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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Amo13g2187 ATGGAGTCGATCCTAGCGAGAGCTCTGGAGTACACTCTCAAGTATTGGCTCAAATCCTTCTCCAGAGAGCAGTTCAAGTTGCAGGGTCGCACTGTTCAGCTCTCCAATTTAGATATAAATGGTGATGCATTGCATGCTAGCGTTGGATTGCCACCTGCACTCAATGTAACCACCGCCAAAGTTGGCAAATTGGAGATTATGCTACCGTCAGTGAGCAGTGTGCAGATAGAGCCAATTTTTGTGCAAATTGATCGGTTGGATTTGGTTCTAAAGGAGAATTCTGATTATGAAAGGCCGCCCGAGAATCATGCTAGCATCACGCCATCAAGTGCCTCTTCAAAGGGTAGTGGTTATGGTTTTGCTGATAAGATTTCAGATGGAATGACTATACAAATTCAAACAGTTAATTTATTACTTGAAACTCATGGGGGTGCCCGTCCCCAAGGGGGAGCAGCATGGGCACCTCCTATGGCATCTGTCACCATACGCAATTTGTTGCTGTATACAACAAATGAAAGCTGGGAGGTTGTAAATCTTAAGGCGGCAAGGGAGTTCTCAAGTAATACGAAGTATATATATGTATTCAAAAAACTGGAGTGGGAATCTTTGTCTATTGATCTTTTGCCTCATCCTGACATGTTCACGGATGATACTTTAGGCCGCTCTCAAGAGCGAGCAAACATGAGAGATGATGATGGTGCAAAACGAGTATTCTTTGGAGGGGAGCGTTTTTTAGAAGGAATATCAGGAGAAGCATATATCACAATTCAGAGAACAGTCTCCAACAGTCCACTTGGGCTTGAGGTTCAGTTGCACATTACAGAAGCCCTTTGCCCTGCATTAAGTGAGCCAGGACTTCGTGCACTTCTCCGCTTTATGACAGGATTATCTGTCTGTCTAAACAGGGGAGATGTAAATTTGAAGGCCCAGAAGAGATCTACTGAAGCTGCTGGGCGCTCTCTTGTCTCAGTTGTTGTGGACCATATATTTATTTGCATCAAAGATTCTGAGTTCCAGCTTGAACTATTAATGCAGTCCCTTTTTCTGTCTCGGGCAAGTCTTTCGGAGGGAGAAAATGACAGTAGTTTGACCAGGATTACCATTGCAGGTCTATTTTTAAGTGATAAGTTTTCACACCCGCCATGTACGTTAGTGCAGCCATCTATGCATTCTGTTAAAAGAGAGTCTTTTCATGTGCCAGAATTCGCTAGAAGCTTTTGCCCTCCAATATATCCACTTGGAGAACAGCAGTGGCAATTGATTGAGGGAACTCCTCTAATCTGCCTTCATTCCCTTCAGATTGTGCCTTCTCCACTTCCACCAGTTTTTGCTTCTCAAACAGTTATTGACTGTCAGCCTCTTATGATTCATCTTCAGGAAGAAGCTTGCCTTAGAATATCTTCTTTCTTAGCTGATAGAATTGTTGTCAATTCTGGTGATATTTTACCAGATTCCTCAATAAACTCTCTTTTCTTCACTCTCAGTGGACTGGATATTATGGTTCCTCTGGACAAGGCCCAGTTGGATATTTCTAAAAGCAACACAGATAATGTAGTCCAAACCTCCTTTGCTGGTGCAAGGCTTCATATTGAAGACTTTTCATATATAGATTCACCATCAATGAAACTAAGAATGCTTAAACTGGATAAGGATCCTGCTTGTTTCTGTCTTTGGGAAGGTCAACCAATTGATGCTAGCCAGAGAAAGTGGAGTGCCAGAGCAGCCCAGATTACTTTATCTCTGGAAGCATGTACTGGCCCACCTGCACGTCAAAATTCTCTTGGATGGACCACAGGACTATGGAGATGTGTTGTTCTGAAAGGTGCTTGGATTGAAGTAGCTATGACAACTGCCGATGGCAGTCCATTGTTAAAGGTTCCTCCTCCAGGAGGTATTGTGAGAGTTGGTGTTGCTTGTGAACAGTTTCTGTCCAATAGTTCTGTTGAACAATTATTTTTTATCTTGGATCTTTACGTGTATTTTGGGAGAGTTAGTGAGAAAATAGCAGTGGCTGGAAAAAGGAAACAATTGGAGGGCATTAAGAACAAATCTTCTAGCGAAAAGTTAATGGACATAACTCCTAGTGACAGTGCTGTAAGTTTAGCAGTTAAAGACCTTCAACTTCGATTTCTTGAGTCTTCACCATTGAATGTCGAGGGAATGCCTCTAGTGCAGTTTGTTGGAAATGATTTGTTAATTAGTGCCACTCATAGAACCTTTGGTGGTGTTATTGTTATTTCGTCCACCTCACGCTGGGAGAGTGTTCAGATAGATTGCGTGGATGCTGAGAAGCACATAGCAGGAGAGAATGGCTCATTCTTAAGTTCTGGAGAAAATATTCCTTCAAGCAGTGGAGACTGTCAACTGAGAACTGTATTCTGGATACATAACAAGAGGAACCATCTATTGAACAGAAATGCTCCTTCAATCCCTTTTCTGGATGTAAACATGGTGCATGTCATACCATTGGGGGAACAAGATAGAGAGTCTCATTGTTTGAACGGCTCAGCTTCTGTATCTGGTATTCGTCTTGGTGGGGGAATGAACTATGCTGAAGTCCTCCTACATCAATTTGGAATACTTGGTCCTGATGGTGGTCCTGGGAAGGGTCTTTGTAAAGGCTTAGAAAAGTTACAGGCAGGACCATTGGCAACAATTTTCAAGACAACGCCTCCCGATGTTGATAATTCAGAAGATGGAAGTTTGAGCAAAGGGAAAGAAACCAGTTTTCCAAAATTGAAGAAGCCAGATAATGTGGATATAACCATAGAATTGAGAGACTGGTTATTTGCTCTTGAAGGGGCACAAGAGATGGCTGAAAGGTGGTGGATATCTAGCCCAGAAAATGTAAGTAGAGAAGAGAGGTGTTGGCACACAACTTTCCAAAGTTTGCAAGTAATTACAAGAAGCAGCCCAAAGAATGTTCTGGGTGAAAAAGCGCCAGCACGTAGAAAACAACAGTATCCTGTGGAACGGGTTACAGTTGGAATCCAAGGGCTGCAGATCATGAAGCCGCAGAGACCGAAAGAGATTCATTTGTCAAAATCAATTGCAAATGGTGCTAAAGAAGTTAACGGCACTGCTACGGGAATTTGTCTTCAGCTGGATTTGGTATCAAGTGAGGATAATGTTGAAGTTGAAATGGCTAATTGGGAAGTGGAAAATCTAAAGTTCACTGTTAAGCAACCGATAGAGGTGGTTTTAACCAGTGATGAGGCTCAACACCTTACTTTTCTGTGCAAATCTGAAGTTGATTCCATGGGCCGGATAGCAGCTGGAATTCTAAGAGTGCTTAAGCTCGAAGGTTCGGTCGGCCATTCTGTAATGGATCAACTAGGCAACTTAGGAAGTGAAGGCATTGACAAGATTTTCTCTCCTAAGCATAGCAGAGATGATAGTGTCCACAATAGAGGATTTTGTCCATCACCGAAGCTGGTAAGCAAAAGCTTGCACAAATCAACGATGGAACCGACATTAACTTTGCTCGAGGAAGCAGTTGCAGATTCACAGGAAAAGATCAATGCCTTAATCAGTGATTTTGGTATTTCAGAGTCCTCTGGGCAGCAACTTACCATTGCTAAAGAACTCAGTCAAAAGATTGAATCAATGGAGGGTTTATTGAAGCAATTACGGAATAAAACTTAA 3645 0.4239 MESILARALEYTLKYWLKSFSREQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHASVGLPPALNVTTAKVGKLEIMLPSVSSVQIEPIFVQIDRLDLVLKENSDYERPPENHASITPSSASSKGSGYGFADKISDGMTIQIQTVNLLLETHGGARPQGGAAWAPPMASVTIRNLLLYTTNESWEVVNLKAAREFSSNTKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFTDDTLGRSQERANMRDDDGAKRVFFGGERFLEGISGEAYITIQRTVSNSPLGLEVQLHITEALCPALSEPGLRALLRFMTGLSVCLNRGDVNLKAQKRSTEAAGRSLVSVVVDHIFICIKDSEFQLELLMQSLFLSRASLSEGENDSSLTRITIAGLFLSDKFSHPPCTLVQPSMHSVKRESFHVPEFARSFCPPIYPLGEQQWQLIEGTPLICLHSLQIVPSPLPPVFASQTVIDCQPLMIHLQEEACLRISSFLADRIVVNSGDILPDSSINSLFFTLSGLDIMVPLDKAQLDISKSNTDNVVQTSFAGARLHIEDFSYIDSPSMKLRMLKLDKDPACFCLWEGQPIDASQRKWSARAAQITLSLEACTGPPARQNSLGWTTGLWRCVVLKGAWIEVAMTTADGSPLLKVPPPGGIVRVGVACEQFLSNSSVEQLFFILDLYVYFGRVSEKIAVAGKRKQLEGIKNKSSSEKLMDITPSDSAVSLAVKDLQLRFLESSPLNVEGMPLVQFVGNDLLISATHRTFGGVIVISSTSRWESVQIDCVDAEKHIAGENGSFLSSGENIPSSSGDCQLRTVFWIHNKRNHLLNRNAPSIPFLDVNMVHVIPLGEQDRESHCLNGSASVSGIRLGGGMNYAEVLLHQFGILGPDGGPGKGLCKGLEKLQAGPLATIFKTTPPDVDNSEDGSLSKGKETSFPKLKKPDNVDITIELRDWLFALEGAQEMAERWWISSPENVSREERCWHTTFQSLQVITRSSPKNVLGEKAPARRKQQYPVERVTVGIQGLQIMKPQRPKEIHLSKSIANGAKEVNGTATGICLQLDLVSSEDNVEVEMANWEVENLKFTVKQPIEVVLTSDEAQHLTFLCKSEVDSMGRIAAGILRVLKLEGSVGHSVMDQLGNLGSEGIDKIFSPKHSRDDSVHNRGFCPSPKLVSKSLHKSTMEPTLTLLEEAVADSQEKINALISDFGISESSGQQLTIAKELSQKIESMEGLLKQLRNKT* 1215
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Amo13g2187 1214 Coils Coil 1159 1179 - -
Amo13g2187 1214 Coils Coil 1193 1213 - -
Amo13g2187 1214 MobiDBLite consensus disorder prediction 889 913 - -
Amo13g2187 1214 MobiDBLite consensus disorder prediction 96 115 - -
Amo13g2187 1214 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1213 IPR026728 -
Amo13g2187 1214 PANTHER AMINO-TERMINAL REGION OF CHOREIN, A TM VESICLE-MEDIATED SORTER 1 1213 - -
Amo13g2187 1214 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 97 IPR026854 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Amo13g2187 Amo-Chr13 36458055 36468416 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Amo13g2187 - - adu:107477991 2349.32