Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Aed4g0308 ATGTCGGTTCCCGCGCAAACCAGCGAGTCTGACGCGTGGGACGCGGTCCTCCGCCAAACGAATGCGGCCGTGCAGACCCACGCCGATCCTAACGCGTGGGCCTTGGATGTGATGTCGACGCTTCTCTCCTCCGCCATCTCCCTCCCTTCCGTCGAACTCGCTCACCGCTTGGTCTCTCTTTTCTTCTGGGACAACCACTCCGCCGCCGCATGGAAGTTTCTCCACGCCGCCGTGTCCCTCAACTTGCTCCATCCCTCCCTCCTCATCGCACTCCTCTCCGCCACGGTTGTTCCAAGAAGACAGCTCTACCCTATTGCTTACAGGCTGTATATGGAACTCCTCAAGGAACTCCGTGTTAAGTTTAAAGGCGACATCAGTTGTCCAGATTATGAAAAGATTATGAAATCAATTGATGATGTTCTTCAGCTTTCTCAAGTATACAGTCAAAAGACGAGGGAGTCGGGAGTTGTTCTGGTTGAATTTGTCTTTTCAATTGTATGGCAGTTACTTGAAGCATCATTAGATGATGAAGGGTTACTAGATCACACTACTGAGAATAAGCCTAGATGGCTAGGCAGTTCACATGATATGAATATTGATGGAGCTGACAGCTTTAGTGAAAAGAAAACTGAGCATGCAGAGTTGTTTCAGAAGAAAAATACAGCAATGGCTATAGAGATCATTGCAGAATTTTTGCAACATAAAACAATTTCAAGGATCCTTTCCTTAGTTCATTGGAACATGTCATCACATTGGGGGTCTTTCATTCACCAAATGCAGCTGCTTGTATCAAATTCTTCAGTTTTTAGGAATTTGAAACATATTACTACAGAGAGCCTTTTGTGTTTGACGCAAAATATCCATGGGGTTGTTTCTCATGAGTTCAAAACAAAATCTAAGATGGAGAATAATGTAGTCATACCTCCGGGTTCTCTAATGTCTTTTGCTGGTCAATCTTATGGGGATAGCTGGTCTTCACTCTGGATTCCTATTGATCTTATCCTGGAAGATGCTTTGGATGGAGGGCAAGTGGCAGCATCTAGTGCTATTGAAATTATTACTGGTTTGGTGAAGACTTTACATGTAGTTAGTGGCACTATGTGGCACAGTACATTTTTGGGTTTATGGGTTGCATCACTGCGTTTGGTTCAAAGGGTTGGAATTCTTCTAACAGAAACGGAGAGGGATTCAAAAGAAGGTCCTATACCTCGCCTTGATACTTGCATGTGTATGTTACTGAGCATTGCAACCCTGGTGGTAACTAATATTATCGAAGAAGAGGAAGGTCAACTGATTGAAGAAGCTGAACATACCTCTACAAATCAAGGCAATGATAAACTGCCTATGGGGAAGTGTCGTGGGGAATTGATTACCAGCTTACAGCTATTGGGTGATTATGAGTCCTTACTAACTCCACCTCAACCTGTTCTTGTGGAAGCCAATCAAGCTGCTGCCAAAGCTATTCTGTTCTTATCAGGAAACCCCGTGGATAGTGGATGCTTCAAATATATGAGCATGAATGACATGCTGAAGAAATGTTCTGGCAACTTACGGCATCTAATTGTTGAGGCTTGTATTGCAAAAAATCTACTTGATACATCAGCGTATTTGTGGCCTGGCTATGTGAATGCATGCAACAATCAAATTCCTTGTAGCATTTCTAATCAAGTGTCTGCAGGCTGGTCTTCGTTGATGGAGGGATCACAGCTAACTCCTGCATTGGTTAATGTCTTAGTTGCAACTCCAGCTCCAAGCTTAGCAGAGATTGAGAAAATATATGAAATTGCAATCAGTGGTTCAGATGAAGAAAAGATATCTGCTGCTACCATTCTATGTGGGGCATCTCTGGTACGTGGGTGGAATGTACAGGAGCATACGGTTCTTTTTGTCACAAAATTGCTTTCACCTATAGATCATCCTAACTACTCTGGGGCTGAAAGCGATTTCACCAGCCAAGCTCCATTTTTAAACGTTCTTCTTTTTGGAATCTCATCTATAGACACTATTCATCTGTTCTCCCTACATGGTTTGGTTCCATTACTTGCGGCAGGACTAATGCTTATATGTGAGGTTTTTGGATCATGTTCTCCTGATGCCTCGTGGCCTCTTGAAACCAAAGAAAAACTTACTCATTGGGAGGTATTCTCTAATGCATTTACTCTTCTGCTGAGATTCTGGCGGTTTGATCATCTACCTGTTGAACAAGTGAGGCGTGATGCAACAACTCCACCGTTTGGATCGCTACTTAGTCCCGAATGCCTTCTATTAATTCGAAACTGTAAATTGGCGTCATTCGGAAGAACAGCTAAGGATCGACAGAGGCTCAAAAGATGGTCAATGATTTCATTTTTTTCTGCAGAGCCTGTATTTATTGATTCCTTTCCAAAATTAAACTACTGGTATCGGAAACATCAAGAAAGCATTGCTTTAATCCGCTCTGGTGTTGTGCCTGGAGGGCCTGTTAATGATATTGTTGATGCTCTACTAGGCATGATGTTTAGGAAGGTAAGTAATGGTGCCGAACCTTTGACACCTACGACTTCAGGAAGCAGCAATTCACCTGGGCTTGCATTGGATGAAGCTTTAATGAAACTAAAAGTACCTGCCTGGGATATCCTCGAAGCTATTCCCTTTGTGCTTGATGCTGCTCTGACATCTTGTGCTTATGGGAGACTCTCTACCCATGAACTGGCTACAGGCCTCAAAGATCTAGCCGATTTTCTTCCAGCTTCTTTGGTTACCATTGCAAGCTACCTTTCAGCTGAAGTTACGCGGGGCATATGGAAGCCAGCATTTATGAATGGAAGTGACTGGCCTAGCCCTGCTGCAAATTTAGCCCTTGTTGAGCAACAGATAAAGAAAATCTTAGCAGCCACAGGTGTCGATGTCCCAAGCCTTGTTATAGATGGGAAATCTCCAGTTACACTTCCTCTGCCTTTGGCAGCTTTTGTAAGCCTCACAATAACATATAAACTTGAAAAGGCCACTGAACGATTCCTTGCACTGATTGCCCCTAGTGTGAGTGCCCTTGCTTCTGGTTGTCTCTGGCCCTCCTTGCCCATTGTGACGTCTTTGTGGATCCAGAAGGTGAAGCGTTGGAGTAACTACTTTGTGCTCTCTGCTTCCAGCACTGTTTTTCACAACAACAAGGATGCTATAGTTCAACTACTAAAAAGTTGCTTCACATCTACCCTTGGGCTTGGCTATGGCAGCATTCATAATAACGGCGGTGTCAGTGCCCTCCTTGGTGATGGCTTTGTTTCCCAAATATCCGACGGGATCTCTCCAGTTGCTCCAGGAATTCTTTACCTAAAAGTGTACCGGTCTATTGGAGATATCACATTGTTGATTAAAGAAATTCTGCCTATTCTGATGCTTACAGTTACAGACATAGCAGCAAGTAGCGATTTGATGCCCAAGGGGGATGTAAGGAAACTACAGAAAACCAAGTTTGGCATAAAATATGGCCAAGTTTCTCTTGCCAGATCCATGGCACGTGTCGAGCACGCCGCTCAACTCGGGGCTTCATTGGTTTGGCTATCAGGTGGACCCAAGTTAGTTCAGTATTTGATATGGGAGACTCTGCCTTACTGGTTTTTATCAGCTACCATGTTGGAGCAGGATGGCAGAGAATCTGGAGGAGTTATGGTTGCCATACTCAAAGGCTATGCACTGGCATTTTTTGTTTTTCTTAGTGCAGCATTTGCCTGGGGCATTGACAAATCGCATTCACCAAAACGACGGGGGAAGGTTGTTGGCTTGCATTTGGAATTTGTTGCAACAGCCCTGAACAGGAACATACCAATTCGTTGTCATCGTGCTACTTGGAAAGCCTATGTGTCAGGGTTAGTGAGCTTGATGGTGAGTCGAGCTCCAACATGGGTCCGGGTAGTCGATGATGATTTGTTGAAGAGACTGAGCTGGGGATTAAGACAGATGGATGAACACAAGCTGGCTCTTCGCCTTCTGGAAATTGGAGGGATAGGTGTCATGGGTGCAGCAGCTAAATTGATAATTGAACTTGAACATAGATCTAAAATCTATCTGTACTGA 