Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi5g04013 ATGGTAACCTTTGGTACCCAACCAGTTCTCTCTATTATGCAGATTTTCATGCTTAGCTTGTTAAGTTTTATGGCTACAATTGAAGGTTCCAAGAGTAAAGTTTGTGCCGTTTATGTGTTTGGAGATTCGACAGTAGACCCAGGAAACAACAACTACGTGAACACACCTTTCAAGAGTGATTTTCCACCTTATGGTAGAGATTTTCCTAACCAAAGTCCCACAGGAAGGTTCACAAATGGAAAACTTGGCACTGATTTTATTGCTTCGTATTTAGGTTTGAAAGAATTGGTGCCACCGTATTTGGATCCAAATCTGAGTGATGAAGAACTTATGACAGGAGTTAGTTTTGCTTCTGCTGGTTCTGGTTTTGACCCTCTCACACCAACTCTCACTAATGTTGTCCCAATATCAAAGCAACTAGAATATTTCAAACAATACAAAAATCGGTTGGAGAGTAAGCTTGGTAAGCAAGAAACCAGAAATCATATGAACAACGCTGTATTTATCATAAGCGCCGGTACAAATGATTTTGTTGTTAATTATTTTATGGTGCCAATAAGAAGAAGAAGCTATAACGTTGAAGCTTATGGCCATTTCGTGCTTCAACATATCAAAGATTTCATGCAGAATTTGTTGAAAGAAGGAGCTAGAAAAATTGCTTTTGTTGGATTACCTCCATTGGGATGTTTGCCAATCATGATTACCTTAAATTCCAACAATGCATTGCTTGAACGTAATTGTGTGGACAAATATTCAGCTGTGGCAAGAGATCACAACAAGGTGCTTCAACATGAATTGTTCTTAATGCAACTTAATTCCACTAAGATCTCTTACATTGACATATATCAACCCTTAGCTAACATGATTCAAGGGCATGCAAATCTTGGATTTGATGAGGTTGATCGAGGATGTTGTGGAAGTGGTTTAATTGAAGCAACATTTATGTGTAATCGTAATTCACATGTATGCTCTAATCCATCAAAATATGTATTTTGGGATTCAATACACCCCACAGAGAAGGTATACCATAACCTATTTATTGCCAACCGTCACATCCTTGATGGCCTTATTAACAGCTAG 1080 0.3731 MVTFGTQPVLSIMQIFMLSLLSFMATIEGSKSKVCAVYVFGDSTVDPGNNNYVNTPFKSDFPPYGRDFPNQSPTGRFTNGKLGTDFIASYLGLKELVPPYLDPNLSDEELMTGVSFASAGSGFDPLTPTLTNVVPISKQLEYFKQYKNRLESKLGKQETRNHMNNAVFIISAGTNDFVVNYFMVPIRRRSYNVEAYGHFVLQHIKDFMQNLLKEGARKIAFVGLPPLGCLPIMITLNSNNALLERNCVDKYSAVARDHNKVLQHELFLMQLNSTKISYIDIYQPLANMIQGHANLGFDEVDRGCCGSGLIEATFMCNRNSHVCSNPSKYVFWDSIHPTEKVYHNLFIANRHILDGLINS 359
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi5g04013 359 SUPERFAMILY SGNH hydrolase 163 343 - -
Vivi5g04013 359 Gene3D SGNH hydrolase 25 352 IPR036514 -
Vivi5g04013 359 PANTHER GDSL ESTERASE/LIPASE EXL3 21 345 - -
Vivi5g04013 359 Pfam GDSL-like Lipase/Acylhydrolase 37 346 IPR001087 GO:0016788
Vivi5g04013 359 CDD SGNH_plant_lipase_like 36 355 IPR035669 -
Vivi5g04013 359 FunFam GDSL esterase/lipase APG 27 353 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi5g04013 Vivi-Chr5 136029782 136031743 Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi5g04013 36 345 Pollen Coat Proteome AT1G75910 35.110 4.37e-58 190
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi5g04013 - - gmx:100804919 538.11