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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vivi3g04355 ATGTCTCTTGATAAATCCTTTCTATTTTCTTCTAATGATTCTCATGCATTTCAAAAATGTTTCCAGAATAATAGAACATTGGGCTCATTCGGCATTTGGTTTGGTGATAATCCATTCGATTTTGTCCTCCCTATCGCATTATGCCAAATCATTTTATCCTTCATTGTTTCTCGAACACTTTATTATGTCCTAAGACCTCTACAAACACCCAAATTCTTATGTTGTGTCATTGGTGGTGTTCTATTAGGGCCAACAGCCATAGGACGAAATGTTAGATTGATGGACACATTGTTTCCACTAAAACAAGCTTCATTTTTAACAACATTGGCAAAAATAGGCTCATCCTATTTTGTATTCATCTATGCATTGAAGTTAGATGTAATAAATAACTTGAAAACAGCCAGACGTTGTTGGAGGTTTGGTGTAATTCCTTTTTACTCTTGTTATTTTTCTACAACAATCCTCTTAGCTTTGTATAAACCGCGCGGCGATGAAAAAGAAAATACTGCAAACTCAGTATATTCAATCCCAAATGTCTTCACTGTATCTAGCTTCGCCGTTGTTTCTGAAGCTTTAACAGAATTGAATCTTATAAGTACAGAATTAGGGCAAATTGCTCTATCTTCATCAATGATTAGTGAAATATTGCAATGGATTACTATAACACTGCAGTTTAGTTCGAAAATAAATTTTGTGATTTCGCTCGGATTCTTGGCTTGTACTTGCTTATTTGGTCTATCATTCTTTTTTATTGTAAGACCAATGGCCAAGTTTATCATTCAAAGAACCCCGGTCGGAAAACCGGTGAATGAAATATATATAGTAATGATACTTTTGGGTGTTCTAGTAATGGCAGGTATTAGTGATGCAATTGGTTTACATTTTGTTATGGGGCCTATTCTTTTTGGTTTGGTAATGCCTAATGGACCTCCTTTGGCAACAACAATATTAGAGAGAAGTGAATTAATCAATCAAGAATTTCTTATGCCATTTTTCTTCCTATATGTTGGCATAAGCACAGATTTTGGTAGAATTGGCAAACATTGGAAGGTCGCTCTTACATTTCAAGGTATCTTATTTGTTGGATTCTTAGCAAAGGTGCTTGCATGTGTCCTTGTTTCTCCTACATATAATATGAGGCATAAATATGGCTTAGTGCTTGGACTTATATTGAATATCAAAGGCATCCTCGAACTAATATATTTCTCTAGACTCAAAAAACTCATGGTTATTGATGATGAAGTATACAGCCAAATGGTTTTATATGTGGTGTTGATGACCGGGATATGCATACCCTTGATAAAATCTTTGTATAAACATCGATCTCGTGTGTTAAGAACTAAAAACATACATGAAGATAGGAAAAGAACAATCCAAAGTACTTCTAATAATTCAGAGCTCAGCATCATTTCTTGCGTACACAATGAAGCAAATGTTCGTAGCATGATTGGTTTATTAGAAGCTTGTTACCCATCAAAAGAAAGTCCTTTATATGTCCAAATCGTTCACCTCACAGAGTTATTAGGAAAAAGCACACCGATTCTTCTTCCTATAAATATGAGAAACAAAAAATCATTATCCATAAATTACCCGAACAGCAGCCACATTTTACGTGCTTTTGAGAATTACTCCGAAAATTCAAAAGGTCCAGTCACAATTAACTCATATATTAATGTTTCCCCTTACAATTGCATGCATGAAGCCATTTGTAACCTCGTCGAAGACAAACTAGTTCATTTCCTCATCATTCCATTTCATGAAAATGATCAAAGTTTAGGTAACAATGTTGGATCTGCAATTCATGACCTCAATAGTAATTTTCAAGCTTCCGCGCAATGTACCGTTGGAATATTGGTGGATAGATACTCGCAAATTAGTGTGAGTGCAACCAATCTATCGTTTAATGTCGCTATATTTTTTGTTGGTGGAAAAGATGATCGAGAAGCATTAGCGTTGGGTATTCGAATGTTTGATCGTCCCAATACAAATGTTACATTATTTTGTTTCATCATTAATAATAATAATAAGAATAACAATAATAATAATTCGAGTGATCTTGAATATAAAGTTGATGATAAAGAAGATGAAACATTTGAGAGAATGATGGATGAGAGTTTGATAGATGAGTTTAAGGCTAAAAAAATTAATAATGATAATGTTGTTTGTCATGAGATTGTGGTGGAAGATTGTACACAAATGTTGGAAGCGATTCGAGGTTTAGAGAATGAAGACTATAATCTTGTGATGGTTGGTAAGAGACATAATATTGGTGAATTGACAGATGAAGAAATGTCAAATTTTATGGATAATGCAATTTTATTGGGTGTTTTTGGAGATATGTTGGCATCTACCGAGTTTTGTAATGGAAAAGTTCCTATTTTGGTGTTGCAATGTGGCGAAAAGAGAGTTAAACAGTTTGAGAAGGCTCACAGACATTGTCCCAACTCACTGGTGCTCTTCTACTACCTGAATCTTTGTCGCTCCAAAGAAAGGTTCTGCGAATGGCTTCAACCTGTTTTATCACTTTCTTTGGCATGGGGAAAACCTGCATCTAATAGGCAGTCACAACAAATGAATGCTCATAACCAACTGATATCGGCCTACATAACTCAAGAGCTTAGTTGTCCAATGTCGAATCTTTGCCACAAATTTATCAATATGTGGTTGACATTGATGGGTGTTGAGTTTTCTACTTGA 2697 0.3485 MSLDKSFLFSSNDSHAFQKCFQNNRTLGSFGIWFGDNPFDFVLPIALCQIILSFIVSRTLYYVLRPLQTPKFLCCVIGGVLLGPTAIGRNVRLMDTLFPLKQASFLTTLAKIGSSYFVFIYALKLDVINNLKTARRCWRFGVIPFYSCYFSTTILLALYKPRGDEKENTANSVYSIPNVFTVSSFAVVSEALTELNLISTELGQIALSSSMISEILQWITITLQFSSKINFVISLGFLACTCLFGLSFFFIVRPMAKFIIQRTPVGKPVNEIYIVMILLGVLVMAGISDAIGLHFVMGPILFGLVMPNGPPLATTILERSELINQEFLMPFFFLYVGISTDFGRIGKHWKVALTFQGILFVGFLAKVLACVLVSPTYNMRHKYGLVLGLILNIKGILELIYFSRLKKLMVIDDEVYSQMVLYVVLMTGICIPLIKSLYKHRSRVLRTKNIHEDRKRTIQSTSNNSELSIISCVHNEANVRSMIGLLEACYPSKESPLYVQIVHLTELLGKSTPILLPINMRNKKSLSINYPNSSHILRAFENYSENSKGPVTINSYINVSPYNCMHEAICNLVEDKLVHFLIIPFHENDQSLGNNVGSAIHDLNSNFQASAQCTVGILVDRYSQISVSATNLSFNVAIFFVGGKDDREALALGIRMFDRPNTNVTLFCFIINNNNKNNNNNNSSDLEYKVDDKEDETFERMMDESLIDEFKAKKINNDNVVCHEIVVEDCTQMLEAIRGLENEDYNLVMVGKRHNIGELTDEEMSNFMDNAILLGVFGDMLASTEFCNGKVPILVLQCGEKRVKQFEKAHRHCPNSLVLFYYLNLCRSKERFCEWLQPVLSLSLAWGKPASNRQSQQMNAHNQLISAYITQELSCPMSNLCHKFINMWLTLMGVEFST 898
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vivi3g04355 898 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 25 797 - -
Vivi3g04355 898 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 51 429 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Vivi3g04355 898 Gene3D - 45 447 IPR038770 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vivi3g04355 Vivi-Chr3 78366498 78371804 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vivi3g04355 31 797 Antiporter Super Family AT2G13620 33.376 4.42e-139 432
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vivi3g04355 - - vvo:131658379 1777.68