Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Apr1g0262 ATGGGAAGAGATCTATGTGGAAGTGGGTTTGTTTCAAGATTCAGAAACTCATGGACCCAAATGGAGAAAACCTTAAACGGTGCCGTTTCAAAGAGCTTTGTTGGGAGGCACTTCAAGTTAGAAGCAAGGAAAAGCTGTTTCACAAAAGAACTTCGTGCTGCCACAGCCACTTTTCTCACCATGGCATACATCATCACTGTCAACGCCACCATCATCACGGCCTCTGGCGGAACCTGCTCCGCCGCCGATTGCTCCGCTCCGGCGGGTCCAGATTGCATGCTGAAGCCTAACGTTGGGTATGAAAGTTGTCTTGCAAAGACCAAGAATGACTTGGTTGTGGCCACTGCAGTATCAGCCATGGTTGCTTCTGTTGCTATGGGCCTTTTGGCCAACCTTCCTTTGGGCCTGGCTCCAGGTATGGGGCCCAATGCTTATTTGGCTTTTAATTTGGTTGGTTATCATGGAACTGGGTCAATCTCATACCAAACTGCTTTGGCTGTGGTTTGTGTTGAGGGCTGTGCTTTTCTTGTAGCCTCTGCTGTTGGGTTAAGGGGTAAGCTTGCTAAGCTCGTTCCTCATTCAGTTAGGCTTGGTTCTGCTGCTGGGATTGGGCTTTTCATTGCCTTTGTGGGCTTGCAGACTAACCTGGGTGTTGGGCTTATTGGGCCTGATCCTTCCAATCTTGTGACCATCACTGCCTGTAAAAGTATAGACCCAGAAACTGGGGCATGTTTGGGTGGGAGAATGCAAAGCCCAAAGTTCTGGCTTGGCCTTGTTGGTTTCCTCATTACAAGCTATGGGTTGATGAAGAATATAAAAGGGAGCATGATTTACGGCATTGTTTTTGTGACTTTGGTGTCTTGGTTTAGGCACACTGAAGTGACTTATTTTCCCGATACCCCACTTGGTGATGCAAACTACAACTATTTCAAGAAAGTGGTTGGTTTTCACAAGATCGAATCCACTGCTGGGGTTCTCGGGTTCAGTGACTTTAACAAGAGGCAGGTTTGGGTGGCCTTGGCTACTTTGTTCTATGTTGATGTCCTTGCTATCACTGGCACTATGTATACCATGGCAGAGATTGGTGGGTTTGTGGATGAAAAAGGAAACTTCGAAGGTGAATATGTGGCTTACATGGTTGATGCAGCTGGCACCATTGTGGGTTCTGCATTGGGTGTTACAACCACAGCAACATTTGTGGAATCTTCTGCTGGATTGAGAGAAGGTGGTCGCACAGGATTAACAGCAGTGATCATTGGGCTGTTCTTCTTTTTCTCATTGTTTTTCACTCCTCTATTGTCTAGTGTTCCTCCTTGGGCTATAGGACCTTCACTGGTGATGGTTGGCGTGATGATGATGAAGGTGGTGAAGGACATAGATTGGAGCAACACAAAGGATGCCGTTCCTGCTTTTGCTACAATGCTTCTCATGCCTCTCACATATTCCATAGCAAATGGGATTATTGGTGGGATTGGCCTCTACGTTGCTCTTAGCCTCTATGACTATGCTGCAAGCACCATAAATTGGTTGAGGAAGATGAGAAGAATGGTGATCAAGGAGCAAAACCAAGTTTCTGCTACCGCAGGTGGTGACTCAACAGTGGAAATTATATGA 1614 0.4665 MGRDLCGSGFVSRFRNSWTQMEKTLNGAVSKSFVGRHFKLEARKSCFTKELRAATATFLTMAYIITVNATIITASGGTCSAADCSAPAGPDCMLKPNVGYESCLAKTKNDLVVATAVSAMVASVAMGLLANLPLGLAPGMGPNAYLAFNLVGYHGTGSISYQTALAVVCVEGCAFLVASAVGLRGKLAKLVPHSVRLGSAAGIGLFIAFVGLQTNLGVGLIGPDPSNLVTITACKSIDPETGACLGGRMQSPKFWLGLVGFLITSYGLMKNIKGSMIYGIVFVTLVSWFRHTEVTYFPDTPLGDANYNYFKKVVGFHKIESTAGVLGFSDFNKRQVWVALATLFYVDVLAITGTMYTMAEIGGFVDEKGNFEGEYVAYMVDAAGTIVGSALGVTTTATFVESSAGLREGGRTGLTAVIIGLFFFFSLFFTPLLSSVPPWAIGPSLVMVGVMMMKVVKDIDWSNTKDAVPAFATMLLMPLTYSIANGIIGGIGLYVALSLYDYAASTINWLRKMRRMVIKEQNQVSATAGGDSTVEII* 538
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Apr1g0262 537 Pfam Permease family 107 486 IPR006043 GO:0016020|GO:0022857|GO:0055085
Apr1g0262 537 PANTHER ADENINE/GUANINE PERMEASE AZG2 11 537 IPR029950 GO:0005345|GO:0006863
Apr1g0262 537 PANTHER XANTHINE/URACIL PERMEASE C887.17-RELATED 11 537 IPR045018 GO:0015205
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Apr1g0262 Apr-Chr1 2982505 2984118 Transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Apr1g0262 K06901 - gmx:100778491 872.848
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Apr1g0262 1 2982505 2984118 Apr1g0262 1 2982505 2984118 ECH