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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vium4717g00036 ATGACGGACACACTACCTGCATGTTACAACGTATTTATAGTTAATCGTAATCAATTTTGGAAAACTGATAAAGTCTTGCAAACAGAGCTTCCTATTCTAGCCATTCAAATTGCTTTTGTTGCTGTGTTATCTCGTCTCTTTTCCATAATTTACAAACCTCTACATCAAACTCGTCTCATTTCACAAATATCTGTTGGTTTCCTACTAACACCGCCATTACTTGGAAGATTCACACCCATTTTTGAGTTCATTTTTCCGGTAAACGGGATTGTCAATGTTGAGGTTCTTTCCCATATTGGTCTCATTTATTATGCATTCCTTAGTGGATTGGAGATGAACTTAAATACCATTTTACACATGAAAAAGAAACCTGCAAGCATCACTATTGTTGGGATCATCTTTCCCATGCTTGTTGCACCATGCTTATATGCTTTGTTTCGAAAAGTTTATGGGCATATTATGATGTTTCCCCTTAAGGAAAGTACAAATAATACTTATATACTTTGGACTTTAATTCTCACTGTTACAAGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCCTTTATACTGGTCTTGGTAAAGCGGCTTTAACAGCAGCCATGATTGGTGACACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTTCCATTTTCAACTAATGGTAAAGGAGCTATCTACACTGTGCCATGCACGATAATCTTCATTGTTGTGTGCATCTTTGTGGTACGTCCAATCATTCAATGGTTTATTGATCGTAAGGCAGACAAAGATGAATGGAATGATAATCAATTGCTTTTTATAATCATGGGGGTTTTAGCTTGCTCATGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGAGCTTTTGTTTTTGGATTAATTTTACCTCATGGAAGATTTGCTGAATTGGTCATGTCAATTTCAGATGATTTTGTTGGAGGATTTTTAGTTCCCCTCTTCTTTACTGGAACTGGAATGAGACTTATGTTGGCCTCAATTTTCTCCCAACAAAGTTGGCCCTTTGTAGTTGTGATTATACTCTTATTGTGTGCTCTAAAGATTTTAAGCACTTTAATTGTCACCTTGTTCTTCGGTATGCGTATTCGAGATGGTTTAACCTTGGGCTTAATTTTGAATAATAAAGGTGCCATGGCATTAATAATGCTGAACATTGCTTGGGATAGAATGATATTTTCAGTACCTACTTATGCCGTTATAACTTCTGCTGTTCTTCTGATGACCATAGTTGTGTCTCCCGTCATCAATGTTGTCTACAAACCAAGACAAAGATTTGAACAAAACAAGCTAAAGACCATACAAAAACTAAGAGTTGATGCAGAACTTCGAATTATATCATGTGTTCACAATACTCGCCAAGCTACAAGCATGATTAGCATAGTTGAGTGTTTTAATGCCATGAGAGTTTCCCCTATCCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTTGAACTTACTGGACGAACTGCTGCCCTAGTTGCTGCACATATAGGGAAGCCTAACAGCCAACCTGGAGAACAAAACCTAACTAGGTCACAAGAAGAGTTAGAAAGCATTCACAATGCATTTGATGCCCTTGGAGAGGCATATGACGCTATTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAGCATATACAACTATTCATGAGGACATATACCACTCAGCAGATGAGAAACGCACAAGCTTAATTCTTCTTCCATTTCATAAACAATTAACTTTAGAAGGTACTCTAGAAGTAACAAGTGTTGTATACAAAGATATAAACCAAAATGTAATGCAAGGTGCTCCATGCTCTGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGGTTAGTTCCTAAAAGGAACCTTCATGTTCGTGTGGTCTTTGTTGGGGGCCCTGATGATCGTGAAGCTCTGGCCATTGCATGGAGGATGGCAGGATGTTCAGGAACACAACTCTCAGTGGTTCGAATTCTTCTATTGGGTGAAGCGGCAGAAGCAGATGCATCGGTTCATGATGAAGCGCAAGGGATATTATCTGCAGTAATAGATACAGAGAGGCAAAAAGAGTTAGATGATGAGTATATAAGCACATTCAGACTTACCGGGGTTCACAGTAACGATTTAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTCGTAGTGGTGAAGATATTCCTGCAATCCTAAATGAGATAGAAAAATTTGGTTGTGATCTTTACATAGTTGGACAAGGAAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTGCTGGAGTGGTGTGAGTGCTTAGAACTTGGAGTTATAGGAGACATTTTAGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGCTCGTCTGTGCTTGTTGTTCAACAATACGGATATGGAGGAATGGATTTTAGAAATAATCTTAACCAGAAAGACACGAACAATAACAAGTTTGAGTCTGTTGTTTGA 2436 0.3801 MTDTLPACYNVFIVNRNQFWKTDKVLQTELPILAIQIAFVAVLSRLFSIIYKPLHQTRLISQISVGFLLTPPLLGRFTPIFEFIFPVNGIVNVEVLSHIGLIYYAFLSGLEMNLNTILHMKKKPASITIVGIIFPMLVAPCLYALFRKVYGHIMMFPLKESTNNTYILWTLILTVTSFPVVAHTLSELKLLYTGLGKAALTAAMIGDTYGWILFTLFVPFSTNGKGAIYTVPCTIIFIVVCIFVVRPIIQWFIDRKADKDEWNDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFVFGLILPHGRFAELVMSISDDFVGGFLVPLFFTGTGMRLMLASIFSQQSWPFVVVIILLLCALKILSTLIVTLFFGMRIRDGLTLGLILNNKGAMALIMLNIAWDRMIFSVPTYAVITSAVLLMTIVVSPVINVVYKPRQRFEQNKLKTIQKLRVDAELRIISCVHNTRQATSMISIVECFNAMRVSPIHVFALYLVELTGRTAALVAAHIGKPNSQPGEQNLTRSQEELESIHNAFDALGEAYDAIRVETLNVVSAYTTIHEDIYHSADEKRTSLILLPFHKQLTLEGTLEVTSVVYKDINQNVMQGAPCSVGIFVDRDFGLVPKRNLHVRVVFVGGPDDREALAIAWRMAGCSGTQLSVVRILLLGEAAEADASVHDEAQGILSAVIDTERQKELDDEYISTFRLTGVHSNDLISYSEIDVRSGEDIPAILNEIEKFGCDLYIVGQGNCRNSKVFSNLLEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMDFRNNLNQKDTNNNKFESVV 811
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vium4717g00036 811 CDD USP_Like 630 741 - -
Vium4717g00036 811 Gene3D - 481 747 - -
Vium4717g00036 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 8 786 - -
Vium4717g00036 811 Gene3D - 32 439 IPR038770 -
Vium4717g00036 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 38 426 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vium4717g00036 Vium-Chr4717 295480 298175 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vium4717g00036 2 786 Antiporter Super Family AT2G13620 36.398 1.55e-179 535
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vium4717g00036 - - gmx:100800072 1271.14