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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi6g00293 ATGGAAGGTGAAGGTGTTGCTAGGAAGCAGAATGATGAGGATATCACTCTGAATATTCCTCTACTAACAGAACATGAAGAAAACCAAATTTCTGGGAGGGTTTCCAACAACAATGTCACCACCACTACATCTTTCCTTAAAACTTGTTTCAATTGCCTCAATGCTTTAACAGGAATTGGAATACTATCAGTTCCATATGCTTTAGCCTCTGGAGGGTGGCTAAGTTTAGCACTTTTGTTTTCTATTGCTGCAATAGCATTCTACACTGGTTTATTAATGAAAAGTTGTATGGAAAAACATTCCAACATTAAAACTTATTCTGATATAGGTGAATTTGCATTTGGAAAAACAGGAAGATTATTAGTATCAATATCAATGTATACAGAACTATACTTGGTTTCAACAGGGTTCTTGATTTTAGAAGGAGATAATTTGAGTAAATTATTTCCTATTGAAGAGTTTCAAGTGGCTGGTATATCAATTGGTGCAAAGAAATTCTTTGTGATATTTGTTGCACTAATTATTTTGCCAACGGTTTGGTTGGATAATTTAAGTTTGCTTTCTTATGTATCTGCAAGTGGTGTTTTTGCTACAGTTATAATTATTTTGTCAATAACTTGGACTGCAACATTTGATGGAGTTGGTTTTCACAAAAAGGGTGATATTGTGAATTGGAATGGGATTCCAACAGCTGTTAGCTTGTATGCTTTTTGCTATTGTGCACATCCAGTTTTTCCTACTCTCTACTATTCCATGAGCAAGAAACATCATTTTTCTAATGTACTTATTGTATGCTTTGTATTAACAACAATTGGTTATGCATCAATGGCTATAATTGGTTACCTAATGTTTGGTTCAAAAGTTGAATCACAAGTAACAATCAATTTGCCACTAAACAAAATAAGTTCAAGAATTGCAATATACACAACTTTGGTGAATCCAATATCAAAGTTTGCTTTGATGGCAACACCAATTACAAATGCTTTGAAAGATTTACTTCCAAGGACATACAAGAATAATAAAGTGACCAATATTTTTGTGAGCACCTTCCTTGTAATTAGCAATATTATTCTTGCATTGAGTATTCCTTTCTTTGGGTCTCTCATGTCATTGGTTGGAGCACTTTTAAGTGTCACTGCTTCTGTTTTGCTTCCTTGTTTGTGTTACTTGAAGATTTCTGGCACTTATAGGAAATTTGGATTTGAAACAGTAACAATAGTGGTGGTAATATTAATTGCTATAGCGATGGGAATATTTGGGACATGTATGTCTGTTATTGAAATAGTACAAAATTTGCAATAG 1302 0.3341 MEGEGVARKQNDEDITLNIPLLTEHEENQISGRVSNNNVTTTTSFLKTCFNCLNALTGIGILSVPYALASGGWLSLALLFSIAAIAFYTGLLMKSCMEKHSNIKTYSDIGEFAFGKTGRLLVSISMYTELYLVSTGFLILEGDNLSKLFPIEEFQVAGISIGAKKFFVIFVALIILPTVWLDNLSLLSYVSASGVFATVIIILSITWTATFDGVGFHKKGDIVNWNGIPTAVSLYAFCYCAHPVFPTLYYSMSKKHHFSNVLIVCFVLTTIGYASMAIIGYLMFGSKVESQVTINLPLNKISSRIAIYTTLVNPISKFALMATPITNALKDLLPRTYKNNKVTNIFVSTFLVISNIILALSIPFFGSLMSLVGALLSVTASVLLPCLCYLKISGTYRKFGFETVTIVVVILIAIAMGIFGTCMSVIEIVQNLQ 433
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi6g00293 433 PANTHER OS05G0424000 PROTEIN-RELATED 49 414 - -
Vivi6g00293 433 Pfam Transmembrane amino acid transporter protein 42 426 IPR013057 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi6g00293 Vivi-Chr6 7341003 7345495 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi6g00293 25 429 Amino Acid or Auxin Permease AAAP Family AT3G28960 57.037 1.32e-170 482
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi6g00293 K15015 - gmx:100794374 607.446