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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi4g00533 ATGCTCACTAGTGACATCATTGTTGATTCATGCAATGAGCTTCATAAATTCTCAAACTACACCTCCAAGTGCATTTATGTCAAAACACACCCTGATTGTAGATCAAAAGGTTACATAAACTATCTTCAAATCTTTTATTGTAACCTTGGAAGTTCACCAATTCTTGGTCACACACTACTTTTCTTATGGCTTGTAGTTTTGTTCTATCTTTTAGCCGACACGGCTTCGAATTACTTTTGCACCTCCCTTGAAGGTTTGTCTAATATTTTGAGACTTTCTCCAACTATAGCTGGTGTAACATTACTCTCTCTTGGTAATGGTGCTCCTGATTTCTTTGCTAGTGTTGTTTCTTTCACAAGTTCAAATAATGGTGCAGTTGGTTTGAATAGCATTTTGGGGGGTGCATTTTTTGTTTCCACAGCTGTTTTAGGTATCATAAGTATTCTAGTTAGTTCTAATGAAGTTGCAGTTGACAAAGCTAGTTTCATTAGAGATGTCATTTTCTTCTTATTCTCTTTGTTCATTCTTCTCATCATCATTTCCATTGGTAAAATTAGCCTTTTTGGTTCAATTTGCTACCTTTCTATCTATTTCCTTTATGTTTGTGCCGTCTCGGCCACACATTTCATCTACGAAATGGACAAAAAAGAAGTTGAATCTTCATCGTCTTCCGATGATTTAGTTGAATCTGGCATACCATTATTAGGTTATGTCGACGATACTGATAATGATTCTGATCAGAAATCAATTTTACCAAATCAAGTTGGTATTGGTATAGAAGAAAGCGAGAAGAAGTATAAAGAGTTGTTTTTCGGGTCTTACTACTTATGGAAGTTTCTAGAAATACTCGAATTACCACTTTGTTTACCGAGAAAACTAACTATACCTGTTGTTAGCGAGGAACAATGGTCGAAACCCTATGCAGTTATATCGGTTACCCTAGCACCGATTTTATTCGCGATTCTTTGTAATACACAAATAGAAAATGTGGATTCAAAGAGCACTTTGGTTGCATATTTAACATCATCATTAATTGGAATTGTTTTTGGAAACATGGCATGTGTGACAACAAAGAGTACAAGACCACCTAGGAGATGTTTGTTCCCATGGCTAGCTGGTGGATTTTCAATGAGTGTGACATGGACTTATATAATTGCTGAGGAACTTGTTTCACTTTTGATTTCAATTGGATATGTAATTGGTGTTAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACTGTTCTAGCTTGGGGAAATTCTTTAGGAGATTTGATTGCAAATGGTGCTATGGCTAAAAATGGTGGTGTTGATGGTGCACAAATTGCTGTTTCAGGTTGCTATGCTGGTCCTATGTTTAATATGTTGATGGGATTAGGGTTACCTCTTGTTCTTTCAGCTTGGAGTGAATACCCTAATTCTTATGTTGTTCCTAAGGATAGTTCACTTTTGGGGACTATTTTGTTTTTGATGGTTGGGGTACTTTGGTCACTTGTTGTTTTGGTTAAGAAAAATATGAAGCTTGATAAGTTTTTAGGGGCTGGTCTCTTGACCATTTACCTTTGCTTTTTGTTTTTGAGGTTAGCTATGGCAATTGGTGTTCTTAATTGA 1599 0.3609 MLTSDIIVDSCNELHKFSNYTSKCIYVKTHPDCRSKGYINYLQIFYCNLGSSPILGHTLLFLWLVVLFYLLADTASNYFCTSLEGLSNILRLSPTIAGVTLLSLGNGAPDFFASVVSFTSSNNGAVGLNSILGGAFFVSTAVLGIISILVSSNEVAVDKASFIRDVIFFLFSLFILLIIISIGKISLFGSICYLSIYFLYVCAVSATHFIYEMDKKEVESSSSSDDLVESGIPLLGYVDDTDNDSDQKSILPNQVGIGIEESEKKYKELFFGSYYLWKFLEILELPLCLPRKLTIPVVSEEQWSKPYAVISVTLAPILFAILCNTQIENVDSKSTLVAYLTSSLIGIVFGNMACVTTKSTRPPRRCLFPWLAGGFSMSVTWTYIIAEELVSLLISIGYVIGVSPSILGLTVLAWGNSLGDLIANGAMAKNGGVDGAQIAVSGCYAGPMFNMLMGLGLPLVLSAWSEYPNSYVVPKDSSLLGTILFLMVGVLWSLVVLVKKNMKLDKFLGAGLLTIYLCFLFLRLAMAIGVLN 532
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi4g00533 532 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 61 203 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vivi4g00533 532 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 371 524 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vivi4g00533 532 Gene3D - 92 223 IPR044880 -
Vivi4g00533 532 Gene3D - 299 525 IPR044880 -
Vivi4g00533 532 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 9 531 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi4g00533 Vivi-Chr4 11940910 11942696 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi4g00533 9 532 Antiporters AT5G17860 52.190 0.0 518
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi4g00533 K13754 - gmx:100818583 780.4