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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi3g06351 ATGAACTCCTCCGCAAGTTTATTCACTTCAATTGTTCTGTTGTATGAGGATAATATTACAGGACGTCATCAAGTCTACAATGTTTGCATCGAACAACCACAAATGATAATAGCTGAAGGCATATGGGCTTCTCACACCATTGTTCCTCCTAAATCTTCATTTACAATGCTTGAGATTCAAATCATTATCATCTTTTTCATCACACAATTCTTTCATTTCTTTCTCAAGCGCTTAGGATTCTCTTGTTTCATTTCACAAGTCATGGCTGGATTTCTTCTGGGTCCTTCAATTTCATTAGGACCACTAGATGAATACAAAAAGATGTTATTCCCTTTTGGTGGTCCAGACATACTAAACACAATATCATCCTATGGCTACGCATTTTTCTTATTCTTAAACTCGGTTCAAATGGACTTCACATTAATAAGAAAAACAGGCAAAAAATCTTTGGTCATCGCCCTTCTTTCCTATTATTTACCCATAATGGTTGGCTTCTTGATCATATTTCTTACCCGCTCAGTCTGGATAAATTTAGTTGGCGAAGAACAAGCTTATAATTTACCCATTGTCGTTATATCTCATAGTGGTTGTTCTTTTGCCGTCATTGCTTCTTTGTTAAGAGACATTGGAATCCTCAACTCGGAACTGGGCCGTCTTGCATTGTCTTCGGCTTTCTTAAACGATATAGCAGGTAATGTCTTTGCGGGTGCAGGGACGGCCATAGTGAGTACCATGGAAAGGGGAATGTTTCTGACAGTTAAAAACTTACTTTTATTTTTTGTTTATCTGTTTGGGATTCCATTAATTGGGAGACCAATAATGATGAGGATGGTGAAAAACACACCAGAAGGAAAACCAATCAACAAGATATATATAAACGCAATAGTGCTAGCATTTTTCTTATTGGGTATGTTAGCTGGAAACTTCAACCAACCTTTTTTGGCAGGAGCAGTTATATTGGGCCTTGCCGTTCCTGAAGGCCCGCCATTAGGGTCAGAGTTGGTTAACCAATTTGAATTATTCTCTACATGGATTCTCACTCCACTTTTTGTAACTTGTTGTGTCATGAAAGTGGATCTCACTCTTTGTGGCCCACCTATCCTTATTATTGTTGTCATCGGTTTCATCCTGATGGTGCATACCATTAAGCTACTACAGTGCATGATTGTTTGCAAATATTGCAATATGCCTACAACCGATGGTCTTTGCCTTGCCCTAATTTTGAGTTGCAAAGGTGTTGTTGATTGTTGCTCCTTTATTCTTGTCTATGATGGAACAAAGAAAACTCCTGAATCTATAGGTATTATGGTAATATCAACCTTAGTGTTTGCAACAATCTCAAAATTAGGTGTAAAGGCATTATACGACCCATCAAGAAAATATGCAGGGTATCAGAAAAGAAACATAATGAATCTAAAACAAAACTCAGAGCTTCGTTTGGTTGCAGTTGTGCACAGAGCAAGTCACATGGTTCACGTTAAGAACTTCTTAAGCCTATGTTCTCCGGCACCAGACAACGTGCTAATAGCAGACGTGGTACATGTTATGGAATTAATTGGAAGAACAACACCCATTTTCATTTCACATCGTCTCCAACAAAAAACGGGGTCAACACATAACTACTCGGGAGAGTTAGTTGTTACATTCGACCTTTTTGAGCGAGACCATGCTGGTTCAGCAACAGCTAACACGTACACAGCAATATCTCCACAAACGTTTATGCAGGACGATGTTTGTTACCTTGCATTAGACAAAAACGCAGCTATTATAATTCTACCATTTCACATAAGATGGACGCCACAAGGTTTAATTGAATCAGACGACAACATGGTAAGAACGTTGAATTCAAAGGTTTTGGAAAGAGCACCTTGTTCAATTGGAATTTTGGTTAACCGTGGCAATGCCGCCACAAGAAATAATAATAATAGTAATAATAATAATTCAACTGGTTATAAAGTAGCTATGGTTTTTCTTGGAGGGCCTGATGATAGAGAAGCTTTGTGTTTGGCTAAAAGGTTTTCCAAAAACTTAGATAATTCATTGTATGTGTATCGATTGTTAGCGAGCGACCAAGATGCAATGGGGTGGGAGAAAATGATTGATGATGAGGAGTTAAGGGAAGTTCGTGGATCTTATATTAAACTTGAAAATGTAAAGTATGAAGAAAAAACTATACAGGATGCATCTGAGACAACTACTTTCATTAGGGATATAGCAAATAAATTTGATTTTATTATTGTTGGGAGACGTAATGGAGTTAAATCACCTCAGACACTTGGTTTAGAAAATTGGACTGAGTATACTGAATTAGGTGTTATTGGTGATTTGCTTGCTTCGCCTGATATGGAAACTAAAGCTTCTGTTTTAGTTGTGCAACAACAACAACAAACTAATTATACATCCTCCACTTAA 2412 0.3756 MNSSASLFTSIVLLYEDNITGRHQVYNVCIEQPQMIIAEGIWASHTIVPPKSSFTMLEIQIIIIFFITQFFHFFLKRLGFSCFISQVMAGFLLGPSISLGPLDEYKKMLFPFGGPDILNTISSYGYAFFLFLNSVQMDFTLIRKTGKKSLVIALLSYYLPIMVGFLIIFLTRSVWINLVGEEQAYNLPIVVISHSGCSFAVIASLLRDIGILNSELGRLALSSAFLNDIAGNVFAGAGTAIVSTMERGMFLTVKNLLLFFVYLFGIPLIGRPIMMRMVKNTPEGKPINKIYINAIVLAFFLLGMLAGNFNQPFLAGAVILGLAVPEGPPLGSELVNQFELFSTWILTPLFVTCCVMKVDLTLCGPPILIIVVIGFILMVHTIKLLQCMIVCKYCNMPTTDGLCLALILSCKGVVDCCSFILVYDGTKKTPESIGIMVISTLVFATISKLGVKALYDPSRKYAGYQKRNIMNLKQNSELRLVAVVHRASHMVHVKNFLSLCSPAPDNVLIADVVHVMELIGRTTPIFISHRLQQKTGSTHNYSGELVVTFDLFERDHAGSATANTYTAISPQTFMQDDVCYLALDKNAAIIILPFHIRWTPQGLIESDDNMVRTLNSKVLERAPCSIGILVNRGNAATRNNNNSNNNNSTGYKVAMVFLGGPDDREALCLAKRFSKNLDNSLYVYRLLASDQDAMGWEKMIDDEELREVRGSYIKLENVKYEEKTIQDASETTTFIRDIANKFDFIIVGRRNGVKSPQTLGLENWTEYTELGVIGDLLASPDMETKASVLVVQQQQQTNYTSST 803
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi3g06351 803 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 62 442 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Vivi3g06351 803 Gene3D - 55 462 IPR038770 -
Vivi3g06351 803 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 48 796 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi3g06351 Vivi-Chr3 169815985 169819278 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi3g06351 38 791 Antiporter Super Family AT3G44900 35.786 8.95e-155 470
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi3g06351 K26731 - gmx:100797272 1011.52