 IPR039638 GO:0016592|GO:2000762
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Arst6g01394 Arst-Chr6 13255371 13264353 Dispersed/Tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Arst6g01394 - - pvu:PHAVU_001G148600g 1504.96
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Arst6g01394 6 13255371 13264353 Arst6g01394 6 13255371 13264353 ECH