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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vra1g1614 ATGACGGACACAATACCTGCATGTTACAATATATCTATAGTTAATCCTAATCAATTTTGGAAAACCGATAAAGTCTTGAAAACAGAGCTACCTATTTTGGCCATTCAAATTGCTTTTACTGCTGTGTTATCTCGTCTCTTTTCCATAATCTATAAACCTCTGCATCAAACTCGTCTCATTTCACAAATCTCTGTTGGTTTCCTACTGACACCACCATTACTTGGAAGATTCACGCCAATTTTTGAGTTCATTTTTCCAGTAAATGGGATTATTAATGTCGAGATTCTTTCCCACATTGGTCTCATTTATTATGCATTCCTTAGTGGATTGGAGATGAACTTAAATACCATTCTAAATGTGAATAAGAAAGCTGCAAGCATTGCAATTGCTGGGATCATCTTTCCCATACTCGTTGCACCATGCTTGTATGCTTTGTTTCGAAAAGTTTATGGACATGTTATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAATACAAATAATGCTTATATACTTTGGACTTTAATTCTTACTGTTACAAGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCCTTTATACTGGTCTTGGCAAAGAGGCTTTAACAGCAGCCATGATTGGTGACACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTCCCCTTTGCAATTAATGGTAAAGGAGCCACTAACACTCTGTTATGCACGATAATATTCGTTGTTGTGTGCATCTTTGTGGTACGTCCACTCATTCAATGGTTTATTGATCGCAAGGCAAACAAAGATGAATGGAGTGATAACCAATTGCTCTTCATAATCATGGGCGTTTTAGCTTGTTCATGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGGGCTTTTACTTTTGGATTAATTTTACCTCATGGAAAATTTGCTGAATTGGTCATGTCAATTTCAGATGACTGTGTTAGCGGCTTTTTAGTACCCCTCTTCTTTAGTGGAACTGGAATGAGACTTATGTTGATCACAATTTTCTCCCAAGAAAGTTGGCCCTTTATAATTATGATTATACTCTTGTTGTGTGCTCTAAAGATTTTAGGCACTTTATTTGTCACATTTTTCTTTGGTATGCGTATTCGAGATGGTTTGACCTTGGGCTTGATTTTGAATAATAAAGGTGCCATGGCATTAATAATGCTGAACATTGCTTGGGATAGAACGATATTTTCTGTACCTACCTATGCCGTTTTAACTTCTGCTGTTCTTTTGATGACCATAATTGTGTCTCCCGTCATCAATGCCATCTACAAACCAAGACAATTATTTGAACAAAACAAGCTAAAGACCATACAAAAATTAAGAGTTGATGCAGAACTTCGATTTATAGCGTGTGTTCACAATACTCGCCAAGCTGCAAGCCTGATTAGCATAATTGAATGTTTTAACCCCACGAGAGTTTCCCCTATGCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTCGAACTTACTGGACGTGTTGCTGCCTTAGTTGCTGCACATATAGGGAAGCCTAGTAGCCAACTCGGAGAACAAAACCTGACCAGGTCACAGGAAGAGTTAGAAAGCATTCGCAACACATTTGATGGACTTGGAGAGACATATAATGCTATTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAGCATATACAACTATTCATGAGGACATATACCACTCAGCAGATGAGAAACGCACAAGCTTGATTCTACTTCCATTTCACAAACAATTAACTTTAGAAGGTACTCTAGAAGTAACTAGTGTTGTATACAAAGATATAAATCAAAATGTAATGCAAGGTGCTCCTTGCTCTGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGGTTAGTTCCTAAAATGAATCTTCATGTTCGTGTGGTCTTTGTTGGGGGTCCTGATGATCGTGAAGCCTTAGCCATTGCATGGAGGATGGCAGGACGTTCAGGAACACAACTCTCACTGGTTCGAATTCTTCTATTGGGTGAAGCAGCAGAAGTAGATGCTTCAGTTCACAATGAATCACAAGGGATATTATCTGCGGTAATAGATACAGACAAGCAAAAAGAGTTAGATGAAGAGTATATAAGTGCATTCAGACTTACAACAGTTCACAATAGTGATATAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTTATAGTGATGAAGATATTCCTGTAGTCCTCAAAGAGATAGAAAAAATTGAATGTGATATTTACATAGTTGGACAAGGGAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTGTTGGAGTGGTGTGAATGCTTAGAACTTGGAGTTATTGGGGATATTTTGGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGTTCGTCTGTGCTAGTTGTTCAACAATATGGATATGGAGGAATGGTTTGTGGAAATAATCTTAACCAGAAGGCCACTAACAAAGGCATGTTTGAATCTATTGTTTAA 2436 0.3764 MTDTIPACYNISIVNPNQFWKTDKVLKTELPILAIQIAFTAVLSRLFSIIYKPLHQTRLISQISVGFLLTPPLLGRFTPIFEFIFPVNGIINVEILSHIGLIYYAFLSGLEMNLNTILNVNKKAASIAIAGIIFPILVAPCLYALFRKVYGHVMMFPLEENTNNAYILWTLILTVTSFPVVAHTLSELKLLYTGLGKEALTAAMIGDTYGWILFTLFVPFAINGKGATNTLLCTIIFVVVCIFVVRPLIQWFIDRKANKDEWSDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFTFGLILPHGKFAELVMSISDDCVSGFLVPLFFSGTGMRLMLITIFSQESWPFIIMIILLLCALKILGTLFVTFFFGMRIRDGLTLGLILNNKGAMALIMLNIAWDRTIFSVPTYAVLTSAVLLMTIIVSPVINAIYKPRQLFEQNKLKTIQKLRVDAELRFIACVHNTRQAASLISIIECFNPTRVSPMHVFALYLVELTGRVAALVAAHIGKPSSQLGEQNLTRSQEELESIRNTFDGLGETYNAIRVETLNVVSAYTTIHEDIYHSADEKRTSLILLPFHKQLTLEGTLEVTSVVYKDINQNVMQGAPCSVGIFVDRDFGLVPKMNLHVRVVFVGGPDDREALAIAWRMAGRSGTQLSLVRILLLGEAAEVDASVHNESQGILSAVIDTDKQKELDEEYISAFRLTTVHNSDIISYSEIDVYSDEDIPVVLKEIEKIECDIYIVGQGNCRNSKVFSNLLEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMVCGNNLNQKATNKGMFESIV* 812
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vra1g1614 811 Gene3D - 32 436 IPR038770 -
Vra1g1614 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 5 799 - -
Vra1g1614 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 36 426 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Vra1g1614 811 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 3 5 799 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vra1g1614 Vra-Chr1 28416887 28419522 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vra1g1614 2 786 Antiporter Super Family AT2G13620 36.272 3.27e-180 536
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vra1g1614 - - var:108320251 1343.95