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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi7g04049 ATGAAGCCGCTGAGTGGGTTATTGGGTTTAAGACGCAGGAAAATTCATGGGGTTTTCAATGGGTTGTGTGCTATGGTTGTTTTGTTCTTTTTTTATAATAGGGAAGATATAATTCGTAATCCGCTTCTCAGACAATCTGCATACTTGGTTAATCATCATGGGTTGTCTCAAAATTCAATTTTGAAGGATGGGGTTTCGGTTTCGGTGATTCGTCGTAGAATGGATGAGATTAGTGCTAACACTTCTTCAAGTGTAGATGTTGGTAATGGTTTGGATGTGATTACACCTGGACTGTGTGTTGGATTGCTCCACCATGAAGGTTTTGATAGCCCTTGTGAATTCTTAAAGGTTAATCCTCAGTGTACTTCTGAAGGGTACATTGATTACTTGAGGTTTTTCTATTGTAAATGTCAAGGTTTTAGGGTTCTTGGTTATCTAGTATTGGGTGTTTGGCTTGCTGCTTTGTTTTATCTCTTGGGGAATACTGCGGCGGATTATTTTTGTCCTTCTCTTGAGCATCTCTCGAAGCTCTTGAAATTGCCACCAACTGTGGCTGGTGTTGTTTTGCTTCCACTTGGAAATGGTGCACCAGATGTGTTTGCTAGTATAGCTTCGTTTGTTGGGACTGATACGGGTGAAGTTGGTCTTAATAGTGTATTAGGCGGTGCTCTGTTTGTTACCACTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTTGCGGACAGGAAGGTTCAAATTGATCAACGGTGCTTTGTAAGGGACCTGAGTTTCTTTCTGTTCACCCTTTTTGTGCTGCTTGTGATTTTGTTTGTTGGTAAGATAGGTATTGGGGCAGCCATTGCTTTTGTATCGATTTATGTTCTTTATGCATTCATTGTTGCTGCCAATGAGCTACTGCGGAAACATGCACGGATTTTGAAATTGGATGCTGTGACACCTTTGCTTCCTGTCCAAGGAAGTGTATTCGCTGTTGGTTCTGAAGAGGATACGACAATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGACACTGAGACTGATCCTCCCCGTCTCCCTCCTTCCCTGCCTCAGTGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCAGGCAAATAAAATCAATTTTTCAGATGATGAGAGGCCTCCATGGGGGTGGAGTGATGGATCCACGGAAAACACCAGGTCGTCGTTCTCTGTTTCAAAGCTTTTTTTACTCATGGAGATGCCACTGGCAGTTCCTAGACGGCTAACAATTCCAATGGTTCACGAGGAAGTATGGTCAAAGTTCTTCGCCGTGGCTAGTGCTTCATTGGCTCCCATTCTCTTGGCCTTTTTGTGGAGCACCCAAGACAATGTGAGTTATACGAGTATTATACTTGCTTATTGTTTTGGCGTTTCTCTTGGAAGCACACTTGGTATTCTTGCGTATAAATACACAGTGTCTGATTGTCCACCGTCTCAGTATTTGATCCCTTGGGTTCTCGGAGGATTTGTTATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAGCTTGTGGCTCTATTAGTAGCGTTTGGTGTAGTTTTCGGAATTAATCCATCGATTCTTGGATTAACTGTATTAGCATGGGGAAATTCAATGGGAGATTTAATGTCAAATGTTGCATTGGCATTAGATGGAGATGATGGAGTTCAGATAGCTTTATCTGGATCCTATGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGATTCTCATTGCTGCTTGGTGCATGGTCAAAGAAACCTTCTTCCTACGTGGTGCCTAAAGACAGTAGCTTATTCTACACAATGGGATTTCTTATCACAGGACTTCTATGGGCACTTGTTGTTTTACCGCGCAACAACATGCATCCTAGCAGAATGTTTGGAATAGGTCTCATCATCCTTTATATGCTTTTTCTTTCTTTCAGAGTATGTACTTCTTTGGGGCTAATAACAATTGCTGGTTTAAGTTAG 1968 0.4172 MKPLSGLLGLRRRKIHGVFNGLCAMVVLFFFYNREDIIRNPLLRQSAYLVNHHGLSQNSILKDGVSVSVIRRRMDEISANTSSSVDVGNGLDVITPGLCVGLLHHEGFDSPCEFLKVNPQCTSEGYIDYLRFFYCKCQGFRVLGYLVLGVWLAALFYLLGNTAADYFCPSLEHLSKLLKLPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTTVVVGTVSLCVADRKVQIDQRCFVRDLSFFLFTLFVLLVILFVGKIGIGAAIAFVSIYVLYAFIVAANELLRKHARILKLDAVTPLLPVQGSVFAVGSEEDTTIYSSLLDLDTETDPPRLPPSLPQWMWSSNVAIYSNQANKINFSDDERPPWGWSDGSTENTRSSFSVSKLFLLMEMPLAVPRRLTIPMVHEEVWSKFFAVASASLAPILLAFLWSTQDNVSYTSIILAYCFGVSLGSTLGILAYKYTVSDCPPSQYLIPWVLGGFVMSIVWFYIIANELVALLVAFGVVFGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNVALALDGDDGVQIALSGSYAGPMFNTLVGLGFSLLLGAWSKKPSSYVVPKDSSLFYTMGFLITGLLWALVVLPRNNMHPSRMFGIGLIILYMLFLSFRVCTSLGLITIAGLS 655
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi7g04049 655 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 490 641 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vivi7g04049 655 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 150 292 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vivi7g04049 655 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 19 649 - -
Vivi7g04049 655 FunFam Cation/calcium exchanger 5 427 643 - -
Vivi7g04049 655 Gene3D - 180 332 IPR044880 -
Vivi7g04049 655 Gene3D - 413 643 IPR044880 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi7g04049 Vivi-Chr7 106966094 106968763 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi7g04049 101 649 Antiporters AT5G17860 41.636 7.02e-133 399
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi7g04049 K13754 - gmx:100796101 1048.11
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vivi7g04049 7 106966094 106968763 Vivi7g04049 7 106966094 106968763 ECH