Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Accr6g00130 ATGGCGGAGACAAGCTCTGGTTCTCTTAAGCCACCTTCTTCTACCATCAATCCCATTGATCACCTTCCTCTCCGCCTTCACAGATCCGACATCGTCCCCCCTGCTCCCACTGGTTCCCAATCCACCATCGACTGGCTTCCAGATTTTTCCGGCTATTCATGGATCGCCTATGGAGCGACTTCACTCTTAGTCATCTCCCACTTCCCTTCTCCTCTCTCTGCCGGAGAATCTCACATTGGTCCCATTTTCCGGCAAGTCTTCGAGCTCTCTGGCGACCCCTTGTCTGTTGTGGCCGCCGTTTCTTGGTCTCCGGGGATGCCATCCATTGGGGAGCTGGCGGCCGCAGCTGAAAATTGTATCTGGCTTTTCTCCCATGATTCGTCCAAGTGTAAAGGTTCTTTTTGTTGGAGCCAGAATGCAGTGCTTGTACATCATATGAAGGTTGAAGCTATCAGATGGACAGGGTCTGGCGATGGATTAGTATCTGGTGGAATGGAGGTGGTTTTCTGGAAAAAGAGCAACAGGTGTTGGGAAATGGTTTGGAAGTTTAAAGCAGATGAACCTCAAACTCTTGTTTGTGCAACCTGGTCCATTGATGGCCCTTCAGCAACTGCAGCATGTCCTAGTGAACTACATATTGAGAGAGAGTCTTTGGTTAATAAGGTAAGAAAATGTGTACTAGTATATCAAAGCAATGGACTTTCTGAATATGCAAACTCTAAGCTAGATCATCCTCTACCTGTCACAATGATTCAATGGAGACCATTGAGAGGAACACCATCAAACCGAAAAGGGAGACACTCAGCTAGGCAAGTATTGCTGACTTGCTGTTTAGATGGAACTTTGAGGTTATGGAGTGAGGTTGATAATGGAAAAGCGAGGAAAATTGGGTACTGTGTTGTTTCCGTCATTGAGATTAATAAAGCCTTGAATGGAACTCTTGGTGTAGATGTATTCATGACATGGGGAACAGAAAGTGGGGGGATATTTAAAATTTCTGAAGGAACCGGCCAAGTCTTCTTCAAAGAAGGATTTGACCATGAAGTTGGAAAATGTGATTGGTTAGTTGGACTTGGTCCTGGAATGTTGCTTAGCTTATGGGCCATCCACTGTCTCGATGACCTCTCGCCTCTTAGATTTCCCCTAGTTAAGTTATGGAGGAGACATGAACTCTGTGGCGCTGAAACAGGAAATCTTTATAGGTTTGACTCATCTGATTTCAAAAAGGTATTACTTCTTAATAAAGTCATTTTATTGAGGAACTGCTGGTCTGGCCCCCCGGTTATATGCTCTCCAGTCCAGTTATTGCCCTCTAATTCCTTAATCCGGTCATTTTTTAATATTCAAACGCTACATGATGCTGTAAAAAACTCCCTTGATAATACCAACACTGAGAACATCTCACGTTTGAATGATGGAGTTTTAAATTTGGATGGTCATGTTGGGAGAATTTTAAAGGTTTCTATTCATCCTTGTACATGTGAAGTTCAAATTGCTGCTTCTCTGGATTCTAATGGACTGCTACTATTTTGGTCACTTTCAAGGATTTCAAACTGCACCGTGGGATGTCCAACCTTGCTTCCCACTTGGAAACTCTCTGGAAAGCTTGTAACACGTGACTGTGGTTCCATGTATACAAGCTTGAGGTGGGCACCTTCATTATTTGATGATGAACTGGTTTTTTTTATGGGACATGCCAGAGGCATTGATTGCTTTATTGTCAAATTTTGTCAAACTGAAGAAGAAAACATACAACAACACTACTTTTGCACTATACCTTTCAATAGTCATGGTCCTTATGAGGATGGCCCTACTGATATCTTTGCAATTTCTTTGGACTCCACTTGTAATAAAACATTTTCTGACAACAAGCTTATGCTTTTGGCAATTTGGATGCGGGGATTTCAGGCCCTGTCATGGGAAATTACCTTGCACTCATTTGACATGTCAACAAGCTATTGTGAATGCAATTTTGATGCTAAGAGTCTTGCTGACCACAGTATGTGGGCATTTGAAAGTACTTTTGCTGGTAAAAGATACTGCATTAGTGTCAATCCTTGCTCATCTGAGTTTTCTAGTACTCATAATAATGATCTGGTTACTAGTTTTGCTGTGGCTTGTCCGGCTACTCTTAGCCAAAGACAACAAAAATTTGGTTTTGCAAATGATCATTGTATTTGCTATCCTGCATATGTCCTCATCACAGGCTGCTCTGATGGCAGCTTGAAACTGTGGAGAAGTAAGCATGGTAACAGATCAACCTTGCACTTGCCATGGGAGCTTGCAGGTATGTTTGCTGCACATGAAGGTCCCATCAATGGTATATGTTTGACTGATTGTGGTCAGAAGATTGCTACATTCTGCAACAGTAGTAATTCAAAGGCAGTTAGTGCCATCCGTATATGGCATGCTGTAAACCTGACGAGTGCTGGAACTTTTATTTTGGAGGATCAGCTAACCTTTGATGGTGATGTTATTACTCTAAACTGGTTCACTTTGGGGACTGGTCAGTTATTACTTGGAGTTTGTTTGCAAAATGAATTGCAAGTATATTCTCAGAGGCGTTATGATGGTTTGACTTTGTTAACAGCTGGAAACCTTTCCAAAATTAATATATGGGTTTGCATTGCATCTGCTCATACCTTCATTCCCATTAATGACTTCTTGTGGGGGCCTGGAGCCACAACAGTGGTAGTTCATAGAAATTACTTTACTACATTTAGTAATTGGTTGTTCCATGTGGATGAAAAGCAACAAAGTAATTCTCATTCATATGAGTCGAAGGCAAATCTCTATAATGGTAAGGGTGGTACATTTGAAGACATGCTTTCTGCAGTTTTTACTGATCATGGTACCAGTACCTTCAGAGAGCTGTCAGTTGGGGATAGTGGCGGAGACTCTGAGTCAATGCAGCCTATCAAAAGTAATATGAAGGGAGATGAACTAGATAACAGCTTGCTTCTAGCTAAGTCTCAATTGGAAGCTCAACTTAGTACCTATGCTGGTTTATGGAGCATCTTTGAAATTGTGGAGAAATTAAGTGGATCTTTGCCCATTTATCACCCTGATGTACTCCTTATTAATATAAGTTCAGGCAACTGGAAACGTGCATATGTGGCAGCGAGGCATCTTTTTGAATTTCTGACTTCTAATTATGCTCCTGAAAACAGTTATGTCTCCAAAAAAATTGGTCCTCCTGTAATCTTATTGTCAAATTATTTAGAAGGAGTTGTTTCAACAGTTTCCCAAGATAGGGAATTCCAATGGAGTGGGGATACTGCTTCGATCTCCCTCTCTCAAAGTAGCTTCATGCAGTTTTCGTATCATTCAGGCTTCACTGTTGAAAATACAACCTCAACAAAATCTGAGCTCAATGACTTGATCAAATCCCTTGAAAATTTTCCTGACTTAGAAGCTATTATCAACATAAAAAAGACGCAGATTCTTGCAGTTATTGATCTGCTCGGTGAAGTTAATAGTCCACACTCATCTTCTGCATATCAAAGTCTTGATGAGCCTGGACGAAGGTTTTGGGTGGGATTAAGGTTTCAGCAACTTCTTTTTGTCCGGACTTTTGGTAGGGTTGCAACTCCAGAAGAGCTGATAGTTAACTCAAGGTTGTTTGTATGGGCTTACCAGTCTGATTGCCAAGAAAGTTTGTTTGGTTCTGTCATACCTAATGAACCATCTTGGAAAGAAATGCGAGCTTTGGGTATTGGCTTTTGGTTTGCCAATGTACCTCAACTGCGTTCTAGGATGGAGAAACTGGCAAGGGCACGGTATTTGAAGAACAAAAATCCTAAGGACTGTGCACTACTATACGTTGCACTAAATAGGACTCAAGTATTGGCTGGCCTTTTCAAAATTAGTAAGGATGAGAAAGACAAGCCTTTAGCGGGATTTCTCTCACGCAATTTTCAGGATGAGAAAAATAAAGCAGCTGCTTTGAAAAATGCTTATGTCTTATTGGGGAAGCATCAGCTGGAACTGGCTATTGCTTTCTTTTTGCTTGGAGGTGATAATTCTTCGGCTGTAAATATTTGTGCAAAGAACCTTGGAGATGAACAGCTTGCATTAGTTATTTGTCGGCTTGTTGAGGGCCTTGGTGGATCATTGGAGCGTCACTTGATAACAAAGTATATACTTCCATCTGCAATTGCAAAGGGCGACTACTGGCTTGCAAGCCTACTGGAGTGGGAAATGGGTAATTACTACCAATCTTTTCGGAGAATGCTAGATGTTTCAGTAAATTCTGTAGCTCAAGACTCCACCGTTGTCTCCAACTGTGATCCTTTTTTGGACCCAAATGTTGGCATTTATTGCCAAATGCTTGCAACAAAGAATAACATGAAGAATGCTGTAGGGGAGCAAAATTCAGCTATCCTTCTAAGATGGGCTACTCTTATGACAGCAATTGCCCTGAACAGATGTGGTACTCCTCTCGAAGCATTGGAATGCTTCTCATCTTCTCCGAGTGTGGTTGAGACTGCAGATCAAGGAACTGAGTTGGGTGCTGGAAATGAGGCACTGTCTAAAATTTTTAATCCTTTACCAAGAAAATCTGCTAACTGGCTTTCTGCTGATGTGTCTATGCATCTGGAATTTCATGCTAAATTGAATTTGGCGCTTCAGTATTTAGCAAATTTGACAAGAGATCATCCAAACTGGCCAGATAATGTTGTAGGATGCAATGGGGAACTGGCATATTCTGACGAAAACATTATGCAGTATGATAAATCACTTGAAAATCTGAGGGAAAAATTGTATGCTGGGCTTGCACTGTTTGAACAGAGGTTTTCATTGGCTCCATTCTGTCTACTGAGAATGATTTTACTATCACTTCGCCATCAGGGGCTACTGAACATAGGATATGATATAGCGTGTGGTGTTTCAGGAGATAAATCTCATAAGAATAGTGATATAGGTGATGCTTCTGCGTTGTATTACTCCTGGCTTAGACCTCTCTTCAAGTCTACAATTGAAAGCTCCCATTTCTTTTCAAGATTCTTTACTGCTTGCAGTATGGGTAATTCCCAACATAGTATAACTTCTTTTGAGAACAGTGCATATATTGAAAGTAAATTGAAGTTTTCAAGTGCTTGGCAGCCTCAGTTGGTCAAAGGTCTCCTGATTTCACTTTGGCATTTAAAAGCCATTTTGAGGATTCAGTTTGATTCTTTCTGCAAAAATATTATGGAGAAGACTGTTGATATTCTTAATTTGTTTGAGTATTATTTATACTTTTCATTAGCTTGGCTTCAAAAAAACTTAGAAGCTATTTTCTTAATGGTTCAACCTTTTTTGATTGCACGTATTGACGACCGTAACCCTTATGAGGTTGATATGGTGAATCTGAAGAAACTCATCCCAAAAATTATGGAATTGGTGACTCAACATTCTTTGGTAGACCATGCCTCAAAATGTGGACAAGATATACAAGTCGTGAATGTGAAGCAGTTGATTCCTGATGATGAAAAATCGATGATTTTAGAGACTTGCTTATGGCAGCAAATGTCTAGATTCATGATATATAATTTGAATAAGATTGTGGATACACTTGAAGATGGTAATTTGCCTGGTTCTTTCAACAGAAAGTATGATTGCGAGGCATCAACTCTCTTGACTCCAGATACCGATGGCATCAACTTGCCTGAGCAGATGAGGTTGGTTTCATTGAGCTTATGTGAGTTACTGAAGAGAACTGTTACACACACTTCCTCTTATCATTCTAAACAACTTGCAATATTTCTCTGGCAGAGATTGGAAAATGATCTGAGCACAATGACTCTTGAGTGGTTAAAAAGACCTAGTTTGTCAGAATCCAATCAGGATCAAAGTCAAGGGATCGTCAATTTGGAATTGGTGAACACGAAAGATAAATGCTTGGTTTATCAAATATTATGGGATCATTGTGCAGATCCAAAATTGGTATCTGACTGCTTTGCACATGAAAAACTTGATTGTTCAAATTATTTGGATCATTTGCCTGCTAAAGGATGGAATGACATGTATATAAAACTGACAGAGATGCATAAAACTGATGATACTCGTGATTGTGGAGGTAAAGTTGGCAATAGTTCTGCTAGTCATGAAGTTGTATCATCTGTTAAAAAAGCGTTTCAAGGTGCCCCTGCTTCTGTAAGTTCCCACCAGAAAGAAATAAGTATTAAAAATGTTTCAATTTTCCAGAGCCCTAGAGAAATATACAAAAGAAATGGGGAACTGTTTGAGGCATTGTGCATAAACTCAACTAATCAACGGGAAGCCGCACTTGCTACCAATCGGAAGGGCATACTATTCTTTCATATGGATGGTGAGATGCCTTCTGGTAATGAATCAGTTAATTTGTGGTCTGAGGTTGAATGGCCACAAAATGGGTGGGCAGGTTCAGTATCCACCCCAGCTCCAACATGTGTTTACCCTGGTGTAGGTCTTGGCATCAAGAAAGGGCCACACCTTGGGCTGGGTGGAGCCACAGTTGGTGTGGGCCTTTCAGCAAGGCCTAGCAGAGACTTGACAGCTGGTGGAGCTTTTGGCATTCCCGGACATGCTAGAACTGAGACGGCTAGATTAGGTTGGGAAATTCAAGAGGACTTCGAAGATTTAGTTGATCCACCAGCAACTGTGGAAAACATAAGTACAAGGGCGTTATCTAGTCATCCTTTGAGGCCACTCTTTTTGGTTGGTTCAAGTAATACACACATTTACCTCTGGGAGTTCAACAAGGATAAAGCTAAAGCTACATATGGAGTTCTGGCTGCTGCTAATGTGCCTCCACCTTATGCTTTAGCTTCTGTATCAGGTTTGAAGTTCGATCACTATGGACACCGGTTTGCGAGTGCAGCATCAGATGGGACTGTCTGCACATGGCAGTTGGAGGTAGGAGGAAGGAGCAATATTCGTCCAACAGAATCCTCCCTCTGCTTTAATGGTCATGCATCGGATGTGACTTACTTTCCTTCGAGTGGATCAATAATAGCTGCGTCTGGATATAGCTCAAATAATTTCAACGTGGTTATATGGGATACTCTAGCTCCTGCAACAACCTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTGGTGCTCGCTCCCTTTCTGTATTGGATAATGATGTAGGAAGTGGTTCTATTTCCCCTCTTATTGTGACTGGTGGTAAAAATGGTGACGTTGGAATTCATGACTTCCGTTACATAGCTACTGGAAAAGCTAAAAGGCACAAGCATGTTGATGCTGGCGAACAAAGCACCCCAAAGTCTTTGAATTCCGACAAGGACAAGAATGTAAATGGGATGCTTTGGTATATTCCTAAGGCTCACTCAGATAGCATCACAAAAATAGCTGCCATCCCAAATACCAGCTTGTTTTTCACTGGAAGTAAGGATGGAGATGTCAAACTCTGGGATGTCAAGAGCACTCAGTTAGTCTGTCAATGGTCAAAATTGCATGAAAAGCACACCTTCCTGCAGCCAAGCTCTCGTGGATTTGGTGGTGTTGTTCGGGCTGCTGTTACAGATATCCAAGTCGTTTCTCATGGTTTCCTTTCATGTGGTGGGGATGGAACTGTAAAGCTGGTGCCCCTGAATAGGAACATGCTTCGTCATGAAGTTAAATTATGA 7614 0.4125 MAETSSGSLKPPSSTINPIDHLPLRLHRSDIVPPAPTGSQSTIDWLPDFSGYSWIAYGATSLLVISHFPSPLSAGESHIGPIFRQVFELSGDPLSVVAAVSWSPGMPSIGELAAAAENCIWLFSHDSSKCKGSFCWSQNAVLVHHMKVEAIRWTGSGDGLVSGGMEVVFWKKSNRCWEMVWKFKADEPQTLVCATWSIDGPSATAACPSELHIERESLVNKVRKCVLVYQSNGLSEYANSKLDHPLPVTMIQWRPLRGTPSNRKGRHSARQVLLTCCLDGTLRLWSEVDNGKARKIGYCVVSVIEINKALNGTLGVDVFMTWGTESGGIFKISEGTGQVFFKEGFDHEVGKCDWLVGLGPGMLLSLWAIHCLDDLSPLRFPLVKLWRRHELCGAETGNLYRFDSSDFKKVLLLNKVILLRNCWSGPPVICSPVQLLPSNSLIRSFFNIQTLHDAVKNSLDNTNTENISRLNDGVLNLDGHVGRILKVSIHPCTCEVQIAASLDSNGLLLFWSLSRISNCTVGCPTLLPTWKLSGKLVTRDCGSMYTSLRWAPSLFDDELVFFMGHARGIDCFIVKFCQTEEENIQQHYFCTIPFNSHGPYEDGPTDIFAISLDSTCNKTFSDNKLMLLAIWMRGFQALSWEITLHSFDMSTSYCECNFDAKSLADHSMWAFESTFAGKRYCISVNPCSSEFSSTHNNDLVTSFAVACPATLSQRQQKFGFANDHCICYPAYVLITGCSDGSLKLWRSKHGNRSTLHLPWELAGMFAAHEGPINGICLTDCGQKIATFCNSSNSKAVSAIRIWHAVNLTSAGTFILEDQLTFDGDVITLNWFTLGTGQLLLGVCLQNELQVYSQRRYDGLTLLTAGNLSKINIWVCIASAHTFIPINDFLWGPGATTVVVHRNYFTTFSNWLFHVDEKQQSNSHSYESKANLYNGKGGTFEDMLSAVFTDHGTSTFRELSVGDSGGDSESMQPIKSNMKGDELDNSLLLAKSQLEAQLSTYAGLWSIFEIVEKLSGSLPIYHPDVLLINISSGNWKRAYVAARHLFEFLTSNYAPENSYVSKKIGPPVILLSNYLEGVVSTVSQDREFQWSGDTASISLSQSSFMQFSYHSGFTVENTTSTKSELNDLIKSLENFPDLEAIINIKKTQILAVIDLLGEVNSPHSSSAYQSLDEPGRRFWVGLRFQQLLFVRTFGRVATPEELIVNSRLFVWAYQSDCQESLFGSVIPNEPSWKEMRALGIGFWFANVPQLRSRMEKLARARYLKNKNPKDCALLYVALNRTQVLAGLFKISKDEKDKPLAGFLSRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGKHQLELAIAFFLLGGDNSSAVNICAKNLGDEQLALVICRLVEGLGGSLERHLITKYILPSAIAKGDYWLASLLEWEMGNYYQSFRRMLDVSVNSVAQDSTVVSNCDPFLDPNVGIYCQMLATKNNMKNAVGEQNSAILLRWATLMTAIALNRCGTPLEALECFSSSPSVVETADQGTELGAGNEALSKIFNPLPRKSANWLSADVSMHLEFHAKLNLALQYLANLTRDHPNWPDNVVGCNGELAYSDENIMQYDKSLENLREKLYAGLALFEQRFSLAPFCLLRMILLSLRHQGLLNIGYDIACGVSGDKSHKNSDIGDASALYYSWLRPLFKSTIESSHFFSRFFTACSMGNSQHSITSFENSAYIESKLKFSSAWQPQLVKGLLISLWHLKAILRIQFDSFCKNIMEKTVDILNLFEYYLYFSLAWLQKNLEAIFLMVQPFLIARIDDRNPYEVDMVNLKKLIPKIMELVTQHSLVDHASKCGQDIQVVNVKQLIPDDEKSMILETCLWQQMSRFMIYNLNKIVDTLEDGNLPGSFNRKYDCEASTLLTPDTDGINLPEQMRLVSLSLCELLKRTVTHTSSYHSKQLAIFLWQRLENDLSTMTLEWLKRPSLSESNQDQSQGIVNLELVNTKDKCLVYQILWDHCADPKLVSDCFAHEKLDCSNYLDHLPAKGWNDMYIKLTEMHKTDDTRDCGGKVGNSSASHEVVSSVKKAFQGAPASVSSHQKEISIKNVSIFQSPREIYKRNGELFEALCINSTNQREAALATNRKGILFFHMDGEMPSGNESVNLWSEVEWPQNGWAGSVSTPAPTCVYPGVGLGIKKGPHLGLGGATVGVGLSARPSRDLTAGGAFGIPGHARTETARLGWEIQEDFEDLVDPPATVENISTRALSSHPLRPLFLVGSSNTHIYLWEFNKDKAKATYGVLAAANVPPPYALASVSGLKFDHYGHRFASAASDGTVCTWQLEVGGRSNIRPTESSLCFNGHASDVTYFPSSGSIIAASGYSSNNFNVVIWDTLAPATTSRASILCHEGGARSLSVLDNDVGSGSISPLIVTGGKNGDVGIHDFRYIATGKAKRHKHVDAGEQSTPKSLNSDKDKNVNGMLWYIPKAHSDSITKIAAIPNTSLFFTGSKDGDVKLWDVKSTQLVCQWSKLHEKHTFLQPSSRGFGGVVRAAVTDIQVVSHGFLSCGGDGTVKLVPLNRNMLRHEVKL 2537
