Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi6g02274 ATGGCATGGGCTACTTCAGTAGGAATTCATTGGGAAAAAATGGAAGCCGAGTATAACGCTGAATGGGCGAAATTGGCGTATCTAGACGGTCCAGGATATACCACATGGGACCGAATTGAAGCCAAATTTGACCTGCGACGTAAATACTACTCAGGAAGCTCTTCCCATGGTGTTCAGAACTCAATTGAAAAAGCTCCGACACAGTCATGTTCATCTCACTTCATATCTTCAATGGCTGAATCAAATCGAGAACACAATTCGCGTATGGCTGAAACTGCACGCAAAATCCGAGAGTCGTGTGCAAGAATTCTCAAGTTGTTGCAAGAGGAGATGGAAGCTACCAAATCATCGGGCGATGCGGTTCCGACTTCAGATGAAATTCTTCTGTCCGTGGAAGGAATTGATGAACATTCAGTCACCGATGAATCTGTCCAGGTGAAGAATGTAATCATGACATCAGTTTCTCCTTCAATTGATTTCAACGGTGGAATAGTAGATCTACCCGAGGAAACAACACAGAAGCTAAGAAAGACGCCGGAATCATGTGTTGGTAGCAAACTCGATGTCAACATTACTTTTGCAGACTCGTTCATTTCTGAGCATCTAGTCGTCAATTCCGATGTTGAACGTGATTGTTATAGCACAAAGGTGACACCGCTCGATATGGATAGAAAGCAAAACAACTCTCCAGTTGTAATTTACCAAGGGGTTTTCAATCCTTCTAATCATCTATCAGATCCACCGGACTTTGTGTCCATTCCGCCGCCACCGCTCGCCCCACCATGGCCACATCACTCAGTTTACCCAATAACACTTAAATCCCCACCTTCATCCAAGGTAAACAACATTCCTCACTATTTGCAATTTGAACAGACGAATTTATTTAGAACTCAATCTCACATTACACCCACATTTGGTAGTCGTATTCCTGGTGTGTATATGCTGAAATGTTCATCATATGCTTATACCAACATTGTGTCCTCAATTGATGCCCACTATCTGTTTGTCAAAATGTCCCTCACAGTTGATTTCTCTTTTGACACTTCTATAAGTTTGTTGAGTATGATGAAAATTATTGGACAAATTGATACGGACTCCCAGGTTTCTTCTGCAAGTAATAATTTGTTTCATAATTATCATGCTTGTAGTACTGGTTTTCCATCTAGTGGACTTGGCCTTGAGTTTGGTTTAATTTCTATTGTTGGATCACTCTCCCTCTCAACTGATTTATTTGTTAGATTTGCTTGTAATTCTGGTGGTATGATTCTGCATCGTACCGTGAACTGTCATGATTGTGTGAGTCTTTTTTATTGCTGCCACATTGAGCTCTTACTAGTATTTCACTCATCTCATGACCAATCCAAACTTAAGGGTTGGAGTTTGTTGCCACTTCTGGTTGTTGAAAGAATTGGTGAAGTTAAACTACTGAGTTTCAATCCTTTTCCTAGGTTTAATGGGGATGTTGTGTATAATTGCATTATTAATAGGATTTTGAATTGTGAGGCCATGGCACTTCAACATAGTTTTGATGATTCTAGTGGTAATCACAATGCTTATTCAAGCTATAAGCACAGGGACTTGGACATCTTTCAAAATACCAAAATTTCATGGTACCCTCATCTACACATTGAAGGAGAAAACGAGTTTCAAATAATTGCTCTAAACAAGTTTGAAGAGAAAAATGAGAGCAAATTTCTCAAGTTTTTTGGGTTTATGTGGAATCCATTATCATGGGTGGTGGAAGTTGCTCTTGCAAATGGTGGCGAGCAACCTCCAGATTGGCAAGATTTTGTGGCAATTGTGTGCTTGCTGGTTATCAATTCTACTATTAGTTTTCGTGAAGAAAATAATGTTGGAAATGTTGTTGCTGCTCTTATGGCAGGCCTTGCTCCTAAGACAAAGGTTCTTAGACATGGTATGGGGAGTGATATAGATAAAGGGCATGTGATTCTACTTGCTGCTAGGGCTGCTATGATTACTTGGTTGTCCTATTTTGTTGAAGCTAACTCTAGTTGCTCCAAAGTTATGCAGAGTTTTGTACCAGTTCCCTTGAGCATATTCAAACTTTATTTTGGTCCACACATCATTGTCATTCAAGTAGCATGCTTTGAAGTAGATGCAATAATAAAGGATAAATTAGAAAAACATGAGAGTACTCCAAAACCTGTTGTTTCACATGTGTGGTTGCTTTTTAAAGCATATACTAACTATGATGAGATGGAATGGTTAATAGCTTGGTTTTGGAAGGTTGTTCGGGTGGTGTCTACAAATGACCAATATGCCATAATATTTTTCAATATTGCCTTAGCTTCAACCTTGAGGACAAGGTTGATTTTAATGGGGGAGGTAATGTTATGA 2358 0.3948 MAWATSVGIHWEKMEAEYNAEWAKLAYLDGPGYTTWDRIEAKFDLRRKYYSGSSSHGVQNSIEKAPTQSCSSHFISSMAESNREHNSRMAETARKIRESCARILKLLQEEMEATKSSGDAVPTSDEILLSVEGIDEHSVTDESVQVKNVIMTSVSPSIDFNGGIVDLPEETTQKLRKTPESCVGSKLDVNITFADSFISEHLVVNSDVERDCYSTKVTPLDMDRKQNNSPVVIYQGVFNPSNHLSDPPDFVSIPPPPLAPPWPHHSVYPITLKSPPSSKVNNIPHYLQFEQTNLFRTQSHITPTFGSRIPGVYMLKCSSYAYTNIVSSIDAHYLFVKMSLTVDFSFDTSISLLSMMKIIGQIDTDSQVSSASNNLFHNYHACSTGFPSSGLGLEFGLISIVGSLSLSTDLFVRFACNSGGMILHRTVNCHDCVSLFYCCHIELLLVFHSSHDQSKLKGWSLLPLLVVERIGEVKLLSFNPFPRFNGDVVYNCIINRILNCEAMALQHSFDDSSGNHNAYSSYKHRDLDIFQNTKISWYPHLHIEGENEFQIIALNKFEEKNESKFLKFFGFMWNPLSWVVEVALANGGEQPPDWQDFVAIVCLLVINSTISFREENNVGNVVAALMAGLAPKTKVLRHGMGSDIDKGHVILLAARAAMITWLSYFVEANSSCSKVMQSFVPVPLSIFKLYFGPHIIVIQVACFEVDAIIKDKLEKHESTPKPVVSHVWLLFKAYTNYDEMEWLIAWFWKVVRVVSTNDQYAIIFFNIALASTLRTRLILMGEVML 785
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi6g02274 785 PANTHER CALCIUM-TRANSPORTING ATPASE 543 647 - -
Vivi6g02274 785 SUPERFAMILY Calcium ATPase, transmembrane domain M 553 701 IPR023298 -
Vivi6g02274 785 Gene3D - 571 687 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi6g02274 Vivi-Chr6 100871005 100873967 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi6g02274 528 639 Primary Pumps ATPases AT2G07560 65.254 2.70e-31 129
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi6g02274 - K01535 vvo:131611956 1570.06