Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Apr5g0480 ATGCAGATTTTCACCCAGCGCCAAGGAGCACTTGTGTGCTTCTGGTTGTCTGTGCTTTTTGTGGTAGCAAACTTTTGCTATGGTGACCATAGTACAGTCGAGGTAGTTGGTCTGGGAGAGTGTGCAGATTGTAAGCAGAACAACATTAAAACTGCCAAGGCTTTCTCAGGGCTACGTGTAACAGTATACTGCAAGGCAGCAAGTGGAGACTTTGAAACGAGAGGGGTTGGTGAGCTTGATGAAAATGGAAACTTCAGAGTGTCTCTTCCACATGACATTGTAAAAGCTGGTGAACTCAAAGAAGAATGCTATGCTCAGCTACATAGTGCATCGGCTACACCATGTCCTGCAAATGATGGCTTGTATAACACCAAAATTGTGATTAAGTCAAACACTGATGACAAATACACCCTTGGTCCTTCTGGGAAGCTCAAATTTTCATCAGCGACCTGCCCTTCAGCTTTCTTTTGGCCTTTCCACAAACATCCACTCATCTTCCATAAACACCCTCACTTTCCTCCTTTTCCTATCAATAAGGAGCCTCCACCACCTACATATGTTCCTATTTCACCACCAGTTCCCAATAAGCCATGCCCACCAGAGGTGCAGCCTCCTGTTATTCCACCACCACTTCCACCAAAGGTTAAGCCTCCTATTATTCCACCACCGCTCCCACCAAAGGTTAAGCCTCCTATTATTCCACCACCGCTCCCACCAAAGGTTAAGCCTCCAATTATTCCACCACCGCTCCCACCAAAGGTTAAGCCTCCAATTATTCCACCACCGCTCCCACCAAAGGTTAAGCCTCCTATTATTCCATGCCCACCTAAGGTGAAGCCTCCAGTTATTCCACCACTACCACCAAAGGTTAAGCCGCCACCACTCCCACCAAAGATTAAGCCCCCAGTTATTCCACCACTACCACCAAAGGTTAAGCCGCCACCACTCCCACCAAAGATTAAGCCCCCAGTTATTCCACCACTACCACCAAAGGTTAAGCCGCCACCACTCCCACCAAAGATTAAGCCCCCAGTTATTCCACCACTACCACCAACGGTTAAGCCACCACCACTCCCACCAAAGGTTAAGCCTCCTATTATTCCATGTCCACCAAAGGTTACTCCTCCTCCAACCCCACCGGTTCCAATCATTAAGCCATGCCCACCAATTGTTCTACCACCCATTCCATTCAAGCCACTTCCACCTCTTCCTCCAATCCCAAAGCTTCCACCATTCAAGCCACTTCCACCACTTCCTCCATTCCCAAAGCTTCCACCATTCAAGCCACTTCCACCTCTTCACAAGTTCCCTCCAAAGCACTTTTTCCATCACCCCAAGTATGGGAAATGGCCTCCAGCACCACCTTTTTCTCCTCATCCTTAG 1383 0.483 MQIFTQRQGALVCFWLSVLFVVANFCYGDHSTVEVVGLGECADCKQNNIKTAKAFSGLRVTVYCKAASGDFETRGVGELDENGNFRVSLPHDIVKAGELKEECYAQLHSASATPCPANDGLYNTKIVIKSNTDDKYTLGPSGKLKFSSATCPSAFFWPFHKHPLIFHKHPHFPPFPINKEPPPPTYVPISPPVPNKPCPPEVQPPVIPPPLPPKVKPPIIPPPLPPKVKPPIIPPPLPPKVKPPIIPPPLPPKVKPPIIPPPLPPKVKPPIIPCPPKVKPPVIPPLPPKVKPPPLPPKIKPPVIPPLPPKVKPPPLPPKIKPPVIPPLPPKVKPPPLPPKIKPPVIPPLPPTVKPPPLPPKVKPPIIPCPPKVTPPPTPPVPIIKPCPPIVLPPIPFKPLPPLPPIPKLPPFKPLPPLPPFPKLPPFKPLPPLHKFPPKHFFHHPKYGKWPPAPPFSPHP* 461
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Apr5g0480 460 PANTHER PROLINE-RICH PROTEIN 2 1 237 - -
Apr5g0480 460 Pfam Pollen protein Ole e 1 like 35 117 - -
Apr5g0480 460 PRINTS Proline rich extensin signature 170 182 - -
Apr5g0480 460 PRINTS Proline rich extensin signature 183 204 - -
Apr5g0480 460 PRINTS Proline rich extensin signature 206 222 - -
Apr5g0480 460 PRINTS Proline rich extensin signature 226 243 - -
Apr5g0480 460 PRINTS Proline rich extensin signature 244 269 - -
Apr5g0480 460 PANTHER EXTENSIN, PROLINE-RICH PROTEIN 1 237 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Apr5g0480 - - aprc:113865229 337.806