4053 0.4416 MSVPAQTSESDAWDAVLRQTNAAVQTHADPNAWALDVMSTLLSSAISLPSVELAHRLVSLFFWDNHSAAAWKFLHAAVSLNLLHPSLLIALLSATVVPRRQLYPIAYRLYMELLKELRVKFKGDISCPDYEKIMKSIDDVLQLSQVYSQKTRESGVVLVEFVFSIVWQLLEASLDDEGLLDHTTENKPRWLGSSHDMNIDGADSFSEKKTEHAELFQKKNTAMAIEIIAEFLQHKTISRILSLVHWNMSSHWGSFIHQMQLLVSNSSVFRNLKHITTESLLCLTQNIHGVVSHEFKTKSKMENNVVIPPGSLMSFAGQSYGDSWSSLWIPIDLILEDALDGGQVAASSAIEIITGLVKTLHVVSGTMWHSTFLGLWVASLRLVQRVGILLTETERDSKEGPIPRLDTCMCMLLSIATLVVTNIIEEEEGQLIEEAEHTSTNQGNDKLPMGKCRGELITSLQLLGDYESLLTPPQPVLVEANQAAAKAILFLSGNPVDSGCFKYMSMNDMLKKCSGNLRHLIVEACIAKNLLDTSAYLWPGYVNACNNQIPCSISNQVSAGWSSLMEGSQLTPALVNVLVATPAPSLAEIEKIYEIAISGSDEEKISAATILCGASLVRGWNVQEHTVLFVTKLLSPIDHPNYSGAESDFTSQAPFLNVLLFGISSIDTIHLFSLHGLVPLLAAGLMLICEVFGSCSPDASWPLETKEKLTHWEVFSNAFTLLLRFWRFDHLPVEQVRRDATTPPFGSLLSPECLLLIRNCKLASFGRTAKDRQRLKRWSMISFFSAEPVFIDSFPKLNYWYRKHQESIALIRSGVVPGGPVNDIVDALLGMMFRKVSNGAEPLTPTTSGSSNSPGLALDEALMKLKVPAWDILEAIPFVLDAALTSCAYGRLSTHELATGLKDLADFLPASLVTIASYLSAEVTRGIWKPAFMNGSDWPSPAANLALVEQQIKKILAATGVDVPSLVIDGKSPVTLPLPLAAFVSLTITYKLEKATERFLALIAPSVSALASGCLWPSLPIVTSLWIQKVKRWSNYFVLSASSTVFHNNKDAIVQLLKSCFTSTLGLGYGSIHNNGGVSALLGDGFVSQISDGISPVAPGILYLKVYRSIGDITLLIKEILPILMLTVTDIAASSDLMPKGDVRKLQKTKFGIKYGQVSLARSMARVEHAAQLGASLVWLSGGPKLVQYLIWETLPYWFLSATMLEQDGRESGGVMVAILKGYALAFFVFLSAAFAWGIDKSHSPKRRGKVVGLHLEFVATALNRNIPIRCHRATWKAYVSGLVSLMVSRAPTWVRVVDDDLLKRLSWGLRQMDEHKLALRLLEIGGIGVMGAAAKLIIELEHRSKIYLY 1350
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Aed4g0308 1350 PANTHER OS07G0681500 PROTEIN 19 1344 IPR039638 GO:0016592|GO:2000762
Aed4g0308 1350 PANTHER MEDIATOR OF RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION SUBUNIT 33A 19 1344 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Aed4g0308 Aed-Chr4 2241978 2253121 Dispersed/Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Aed4g0308 - - pvu:PHAVU_001G148600g 1879.37
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Aed4g0308 4 2241978 2253121 Aed4g0308 4 2241978 2253121 ECH