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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Adu08g01848 ATGGAGTCAATACTAGCTCGTGCTCTAGAGTACACACTCAAGTATTGGCTCAAATCCTTCTCCAGAGAGCAGTTCAAGCTTCAAGGCCGCACTCTAAGTCTCTCCAATTTAGATATCGATGGTGATGCCTTGCATTCCAGCTTGGCCTTGCCACCTGCGCTTAACGTTTCCACCGCTAAAGTTGCCAAATTGGACATCATGCTTCCTTCCGTGAGTAATGTGCAAGTAGAGCCGATCATTGTGCAAATTGATCGGCTTGATCTAGTTCTGGAGGAGAATTCTGATTTTGATGCATCTGTTAGTAGTAACAACAGTGCCACTTCATCGGCTGCCACCTCGAAGGGTAGTGGTTATGGTTTTGCTGATAAGATTTCTGATGGCATGACTATACAAATTCACACAGTTAATCTATTACTTGAAACTCGTGGTGGTGGGGGGGCGCGTCGAAAAGTGGGAGCAACATGGGCACCACCAATGGCATCTATCACAATACATAACCTTTCGCTGTATACCACAAATGAAAGCTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAAGCACGGGAATTCTCCAGTAACAAGAAATATATATATGTCTTCAAAAAACTAGAATGGGAATCTTTGTCTATTGATCTTTTGCCTCATCCTGACATGTTCGCGGATGCTGCATTAGGCTTCTCTGAAGAGGGATCAAACCTGAGAGATGATGATGGTGCAAAGCGAGTATTCTTTGGAGGAGAGCGTTTTATTGAAGGAATATCAGGAGAAGCATATATAACAGTTCAGAGAACTGACTTGAACAGTCCACTTGGGCTTGAGGTTCAGTTGCACATCAATGAAGCTGTTTGCCCTGCACTAAGTGAACCTGGCCTACGCGCACTTCTCCGCTTTATGACAGGATTATATGTCTGTCTAAACAGGGGCGATGTTGATTTAAAGACTCAGCAGCAGCGATCAACTGAAGCTGCTGGGCGTTCTCTGGTCTCGATTGTTGTAGATCATATATTTCTTTGCATTAAAGATACTGAATTCCAGCTTGAGCTTTTGCTGCAGTCCCTCTTTTTCTCTCGGGCCAGTCTTTCTGAAGGAGAGAATGACAATAACTTGACCAAGATTACAATTGGTGGAATAATTTTAAGGGACATCTATTCATCTCCGCAGTGTACACTAGTGCAACCATCGATGCAAGCTGTCACAAAAGATGCTTTCCATGTGCCTGAATTTGCTAGAAGCTTTTGCCCTCCAATATACCCTCTAGGAGAACAGCAGTGGCAAGTGATTGAGGGAATCCCTCTAATATGCCTCCATGCACTTCAAGTCATGCCTTCACCACTTCCACCATCCTTTGCTTCTCAGACAGTTATTGATTGTCAGCCTCTTATGGTTCATCTTCAGGAGGAAACATGCCTGAGGATATCCTCATTCTTAGCTGATGGTATTGTTGTCAGTCCTGGTGACATTCTACCGGACTTCTCAATAAAATCTTTTATTTTCAGTCTCAAGGGGCTTGACCTTACAGTTCCACTAGACAACATTGAAACTGATATTTCTAAAATCTACATGGATAATAATACAGTTCAGACCTCCTTCACTGGAGCAAGACTCCATATTGAAAACCTTTTCTTTTCTGATTCACCCTCATTGAAACTAAGAATGCTGAACCTTGAAAAGGATCCTGCTTGTTTTAGTCTTTGGGAAGGTCAACCGATCGATGCTAGCCAGAAGAAGTGGACTGCCAGAGCATCGCAGCTTACTTTGTCCCTGGAGGCATGTAATGACAAAATCAAACTTCAAAATTACCTTGGACAAACTGGAGGACTGTTGAGATGTGTTGATCTCAAAGATGCTTGCATTGAAGTAGCTATGGCAACTGCTGATGGCAGTCCACTGTTACATATTCCTCCTTCAGGGGGTATTGTCAGGGTTGGAGTTGCTTGTGGCCAGTATCTATCCAACACTTCTGTTGAACAATTATTTTTTGTCCTGGACGTCTATGGTTATTTTGGGCGAGTTAGTGAGAAAATAGCTATGGTTGGGAAAAGGAAACAATTAGAGGACATTAGAGACAAGTCTTTTAGTGGAAAGCTGATGGACAAGGTTCCCAGTGATACTGCTGTGAGTTTAACAGTAAAGGACCTCCAACTTAGATTTCTAGAGTCTTCGGTGAATGTTGAGGGAATGCCTTTAGTACAGTTTATCGGAGATGATCTATTCATTAATGCCGCCCATAAAACCCTTGGAGGGGCTATTGTTGTTTCATCTACTTTACGGTGGGAGAGTGTCCAGATAGATTGTGTGGATGCTGAGGGGCACTTACCATGTGAAAATGGATCATTCTTGAGTCCTAGCGAAAATGTTCCCTCACCAAGTGATAATGGATATCCTCATCTAAGAGCTGTTTTTTGGGTAGATAAGAATAAGAAACATCCAATGAATGGAAATGCTCATTCAATCCCTTTTCTAGACATCAGTATGGTTCATGTCATTCCACTATTCGAGCAAGATATGGAGTCTCATAGTTTAAATGTGTCAGCTTCTGTTTCTAGTGTTCGACTTGGTGGAGGAATGAACTATGCTGAAGCCCTCCTGCATAGATTTGGAATACTTGGACCTGATGGAGGCCCTGGGACAGGCCTTTCAAAAGGGTTGGAAAACTTACAAAAAGGACCCTTATCAAAACTTTTTAAGACAACACCTCTCATGGTTGATAATTCAGAAGATGCTGAAAGTATGAGACAAGGGGAGGAAACCAGTTTTCCACACCTGAAGAAGCCAGATGACGTGGATGTAACTATAGAATTGAGAGACTGGTTATTTGCTCTTGAAGGTGCAGATCAGATGGCTGAACAGTGGTGGTTCTCCAGTCTTGAGGTTGTAGACAGAGAAGAGAGGTGTTGGCACACAACTTTCCGTGGTTTACGAGTAAATGCAAAAAGTAGCCCAAAGAAGGTTCTAGATGGCAAAGCACAATTGCGGCGGATAAAACAAAATCCAATAGAGCTTGTTACGGTAGGAATTGAAGGGCTACGAATATTAAAGCCTCATATCCAAAAGGGCAATCCTCCATCAATGTTAATTGCAAACGGGGATAAAGAAAATAGTAACACAATTGAGGGAGTTGGTCTTGAAGTTCGCTTGATATTATGTGAGGACAACCCTGATGACATAGTGAATTGGGAAGTGGAAGACATAAAGTTCGCTGTTAAACAACCGATTGAAGCAGCAGTAACCAAGGATGAGCTTCAGCACCTCACTTTGCTGTGCAAATCTGAAATTGATTCGATTGGCCGAATCACTGCTGGAGTTTTGCGGCTGCTTAAGCTGGAAGGTTCTGTTGGTCAGGCTGTAATAGATCAACTTGGTAATCTAGGAAGCGAGGGCATTGACAAGATTTTCTCTTCTGAAAAGGTTACCAGAGATGGTAGTGTTGTTGGTAATAGAGGACATTCTCCCTTACCAAGCGGGGTTAATGAAGGACCACACAAAACCATGGAAGAGACATTAACTCAGCTTGAGGAAGTGGTTGTAGAGTCACAGGCTAAACTCAGTGAACTAATCACTCATGTTGGTACTTTGGACTCTTCTTCCACTCAGCACCGTACCATTGTCAAACTAAGTCAAAAGATTGAGACCATGCAGGGCCTATTGATGCAGTTGAGGAATCAACTTTAA 3663 0.4275 MESILARALEYTLKYWLKSFSREQFKLQGRTLSLSNLDIDGDALHSSLALPPALNVSTAKVAKLDIMLPSVSNVQVEPIIVQIDRLDLVLEENSDFDASVSSNNSATSSAATSKGSGYGFADKISDGMTIQIHTVNLLLETRGGGGARRKVGATWAPPMASITIHNLSLYTTNESWQVVNLKEAREFSSNKKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFADAALGFSEEGSNLRDDDGAKRVFFGGERFIEGISGEAYITVQRTDLNSPLGLEVQLHINEAVCPALSEPGLRALLRFMTGLYVCLNRGDVDLKTQQQRSTEAAGRSLVSIVVDHIFLCIKDTEFQLELLLQSLFFSRASLSEGENDNNLTKITIGGIILRDIYSSPQCTLVQPSMQAVTKDAFHVPEFARSFCPPIYPLGEQQWQVIEGIPLICLHALQVMPSPLPPSFASQTVIDCQPLMVHLQEETCLRISSFLADGIVVSPGDILPDFSIKSFIFSLKGLDLTVPLDNIETDISKIYMDNNTVQTSFTGARLHIENLFFSDSPSLKLRMLNLEKDPACFSLWEGQPIDASQKKWTARASQLTLSLEACNDKIKLQNYLGQTGGLLRCVDLKDACIEVAMATADGSPLLHIPPSGGIVRVGVACGQYLSNTSVEQLFFVLDVYGYFGRVSEKIAMVGKRKQLEDIRDKSFSGKLMDKVPSDTAVSLTVKDLQLRFLESSVNVEGMPLVQFIGDDLFINAAHKTLGGAIVVSSTLRWESVQIDCVDAEGHLPCENGSFLSPSENVPSPSDNGYPHLRAVFWVDKNKKHPMNGNAHSIPFLDISMVHVIPLFEQDMESHSLNVSASVSSVRLGGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGTGLSKGLENLQKGPLSKLFKTTPLMVDNSEDAESMRQGEETSFPHLKKPDDVDVTIELRDWLFALEGADQMAEQWWFSSLEVVDREERCWHTTFRGLRVNAKSSPKKVLDGKAQLRRIKQNPIELVTVGIEGLRILKPHIQKGNPPSMLIANGDKENSNTIEGVGLEVRLILCEDNPDDIVNWEVEDIKFAVKQPIEAAVTKDELQHLTLLCKSEIDSIGRITAGVLRLLKLEGSVGQAVIDQLGNLGSEGIDKIFSSEKVTRDGSVVGNRGHSPLPSGVNEGPHKTMEETLTQLEEVVVESQAKLSELITHVGTLDSSSTQHRTIVKLSQKIETMQGLLMQLRNQL 1220
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Adu08g01848 1220 Coils Coil 1158 1178 - -
Adu08g01848 1220 MobiDBLite consensus disorder prediction 1137 1158 - -
Adu08g01848 1220 PANTHER AMINO-TERMINAL REGION OF CHOREIN, A TM VESICLE-MEDIATED SORTER 1 1219 - -
Adu08g01848 1220 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 105 IPR026854 -
Adu08g01848 1220 Coils Coil 1199 1219 - -
Adu08g01848 1220 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1219 IPR026728 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Adu08g01848 Adu-Chr8 30401399 30409009 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Adu08g01848 - - ahf:112802603 1923.29
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Adu08g01848 08 30401399 30409009 Adu08g01848 08 30401399 30409009 ECH