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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun6g00290 ATGGGATACACTGTGTTCTTGAACACCTCTTTCCTCCTTGTGATATGTTCTTTTATGATTATTCATTTCCACACCCCGGAAACTGAAGTAGTGGTTGTAGCCAAAATTTCAACCTTTGGTAGCAGCAATGAGCAAGAATGTGAGAGCTTAGCCAGCCTAGATGACTTCAAAGCCAAGTGCCTGTACCTGAAATCCAACGATCCTTGTGCTCCTCAGGGCTATATTGATTATCTATACCTTTTCTATTGCCAAATTGGTGGTTACCCTTCATTGGGTTACACCCTTTTATTTCTTTGGCTCCTAATTCTGTTCTATTTATTGGCTAATACAACTTCTCAATACTTTTGTCCCTCCCTAGAAAGCTTGTCAAAATTACTAAGGTTGTCCCCTACAATTGCTGGAGTCACCCTCCTCTCACTTGGCAATGGTGCCTGTGACGTTTTCTCTAGCCTTGTCTCTTTCCAGGGAAGTGGGACACGCAGCGTTGGTTTCAACACAGTTCTTGGGGGTGTTTCGTTTGTATCCTGTGTTGTGGTGGGGACTGTGAGTATTGCAATACGTCAAAAGAGGGTTCAAATTGATAAGTCAGCGTTTGTGAGAGACGTCTATTTTCTCCTTTTGGTTCTTTTTACCTTGTTTGGTATTTTGATCTTTGGCAAGATCAATGTTCTTGGAGCAGTTGCTTTTACTATGATGTATGCTGTGTATGTAGCTATTGCTTATGTCTCTTCCACCCGATGGAAGGAAGGTGTTGCAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGCTGCTGAGAGGGGTGGTGTTGGTTGCGGCAATGATTTGAATTTGCCTCTTCTCATTGGTGTGAAGAAAGAAGCAATTGATTGTGCTGAAAATGATGCTGGAGAAAATGGATTAAATGCGGAGAAGTATTGTTGCTGTACGAGATATTTAATGTGTCGAGTGCCACTTTATGTTCTGGAGGTGCCCCTTTACTTGCCTAGGAGATTGACAATTCCTGTTGTGAGTGAAGAGAGATGGTCGAAAGTGTACGCAGTGTTTTGTGTTATGCTAGCACCACTTCTCATGTCATTCCTATGGGGGAGTACTTATAACAGAAACAGTTTCTACAGCAAGAACCTTATTGTTTATGGAATTGGAGTTTTGGTGGGAACTATACTTGGTGTAACTGCATATTTCACAACCAAAAAGTCAGGGCCACCAAAGAAGTTCCTATTTGCATGGGTTGCAGGTGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGCTATATAATAGCTCAAGAGTTGGTGGGGTTGCTTGTTTCAATTGGGTACATATGTGGAATAAGTCCTTCTATACTAGGGTTAACAGTTATGGCTTGGGGGAACTCAATTGGGGATTTGATGACAAATGTAACTATGGCTTTAAATGGAGGGCCAGAGGGTGCTCAAGTTGCAATATCAGGTTGCTATGCTGGTCCCATCTTCAATATCCTCATTGGTTTGGGCTTTTCTCTTGTCACTTCTACATGGTCAGAGTACCCTCAACATGTTGTGATCCCTAGAGACCCTTATCTTTGGGAGACAATGGTGTTTTTGGTGCTTGGATTAGTTTGGGCACTATTTGTTTTGATAAAAAGAGATATGAAGCTTGACGGACTCTTAGGAGGAGGGCTTTTGTTTGTGTACTTTCTTTCTCTGTTTTCAAGACTGATTCAGACAGAAGGCTCACTCCAATAG 1707 0.4241 MGYTVFLNTSFLLVICSFMIIHFHTPETEVVVVAKISTFGSSNEQECESLASLDDFKAKCLYLKSNDPCAPQGYIDYLYLFYCQIGGYPSLGYTLLFLWLLILFYLLANTTSQYFCPSLESLSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQGSGTRSVGFNTVLGGVSFVSCVVVGTVSIAIRQKRVQIDKSAFVRDVYFLLLVLFTLFGILIFGKINVLGAVAFTMMYAVYVAIAYVSSTRWKEGVAGGGGGGDAAERGGVGCGNDLNLPLLIGVKKEAIDCAENDAGENGLNAEKYCCCTRYLMCRVPLYVLEVPLYLPRRLTIPVVSEERWSKVYAVFCVMLAPLLMSFLWGSTYNRNSFYSKNLIVYGIGVLVGTILGVTAYFTTKKSGPPKKFLFAWVAGGFVMSVTWSYIIAQELVGLLVSIGYICGISPSILGLTVMAWGNSIGDLMTNVTMALNGGPEGAQVAISGCYAGPIFNILIGLGFSLVTSTWSEYPQHVVIPRDPYLWETMVFLVLGLVWALFVLIKRDMKLDGLLGGGLLFVYFLSLFSRLIQTEGSLQ 568
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun6g00290 568 Gene3D - 128 254 IPR044880 -
Viun6g00290 568 Gene3D - 341 559 IPR044880 -
Viun6g00290 568 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 408 557 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Viun6g00290 568 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 97 241 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Viun6g00290 568 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 309 565 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun6g00290 Viun-Chr6 7471602 7473638 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Viun6g00290 6 568 Antiporters AT5G17850 51.146 6.16e-163 474
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Viun6g00290 K13754 - gmx:100813848 784.252