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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Viun4g02304 ATGACGGACACAATACCAGCATGTTACAACATATTTAAAGTTAATCCTAATCAATTTTGGAAAACCGATAAAGTCTTGAAAACAGAGCTCCCTATTTTGGCCATTCAAATTGCTTTTGTTGCTGTATTATCTTGTCTGTTTTCCATAATCTACAAACCTCTGCATCAAACTCATCTCATTTCACAAATCTCGGTTGGTTTCCTACTGACACAGCCATTACTAGGAAGATTCACAGAAATTTTTGAGTTCATTTTTCCGGTAAATGGAGTCGTTAATGTCGAGGTCCTTTCTCACATTGGTCTCATTTATTATGCATTCCTAAGTGGATTGGAGATGGACTTAAATACCATTCTAAACGTTAAAAAGAAAGCTGCAAGCATCGCAATTGCTGGGATCGTCTTTCCCGTACTCGTTGCACCATGCTTATATGCATTATTTCGAAAAGTTTATGGACATATTATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAGTACATATAATGCTTATATACTTTGGACTTTAATTCTCACTGTTACAGGTTTTCCAGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAACTCCTTTATACTGGTCTTGGCAAAACAGCTTTAACAACAGCCATGATTAGTGACACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTATTCCATTTTCAATTAATGGTAAAGGAGCTATCTACACTGTGTTATGCACGATAATATTTGTTGTTGTCTGCATCTTTGTGGTACGTCCACTCATTCAATGGTTTATTGATCGCAAGGCAGATAAAGATGAATGGAATGATAACCAATTGCTCTTTATAATCATGGGAGTTTTAGCTTGTTCATGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGGGCTTTTGTTTTTGGATTAATTTTACCTCATGGGAAATTTGCTGAAATGGTCATGTCAATTTCAGATGATTTTGTTGGCGGCTTTTTAGTACCCCTCTTCTTTACTGGAACTGGGATGAGACTTATGTTGACCGCAATTTTTTCCCAAGAAAGTTGGCCCTTTACAATTGTGATTATACTCTTGTTATGTGCCTTAAAGATTTTAAGCACTTTATTTGTCACATGTTTCTTTGGTATGCGTATTCGAGATGGTTTAACCTTGGGTTTGATTTTGAATAATAAAGGGGTCATGGCATTAATAATGTTGAACATTGCTTGGGATAGCAAGATATTTTTTGTGCCTACCTATGCCGTTATAACTTCTGCAGTTCTTTTGATGACCATAATTGTGTCTCCGGTCATCAATGTTGTCTACAAACCAAGACAAAGATTTGAACAAAACAAGCTAAAGACCATACAAAAACTAAGAGTTGATGTAGAGCTCCGATTTATAGCATGTGTTCACAATACTCGGCAAGCTGCAAGCATGGTTAACATAATTGAATGTTTTAATGCCATGAGAGTTTCCCCTGTGCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTCGAACTTACTGGACGTGTTGCTGCCCTAGTTGTTGCACATATAGGAAAGCCTAGGAGCCAACTTGGAGAACAAAACCTAACCAGGTCACAAGAAGAGTTAGAAAGCATTCATAACACATTTGATGCACTTGGAGAGGCATATGATGCTATTAGAGTTGAAACATTAAATGTGGTGTCAGCATATAAAATTATTCATGAGGACATATACCACTCAGCGGATGAGAAACACACAAGCTTAATTCTTCTTCCATTTCACAAACAACTAACTTTAGAAGGTACTCTAGAAGTAACCAATGTTGTACACAAAGATATAAACCAAAATGTAATGCAAGGTGCACCCTGCTCCGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGGTTAGTTTCCAAAATGAACCTTCATATTCGTGTGGTCTTTGTTGGGGGCCCTGATGATCGTGAAGCCTTAGCCATTGCATGGAGGATGGCAGGACGTCCAGGAACACAACTCTCAGTGGTTCGAATTCTTTTATTAGGCGAAGCGGCAAAAGTAGATGCTTCAGTTCCCGATGAAGCACAGGGGATATTATCTGCAGTAATAGATACAGACAAACAAAAAGAGTTAGATGAAGAGTATGTAAGCACATTTAGACTTACTGCAGTTAACAATAACGATTCAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTCATAGTGGTGAAGATATTACTACAGTCCTCAATGAGATAGAAAAAATTGGTTGTGATATTTACATAGTTGGACAAGGGAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTGCTAGAGTGGTGTGAATGCTTAGAACTTGGAGTTATAGGAGACATTTTGGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGTTCGTCTGTGCTAGTTGTTCAACAATATGGATATGGAGGAATGGTTTTTGGATATAATCTTAACCAGAAGGCCACTAACAAAGGCACGTTTGAATCTGTTGTCTGA 2436 0.3756 MTDTIPACYNIFKVNPNQFWKTDKVLKTELPILAIQIAFVAVLSCLFSIIYKPLHQTHLISQISVGFLLTQPLLGRFTEIFEFIFPVNGVVNVEVLSHIGLIYYAFLSGLEMDLNTILNVKKKAASIAIAGIVFPVLVAPCLYALFRKVYGHIMMFPLEESTYNAYILWTLILTVTGFPVVAHTLSELKLLYTGLGKTALTTAMISDTYGWILFTLFIPFSINGKGAIYTVLCTIIFVVVCIFVVRPLIQWFIDRKADKDEWNDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFVFGLILPHGKFAEMVMSISDDFVGGFLVPLFFTGTGMRLMLTAIFSQESWPFTIVIILLLCALKILSTLFVTCFFGMRIRDGLTLGLILNNKGVMALIMLNIAWDSKIFFVPTYAVITSAVLLMTIIVSPVINVVYKPRQRFEQNKLKTIQKLRVDVELRFIACVHNTRQAASMVNIIECFNAMRVSPVHVFALYLVELTGRVAALVVAHIGKPRSQLGEQNLTRSQEELESIHNTFDALGEAYDAIRVETLNVVSAYKIIHEDIYHSADEKHTSLILLPFHKQLTLEGTLEVTNVVHKDINQNVMQGAPCSVGIFVDRDFGLVSKMNLHIRVVFVGGPDDREALAIAWRMAGRPGTQLSVVRILLLGEAAKVDASVPDEAQGILSAVIDTDKQKELDEEYVSTFRLTAVNNNDSISYSEIDVHSGEDITTVLNEIEKIGCDIYIVGQGNCRNSKVFSNLLEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMVFGYNLNQKATNKGTFESVV 811
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Viun4g02304 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 8 786 - -
Viun4g02304 811 Gene3D - 32 439 IPR038770 -
Viun4g02304 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 39 425 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Viun4g02304 Viun-Chr4 38640101 38642745 Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Viun4g02304 2 786 Antiporter Super Family AT2G13620 35.894 1.12e-177 530
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Viun4g02304 - - var:108320251 1280.39