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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun5g02625 ATGACAGACACAATACCTGCATGTTACAACGTATCTATAGTTAATCCTAATCAATTTTGGAAAACCGATAAAGTCTTGAAAACAGAGCTCCCTATTCTAGCAATTCAAATTGCTTTTGTTGCTGTGTTATCTCGTCTCTTTTCCATAATTTACAAACCTCTGCATCAAACTCGTCTCATTTCACAAATCTCTGTTGGTTTCCTACTGACACCACCACTACTTGGAAGATTCACGGCAATTTTTGAGTTCATTTTTCCGGTTAATGGGGTTGTCAATGTAGAGGTCCTTTCTCATATTGGTCTCATTTATTATGCATTCCTTAGTGGATTGGAGATGAACTTAAATACTATTCTAAATGTGAACAAGAAGGCTGCAAGCATCGCAATTGCTGGGATCGTCTTTCCTATACTCGTTGCACCATGCTTATATGCTTTGTTTCGAAATGTATATGGACATATTATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAGTACAAATAATGCTTATATACTTTGGACTTTAATTCTTACTGTTACAGGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCCTTTATACTGGTCTTGGGAAAGCAGCTTTAACAGCAGCCATGATTGGTGAAACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTTCCATTTTCTATTAATGGTAAAGGAGCTATCTACACTGTGTTATCCACGATAACATTCATTATTGTGTGCATCTTTGTGGTACGTCCACTCATTCAATGGTTTATTGATCGCAAGGAAGACAAAGATGAATGGAATGATAACCAATTGCTATTTATAATCATGGGGGTTTTAGCTTGTTCATGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGGGCTTTTGTTTTTGGATTAATTTTACCAAATGGGAAATTTGCTGAATTGGTCATGTCAATTTCAGATGATTTTGTTGGTGGCTTTTTAGTACCTCTCTTCTTTACTGGAACTGGGATGAGACTTATGTTGATCGCAATTTTCTCCCAAGAAAGTTGGCCCTTTACAGTTGTGATTATACTTTTGTTGTGTGCTTTAAAGATTTTAAGCACCTTATTTGTCACGTTTTTCTTTGGTATGCGTATTCGAGATGGTTTGACCTTAGGCTTGATTTTGAATAATAAAGGCACCATGGCATTAATAATGTTGAACATTGCTTGGGATAGAACGATATTTTCTATACCTACCTATGCCGTTATAACTTCCGCTGTTCTTCTGATGACCATAGTTGTGTCTCCCATCATCAATGTCGTATACAAACCAAGACAGCTATTTGAACAGAATAAGCTAAAGACCGTACAAAAACTAAGAGTTGATGCAGAGCTCCGATTTATAGCATGTGTTCACAATACTCGTCAAGCTGCAAGCATGATTAACATAATTGAATGTTTTAATGCCACGAGAGTTTCCCCCGTGCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTCGAACTTACTGGACGTGCTGCTGCCCTAGTTGTTGCACATATAGGGAAGCATAGGAGCCAATTCGGAGAACAAAACCTGACCAGGTCACAAGAAGAGTTAGAAAGCATTAACAACGCATTTGATGCACTTGGAGAGGCATATGACGCTGTTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAGCATATACAACTATTCATGAGGACATATACCATTCAGCAGATGAGAAACGCACAAGCTTAATTCTTCTTCCATTTCACAAACAATTAAGTTTAGAAGGTACTTTAGAAGTAACCAATGTTGTATACAAAGATATAAACCAAAATGTAATGCAAGGTGCTCCTTGCTCCGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGGTTAGTTCCCAAAACGAACCTTCATATACGTGTAGTCTTTGTTGGGGGTCCTGATGACCGTGAAGCCTTAGCCATTGCATGGAGAATGGCAGGACGTTCAGGAACACAACTCTCAGTGGTTCGAATTCTTTTGTTGGGTGAAGCAGCAAAATTAGATGGTTTAGTTCCCGATGAAGCACAAGGGATATTATCTGCGGTAATAGATACAGACAGGCAAAAAGAGTTAGATGAAGAGTATATAAGCACATTCAGACTTACAGCGGTTAACAATAGTGATTCAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTCATAGTGGTGAAGATATTCCTGCAGTCCTCAAAGAGATAGAAAAATATGGTTGTGATATTTACATTGTTGGTCAAGGAAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTAATGGAATGGTGCGAGTGCTTAGAACTTGGTGTTATAGGGGACATTTTGGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGCTCATCTGTGCTTGTTGTTCAACAGTATGGATATGGAGGAATGGTTTTTGGAAATAATCTTAACCAGAAGGCCACTGACAAAGGCACATTTGAGTCTGTTGTCTAA 2436 0.3818 MTDTIPACYNVSIVNPNQFWKTDKVLKTELPILAIQIAFVAVLSRLFSIIYKPLHQTRLISQISVGFLLTPPLLGRFTAIFEFIFPVNGVVNVEVLSHIGLIYYAFLSGLEMNLNTILNVNKKAASIAIAGIVFPILVAPCLYALFRNVYGHIMMFPLEESTNNAYILWTLILTVTGFPVVAHTLSELKLLYTGLGKAALTAAMIGETYGWILFTLFVPFSINGKGAIYTVLSTITFIIVCIFVVRPLIQWFIDRKEDKDEWNDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFVFGLILPNGKFAELVMSISDDFVGGFLVPLFFTGTGMRLMLIAIFSQESWPFTVVIILLLCALKILSTLFVTFFFGMRIRDGLTLGLILNNKGTMALIMLNIAWDRTIFSIPTYAVITSAVLLMTIVVSPIINVVYKPRQLFEQNKLKTVQKLRVDAELRFIACVHNTRQAASMINIIECFNATRVSPVHVFALYLVELTGRAAALVVAHIGKHRSQFGEQNLTRSQEELESINNAFDALGEAYDAVRVETLNVVSAYTTIHEDIYHSADEKRTSLILLPFHKQLSLEGTLEVTNVVYKDINQNVMQGAPCSVGIFVDRDFGLVPKTNLHIRVVFVGGPDDREALAIAWRMAGRSGTQLSVVRILLLGEAAKLDGLVPDEAQGILSAVIDTDRQKELDEEYISTFRLTAVNNSDSISYSEIDVHSGEDIPAVLKEIEKYGCDIYIVGQGNCRNSKVFSNLMEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMVFGNNLNQKATDKGTFESVV 811
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun5g02625 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 38 426 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Viun5g02625 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 8 786 - -
Viun5g02625 811 Gene3D - 32 436 IPR038770 -
Viun5g02625 811 Gene3D - 477 745 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun5g02625 Viun-Chr5 37480749 37483391 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Viun5g02625 2 786 Antiporter Super Family AT2G13620 37.280 0.0 545
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Viun5g02625 - - var:108320251 1300.03