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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi9g0980 ATGTCTCGCCCACCTGCTGCTCGCCTCTTGCTCTTCATCTTTTCCTTTTGGTTTGGTGCTTCTTTCATTCAGATCTGTTGTGCACAAAGCGTGGTGGTTGATCCAAAGTTGAAGTTTGAGAATCCAAGACTTCGGCAAGCCTACATTGCCCTCCAAGCATGGAAGACGGCCATTTTCTCAGACCCCTTCAACTTCACCTCCAACTGGGTTGGTCCTCAAGTCTGCTCCTACATGGGTGTGTATTGTGCCCCTTCTCTCTCCAATCCCTCCCTCAAAGTGGTTGCTGGCATCGACCTCAACCATGCCGATATCGCCGGTTATCTGCCCTCTGAGCTGGGCCTCCTCTCCGACTTGGCTCTCTTCCATCTCAACTCCAACCGCTTCTGCGGCATTGTTCCCAGCTCTTTGAAGCGCATGAAGCTCCTCTACGAGCTGGACATCAGTAACAACCGCTTCGTGGGGAGCTTCCCCAATGTGGTGTTGTCCATGCCCTCCCTCAAGTTCCTGGATCTCCGATTCAATGAGTTCGAGGGTCCAGTTCCATCCCAGCTCTTCAATAAGGATCTGGATGCAGTTTTCCTCAATGACAACAGATTCCAATTCGGCATCCCTCAGAATCTGGGCAATTCACCCGTCTCTGTTCTGGTCTTGGCCAACAACAATCTTGGGGGTTGCATTCCAGGCAGCATTGGTAAGATGGGAAAAACCCTAAATGAGATCATCCTCATGAACGACAATCTCACTTCATGCTTACCTCCTCAAATCGGCCTTCTCAAAGAGGTTACCGTGTTTGATGTGAGCTTCAATCATCTCCAAGGCTCACTGCCACCCGCCATTGGCAAGATGAAGAGCTTGGAGCAGCTGGATGTTGCCCACAACAGTTTCACCGGTGCGATTCCGCCCAGCATCTGTCAGCTGCCCAGATTGGAAAACTTCACCTATTCTTTCAACTATTTCACCGGAGAGGCTCCTGTTTGTGCTGCCATTACTGGTGATGGTCGCCAGAATTGTATCCCAGGAAAGACGGACCAGCGGTCCTCTAGTATGTGTTCCTCTCAAGCTGCACGTCCTGTGGATTGCAGCAAGTCCAAATGCGGCGGCGGCAGCACCAACGCTGGTGATCACACCCACCACCACCCCAATCACAACACTCGTCCGTGCCTCCTCCCGCCAAATCATATCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACCTCCATCATCGAATCATTACCATTATTCATCACCACCACCGCCATTATCCACAACAGGACATTACAGTTCGCCACCTCCGTCATCAAACCACTATCATTATTCACCACCACCACCACCACCACAATCATCGAGCCATTATACTTCCCCACCTCCCCCACCCACCGAAAAAGGATCACCAAATGCCCATTTTGTACCACCACCGCCACCACCTGTCTATCCACATATGACACCGCCATCCCCACCCCCGCCCTCACCTTCATCACCAAATCCGCCCCCAGAGTCTGAGATGCCTCCGTCACATCAACAACAGCCTCCATCACCTGGGCCTTTGCATCCTCTTCCTCCTTCACCACCATCTGGATGTGGCACTCCTGGATCCCTACTCCCACCACCACCACCGCCACATTCTCTACCAGTACCATTGGCACCAGCACCCAGCCATCACCACTCACAATCATACCCACCTCCCTCACAACATTGGCATCATCCACCACCGTTACACCATCAAAATTCTCCACCACCCACCAAAAACCCATATTCACCCCCTCCACCGCCTCCGGATAACGTGCCATTGCCACCAGTTATCGGGGTATCGTATGCATCTCCTCCTCCCCCAGGAATCCCCTACTACTGA 3261 0.2938 MSRPPAARLLLFIFSFWFGASFIQICCAQSVVVDPKLKFENPRLRQAYIALQAWKTAIFSDPFNFTSNWVGPQVCSYMGVYCAPSLSNPSLKVVAGIDLNHADIAGYLPSELGLLSDLALFHLNSNRFCGIVPSSLKRMKLLYELDISNNRFVGSFPNVVLSMPSLKFLDLRFNEFEGPVPSQLFNKDLDAVFLNDNRFQFGIPQNLGNSPVSVLVLANNNLGGCIPGSIGKMGKTLNEIILMNDNLTSCLPPQIGLLKEVTVFDVSFNHLQGSLPPAIGKMKSLEQLDVAHNSFTGAIPPSICQLPRLENFTYSFNYFTGEAPVCAAITGDGRQNCIPGKTDQRSSSMCSSQAARPVDCSKSKCGGGSTNAGDHTHHHPNHNTRPCLLPPNHIXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXPPPSSNHYHYSSPPPPLSTTGHYSSPPPSSNHYHYSPPPPPPQSSSHYTSPPPPPTEKGSPNAHFVPPPPPPVYPHMTPPSPPPPSPSSPNPPPESEMPPSHQQQPPSPGPLHPLPPSPPSGCGTPGSLLPPPPPPHSLPVPLAPAPSHHHSQSYPPPSQHWHHPPPLHHQNSPPPTKNPYSPPPPPPDNVPLPPVIGVSYASPPPPGIPYY* 1087
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi9g0980 1086 Coils Coil 394 394 - -
Vvi9g0980 1086 FunFam Leucine-rich repeat extensin-like protein 1 48 209 - -
Vvi9g0980 1086 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 211 330 IPR032675 -
Vvi9g0980 1086 FunFam LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERECTA 233 323 - -
Vvi9g0980 1086 MobiDBLite consensus disorder prediction 885 904 - -
Vvi9g0980 1086 MobiDBLite consensus disorder prediction 905 1017 - -
Vvi9g0980 1086 SUPERFAMILY L domain-like 48 324 - -
Vvi9g0980 1086 PANTHER LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 3-RELATED 30 1081 - -
Vvi9g0980 1086 MobiDBLite consensus disorder prediction 366 390 - -
Vvi9g0980 1086 MobiDBLite consensus disorder prediction 1033 1086 - -
Vvi9g0980 1086 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 45 210 IPR032675 -
Vvi9g0980 1086 MobiDBLite consensus disorder prediction 860 1086 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vvi9g0980 Vvi-Chr9 13695703 13699075 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vvi9g0980 30 365 Leucine-rich Repeat extension Gene Families AT1G62440 74.487 5.48e-175 531
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi9g0980 - - vvi:100265463 755.362