LGRPv2

Gene search

Sequence information

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	Vivi936g00011	ATGGAAACTTCTAGAGGCAACGGAACCGTTTCAGTTTCTTTCGATGCCCACGGATTATTGGAAGTTTGCGTCAAAAATGACAGAAACGTTGGCTCCTACGGCATTTTCTTGGGTGATAATCCTTTCGATTTCGCTCTTCCTGCCACATTGTTCCAACTCATCGTCATCATCACAATCTCTCAAACGCTTTACTTTCTTCTCCGCCCCTTACAAACCCCCAAATTCATCTGCAGCGTTCTCGGTGGAATTCTGTTGGGGCCATCATTTCTAGGGAGGAATGAAATTTACTGGAAAGCATTATTTCCGGCGAGACAAGCTGATGTTTTAGTAGTGATGTCGATGATCGGAGTTATATACTTTCTGTTCTTTATTGCAATAAAAATGGATCTACTCATGACAGTACGAGCGGCGAAAAGTACGTGGTGGCTCGGGATAATACCTTTCATGGCTTCTTTTATAGTGATGTCAACGTTGATAAATGTTTTCTATTTACCGCAGAATTTCGCGAATCTTAAATTAGAAACATCGCGCTCAGCATTAAGTGCTACGATGTCGTTTAGTAATTTTCCGGTTGTGTCGGAAGCTTTGATAGAATTGAATCTCATAGCAACTGAATTAGGACAGATAGCTTTGTCTTCCGCTACACTTAATGATTGCATACAGTTTTTCATCATAGTGTCGCACCATCTTATGGATACTGGGAAAGTGAAGTATTTAGTTTTAGGTACGTTGAGTTGGGTATTGTTCATGCTTTTCAGTTTTTACATTTTAGGACCGGTTATGAAGATGATTGCACACAGCACGCCGACTGGGAAACCGGTGAAGCGTATTTTCGTTGTGTTTATTCTTCTTGGTGCTTTAGTTATGGCAGGTATAACGGATACAATTGGGGTAACGTTTATTATTGGACCGTTGATTTATGGCTTGGTTATACCGAGTGGACCTCCTTTGGGGACAACATTGGTTGAAAAATGTGAAGTTATTATCTTAGAATTTTTGTTACCTTTCTTCTTTGCTGATGTTGGCATGACCACAAATCTCACCGCACTTCATAGTTGGAAAGAGTTTGTAACTTTGCAACTTATATTAACCGCGGGAGACTTAGCCAAGGTTATTGCTTGCGTGTTGGTTTCTATGACATATAACATTAAGCCCAAACATGGCACAGTGCTTGGACTCATGTTGAACATCAAGGGTATCACTCACCTGATTGCTCTTAGTAAATTAAGGAAACTCAAGATATTGGATGATGAAACATTCAGTCACTTGGTGATTTCTGTGGTGGTTACAACCGGATTCATCACACCTATCATTACAATATTATACAAGCATCGTCCTCGAGCACTAAAGTCATCACACATATACGACGGTCAGATGAGAACAATCCAAAACTCTTCTAGAAATTCAGAGTTGCGCATTATTACTTGTTTACACAACGAAGGAAATGTACGTGGTATCACTACTCTGTTAGAAGTTTGCAACCCAGTTCCAGCAAGCCCGTTAGGTGTCTATGTGATTCACCTCATCGAGCTTTTAGGAAAAAGTGCACCAATTTTGCTTCCAATTAATTACAGACGAAACAAAAAATTACTGTCAGTTAATTACCCCGACACAAACCACATCATGCAAGCATTTGAGAATTACTCTAACAACTCTTCTGGTCCGGTTATTGTTTTACCATATGTCAACGTGGCACCTTATAGGAGTATGCACGATGCTGTTGTCAACTTAGCACAAGACAAAATGGCTGCTCTTATTATAGTCCCTTTTCATGAAAATGACCATATTGATCTCACTGGACACATTTCAACTTCAATTCGAAAACTCAACACTAGGTTTCAAGCGCACGTGCCTTGCACGCTGGGGATATTGGTTGATAGATACTCGAGGCTTGGCGTGAGGAATGATCACACGAAACCTTATTTCCATGTAGGGGTATTTTTCGTTGGCGGGCCTGATGACAGAGAAGCATTGGCTTTAGGAATTCGAATGTCGGATAGAGAGAATATGAAGGTGTCTTTGTTTCGGTTCATTGTGATGAATAAAAAAGAACGTCAAATTAAATCTCTATCAGGTAGAGAAATTCCACCAAGTGAGCAAGAACAGGAAGAAATGTTGGACGAAGGTCTAATTGATGAGTTTAAAAGTATGAAATTTGGGATGGGTAATGTTTCTTGGTATGAGGTTGCGGTGGAGGATACAGTAGAGGTAATGAGTGCAATTCGAGGTTTGGAAGGAAACTATGATCTTGTGATGGTTGGGAAGAGACATACTATTGGATCTTTAAAAGATGAAGAAATGGGAAATTTCATAGAGAATGTTCAAATATTAGGGATATTTGGAGATATGTTGTCATCAACAGAATTTTGTATTGGAACGGTTCCTGTTTTGGTGACACAATGTGGTGGGGATAAGAGAGCAATGAGGTTGGATAGAGTAGGTTCAGCTAATGTATCTGAGAAAAGCGTAACTAATGTATCTCAGAAAAGTTTAAATGTTAATAAATAA	2508	0.3959	METSRGNGTVSVSFDAHGLLEVCVKNDRNVGSYGIFLGDNPFDFALPATLFQLIVIITISQTLYFLLRPLQTPKFICSVLGGILLGPSFLGRNEIYWKALFPARQADVLVVMSMIGVIYFLFFIAIKMDLLMTVRAAKSTWWLGIIPFMASFIVMSTLINVFYLPQNFANLKLETSRSALSATMSFSNFPVVSEALIELNLIATELGQIALSSATLNDCIQFFIIVSHHLMDTGKVKYLVLGTLSWVLFMLFSFYILGPVMKMIAHSTPTGKPVKRIFVVFILLGALVMAGITDTIGVTFIIGPLIYGLVIPSGPPLGTTLVEKCEVIILEFLLPFFFADVGMTTNLTALHSWKEFVTLQLILTAGDLAKVIACVLVSMTYNIKPKHGTVLGLMLNIKGITHLIALSKLRKLKILDDETFSHLVISVVVTTGFITPIITILYKHRPRALKSSHIYDGQMRTIQNSSRNSELRIITCLHNEGNVRGITTLLEVCNPVPASPLGVYVIHLIELLGKSAPILLPINYRRNKKLLSVNYPDTNHIMQAFENYSNNSSGPVIVLPYVNVAPYRSMHDAVVNLAQDKMAALIIVPFHENDHIDLTGHISTSIRKLNTRFQAHVPCTLGILVDRYSRLGVRNDHTKPYFHVGVFFVGGPDDREALALGIRMSDRENMKVSLFRFIVMNKKERQIKSLSGREIPPSEQEQEEMLDEGLIDEFKSMKFGMGNVSWYEVAVEDTVEVMSAIRGLEGNYDLVMVGKRHTIGSLKDEEMGNFIENVQILGIFGDMLSSTEFCIGTVPVLVTQCGGDKRAMRLDRVGSANVSEKSVTNVSQKSLNVNK	835

Annotation information

Select	Seq ID	Length	Analysis	Description	Start	End	IPR	GO
	Vivi936g00011	835	Gene3D	-	47	450	IPR038770	-
	Vivi936g00011	835	Pfam	Sodium/hydrogen exchanger family	54	438	IPR006153	GO:0006812\|GO:0015297\|GO:0016020\|GO:0055085\|GO:1902600
	Vivi936g00011	835	PANTHER	CATION/H + ANTIPORTER	29	800	-	-

Functional genes information

Select	Gene	Gene_start	Gene_end	Function	Ath_gene	Identity(%)	E-value	Score
	Vivi936g00011	34	800	Antiporter Super Family	AT2G13620	34.275	4.37e-142	438

Pathway information

Select	Query	KO	Definition	Second KO	KEGG Genes ID	GHOSTX Score
	Vivi936g00011	-		-	gmx:106794183	1060.06