Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi569g00028 ATGGTGGCTTCTGTGAAATGGTTTCTCAATGTTTGTCTCTTGATGTTGCTTTTTGTGCTGCTCGTTGAAGATGAAGCTATGGCTTCATCACAGATCTCTCAGTTCAGCAATGTGGATACTGAGACACACAGGTTAACAAGCTTTAACGATTCATCAATGGCGGCAAGGCAAAAAGAAGCTGAGAAATTGAATGAGCGTGCTGCCGTGGCTGATCCAAAGGAGGTTGTTTCTATGGTTGAGATGCACATTAAGAACAGTACTGAAAGAAGAAACCTTGGATATTTCTCGTGTGGAACGGGTAACCCGATTGACGATTGCTGGCGTTGTGACCCTAATTGGCAACAGAACAGGAAGCGTCTAGCAGACTGCGGTATTGGTTTTGGCAGGAACGCTATCGGTGGCCGCGATGGAAAGTTCTATGTTGTCACTGACCCGAGAGACGATGACCCTGTTAACCCAAGGCCGGGAACTTTGCGTCACGCTGTTATTCAAGATAGGCCACTTTGGATTGTGTTCAAGAGAGACATGGTTATTCAATTGAAACAAGAGCTTATTATGAACAGTTTCAAGACTATTGATGGAAGAGGAGCGAATGTGCATATCGCGAATGGAGCGTGCATTACCATTCAGTATGTTACTAATGTTATCATTCATGGACTTCATATTCATGATTGTGTACCAACTGGTAATGCTATGGTGAGAAGCTCTGAAACACATTTTGGTTGGAGGACTATGGCCGATGGCGATGCTGTTTCTATTTTTGGTTCAAGTCATATTTGGGTTGATCATAATTCTTTGTCTCATTGCGCTGATGGTCTTGTTGATGCTGTCGTCGGTTCAACAGCCATCACCATTTCAAACAACCATTTCACCCACCACAATGAGGTGATTCTGTTGGGCCACAGTGACTCCTACACAAGGGACAAGCAAATGCAAGTGACCATAGCTTATAACCATTTCGGAGAGGGACTTATTCAGAGAATGCCTCGGTGTAGACATGGTTATTTCCATGTGGTGAACAATGATTATACTCACTGGGAGATGTATGCTATTGGTGGAAGTGCTGAGCCCACAATCAACAGCCAGGGTAACAGATACAATGCTCCTGTTAACCCTTTTGCCAAAGAGGTGACTAAGAGAGTGGAAACAGCTGAAAGCCAATGGAAAGGCTGGAACTGGAGATCAGAGGGAGATTTGTATCTAAATGGTGCATACTTCACAGCCTCTGGTGCTGGTGCTTCAGCTAGCTATGCAAGAGCCTCAAGCTTAGGAGCAAAATCTTCAGCTATGGTTGGCACCATGACATCAAATGCTGGTGCACTAGGTTGCAAAAGAGGCCGTCAGTGCTAA 1350 0.4474 MVASVKWFLNVCLLMLLFVLLVEDEAMASSQISQFSNVDTETHRLTSFNDSSMAARQKEAEKLNERAAVADPKEVVSMVEMHIKNSTERRNLGYFSCGTGNPIDDCWRCDPNWQQNRKRLADCGIGFGRNAIGGRDGKFYVVTDPRDDDPVNPRPGTLRHAVIQDRPLWIVFKRDMVIQLKQELIMNSFKTIDGRGANVHIANGACITIQYVTNVIIHGLHIHDCVPTGNAMVRSSETHFGWRTMADGDAVSIFGSSHIWVDHNSLSHCADGLVDAVVGSTAITISNNHFTHHNEVILLGHSDSYTRDKQMQVTIAYNHFGEGLIQRMPRCRHGYFHVVNNDYTHWEMYAIGGSAEPTINSQGNRYNAPVNPFAKEVTKRVETAESQWKGWNWRSEGDLYLNGAYFTASGAGASASYARASSLGAKSSAMVGTMTSNAGALGCKRGRQC 449
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi569g00028 449 SUPERFAMILY Pectin lyase-like 76 443 IPR011050 -
Vivi569g00028 449 Pfam Pectate lyase 182 364 IPR002022 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 247 268 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 123 140 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 349 368 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 391 415 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 147 172 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 420 443 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 183 199 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 327 346 IPR018082 -
Vivi569g00028 449 SMART amb_all 175 372 IPR002022 -
Vivi569g00028 449 Gene3D - 100 442 IPR012334 -
Vivi569g00028 449 FunFam Pectate lyase 100 442 - -
Vivi569g00028 449 PANTHER PECTATE LYASE 18-RELATED 63 447 IPR045032 GO:0030570
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi569g00028 29 449 Polysaccharide Lyase AT4G13710 78.169 0.0 708