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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi6g03512 ATGTCACAATTATCACAACCCAACCGCATGTTTTTGAACACCTCGTTCCTCTTGTTGCTTTCTGTTTTTCTTCTTGTTCACTTCCAATCCTCGGAGCATGTTTTTCTGAAAACCAAAACCAACAACATCAATAAAAACAAAAACTTTCTCTCTGGCACCAACGATGATGAGAGTTGCAAGAGTTTCCATACCTTAACTGATTATAAAGCTAAGTGCTTTTACCTTAAATCAAACGACCCATGTGTCTCTCAAGGCTATATTGATTATCTCTACCTTTTCTATTGCAAATTCGGTGGATTCCCTTTACTGGGTCACACTCTTTTGTTCCTTTGGTTATTGGTCATGTTCTATCTTCTAGCTAACACAGCTTCTGAATACTTTTGTCCTTCTCTTGAAAGCCTCTCCAAGCTTTTGAGGCTTTCACCAACAATTGCTGGTGTCACTCTTCTCTCTTTTGGTAGTGGTGCTAATGATGTTTTTTCCACACTTGTTTCTTTCAAGAGTAATGGAACACAGGATATTGGGTTCAATGCTGTTCTTGGTGGTGCTTCCTTTATTTCATGTGTTGTGGTTGGAATTGTGAGCATTTCTGTTAGACATAAAGGGATTCATGTTCAGAAATCTGCTTTGATAAGAGATATTTGTTTTCTTCTCTTTGTTATTGTTTGCTTGTTCACTATCTTCATCATTGGTGAGATTAACCTTGTTGTGGGAATTGGGTTTTGTTTGATGTATGTTGTGTATGTGGTCATTGTTTATGTCACAAGTAAAAGAAAAGATGTTTGTGATGAAGAAGATGGTGAAAGTGAAAGTGATTCAAGACATGGTAAAGGCAATGATTTAGGTGTTCCTCTACTTGGTTTTATGGAGAAGGGAATGATCAATGAAGCTCAAGAATGTGAGTTTAAAATTGAGAAGAATTGTTGCTATGAAAAATCTTCAATCATTAGAATTTTACTTTGTGTTTTGGATATGCCTCTTTACTTGCCAAGAAGATTAACAATTCCTGTTGTTTGTGAAGAGAAATGGTCTAAACTATATGCAGTTTCAACAGCTATGTTATCACCACTTTTATTATCTTTCCTTTGGAAAAACAATATCTCAAACTCATCAAACCTTCTAGTTTACGGAATCGGATTATCGGTCGGTATCACATTAGCACTAACAGCGATTTTCACAACGGAGTCATCGAATCCGCCGAAAAAGTACTTGTTACCATGGCTAGCTGCAGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGTTACATCTCAGCTCAAGAGTTAGTAGGATTGTTAGTTTCAATTGGTTACATATGTGGAGTTAGTCCTTCAATACTTGGATTAACAGTACTTGCTTGGGGAAATTCAGTTGGTGATTTGGTAACAAATTTAACAATGGCTTTAAGTGGTGGATCAGATGGAACACAAACAGCAATTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATATTTAACACACTTGTTGGATTGGGACTGTCTCTTGTGTCATCAACTTGGCGTGACTATCCTTCACCTGTTGTGATTCCTAGAGATCCTTACTTGTGGGAAACATTGGGATTTTTGGTGGTTGGATTGATTTGGGCACTTGTTGTTTTGGTTAGAAGAGATATGAAGCTTAATGCAATGTTGGGTGGAGGGCTTTTGGCTATTTACTTTAGTTCTGTTATTCTTAGGTTAATACAAACACTTGGGCCTCTTCAATTTAAGGATATGTTAGTGTGA 1728 0.3727 MSQLSQPNRMFLNTSFLLLLSVFLLVHFQSSEHVFLKTKTNNINKNKNFLSGTNDDESCKSFHTLTDYKAKCFYLKSNDPCVSQGYIDYLYLFYCKFGGFPLLGHTLLFLWLLVMFYLLANTASEYFCPSLESLSKLLRLSPTIAGVTLLSFGSGANDVFSTLVSFKSNGTQDIGFNAVLGGASFISCVVVGIVSISVRHKGIHVQKSALIRDICFLLFVIVCLFTIFIIGEINLVVGIGFCLMYVVYVVIVYVTSKRKDVCDEEDGESESDSRHGKGNDLGVPLLGFMEKGMINEAQECEFKIEKNCCYEKSSIIRILLCVLDMPLYLPRRLTIPVVCEEKWSKLYAVSTAMLSPLLLSFLWKNNISNSSNLLVYGIGLSVGITLALTAIFTTESSNPPKKYLLPWLAAGFVMSVTWSYISAQELVGLLVSIGYICGVSPSILGLTVLAWGNSVGDLVTNLTMALSGGSDGTQTAISGCYAGPIFNTLVGLGLSLVSSTWRDYPSPVVIPRDPYLWETLGFLVVGLIWALVVLVRRDMKLNAMLGGGLLAIYFSSVILRLIQTLGPLQFKDMLV 575
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi6g03512 575 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 312 568 - -
Vivi6g03512 575 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 109 253 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vivi6g03512 575 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 408 560 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vivi6g03512 575 Gene3D - 313 561 IPR044880 -
Vivi6g03512 575 Gene3D - 140 271 IPR044880 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi6g03512 Vivi-Chr6 128003798 128006142 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi6g03512 8 566 Antiporters AT5G17850 51.142 3.76e-166 483
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi6g03512 K13754 - gmx:100787016 759.599