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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Aed7g2201 ATGGCGCTAACCGTTTTCTCTATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCACCTTCCACCTTCTCTCATGCTCCTCAGGACAATCATCCAGCTCCATGGAATCAGTGCCTGATCTTCAGAACACTATGTACGCTTCCATCGATGGCTATCCTTGCGTGCGGCTGATGAATCTCTCTGGAACCATCGGTTGTTCAAATCCTGGACGAGATAAGGTTGTGGCTCCAATTGTAAGGTTCGAAAATGTTGACAAAATAGCCGAGCCGTCTGCTATATTGGTGTCACTGGATGAGTTTCCAACTCTCTTTACTAGAATATCAGATGACTCTAGCTTTGCTAGTAAAGTCGGTGGTGTACTGGTTGAACCAAGGGGTGATGTGCAGAAAAAGTTAAAGGGATTCTCTCCGGATCAAAAGTTTCCACAAGCTCAATTTGCTCCTTACCATAATACCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGGTATTATGTGGAAGTCCTACAGTTTTCCTGTATTTTTACTCACAGAAAGGGGCTCAAAGACTCTTCAAGAGTTCGTAACAAAGAATGAGGACAAAAAGAAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATGTGGTGATGCAGACAGTGAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGAAACTTGCCTTCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCATCTCTTCCTCCGATCAACATTTCATCCTTACAATCACAACAGTCTAAGCCGATTTTATTGACAGTAGCGTCTATGGATTCTGCTTCATTTTTTCGGGACAAAAGCCTTGGTGCAGACTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTAGCAGCTGTTGATGCACTTTCTAATTTGGATGGTCTTGGTGACCTTAATAAACAGCTTGTTTTTGCAGTTTTCACTGGAGAGGCATGGGGTTACCTTGGAAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACATGCACTCAGATGCTGTTCATGGCCTTAATCATATGTTAATTGAAACGGTCATTGAAATTGGTTCTATTGGAAAGGGTCTCAGTCAAGGTGTTAAAAACTTTTTTGCTCATACAGAAGGGGATTCTTCTGCCACAAATCAGACAGTGGCTGCCTTGAAACGTGCACAGGAATCACTGATATCTGAAAACATAAAGATAGCATCTGCAAGTGCCTCAAATCCTGGGATACCTCCATCCTCTTTAATGTCCTTTTTGGAAAAGAATCCTGCAATCTCTGGTGTTGTCCTAGAAGATTTTGACTCTGTCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCATCTTGATGATTTATCAAATGTAAATTCATCAGCGGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTCATTGCCCGAACCCTTTACATGCTCACTAGTGAAACTGAAGATGTACAAAATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTTAATGTCTCACTTGTTGAACAACTTATGGGTTGCTTGTTGGACTGTGATCCTGGTCTTTCTTGCGAATTGGATACATCAATGATGTTCCAAGGTTCATCTGGAATTTTCTGGCCGACAGAACTTCTATCCCAAGGGAGAATAATAGCTCAGATTGTCAACATGGTTGCAATGGTAGAGATGAAGTATGTTCCAGCATATTCAACACGGCTAAAATTTGAATCAGGGGTGTGGAATGTTTTGCCCCCTAATTCCTCTGACAAAATGGGGGTTGTGGACCCTGTCTGGACAGAGAGCAACTGGAATACGATAGGTATGCGGGTCTACACAGTCCAAAATGGTGCTTATGATCGTTTTGTTCTGTTTGGGGGCCTCACTCTGACAGTCTTCGCATACCTTGCAATAGCAACCGCAAGAGCCCTTTTGTCCAAAGCAATGAAGAGGGATTGA 1878 0.4207 MALTVFSIFFFLFFTFHLLSCSSGQSSSSMESVPDLQNTMYASIDGYPCVRLMNLSGTIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDKIAEPSAILVSLDEFPTLFTRISDDSSFASKVGGVLVEPRGDVQKKLKGFSPDQKFPQAQFAPYHNTSYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTERGSKTLQEFVTKNEDKKKAYTSNVAEFDVVMQTVKSGTHDSESCLKEETCLPLGGYSVWSSLPPINISSLQSQQSKPILLTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSNLDGLGDLNKQLVFAVFTGEAWGYLGSRRFLVELDMHSDAVHGLNHMLIETVIEIGSIGKGLSQGVKNFFAHTEGDSSATNQTVAALKRAQESLISENIKIASASASNPGIPPSSLMSFLEKNPAISGVVLEDFDSVFVNKFYHSHLDDLSNVNSSAVVAAASLIARTLYMLTSETEDVQNSTLAAINVNVSLVEQLMGCLLDCDPGLSCELDTSMMFQGSSGIFWPTELLSQGRIIAQIVNMVAMVEMKYVPAYSTRLKFESGVWNVLPPNSSDKMGVVDPVWTESNWNTIGMRVYTVQNGAYDRFVLFGGLTLTVFAYLAIATARALLSKAMKRD 625
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Aed7g2201 625 CDD M28_Nicastrin 42 578 - -
Aed7g2201 625 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 221 457 - -
Aed7g2201 625 Pfam Nicastrin 249 458 - -
Aed7g2201 625 Gene3D Zn peptidases 175 478 - -
Aed7g2201 625 Pfam Nicastrin small lobe 48 205 IPR041084 -
Aed7g2201 625 PANTHER NICASTRIN 16 505 IPR008710 GO:0016021|GO:0016485
Aed7g2201 625 PANTHER NICASTRIN 531 624 IPR008710 GO:0016021|GO:0016485
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Aed7g2201 K06171 - gmx:100801506 884.019