Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vium8470g00007 ATGGGATACGCTGTGTTCTTGAACGCTTCTTTCCTCCTTGTGACGTGTTCTTTTATGATTATTCATTTCCACACCCCGGAAACACAAGTTGTGGCTGTGACCAAAATTTCTGGCTTTGGTAGCAGCAATGAGCAAGAATGTGAGAGCTTAGCCAGCCTCGATGACTTCAAAGCCAAGTGCCTGTACCTGAAATCCAATCATCCTTGTGCTCCTCAGGGCTATATTGATTATCTGTACCTTTTCTATTGCCAAATTGGGAGTTATCCTTCGTTAGGTTACACCCTTTTATTTCTTTGGCTCCTAATTCTGTTTTACTTATTGGCTAATACAACTTCTCAATACTTTTGTCCCTCCCTTGAAAGCATGTCCAAATTACTAAGGTTGTCCCCCACAATTGCTGGAGTCACCCTCCTCTCACTTGGCAATGGTGCCTGTGACGTTTTCTCTAGCCTTGTCTCTTTCCAGGGAAGTGGGACACGCAGCATTGGTTTTAACACGGTTCTTGGGGGTGTTTCTTTTGTGTCCTGTGTTGTGGTGGGGACTGTGAGTATCGCAGTACGTCAAAAGAGGGTTCAAATTGATAAGTCCGCGTTTCTGAGAGATGTTTCTTCTCTCCTTTTGGTTCTTTTGACCTTGTTTGGTATTTTGATCTTTGGCAAGATCAATGTTGTTGGAGCAGTTGCTTTTACTATGATGTATGCTGTGTATGTGGCTATTGCTTATGTTTCTTCTACCAGATGGAAGGAAGGTGTTGCAGGTGATGATGGAGGTGGTGATGTTGGTTGCGGAAATGGTTTGAATTTGCCACTTCTCGTTGGTGTGAAGAAAGAAGCAATTGATTGTGCGGAAAATGGTGCTGAAGAATATGGACTGAATGTGGATAAGTATTGTTGTTGTATGAGATATTTAATGTGTCGAGTGCCAGTTTATGTTCTGGAGTTGCCCCTTTACTTGCCTAGGAGATTGACAATTCCTGTTGTGAGTGAAGAGAGATGGTCAAAGGTGTATGCAGTTTTTTCTGTCATACTAGCACCACTTCTCATGTCTGTCCTGTGGAGGAGTACTTATGAGAATGGAAACAGTTTCTTCAGCAAGAACCTTATTGTTTATGGAATTGGACTTTTGGTGGGAAGTATACTTGGAGTAACTGCATATTTCACAACCAAAAAGGGAGGGCCACCAAAGAAGTTCTTATTTGGTTGGCTTGCTGGTGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGTTATATAATAGCTCAAGAGTTGGTGGGGTTGCTTGTTTCAATTGGGTACATATGTGGAATAAGTCCTTCTATACTAGGGTTAACAGTTATGGCTTGGGGGAATTCAATTGGGGATTTGATGACAAATTTAACTATGGCTTTAAATGGAGGAGCAGAGGGTGCTCAAGTAGCAATATCAGGTTGCTATGCTGCTCCCATCTTCAATATCCTTATTGGTTTGGGTTTGTCTCTTGTCACTACTACATGGTCAGAGTACCCTCAACATGTTGTCATTCCTAGAGACCCTTATCTTTGGGAGACAATGGTGTTTTTGGTGGTTGGATTAGTTTGGGCACTTTTGGTTTTGATAAAAAGAGATATGAAGCTTGACAGACTCTTAGGAGGAGGGCTTTTGTTTGTTTACTTTCTTTCTCTGTTTTCAAGACTGATTCATGCAGAAGCTCACTCCAATACTCTAATTTTATGA 1704 0.4178 MGYAVFLNASFLLVTCSFMIIHFHTPETQVVAVTKISGFGSSNEQECESLASLDDFKAKCLYLKSNHPCAPQGYIDYLYLFYCQIGSYPSLGYTLLFLWLLILFYLLANTTSQYFCPSLESMSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQGSGTRSIGFNTVLGGVSFVSCVVVGTVSIAVRQKRVQIDKSAFLRDVSSLLLVLLTLFGILIFGKINVVGAVAFTMMYAVYVAIAYVSSTRWKEGVAGDDGGGDVGCGNGLNLPLLVGVKKEAIDCAENGAEEYGLNVDKYCCCMRYLMCRVPVYVLELPLYLPRRLTIPVVSEERWSKVYAVFSVILAPLLMSVLWRSTYENGNSFFSKNLIVYGIGLLVGSILGVTAYFTTKKGGPPKKFLFGWLAGGFVMSVTWSYIIAQELVGLLVSIGYICGISPSILGLTVMAWGNSIGDLMTNLTMALNGGAEGAQVAISGCYAAPIFNILIGLGLSLVTTTWSEYPQHVVIPRDPYLWETMVFLVVGLVWALLVLIKRDMKLDRLLGGGLLFVYFLSLFSRLIHAEAHSNTLIL 567
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vium8470g00007 567 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 305 557 - -
Vium8470g00007 567 Gene3D - 334 554 IPR044880 -
Vium8470g00007 567 Gene3D - 128 254 IPR044880 -
Vium8470g00007 567 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 97 241 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vium8470g00007 567 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 402 552 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vium8470g00007 Vium-Chr8470 106566 108663 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vium8470g00007 22 551 Antiporters AT5G17860 47.388 7.04e-157 457
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vium8470g00007 K13754 - gmx:100813848 758.059