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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vium9504g00005 ATGACAAATACAATACCTGCATGTTACAATATATCTATAGTTAATCCTAATCAATTTTGGAAAACCGATAAAGTCTTGAAAATAGAGCTACCTATTCTGGCTATTCAAATTGTTTTTGTTGTTGTGTTATCTCGTCTCTTTTCCATAATCTATAAACCTCTGCATCAAACTCGTCTCATTTCACAAATCTCTGTTGGTTTCCTACTAACACCACCATTACTTGGAAGATTCACGACAATTTTTGAGTTCATTTTTCCAGTAAATGGGATTGTTAATGTTGAGATCCTTTCCCACATTGGTCTCATTTATTATGCATTCCTTAGTGGATTGGAGATGAACTTAAATACCATTCTAAACGTGAACAAGAAAGCTGCAAGTATTGCGATTGCTGGAATCGTCTTTCCCATACTCGTTGCACCATGCTTGTATGCTTTGTTTCGAAAAGTTTATGGACATAATATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAATACAAATAATGCTTATATACTTTGGACTTTAATTCTCATTGTTACAAGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCGTTTATACTGGTCTTGGCAAAGAGGCTTTAACAGCAGCCATGATAGGTGACACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTTCCCTTTTCAATTAATGGTAAAGAAGCCATCTACACCGTGTTATGCACGACAATATTCATTGTTGTGTGCATATTTGTGGTACGTCCACTCATTCAATGGTTTATTGATCGCAAGGCAAACAAAGATGAATGGAATGATAACCAATTACTCTTTATAATCATGGGGGTTTTAGCTTGTTCTTGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGGGCTTTTATTTTTGGATTAATTTTACCTCATGGAAAATTTGCTGAATTGGTCATGTCAATTTCAGATGATTGTGTTAGTGGCTTTTTAGTACCCCTCTTCTTTAGTGGATCTGGAATGAGACTTATGTTGATCACAATTTTCTCCCAAGAAAGTTGGCCCTTTATAATTGTGATTATACTCTTGTTGTGTGCTTTAAAGATTTTAAGCACTTTATTTGTCACATTTTTCTTTGGTATGCGTATTCGAGATGGTTTGACCTTGGGCATGATTTTGAATAATAAAGGTGCCATGGCATTAATAATGCTAAACATTGCTTGGGATAGAACGATATTTTCTGTACCTACCTATGCCGTTATAACTTCTGCTGTTCTTTTGATGACCATAGTTGTGTCTCCCGTCGTCAATGCCATCTACAAAACAAGACAAATATTTGAACAAAACAAGCTAAAGACCATACAAAAACTAAGACTTAATGCAGAGCTCCGATTTATAGCGTGTGTTCACAATACTCGCCAAGCTATAAGCATGATTAGCATAATTGAATGTTTTAACCCTACGAGAGTTTCCCCTGTGCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTTGAACTTACTGGACGTGTTGCTGCCTTAGTTGCTACACATATAGGGAAGCCTAGTAACCAACTCAGAGAACAAAACCTGACCAAGTCACAGGAAGAGTTAGAAAGCATTCACAATACATTTGATGCACTTGAAGAGGCATATAATGCTATTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAGCATATACAACTATTCATGAGGACATATACCACTCAGCATATGAGAAACGCACAAGCTTAATTCTACTTCCATTTCACAAACAATTAACTTTAGAAGGTACTCTAGAAGTAACCAGTGTTGTATATAAAGATATAAATCAAAATGTAATGCAAGGTGCTCCCTGCTCCGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGGTTAGTTCCCAAAATGAACCTTCATATTTGTGTGGTCTTTGTTGGGGGTCCTGATGATCGTGAAGCCTTAGCCATTGCATGGAGGATGACAGGACGTTCAGGAACACAACTCTCACTGGTTCGAATTCTTCTATTGGGTGAAGCGGCAGAAATAGATGCTTCAGTTCACAATGAATCACAAGGGATATTATCTGAGGTAATAGATACGGACAAGCAAAAAGAGTTAGATGAAGAGTATATAAGCGCATTTAGACTTACAATAGTTAACAATAGCGATACAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTTATAGTGAAGAAGATATCCCTGTAGTCCTCAAAGAGATAGAAAAAATTGGTTGTGATATTTACATAGTTGGACAAGGGAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTGTTGGAGTGGTGTGAGTGCTTAGAACTTGGAGTTATTGGGGATATTTTGGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGCTCGTCTGTGCTAGTTGTTCAACAATATGGATATGGAGGAATGATTTGTGGAAATAATCTTAACCAGAAGGCCACCGACAAAGGCACGTTTGAATCTATTGTTTGA 2436 0.369 MTNTIPACYNISIVNPNQFWKTDKVLKIELPILAIQIVFVVVLSRLFSIIYKPLHQTRLISQISVGFLLTPPLLGRFTTIFEFIFPVNGIVNVEILSHIGLIYYAFLSGLEMNLNTILNVNKKAASIAIAGIVFPILVAPCLYALFRKVYGHNMMFPLEENTNNAYILWTLILIVTSFPVVAHTLSELKLVYTGLGKEALTAAMIGDTYGWILFTLFVPFSINGKEAIYTVLCTTIFIVVCIFVVRPLIQWFIDRKANKDEWNDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFIFGLILPHGKFAELVMSISDDCVSGFLVPLFFSGSGMRLMLITIFSQESWPFIIVIILLLCALKILSTLFVTFFFGMRIRDGLTLGMILNNKGAMALIMLNIAWDRTIFSVPTYAVITSAVLLMTIVVSPVVNAIYKTRQIFEQNKLKTIQKLRLNAELRFIACVHNTRQAISMISIIECFNPTRVSPVHVFALYLVELTGRVAALVATHIGKPSNQLREQNLTKSQEELESIHNTFDALEEAYNAIRVETLNVVSAYTTIHEDIYHSAYEKRTSLILLPFHKQLTLEGTLEVTSVVYKDINQNVMQGAPCSVGIFVDRDFGLVPKMNLHICVVFVGGPDDREALAIAWRMTGRSGTQLSLVRILLLGEAAEIDASVHNESQGILSEVIDTDKQKELDEEYISAFRLTIVNNSDTISYSEIDVYSEEDIPVVLKEIEKIGCDIYIVGQGNCRNSKVFSNLLEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMICGNNLNQKATDKGTFESIV 811
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vium9504g00005 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 38 426 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Vium9504g00005 811 Coils Coil 516 536 - -
Vium9504g00005 811 Gene3D - 32 437 IPR038770 -
Vium9504g00005 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 10 786 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vium9504g00005 Vium-Chr9504 38559 49574 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vium9504g00005 8 786 Antiporter Super Family AT2G13620 36.203 8.00e-176 525
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vium9504g00005 - - var:108320251 1407.89