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Accr6g00130 2537 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 15 - -
Accr6g00130 2537 MobiDBLite consensus disorder prediction 1 20 - -
Accr6g00130 2537 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 95 851 IPR036322 GO:0005515
Accr6g00130 2537 Pfam RAVE protein 1 C terminal 812 1424 IPR022033 -
Accr6g00130 2537 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 2216 2527 IPR036322 GO:0005515
Accr6g00130 2537 Pfam WD domain, G-beta repeat 2435 2467 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 Gene3D - 40 328 IPR015943 GO:0005515
Accr6g00130 2537 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 28 2526 - -
Accr6g00130 2537 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2435 2470 - -
Accr6g00130 2537 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2435 2476 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 Gene3D - 452 874 IPR015943 GO:0005515
Accr6g00130 2537 Gene3D - 2211 2516 IPR015943 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 711 746 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 135 171 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 235 286 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 2479 2525 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 2302 2342 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 2347 2393 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 758 803 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 2202 2239 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 2256 2291 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 470 512 IPR001680 GO:0005515
Accr6g00130 2537 SMART WD40_4 2428 2467 IPR001680 GO:0005515
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Accr6g00130 K24155 - gmx:100789935 3420.94
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Accr6g00130 6 2095770 2114549 Accr6g00130 6 2095770 2114549 ECH