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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vium6666g00003 ATGTTAGCTGGTGGAGCTATATCTTGGAGAAGTGCCAAGCAGACATTATCTGCTACTTCTACTATGAAAGCTGAGTTCGTTTCTTGTTTTGAGACTACCTCGCATGGTGTATGGTTAAAGAGTTTCTTTTCTGGGCTCAGAGTTGTGGACTTTATTTCTAGGCCATTAAAGTTGTACTGTGACAACTCTGCTGCGGTGTTTATGGCTAAGAACAATAAAAGTGGATGTCGAAGTAAGCACATTGACATCAAATACTTAGCCATTAGAGAACATGTTAAGGAAAAGAAAGTGGTCATTGAACACATAAGCACTGAGTTGATGATTGTTGATCCTTTAACTAAAGGCATGCCACCAAAGAATTTTAAGGATCATGTAGTGCAAATGGAACTTGGTTCCGAAAATAATAGGTTGTGGTATAACATGCAAAGGGGAAAGGTTAAGCTAGATGAGGATCTACGTCCTGATCGTGAGGATGATTTCCAAACAGATGATGAAGAAAATCAGGCACAAAGGGTGTTTGAACATTTGGATGATGATACTGATTCAGATAATTCACCTCCTTCACCAAGTTTGTCCAACGATGTTTCCATGATCTCTTGGCCTCAAAGCTATAGACAATCTATGGACATGTTAACTAGTGCAACACCTCCTGGAATTAATTTGTTAAAGAGATTTGGTTCAGTGGGGAGAGGAAATTCTCCCATTACATCATTCAAGAGATCTCAAGAACACCAAGAGGATTCTACCTTATCTCTACCCCTTGTTTCTGAGACATGTGGATTCAAACAAGAGAATCGTCTTGCATCAGTACCACGCCTGCAACCACTTAGCAGTGCAAAATTTTCTGTGGACGAATTGCCACCGCCACATGAACAATGTTCATATACAAAATCAGTAATTAATGGAACCAATATACTATGTGGAATAGGACTTCTTACCACTCCATATGCAATAAAAGAAGGAGGGTTTCTGAGCCTTGCAATACTTTTAATGTTTTCTCTCATGTGTTGTTATACTGGGATGCTACTAATAAAATGTTTAGAAAGCAATGATGGACTCAAAACCTACCCAGATATTGGCCAAGCTGCTTTTGGAATTGTTGGTCGCTTGGGGATTGCAATATTTCTATACGTGGAACTTTTTGCTTCTTGTGTTGAGTATATAATACTAGTCAGTGATAACCTCTCCTCACTATATCCTAACACCCAGATGAAATTTGGTGGGATTGATTTGAATTCTGAAGAAATTTATGCCATCACAGCAGCAATTATTGTTCTACCAACAGTTTGGTTGCGAAATCTAAGCTTACTTTCTTATATTTCAGTTGGAGGAATATTTGCAACAATACTCGTTGCTCTTTGTTTGTTTTGGGTTGGGACAATGGACCAAGTTGTTGGATATAAACCAGGAAAAAAAATTCTAGACTTGGCAAACTTACCTGTCTCAGTTGGTCTCTATAGTTTTTGCTTTGCTGGCCATGCTGTTTTTCCTAACATCTACTCTTCTATGAAGGAACCATCCAAATTCCCATCAGTGTTATTTGTCTGCTTTGGCTTTTGCAGTTTCATGTACATGAGTGTGGGAATAATGGGCTACTTAACATTTGGTGACTTAGTTTCATCTCAGTTTACCTTAAACATGCCTAAAGAATTGTATGCATCTGAGATTGCAACTTGGACAACGGTTGTGACTCCATTGGCAAAATATGCCTTAACGTTATTGCCGATTGCATTGAGCATAGAGGAACTAGCCACCTCTCCTAGACTAAGATGCCATGCTATGTCCGTTCTTGTCAGAACAAGTTTAGTGATTTTAAGCTTACTTGTTGCTCTCTACATTCCATATTTTGGTTCTTTGATGGCACTAATTGGTTCTTTCTTGTCAATACTAGTTGCACTTATTTATCCATGTGCATGTTTCCTCAAGTTACATAGAGGGAGATTATCAAATTCGGAGATAACAATTTGTGGTATTATAATTGTTGTGGGGCTAATATCCGCTTGTATGGGAACATTGTCAGCTGTTTCAAAAATAAGTGGGGAAGGGGACTGA 2052 0.386 MLAGGAISWRSAKQTLSATSTMKAEFVSCFETTSHGVWLKSFFSGLRVVDFISRPLKLYCDNSAAVFMAKNNKSGCRSKHIDIKYLAIREHVKEKKVVIEHISTELMIVDPLTKGMPPKNFKDHVVQMELGSENNRLWYNMQRGKVKLDEDLRPDREDDFQTDDEENQAQRVFEHLDDDTDSDNSPPSPSLSNDVSMISWPQSYRQSMDMLTSATPPGINLLKRFGSVGRGNSPITSFKRSQEHQEDSTLSLPLVSETCGFKQENRLASVPRLQPLSSAKFSVDELPPPHEQCSYTKSVINGTNILCGIGLLTTPYAIKEGGFLSLAILLMFSLMCCYTGMLLIKCLESNDGLKTYPDIGQAAFGIVGRLGIAIFLYVELFASCVEYIILVSDNLSSLYPNTQMKFGGIDLNSEEIYAITAAIIVLPTVWLRNLSLLSYISVGGIFATILVALCLFWVGTMDQVVGYKPGKKILDLANLPVSVGLYSFCFAGHAVFPNIYSSMKEPSKFPSVLFVCFGFCSFMYMSVGIMGYLTFGDLVSSQFTLNMPKELYASEIATWTTVVTPLAKYALTLLPIALSIEELATSPRLRCHAMSVLVRTSLVILSLLVALYIPYFGSLMALIGSFLSILVALIYPCACFLKLHRGRLSNSEITICGIIIVVGLISACMGTLSAVSKISGEGD 683
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vium6666g00003 683 Pfam Transmembrane amino acid transporter protein 293 672 IPR013057 -
Vium6666g00003 683 PANTHER OS05G0424000 PROTEIN-RELATED 301 663 - -
Vium6666g00003 683 MobiDBLite consensus disorder prediction 175 196 - -
Vium6666g00003 683 CDD RNase_HI_RT_Ty1 1 119 - -
Vium6666g00003 683 FunFam Amino acid transporter AVT1A 291 681 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vium6666g00003 Vium-Chr6666 35628 48815 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vium6666g00003 146 681 Amino Acid or Auxin Permease AAAP Family AT5G02180 48.913 0.0 543