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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Accr3g01620 ATGGCGCCAACATTTCTGTCTCTGTGCTTGCTCCTATGCTTTGGCTTCCGCCTGTCCTTCTCTGGACAATCTGGCTCCATAGAATCAGTTCCTGATCTTCAGAAGTCTATGTACAAGGTAGTTGACGGATATCCCTGTGTGCGGCTACTAAATCTTTCTGGACCTATCGGTTGTTCCAATCCTGGACGAGACAAGGTTGTCGCCCCAATAGTGACATTCCAAAATGCTAATCAACTGTCAGAGTCATCTGCTATATTGGTGTCATTGGATGAGTTTGAAAGTCTCTTAACAAGAATATCTGGTGATTCAAGCTTTGCAAGTAAGGTTGCTGGTGTGCTTGTTGAGTCAGGAGCTGGAGTGCAGAATAAGTTGAAGGGATTCTCTCCAGAATTAAAGTTTCCACAAAATGAATTTGCTCCTTACCATAACACTGGATATCAATGGAACCCAACTGGTTCTGGTATCATGTGGAAATCCTACAATTTTCCTGTTTTCCTGCTCTCAGATAGTAGCACGGAGACTCTTCATGAGGTTGCAACCAAGAATGAGAACAACAGGAAAGGTTATACTGTTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGGTAACGAAATCTGAAAATCGTGGTTCAGAGTCTTGCTTGAAAGAAGCTACTTGCCTTCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCATCACTTCCACCAATCAACACTTCAGCCTTTGATCATTCTAAACCCATAATATTGACGATGGCATCAATGGATTCTGCTTCATTTTTTCGGGACAAGAGCCCAGGGGCAGAGTCTCCTATTTCTGGCTTGATAGCATTGCTGGCAGCAGTTGATGCTCTCTCTCATGTGAATGGTCTTGGCGACCTTACTAAACAGCTCGCTTTTGTGGTTTTTACTGGCGAGGCATGGGGTTACCTTGGAAGTCGAAGATTTTTGCTTGAGCTTGACATGCATTCAGATGTTGTCCATGGGCTTAATAACTCTCAAATTGAAATGGTTATTGAAATTGGTTCTGTTGGAAAGGGTTTCAGTGAAGGTGTTCATAGATTTATTACTCATACCTCAGGGGTATCTTCTGCTATAAATGAGACATTGGCAGCCTTGAGACATGCACAAGAGTCACTGCTATCCAAGAACATTAAGATCGCATCTCCAAGTGACTCAAATCCTGGGATACCTCCGTCATCCTTTATGGCATTTTTGAAAAAGAATCCTGCAGTCTCTGGGATTGTCTTGGAAGATTTTGATGCTGTCTTCACTAACAAGTTCTACCATAGTCCCCTTGATGATTTATCAAATGTAAACTCATCAGCTATAGTTGCAGCTGCTTCTCTTATTGCCCGAACTCTGTACATTCTTGCTAGTGGAAAGGAAACTGTGAGAGATTCAGCTTTATCTGCTATAAATGTAAATGCGTCACTTGTTGAAGAACTTATGGGTTGCTTATTGACCTGTGATCCTGGCCTTTCTTGTGAATTAGTGAAGAGCTATATTTCACCTTCATCAGCCTGCCCTAGCCATTATGTCGGTGTTATGGTGGATGAACCTTCATCTACACCATATCCAGAAGAGATTAACGATGTTCCCAGATTTATCTGGAATTTTTTATCTGACAAAACCTCTATTTCAAAGGAAAATGGTGGCACCAGTTGTCTAGAAGATTGCAAAAGTAGGGATAAAGTTTGCATTAAAGCAGAGACTGATGGGAAAGGGGTTTGTGTTACCTCTACAACCAGGTATGTTCCAGCATATTCAACGCGATTAAAATATGAATCAGGAGTATGGAATGTTTTGCCCCCTAATTCATCTGACGAAATGGGAGTTGTGGACCCAGTCTGGACAGAAAGCAATTGGAACACAATTGGGATTCAAGTGTACACTGTCCAAGATGCAGCTTATGATCGTCTCGTTCTGTTTGGGGGTATCACCATTACGATCTTAGCCTACGTTGTTATAGAAACCACGAGAGCTTATATCACCAAAGCCTTGAAGAGGGATTGA 2007 0.422 MAPTFLSLCLLLCFGFRLSFSGQSGSIESVPDLQKSMYKVVDGYPCVRLLNLSGPIGCSNPGRDKVVAPIVTFQNANQLSESSAILVSLDEFESLLTRISGDSSFASKVAGVLVESGAGVQNKLKGFSPELKFPQNEFAPYHNTGYQWNPTGSGIMWKSYNFPVFLLSDSSTETLHEVATKNENNRKGYTVNVAEFDLVMQVTKSENRGSESCLKEATCLPLGGYSVWSSLPPINTSAFDHSKPIILTMASMDSASFFRDKSPGAESPISGLIALLAAVDALSHVNGLGDLTKQLAFVVFTGEAWGYLGSRRFLLELDMHSDVVHGLNNSQIEMVIEIGSVGKGFSEGVHRFITHTSGVSSAINETLAALRHAQESLLSKNIKIASPSDSNPGIPPSSFMAFLKKNPAVSGIVLEDFDAVFTNKFYHSPLDDLSNVNSSAIVAAASLIARTLYILASGKETVRDSALSAINVNASLVEELMGCLLTCDPGLSCELVKSYISPSSACPSHYVGVMVDEPSSTPYPEEINDVPRFIWNFLSDKTSISKENGGTSCLEDCKSRDKVCIKAETDGKGVCVTSTTRYVPAYSTRLKYESGVWNVLPPNSSDEMGVVDPVWTESNWNTIGIQVYTVQDAAYDRLVLFGGITITILAYVVIETTRAYITKALKRD 668
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Accr3g01620 668 PANTHER NICASTRIN 9 667 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Accr3g01620 668 Pfam Nicastrin small lobe 45 201 IPR041084 -
Accr3g01620 668 CDD M28_Nicastrin 41 621 - -
Accr3g01620 668 Gene3D Zn peptidases 168 471 - -
Accr3g01620 668 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 217 452 - -
Accr3g01620 668 Pfam Nicastrin 244 453 - -
Accr3g01620 668 FunFam Nicastrin 172 468 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Accr3g01620 K06171 - gmx:100818367 999.193